Proteínas de membrana
Dra. Evelin Rojas
Membranas
¿ Relación exacta Lípidos ↔Proteínas ?
Varía según identidad de membrana
Proporción lípidos- proteínas
Membrana Componente en
mayor proporción
Célula nerviosa Lípidos
Mitocondrial interna Proteínas
Plasmática Eucariota 50% proteínas
50% Lípidos
Funciones proteínas de membrana
• Reacciones químicas
• Flujo de nutrientes y desechos
• Transmisión de información
• Transducción de señales
Interacción de las proteínas con la membrana
Centro hidrofóbico
Superficie polar
Clasificación proteínas de membrana
• Proteínas integrales o intrínsecas
• Proteínas ancladas a lípidos
• Proteínas periféricas
Proteínas integrales de membrana
Fuerte interacción a la bicapa: interacciones hidrofóbicas
Separación: Detergentes (SDS, Triton X-100, Brij)
Agentes caotrópicos (alteran estructura agua: ↓ efecto hidrofóbico)
Agentes desnaturalizantes (unión tenáz lípido-proteína)
Purificación
Proteínas integrales. Requerimientos
1.- ”Anfífilos orientados asimétricamente”
Aminoácidos hidrófobos Aminoácidos polares
Porción no polar
de la membrana
Porciones que se
extienden
al ambiente acuoso
Glicoforina A
Ej: Glicoforina A (Proteína transmembrana del eritrocito)
Dominio N-terminal
72 aa lado externo
16 cadenas de
carbohidratos
Dominio hidrofóbico
19 aa
Dominio C-terminal
40 aa
Polares y cargados
Glicoforina A
Proteínas integrales. Requerimientos
2.- Contienen hélices α u hojas β en su conformación
Ej : Bacteriorrodopsina:
Proteína homotrimérica 247 aa
7 α-hélices perpendiculares al plano bicapa
Halobactrium salinarium
Luz Gradiente de protones Bomba de protones
Impulsa síntesis de ATP
Bacteriorrodopsina
Centro de reacción fotosintética
• Proteínas bacterianas fotosintéticas
• 11 α-hélices atraviesan membrana
Porinas
• Proteínas formadoras de canales o poros
• Bacterias Gram –
• Eucariotas: mme y cloroplastos
Proteínas ancladas a lípidos
Proteínas de membrana que contienen 1 o más
grupos lipídicos unidos cavalentemente.
Tres variedades:
Proteínas preniladas
Proteínas ancladas a ácido graso
Proteínas unidas a glucosilfosfatidilinosito (GPI)
Proteínas preniladas
Unidas a lípido constituido por unidades
de isopreno
CH2 = C _
CH = CH2
l
CH3
Los más comunes: C15 Farnesilo
C20 Geranilgeranilo
Sitio común de prenilación: tetrapéptido C-terminal C-X-X-Y
C= Cys
X= aminoácido alifático
Y= Determina el tipo de farnesilación
Y= Ala, Met o Ser: ocurre farnesilación
Y= Leu: geranilgeraniladas
Proteínas farnesiladas y geranilgeraniladas
Grupos prenilos
↓
Une ezimáticamente
↓
Grupo azufre de Cys
(enlace tioester)
↓
El tripéptido X-X-Y se
elimina proteolíticamente
↓
Grupo carboxilo:
Esterifica con CH3
Produce extremo C-terminal
Proteínas Ras farnesiladas
Proteínas ancladas a ácidos grasos
Miristoilación
• Anclaje de ácido mirístico ( saturado C14) a proteínas de membrana.
• Citosol, RE, membrana plasmática, núcleo
• Enlace amida entre grupo α-amino de Gly terminal
• Estable: permanece unido a lo largo de la vida de la proteína
Miristoilación
Palmitoilación
• Anclaje de ácido palmítico ( saturado C16) a proteínas de membrana.
