Dra. Evelin Rojas  Villarroel
 
Biocatalizadores de naturaleza proteica.  Catalizadores orgánicos (Sustrato    Producto). Potentes y eficaces Aceleran la velocidad de reacción. No se consumen. Específicas: catalizan reacciones específicas. Distintos grados de especificidad: Ej.  Sacarasa  es específica:    sacarosa  (sustrato natural)        maltosa e isomaltosa  Máxima eficacia sobre el sustrato natural
Sitio  activo comprende: Sitio de unión:  aminoácidos que están en contacto directo con el sustrato. Sitio catalítico:  aminoácidos directamente implicados en el mecanismo de la reacción.
E +S E - S E +P Sustrato: compuesto sobre el que actúa la enzima SITIO ACTIVO: región particular de la enzima donde se une el sustrato Formación de productos:  enzima puede comenzar un nuevo ciclo de reacción
Según su acción catalítica específica: 6 grupos o clases: OXIDOREDUCTASAS TRANSFERASAS HIDROLASAS  LIASAS  ISOMERASAS  LIGASAS
. Catalizan reacciones de oxidorreducción:  Transferencia de hidrógeno (H) o electrones (e-) de  un sustrato a otro. Ejemplo: dehidrogenasas
Catalizan la transferencia de un grupo químico (distinto del hidrógeno) de un sustrato a otro. Reacción:  Ejemplo: glucoquinasa A-B + C A + C-B glucosa + ATP ADP + glucosa-6-fosfato
Catalizan las reacciones de hidrólisis:  Ruptura de enlaces en presencia de agua A-B + H 2 O AH + B-OH    H 2 O
Catalizan reacciones de ruptura y/o formación de enlaces  covalentes en un sustrato. NH2 A-B  A + B
Catalizan la ínterconversión de isómeros: Ej:  Fosfotriosa isomerasa  Fosfoglucosa isomerasa A  B
A + B + XTP A-B + XDP + P i     Catalizan la unión de dos sustratos con hidrólisis  simultánea de un nucleótido trifosfato (ATP, GTP, etc.): Ej: Piruvato carboxilasa:  piruvato + CO 2  + ATP oxaloacetato + ADP + P i
Sustrato: interactúa con  enzima  (energía y orientación adecuada).  Forma  complejo enzima-sustrato ( sitio activo)  Enzima:  modifica las propiedades químicas del sustrato unido .  Se debilitan los enlaces existentes y se facilita la formación de otros CINÉTICA ENZIMÁTICA http://www.ehu.es/biomoleculas/enzimas/enz3.htm#e
UNIÓN ENZIMA-SUSTRATO. MODELOS Forma en que el sustrato se une al sitio activo de la enzima: Llave-cerradura   Estructuras del  sustrato y sitio activo de la enzima:  Complementarias y  rígidas http://enzimass.blogspot.com/2011/06/mecanismos-de-accion-enzimatica.html
Ajuste inducido   Sitio activo de la enzima sufre cambio conformacional: En presencia del sustrato UNIÓN ENZIMA-SUSTRATO http://bioquimicafariusblackwolf.blogspot.com/2009/05/bases-de-la-accion-enzimatica-energia.html
Al inicio, la reacción requiere un aporte de energía.  Energía inicial:  energía de activación  (Ea).  Cuanto menor es la Ea más fácilmente transcurre la reacción.  Los productos finales tienen menos energía libre de Gibbs ( Δ G) que los reactantes. En las reacciones espontáneas se libera energía de Gibbs ( Δ G<0).
Acción de los catalizadores: Disminuir la E a . Las enzimas son  catalizadores  especialmente eficaces: ya que disminuyen la E a  aún más que los catalizadores inorgánicos. Ej:  H 2 O 2  H 2 O  + O 2   Sin catalizador: 18 Kcal/mol Catalizador inorgánico (platino): 12 Kcal/mol (20.000 veces) Enzima específica (catalasa): 6 Kcal/mol (370.000 veces).
