La Secretaría General de la Comisión Permanente del Pacífico Sur (CPPS) se encarga de ejecutar las resoluciones adoptadas por la CPPS, registrar tratados suscritos, coordinar actividades de las secciones nacionales y promover la cooperación entre estados miembros. Sus funciones específicas incluyen coordinar políticas entre estados miembros para consolidar su presencia en zonas de jurisdicción nacional y proyectarse de manera efectiva hacia zonas aledañas de la cuenca del Pacífico.