• Cara citoplasmática de la membrana plasmática
• Enlace tioéster con resíduo de Cys específico
• Reversible (palmitoil tioesterasas): Regula asociación proteína –membrana
• Participan en señalización transmembrana
Proteínas ancladas a ácidos grasos
Palmitoilación
Proteínas unidas a GPI
• Observadas en todos los eucariotas
• Abundantes en protozoos intestinales
• Sólo en superficie exterior de membrana plamática
Proteínas periféricas
Se disocian de la membrana por procedimientos suaves que dejan la
membrana intacta: No se unen a lípidos
Al extraerlas Comportan como proteínas solubles
Unidas a la superficie de la membrana ( ej citocromo c )
Interacciones electrostáticas
Enlaces de hidrógeno
Síntesis de proteínas
• Ribosomas
• Molde de ARNm
• Crece desde N-terminal
• Adición de aminoácidos
Síntesis de proteínas
Ribosomas libres
Ribosomas unidos a RE
Solubles y mitocondriales
De membrana
Destinadas a secreción
Funcionan en RE
Incorporan en lisosomas
Vía secretora
Vía secretora
Proteínas de todas las células
~ 25% proteínas integrales
~ 40 % procesadas por la vía
secretora u otra de señalización
Vía secretora
Papel del RE en el procesamiento y selección de proteínas
Vía secretora
Proteínas de secreción
RE
Lisosómicas
Muchas TM
Sintetizan con péptido señal (N-terminal; 13-36 a.a)
H2N-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x
Centro hidrofóbico
(6-15 a.a)
1 o más residuos hidrofílicos básicos
• Forman α-hélices en ambientes no polares
• Tienen poca similitud de secuencia
• Sobresale de la superficie del ribosoma
COO-
NH2
Péptido señal
Pre-proteína
Partícula de reconocimiento de señal
SRP (complejo de 6 polipéptidos, unido a GDP)
Une al péptido señal
Reemplaza GDP → GTP
Cambio conformacional en SRP
Ribosoma detiene crecimiento del péptido
Evita que proteínas destinadas al RER se libere al citosol
Partícula de reconocimiento de señal
Translocón
• Poro acuoso transmembrana (multifuncional)
• Abarcan completamente la membrana del RE
• Forman un conducto → paso de proteínas solubles
• Proteína heterotrimérica
Sec 61 (mamíferos)
Sec Y ( procariotas)
• Median la inserción del segmento TM de proteína integral
Conservadas en todos los reinos
Estructura y función similar
Figura translocon Sec 61 y Sec Y
RE
Lisosómicas
Pasan completamente de la
membrana RER→ luz
Proteínas
TM
Contienen 1 o más secuencias
de anclaje (hidrófobas)
↓
Permanecen incrustadas
Vía secretora
Tránsito de vesículas
Después de síntesis
P. Secreción
P. Lisosómicas
P. TM
Aparecen en aparato de Golgi
Procesamiento post-traduccional
Tránsito de vesículas
Aparato de Golgi
Red Cis
Enfrente del RER
Área por donde ingresan
Proteínas al Golgi
Red trans
Área por donde salen
las proteínas procesadas
↓
Destino final
Tres tipos de cisternas o sacos membranosos
Tránsito de vesículas
Cisternas Cis
Cisternas media
Cisternas Trans
Tránsito de vesículas
Procesamiento o modificación de proteínas
↓
Transitan de un extremo a otro del Golgi
¿Cómo transitan estas proteínas?
1.- TRANSPORTE ANTERÓGRADO: En dirección Cis-Trans: entre
compartimentos sucesivos→ vesículas brotan de un compartimento y se
fusionan con el siguiente.