MODO DE ACCIÓN  Perfil energético de una reacción espontánea Perfil energético de una reacción catalizada por enzimas
Velocidad de las reacciones catalizadas por enzimas. Proporcionan información sobre: Mecanismo de la reacción catalítica Especificidad de la enzima.  La medida de la velocidad de una reacción: Condiciones óptimas de pH Temperatura,  Presencia de cofactores, etc Concentraciones saturantes de sustrato.  En estas condiciones:  la velocidad de reacción =  velocidad máxima (Vmax).  La velocidad puede determinarse midiendo la desaparición de los sustratos o la aparición de  los productos.
MODELO  CINÉTICO  DE  MICHAELIS-MENTEN   Finales del siglo XIX. En1882: concepto del complejo enzima-sustrato ( intermediario del proceso).  Leonor Michaelis   y Maud Menten  (1913): Ecuación de velocidad que explica el comportamiento  cinético de las enzimas. Las reacciones catalizadas enzimáticamente ocurren  en dos etapa: 1era etapa:  se forma el complejo enzima-sustrato   2da etapa: el complejo enzima-sustrato da lugar a la  formación del producto , liberando la enzima libre.
  ECUACIÓN DE  DE MICHAELIS-MENTEN   V1= k1   E     ES  V2= k2    ES  V3= k3    ES  Velocidad de formación y disociación del complejo E-S es CONSTANTE    = velocidad de la reacci ó n enzim á tica. Vmax= Velocidad máxima  S  = Concentraci ó n del sustrato. K M = Constante de Michaelis
REPRESENTACIÓN DE MICHAELIS-MENTEN  K M  :Concentración de sustrato a la cual la velocidad de la reacción es la mitad de la Vmax  Vmax: Valor máximo al que tiende la curva.
REPRESENTACIÓN DE LINEWEAVER-BURK Representación doble recíproca (1/v frente a 1/[S]:  línea recta. Pendiente es K M /V max   Origen de la abscisa  es -1/K M   Origen de la ordenada  es 1/V max
Proteínas    catalizadores.  Cambios en la conformación    asociados  a cambios en la actividad. Los factores que influyen de manera más directa sobre la actividad de un enzima son:  Concentración de sustrato. Concentración de enzima Temperatura pH Presencia/concentración de Inhibido r
Baja [S]:  velocidad inicial directamente proporcional a la concentración de sustrato ( reacción de primer orden). Alta [S]:  enzima saturada por el sustrato, y la velocidad ya no depende de [S]. Se alcanza la velocidad es máxima (V max ).
Baja   E  : velocidad  de la reacción directamente proporcional a la   E  . Alta   E  : se alcanza Vmax, se agota el sustrato
Temperatura óptima :  la actividad catalítica es máxima.  Por encima de la temperatura óptima: pérdida de actividad catalítica debido a la desnaturalización. La actividad enzimática decrece rápidamente hasta anularse  EFECTO DE LA TEMPERATURA
EFECTO DEL pH     Enzimas son  sensibles   a cambios de pH.  pH óptimo : Conformación más adecuada  de la enzima para la actividad catalítica:   Por encima o por debajo del pH óptimo:   se afecta la  actividad y pueden provocar la desnaturalización de la enzima.
