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Universidad Central de Venezuela
Facultad de Medicina
Escuela de Medicina Luis Razetti
Cátedra de Bioquímica



   Tema 2:
   Estructura y Función de las
   Proteínas (2/5)
                         Dra. Vanessa Miguel
                       vanessa.miguel@ucv.ve
                             @bioquitips

                                     Noviembre 2011
Niveles de Organización de las Proteínas
•   Estructura primaria.
•   Estructura secundaria.
•   Estructura terciaria.
•   Estructura cuaternaria.
Estructura primaria
Es la secuencia de sus aminoácidos. Por convención el
orden de escritura es siempre desde el grupo amino-
terminal hasta el carboxilo final
Estructura Secundaria
   Arreglos periódicos de
    segmentos de la proteína
   No considera grupos R
   Estabilizada por puentes de
    hidrógeno entre el grupo
    carbonilo y el amida del enlace
    peptídico

   Tipos: -hélice, Lámina , giros o
    plegamientos al azar
α-Hélice
•Estabilizada por puentes
de hidrógeno.
•Entre átomos de O y NH
que forman parte del
enlace peptídico.
•Grupos R de los
aminoácidos se localizan
hacia el exterior de la
hélice
•Muy frecuente en las
proteínas globulares.
α-Hélice
Hoja -Plegada

•Estabilizada por puentes
de hidrógeno.
•Entre átomos de O y NH
que forman parte del
enlace peptídico.
•Cadena polipeptídica
completamente extendida.
•Grupos R localizados por
arriba y por debajo del
plano de la hoja.
Laminas-
Estructuras supersecundarias

 -hélice                                                  4 hélices


             hélice-giro-hélice
                                  coiled-coil   Mano EF


             Horquilla
Estructura                        Meandro                 Hélice

                                                Barril


 -                                Rossmann
Estructura secundaria
Estructura Terciaria

   Estructura tridimensional que adoptan todos
    los átomos que conforman la proteína.
   Involucra interacciones entre aa distantes en
    la secuencia primaria de la proteína.
   Estabilizada por interacciones no covalentes
   Se llama dominio a regiones compactas
    dentro de la estructura con funciones
    específicas
Estructura Terciaria
Combinaciones de hélices, láminas,
    con giros, inversiones,...
Dominios
   Regiones diferenciadas dentro de la
    estructura terciaria que actúan como
    unidades autónomas de plegamiento
   Constituyen un nivel estructural intermedio
    entre las estructuras secundaria y terciaria
   Los dominios se pliegan por separado a
    medida que se sintetiza la cadena
    polipeptídica.
   Es la asociación de los distintos dominios
    la que origina la estructura terciaria
Dominios Piruvato Quinasa
      Cuatro dominios, cada uno
       representado de un color.
Estructura Terciaria

    Dos tipos de estructuras
    terciarias básicas:
   Proteínas fibrosas,
    insolubles en agua,
    como la alfa queratina o
    el colágeno
   Proteínas globulares,
    solubles en agua.
Clasificación de las Proteínas
Holoproteínas: solo contienen aminoácidos
 Fibrosas (Insolubles en agua): Colágeno,
  elastina, queratina
 Intermedias (Estructura fibrosa pero son

Solubles) : Actina, miosina, fibrinógeno
 Globulares (Son solubles): Albuminas,
  globulinas, histonas
Heteroproteínas: aa y otros compuestos no
  proteicos. Ej: Lipoproteínas, Fosfoproteínas,
  Glucoproteínas, Nucleoproteínas
Calmodulina
Estructura Cuaternaria
   Formadas por la unión mediante enlaces no
    covalentes de dos o más cadenas
    polipeptídicas
   La estructura cuaternaria debe considerar:
    (1) El número y la naturaleza de las distintas
    subunidades o monómeros que integran la
    proteína
    (2) La forma en que se asocian en el espacio
    para dar lugar a la proteína.
Inmunoglobulina G
Inmunoglobulina

   La molécula de IgG está formada por cuatro
    cadenas polipeptídicas: dos cadenas pesadas
    idénticas de 44o aa (H1y H2)y 2 cadenas
    livianas iguales de 220 aa (L1 y L2).
   El plegamiento de las cadenas crea 3
    dominios globulares, cada uno formado por dos
    cadenas asociadas y una región bisagra que
    los conecta.
Inmunoglobulina
Colágeno
Colágeno

   El colágeno está compuesto por 3 cadenas
    de 1400 aa que forman una triple hélice.
   Presenta una secuencia típica 3 aa repetida
    periódicamente: Gly-Pro-X
   La glicina (R=H) permite que las 3 hélices
    levógiras se asocien para formar un helicoide
    dextrógiro
Hemoglobina
Hemoglobina

   Tiene 4 subunidades que son 2 α y 2 que
    tienen 141 y 146 aa respectivamente.
   El tetrámero de la hemoglobina puede ser
    considerado de un dímero de dímeros (α )1
    y (α )2, unidos por interacciones
    hidrofóbicas.
    Cada cadena polipeptídica está unida a un
    grupo prostético, el hemo, que contiene un
    átomo hierro en el centro (hemoproteína)
Hemoglobina
Estructura de la   Estructura de la
  Mioglobina        Hemoglobina




 1 subunidad         4 subunidad:   2 2

1 grupo Hemo          4 grupos Hemo

  Une 1 O2              Une 4 O2
Receptor de insulina

                      Un dominio extracelular
                       (extracitoplasmático),
                       que une al primer
                       mensajero (ligando)
                      Un dominio
                       transmembrana
                      Un dominio intracelular
                       (citoplasmático), con
                       actividad enzimática.
Estructura del complejo PE/PPE de
Mycobacterium tuberculosis
Desnaturalización