2.- MADURACIÓN CISTERNAL (PROGRESIÖN): viajan como “pasajeros”
Cisternas cis se vuelven cisternas trans
Procesamiento post-traduccional de proteínas
Al llegar a la red Trans → Proteínas maduras→ Clasificadas→ Destino celular
final
Transporte de proteínas al destino final
Vésículas recubiertas
Vesícula→ brota→ desde membrana de → Fusiona con membrana
origen de destino (diana)
Tipos de vesículas
Con base a la cubierta existen 3 tipos:
1. Clatrina
2. COP I
3. COP II
Contienen receptores:
Unen proteínas que se están transportando
Unen proteínas que median la fusión vesícula- membrana
Vesículas de Clatrina
•Están recubiertas de Clatrina
•Clatrina: proteína que forma estructura polihédrica (celdas o jaulas)
•Transportan proteínas TM, unidas a GPI, secreción desde el Golgi→ memb
plasm
•Forman trisquelones (estructuras flexibles de 3 patas)
Permiten formación de vesículas de ≠ tamaño
Brotación de vesículas desde una membrana
•Participan en Endocitosis→ Internalizar proteínas medio externo→medio interno
Foto vesícula de clatrina
Vesículas cubiertas COP I y COP II
COP I :
• Proteína coat (para cubierta) = coatómero
• Forman una capa borrosa alrrededor de la vesícula
• En compartimentos sucesivos del Golgi
• Devuelven proteínas del RE que escapan a la retención del Golgi
COP II :
• Reciclados de COP I que ingresan al RE
•Transportan proteínas desde el RE al Golgi
fotos
Transporte a través de vesículas
• Preserva la orientación de proteínas TM.
• Luz del RE y cisternas Golgi: topológicamente equivcalentes
al lado externo de la célula.
• Porciones carbohidratos de glicoproteínas y uniones GPI
localizadas solamente en superficie externa de la membrana
plasmática
Transporte al lisosoma
¿ Cómo se dirigen las proteínas al lisosoma ?
Marcadores de carbohidratos
(residuos de manosa 6-P)
↓
Reconocidos por receptores
↓
Reconocen vesículas recubiertas que
Transportan hidrolasas desde el Golgi
↓
Lisosomas
Proteínas que residen en el RE
Proteínas solubles que residen en el RE ( mamíferos)
Poseen una secuencia C- terminal KDEL (KKXX , KXKXXX)
K= Lys
D= Asp
E= Glu
L= Leucina
X= Cualquier a.a
Receptor unido a membrana
(une la secuencia)
Complejo Proteína- receptor
(compartimento post-RE)
Devuelta al RE en vesículas COP I
Fusión de vesículas
Transito de vesícula
↓
Fusión de vesícula que brota con otra
Membrana
↓
Libera su contenido lado opuesto
membrana diana (EXOCITOSIS)
↓
Expansión de membrana diana existente
↓
Genera membranas nuevas
Fusión de vesículas
¿Cómo y porqué las vesículas se fusionan con membranas diana?
Proteínas que participan en proceso de fusión
NSF = Proteína de fusión sensible a NEM ( N-etilmaleimida)
ATPasa citosólica
Actúa como chaperona molecular impulsada por ATP
Funciona en presencia de Factor Soluble de unión a NSF (SNAP).
SNAP= Se unen a las membranas a través de receptores
SNARE= Receptor que une SANAP
Proteína integral de membrana
Fusión de vesículas
SNARE
Asociados a membranas de vesículas (R-SNARE)
Asociados a membranas diana (Q-SNARE)
Numerosos
Diferentes
Alta especificidad
Fusión de vesículas
R-SNARE Q-SNARE
Asociación → Complejo altamente estable
↓
Ancla con firmeza vesícula a célula diana
“ATRAQUE”
↓
Estrés mecánico → expulsión de lípidos de las bicapas
↓
Estructura transitoria
↓
Fusión→ Liberación SNARE
↓
Nueva ronda de fusión
Fusión de vesículas
Toxinas Botulínicas, tétano
(proteasas)
Incorporan a la s membranas
Endocitosis
Escinden SNARE diana en sitios específicos
Detiene exocitosis de compuestos (ej neurotransmisores, )

Proteínas de membrana

  • 1.