Moléculas que  inhiben  acción catalítica de una enzima. Pueden ocupar temporalmente el sitio activo por semejanza estructural con el sustrato original  ( inhibidor competitivo ). Alteran la conformación espacial de la enzima, impidiendo su unión al sustrato ( inhibidor no competitivo ). INHIBIDORES
Se alcanza la Vmax El K M  se altera (aumenta) INHIBICIÓN COMPETITIVA   Inhibidor  estructuralmente similar a estructura del sustrato  (isostérico). Competencia por el sitio activo
No se alcanza la Vmax El K M  no se altera Inhibidor  se une  en sitio alostérico. Provoca cambio conformacional del sitio activo INHIBICIÓN  NO COMPETITIVA
El inhibidor se une al complejo E-S Sitio alostérico: diferente al sitio activo INHIBICIÓN ACOMPETITIVA   Vmax no se alcanza K M  disminuye
CONCENTRACIÓN DE SUSTRATO Y PRODUCTOS CONCENTRACIÓN DE ENZIMA TEMPERATURA  pH PRESENCIA Y CONCENTRACIÓN  DE INHIBIDORES PRESENCIA DE COFACTORES
Sustancias no proteicas que potencian  la  actividad de la enzima. Cofactores inorgánicos: iobnes  Fe ++ , Mg ++ , Mn ++ , Zn ++  etc. Cofactor orgánico=  coenzima .  Derivadas de  vitaminas hidrosolubles  (complejo B y vit. C): ej. NAD+; FAD; CoA, NADP. Derivadas de  vitaminas liposolubles  ( A, D, E, K): ej. retinal. Cofactores y coenzimas unidos covalentemente a la enzima forman  grupos prostéticos. La enzima unida a su grupo prostético, se llama  holoenzima . Parte proteica de un holoenzima:  apoenzima. COFACTORES apoenzima + grupo prostético= holoenzima
VITAMINAS HIDROSOLUBLES Y SU FORMA COENZIMÁTICA Desconocida Ácido ascórbico ( Vit C) Pirofosfato de Tiamina (PPT) Tiamina (B1) Coenzimas de Flavina (FAD, FMN) Riboflavina ( B2) Fosfato de piriridoxal Piridoxina (B6) Coenzima A (CoA) Ácido pantoténico Coenzimas de nicotinamida (NAD+ y NADP) Ácido nicotínico (niacina) Ácido Tetrahidrofólico (THF) Ácido Fólico Coenzimas de cobalamina: Desoxiadenosilcobalamina Metilcobalamina Cobalamina ( B12) Biocitina Biotina Coenzima Vitaminas Hidrosolubles
VITAMINAS LIPOSOLUBLES Y SU FORMA COENZIMÁTICA Desconocida Vitamina K Desconocida Vitamina E 1, 25-Dihidroxicolecalciferol Vitamina D Retinal Vitamina  A Coenzima Vitaminas Liposolubless

Enzimología

  • 1.
    Dra. Evelin Rojas Villarroel
  • 2.
  • 3.
    Biocatalizadores de naturalezaproteica. Catalizadores orgánicos (Sustrato  Producto). Potentes y eficaces Aceleran la velocidad de reacción. No se consumen. Específicas: catalizan reacciones específicas. Distintos grados de especificidad: Ej. Sacarasa es específica:  sacarosa (sustrato natural) maltosa e isomaltosa Máxima eficacia sobre el sustrato natural
  • 4.
    Sitio activocomprende: Sitio de unión: aminoácidos que están en contacto directo con el sustrato. Sitio catalítico: aminoácidos directamente implicados en el mecanismo de la reacción.
  • 5.
    E +S E- S E +P Sustrato: compuesto sobre el que actúa la enzima SITIO ACTIVO: región particular de la enzima donde se une el sustrato Formación de productos: enzima puede comenzar un nuevo ciclo de reacción
  • 6.
    Según su accióncatalítica específica: 6 grupos o clases: OXIDOREDUCTASAS TRANSFERASAS HIDROLASAS LIASAS ISOMERASAS LIGASAS
  • 7.
    . Catalizan reaccionesde oxidorreducción: Transferencia de hidrógeno (H) o electrones (e-) de un sustrato a otro. Ejemplo: dehidrogenasas
  • 8.
    Catalizan la transferenciade un grupo químico (distinto del hidrógeno) de un sustrato a otro. Reacción: Ejemplo: glucoquinasa A-B + C A + C-B glucosa + ATP ADP + glucosa-6-fosfato
  • 9.
    Catalizan las reaccionesde hidrólisis: Ruptura de enlaces en presencia de agua A-B + H 2 O AH + B-OH   H 2 O
  • 10.
    Catalizan reacciones deruptura y/o formación de enlaces covalentes en un sustrato. NH2 A-B A + B
  • 11.
    Catalizan la ínterconversiónde isómeros: Ej: Fosfotriosa isomerasa Fosfoglucosa isomerasa A B
  • 12.
    A + B+ XTP A-B + XDP + P i   Catalizan la unión de dos sustratos con hidrólisis simultánea de un nucleótido trifosfato (ATP, GTP, etc.): Ej: Piruvato carboxilasa: piruvato + CO 2 + ATP oxaloacetato + ADP + P i
  • 13.
