Un experimento de dos factores implica variar dos factores, cada uno de los cuales puede afectar la respuesta. Esto produce I x J combinaciones de tratamientos posibles. Cuando el número de réplicas es el mismo para cada tratamiento, el diseño es balanceado. Para un análisis de varianza de dos sentidos, se busca determinar si los cambios en los niveles de los factores de fila o columna cambian el valor medido y si el modelo aditivo, donde las interacciones son iguales a cero, es aplicable.