  • 2.
    Membranas ¿ Relación exactaLípidos ↔Proteínas ? Varía según identidad de membrana
  • 3.
    Proporción lípidos- proteínas MembranaComponente en mayor proporción Célula nerviosa Lípidos Mitocondrial interna Proteínas Plasmática Eucariota 50% proteínas 50% Lípidos
  • 4.
    Funciones proteínas demembrana • Reacciones químicas • Flujo de nutrientes y desechos • Transmisión de información • Transducción de señales
  • 5.
    Interacción de lasproteínas con la membrana Centro hidrofóbico Superficie polar
  • 6.
    Clasificación proteínas demembrana • Proteínas integrales o intrínsecas • Proteínas ancladas a lípidos • Proteínas periféricas
  • 7.
    Proteínas integrales demembrana Fuerte interacción a la bicapa: interacciones hidrofóbicas Separación: Detergentes (SDS, Triton X-100, Brij) Agentes caotrópicos (alteran estructura agua: ↓ efecto hidrofóbico) Agentes desnaturalizantes (unión tenáz lípido-proteína) Purificación
  • 8.
    Proteínas integrales. Requerimientos 1.-”Anfífilos orientados asimétricamente” Aminoácidos hidrófobos Aminoácidos polares Porción no polar de la membrana Porciones que se extienden al ambiente acuoso
  • 9.
    Glicoforina A Ej: GlicoforinaA (Proteína transmembrana del eritrocito) Dominio N-terminal 72 aa lado externo 16 cadenas de carbohidratos Dominio hidrofóbico 19 aa Dominio C-terminal 40 aa Polares y cargados
  • 10.
  • 11.
    Proteínas integrales. Requerimientos 2.-Contienen hélices α u hojas β en su conformación Ej : Bacteriorrodopsina: Proteína homotrimérica 247 aa 7 α-hélices perpendiculares al plano bicapa Halobactrium salinarium Luz Gradiente de protones Bomba de protones Impulsa síntesis de ATP
  • 12.
  • 13.
    Centro de reacciónfotosintética • Proteínas bacterianas fotosintéticas • 11 α-hélices atraviesan membrana
  • 14.
    Porinas • Proteínas formadorasde canales o poros • Bacterias Gram – • Eucariotas: mme y cloroplastos
  • 15.
    Proteínas ancladas alípidos Proteínas de membrana que contienen 1 o más grupos lipídicos unidos cavalentemente. Tres variedades: Proteínas preniladas Proteínas ancladas a ácido graso Proteínas unidas a glucosilfosfatidilinosito (GPI)
  • 16.
    Proteínas preniladas Unidas alípido constituido por unidades de isopreno CH2 = C _ CH = CH2 l CH3 Los más comunes: C15 Farnesilo C20 Geranilgeranilo Sitio común de prenilación: tetrapéptido C-terminal C-X-X-Y C= Cys X= aminoácido alifático Y= Determina el tipo de farnesilación Y= Ala, Met o Ser: ocurre farnesilación Y= Leu: geranilgeraniladas
  • 17.
    Proteínas farnesiladas ygeranilgeraniladas Grupos prenilos ↓ Une ezimáticamente ↓ Grupo azufre de Cys (enlace tioester) ↓ El tripéptido X-X-Y se elimina proteolíticamente ↓ Grupo carboxilo: Esterifica con CH3 Produce extremo C-terminal
  • 18.
  • 19.
    Proteínas ancladas aácidos grasos Miristoilación • Anclaje de ácido mirístico ( saturado C14) a proteínas de membrana. • Citosol, RE, membrana plasmática, núcleo • Enlace amida entre grupo α-amino de Gly terminal • Estable: permanece unido a lo largo de la vida de la proteína
  • 20.
  • 21.