    Sustrato: interactúa con enzima (energía y orientación adecuada). Forma complejo enzima-sustrato ( sitio activo) Enzima: modifica las propiedades químicas del sustrato unido . Se debilitan los enlaces existentes y se facilita la formación de otros CINÉTICA ENZIMÁTICA http://www.ehu.es/biomoleculas/enzimas/enz3.htm#e
  • 14.
    UNIÓN ENZIMA-SUSTRATO. MODELOSForma en que el sustrato se une al sitio activo de la enzima: Llave-cerradura Estructuras del sustrato y sitio activo de la enzima: Complementarias y rígidas http://enzimass.blogspot.com/2011/06/mecanismos-de-accion-enzimatica.html
  • 15.
    Ajuste inducido Sitio activo de la enzima sufre cambio conformacional: En presencia del sustrato UNIÓN ENZIMA-SUSTRATO http://bioquimicafariusblackwolf.blogspot.com/2009/05/bases-de-la-accion-enzimatica-energia.html
  • 16.
    Al inicio, lareacción requiere un aporte de energía. Energía inicial: energía de activación (Ea). Cuanto menor es la Ea más fácilmente transcurre la reacción. Los productos finales tienen menos energía libre de Gibbs ( Δ G) que los reactantes. En las reacciones espontáneas se libera energía de Gibbs ( Δ G<0).
  • 17.
    Acción de loscatalizadores: Disminuir la E a . Las enzimas son catalizadores especialmente eficaces: ya que disminuyen la E a aún más que los catalizadores inorgánicos. Ej: H 2 O 2 H 2 O + O 2 Sin catalizador: 18 Kcal/mol Catalizador inorgánico (platino): 12 Kcal/mol (20.000 veces) Enzima específica (catalasa): 6 Kcal/mol (370.000 veces).
  • 18.
    MODO DE ACCIÓN Perfil energético de una reacción espontánea Perfil energético de una reacción catalizada por enzimas
  • 19.
    Velocidad de lasreacciones catalizadas por enzimas. Proporcionan información sobre: Mecanismo de la reacción catalítica Especificidad de la enzima. La medida de la velocidad de una reacción: Condiciones óptimas de pH Temperatura, Presencia de cofactores, etc Concentraciones saturantes de sustrato. En estas condiciones: la velocidad de reacción = velocidad máxima (Vmax). La velocidad puede determinarse midiendo la desaparición de los sustratos o la aparición de los productos.
  • 20.
    MODELO CINÉTICO DE MICHAELIS-MENTEN Finales del siglo XIX. En1882: concepto del complejo enzima-sustrato ( intermediario del proceso). Leonor Michaelis y Maud Menten (1913): Ecuación de velocidad que explica el comportamiento cinético de las enzimas. Las reacciones catalizadas enzimáticamente ocurren en dos etapa: 1era etapa: se forma el complejo enzima-sustrato 2da etapa: el complejo enzima-sustrato da lugar a la formación del producto , liberando la enzima libre.
  • 21.
      ECUACIÓN DE DE MICHAELIS-MENTEN V1= k1  E   ES  V2= k2  ES  V3= k3  ES  Velocidad de formación y disociación del complejo E-S es CONSTANTE  = velocidad de la reacci ó n enzim á tica. Vmax= Velocidad máxima  S  = Concentraci ó n del sustrato. K M = Constante de Michaelis
  • 22.
    REPRESENTACIÓN DE MICHAELIS-MENTEN K M :Concentración de sustrato a la cual la velocidad de la reacción es la mitad de la Vmax Vmax: Valor máximo al que tiende la curva.
  • 23.
    REPRESENTACIÓN DE LINEWEAVER-BURKRepresentación doble recíproca (1/v frente a 1/[S]: línea recta. Pendiente es K M /V max Origen de la abscisa es -1/K M Origen de la ordenada es 1/V max
  • 24.