    Palmitoilación • Anclaje deácido palmítico ( saturado C16) a proteínas de membrana. • Cara citoplasmática de la membrana plasmática • Enlace tioéster con resíduo de Cys específico • Reversible (palmitoil tioesterasas): Regula asociación proteína –membrana • Participan en señalización transmembrana Proteínas ancladas a ácidos grasos
  • 22.
  • 23.
    Proteínas unidas aGPI • Observadas en todos los eucariotas • Abundantes en protozoos intestinales • Sólo en superficie exterior de membrana plamática
  • 24.
    Proteínas periféricas Se disociande la membrana por procedimientos suaves que dejan la membrana intacta: No se unen a lípidos Al extraerlas Comportan como proteínas solubles Unidas a la superficie de la membrana ( ej citocromo c ) Interacciones electrostáticas Enlaces de hidrógeno
  • 25.
    Síntesis de proteínas •Ribosomas • Molde de ARNm • Crece desde N-terminal • Adición de aminoácidos
  • 26.
    Síntesis de proteínas Ribosomaslibres Ribosomas unidos a RE Solubles y mitocondriales De membrana Destinadas a secreción Funcionan en RE Incorporan en lisosomas Vía secretora
  • 27.
    Vía secretora Proteínas detodas las células ~ 25% proteínas integrales ~ 40 % procesadas por la vía secretora u otra de señalización
  • 28.
    Vía secretora Papel delRE en el procesamiento y selección de proteínas
  • 29.
    Vía secretora Proteínas desecreción RE Lisosómicas Muchas TM Sintetizan con péptido señal (N-terminal; 13-36 a.a) H2N-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x Centro hidrofóbico (6-15 a.a) 1 o más residuos hidrofílicos básicos • Forman α-hélices en ambientes no polares • Tienen poca similitud de secuencia • Sobresale de la superficie del ribosoma COO- NH2 Péptido señal Pre-proteína
  • 30.
    Partícula de reconocimientode señal SRP (complejo de 6 polipéptidos, unido a GDP) Une al péptido señal Reemplaza GDP → GTP Cambio conformacional en SRP Ribosoma detiene crecimiento del péptido Evita que proteínas destinadas al RER se libere al citosol
  • 31.
  • 32.
    Translocón • Poro acuosotransmembrana (multifuncional) • Abarcan completamente la membrana del RE • Forman un conducto → paso de proteínas solubles • Proteína heterotrimérica Sec 61 (mamíferos) Sec Y ( procariotas) • Median la inserción del segmento TM de proteína integral Conservadas en todos los reinos Estructura y función similar Figura translocon Sec 61 y Sec Y
  • 33.
    RE Lisosómicas Pasan completamente dela membrana RER→ luz Proteínas TM Contienen 1 o más secuencias de anclaje (hidrófobas) ↓ Permanecen incrustadas Vía secretora
  • 34.
    Tránsito de vesículas Despuésde síntesis P. Secreción P. Lisosómicas P. TM Aparecen en aparato de Golgi Procesamiento post-traduccional
  • 35.
    Tránsito de vesículas Aparatode Golgi Red Cis Enfrente del RER Área por donde ingresan Proteínas al Golgi Red trans Área por donde salen las proteínas procesadas ↓ Destino final
  • 36.
    Tres tipos decisternas o sacos membranosos Tránsito de vesículas Cisternas Cis Cisternas media Cisternas Trans
  • 37.
    Tránsito de vesículas Procesamientoo modificación de proteínas ↓ Transitan de un extremo a otro del Golgi ¿Cómo transitan estas proteínas? 1.- TRANSPORTE ANTERÓGRADO: En dirección Cis-Trans: entre compartimentos sucesivos→ vesículas brotan de un compartimento y se fusionan con el siguiente. 2.- MADURACIÓN CISTERNAL (PROGRESIÖN): viajan como “pasajeros” Cisternas cis se vuelven cisternas trans
  • 38.
    Procesamiento post-traduccional deproteínas Al llegar a la red Trans → Proteínas maduras→ Clasificadas→ Destino celular final
  • 39.