    Proteínas  catalizadores. Cambios en la conformación  asociados a cambios en la actividad. Los factores que influyen de manera más directa sobre la actividad de un enzima son: Concentración de sustrato. Concentración de enzima Temperatura pH Presencia/concentración de Inhibido r
  • 25.
    Baja [S]: velocidad inicial directamente proporcional a la concentración de sustrato ( reacción de primer orden). Alta [S]: enzima saturada por el sustrato, y la velocidad ya no depende de [S]. Se alcanza la velocidad es máxima (V max ).
  • 26.
    Baja E  : velocidad de la reacción directamente proporcional a la  E  . Alta  E  : se alcanza Vmax, se agota el sustrato
  • 27.
    Temperatura óptima : la actividad catalítica es máxima. Por encima de la temperatura óptima: pérdida de actividad catalítica debido a la desnaturalización. La actividad enzimática decrece rápidamente hasta anularse EFECTO DE LA TEMPERATURA
  • 28.
    EFECTO DEL pH   Enzimas son sensibles a cambios de pH. pH óptimo : Conformación más adecuada de la enzima para la actividad catalítica: Por encima o por debajo del pH óptimo: se afecta la actividad y pueden provocar la desnaturalización de la enzima.
  • 29.
    Moléculas que inhiben acción catalítica de una enzima. Pueden ocupar temporalmente el sitio activo por semejanza estructural con el sustrato original ( inhibidor competitivo ). Alteran la conformación espacial de la enzima, impidiendo su unión al sustrato ( inhibidor no competitivo ). INHIBIDORES
  • 30.
    Se alcanza laVmax El K M se altera (aumenta) INHIBICIÓN COMPETITIVA Inhibidor estructuralmente similar a estructura del sustrato (isostérico). Competencia por el sitio activo
  • 31.
    No se alcanzala Vmax El K M no se altera Inhibidor se une en sitio alostérico. Provoca cambio conformacional del sitio activo INHIBICIÓN NO COMPETITIVA
  • 32.
    El inhibidor seune al complejo E-S Sitio alostérico: diferente al sitio activo INHIBICIÓN ACOMPETITIVA Vmax no se alcanza K M disminuye
  • 33.
    CONCENTRACIÓN DE SUSTRATOY PRODUCTOS CONCENTRACIÓN DE ENZIMA TEMPERATURA pH PRESENCIA Y CONCENTRACIÓN DE INHIBIDORES PRESENCIA DE COFACTORES
  • 34.
    Sustancias no proteicasque potencian la actividad de la enzima. Cofactores inorgánicos: iobnes Fe ++ , Mg ++ , Mn ++ , Zn ++ etc. Cofactor orgánico= coenzima . Derivadas de vitaminas hidrosolubles (complejo B y vit. C): ej. NAD+; FAD; CoA, NADP. Derivadas de vitaminas liposolubles ( A, D, E, K): ej. retinal. Cofactores y coenzimas unidos covalentemente a la enzima forman grupos prostéticos. La enzima unida a su grupo prostético, se llama holoenzima . Parte proteica de un holoenzima: apoenzima. COFACTORES apoenzima + grupo prostético= holoenzima
  • 35.
    VITAMINAS HIDROSOLUBLES YSU FORMA COENZIMÁTICA Desconocida Ácido ascórbico ( Vit C) Pirofosfato de Tiamina (PPT) Tiamina (B1) Coenzimas de Flavina (FAD, FMN) Riboflavina ( B2) Fosfato de piriridoxal Piridoxina (B6) Coenzima A (CoA) Ácido pantoténico Coenzimas de nicotinamida (NAD+ y NADP) Ácido nicotínico (niacina) Ácido Tetrahidrofólico (THF) Ácido Fólico Coenzimas de cobalamina: Desoxiadenosilcobalamina Metilcobalamina Cobalamina ( B12) Biocitina Biotina Coenzima Vitaminas Hidrosolubles
  • 36.
    VITAMINAS LIPOSOLUBLES YSU FORMA COENZIMÁTICA Desconocida Vitamina K Desconocida Vitamina E 1, 25-Dihidroxicolecalciferol Vitamina D Retinal Vitamina A Coenzima Vitaminas Liposolubless