    Transporte de proteínasal destino final Vésículas recubiertas Vesícula→ brota→ desde membrana de → Fusiona con membrana origen de destino (diana)
  • 40.
    Tipos de vesículas Conbase a la cubierta existen 3 tipos: 1. Clatrina 2. COP I 3. COP II Contienen receptores: Unen proteínas que se están transportando Unen proteínas que median la fusión vesícula- membrana
  • 41.
    Vesículas de Clatrina •Estánrecubiertas de Clatrina •Clatrina: proteína que forma estructura polihédrica (celdas o jaulas) •Transportan proteínas TM, unidas a GPI, secreción desde el Golgi→ memb plasm •Forman trisquelones (estructuras flexibles de 3 patas) Permiten formación de vesículas de ≠ tamaño Brotación de vesículas desde una membrana •Participan en Endocitosis→ Internalizar proteínas medio externo→medio interno Foto vesícula de clatrina
  • 42.
    Vesículas cubiertas COPI y COP II COP I : • Proteína coat (para cubierta) = coatómero • Forman una capa borrosa alrrededor de la vesícula • En compartimentos sucesivos del Golgi • Devuelven proteínas del RE que escapan a la retención del Golgi COP II : • Reciclados de COP I que ingresan al RE •Transportan proteínas desde el RE al Golgi fotos
  • 43.
    Transporte a travésde vesículas • Preserva la orientación de proteínas TM. • Luz del RE y cisternas Golgi: topológicamente equivcalentes al lado externo de la célula. • Porciones carbohidratos de glicoproteínas y uniones GPI localizadas solamente en superficie externa de la membrana plasmática
  • 44.
    Transporte al lisosoma ¿Cómo se dirigen las proteínas al lisosoma ? Marcadores de carbohidratos (residuos de manosa 6-P) ↓ Reconocidos por receptores ↓ Reconocen vesículas recubiertas que Transportan hidrolasas desde el Golgi ↓ Lisosomas
  • 45.
    Proteínas que residenen el RE Proteínas solubles que residen en el RE ( mamíferos) Poseen una secuencia C- terminal KDEL (KKXX , KXKXXX) K= Lys D= Asp E= Glu L= Leucina X= Cualquier a.a Receptor unido a membrana (une la secuencia) Complejo Proteína- receptor (compartimento post-RE) Devuelta al RE en vesículas COP I
  • 46.
    Fusión de vesículas Transitode vesícula ↓ Fusión de vesícula que brota con otra Membrana ↓ Libera su contenido lado opuesto membrana diana (EXOCITOSIS) ↓ Expansión de membrana diana existente ↓ Genera membranas nuevas
  • 47.
    Fusión de vesículas ¿Cómoy porqué las vesículas se fusionan con membranas diana? Proteínas que participan en proceso de fusión NSF = Proteína de fusión sensible a NEM ( N-etilmaleimida) ATPasa citosólica Actúa como chaperona molecular impulsada por ATP Funciona en presencia de Factor Soluble de unión a NSF (SNAP). SNAP= Se unen a las membranas a través de receptores SNARE= Receptor que une SANAP Proteína integral de membrana
  • 48.
    Fusión de vesículas SNARE Asociadosa membranas de vesículas (R-SNARE) Asociados a membranas diana (Q-SNARE) Numerosos Diferentes Alta especificidad
  • 49.
    Fusión de vesículas R-SNAREQ-SNARE Asociación → Complejo altamente estable ↓ Ancla con firmeza vesícula a célula diana “ATRAQUE” ↓ Estrés mecánico → expulsión de lípidos de las bicapas ↓ Estructura transitoria ↓ Fusión→ Liberación SNARE ↓ Nueva ronda de fusión
  • 50.
    Fusión de vesículas ToxinasBotulínicas, tétano (proteasas) Incorporan a la s membranas Endocitosis Escinden SNARE diana en sitios específicos Detiene exocitosis de compuestos (ej neurotransmisores, )