   Pérdida de las
    estructuras de orden
    superior (secundaria,
    terciaria y cuaternaria),
    quedando la cadena          Estado nativo

    polipeptídica sin
    ninguna estructura
    tridimensional fija



                                          Estado desnaturalizado
Desnaturalización

   La estructura nativa y la desnaturalizada tan
    sólo tienen en común la estructura primaria. Los
    demás niveles de organización estructural
    desaparecen en la estructura desnaturalizada.
   La desnaturalización provoca :
       Cambios en las propiedades hidrodinámicas de la
        proteína: aumenta la viscosidad y disminuye el coeficiente
        de difusión
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Clase2 tema2 2011-v_miguel

  • 1. Universidad Central de Venezuela Facultad de Medicina Escuela de Medicina Luis Razetti Cátedra de Bioquímica Tema 2: Estructura y Función de las Proteínas (2/5) Dra. Vanessa Miguel vanessa.miguel@ucv.ve @bioquitips Noviembre 2011
  • 2. Niveles de Organización de las Proteínas • Estructura primaria. • Estructura secundaria. • Estructura terciaria. • Estructura cuaternaria.
  • 3. Estructura primaria Es la secuencia de sus aminoácidos. Por convención el orden de escritura es siempre desde el grupo amino- terminal hasta el carboxilo final
  • 4. Estructura Secundaria  Arreglos periódicos de segmentos de la proteína  No considera grupos R  Estabilizada por puentes de hidrógeno entre el grupo carbonilo y el amida del enlace peptídico  Tipos: -hélice, Lámina , giros o plegamientos al azar
  • 5. α-Hélice •Estabilizada por puentes de hidrógeno. •Entre átomos de O y NH que forman parte del enlace peptídico. •Grupos R de los aminoácidos se localizan hacia el exterior de la hélice •Muy frecuente en las proteínas globulares.
  • 7. Hoja -Plegada •Estabilizada por puentes de hidrógeno. •Entre átomos de O y NH que forman parte del enlace peptídico. •Cadena polipeptídica completamente extendida. •Grupos R localizados por arriba y por debajo del plano de la hoja.
  • 9. Estructuras supersecundarias -hélice 4 hélices hélice-giro-hélice coiled-coil Mano EF Horquilla Estructura Meandro Hélice Barril - Rossmann
  • 11. Estructura Terciaria  Estructura tridimensional que adoptan todos los átomos que conforman la proteína.  Involucra interacciones entre aa distantes en la secuencia primaria de la proteína.  Estabilizada por interacciones no covalentes  Se llama dominio a regiones compactas dentro de la estructura con funciones específicas
  • 12. Estructura Terciaria Combinaciones de hélices, láminas, con giros, inversiones,...
  • 13. Dominios  Regiones diferenciadas dentro de la estructura terciaria que actúan como unidades autónomas de plegamiento  Constituyen un nivel estructural intermedio entre las estructuras secundaria y terciaria  Los dominios se pliegan por separado a medida que se sintetiza la cadena polipeptídica.  Es la asociación de los distintos dominios la que origina la estructura terciaria
  • 14. Dominios Piruvato Quinasa Cuatro dominios, cada uno representado de un color.
  • 15. Estructura Terciaria Dos tipos de estructuras terciarias básicas:  Proteínas fibrosas, insolubles en agua, como la alfa queratina o el colágeno  Proteínas globulares, solubles en agua.
  • 16. Clasificación de las Proteínas Holoproteínas: solo contienen aminoácidos  Fibrosas (Insolubles en agua): Colágeno, elastina, queratina  Intermedias (Estructura fibrosa pero son Solubles) : Actina, miosina, fibrinógeno  Globulares (Son solubles): Albuminas, globulinas, histonas Heteroproteínas: aa y otros compuestos no proteicos. Ej: Lipoproteínas, Fosfoproteínas, Glucoproteínas, Nucleoproteínas
  • 18. Estructura Cuaternaria  Formadas por la unión mediante enlaces no covalentes de dos o más cadenas polipeptídicas  La estructura cuaternaria debe considerar: (1) El número y la naturaleza de las distintas subunidades o monómeros que integran la proteína (2) La forma en que se asocian en el espacio para dar lugar a la proteína.
  • 20. Inmunoglobulina  La molécula de IgG está formada por cuatro cadenas polipeptídicas: dos cadenas pesadas idénticas de 44o aa (H1y H2)y 2 cadenas livianas iguales de 220 aa (L1 y L2).  El plegamiento de las cadenas crea 3 dominios globulares, cada uno formado por dos cadenas asociadas y una región bisagra que los conecta.
  • 23. Colágeno  El colágeno está compuesto por 3 cadenas de 1400 aa que forman una triple hélice.  Presenta una secuencia típica 3 aa repetida periódicamente: Gly-Pro-X  La glicina (R=H) permite que las 3 hélices levógiras se asocien para formar un helicoide dextrógiro
  • 25. Hemoglobina  Tiene 4 subunidades que son 2 α y 2 que tienen 141 y 146 aa respectivamente.  El tetrámero de la hemoglobina puede ser considerado de un dímero de dímeros (α )1 y (α )2, unidos por interacciones hidrofóbicas.  Cada cadena polipeptídica está unida a un grupo prostético, el hemo, que contiene un átomo hierro en el centro (hemoproteína)
  • 27. Estructura de la Estructura de la Mioglobina Hemoglobina 1 subunidad 4 subunidad: 2 2 1 grupo Hemo 4 grupos Hemo Une 1 O2 Une 4 O2
  • 28. Receptor de insulina  Un dominio extracelular (extracitoplasmático), que une al primer mensajero (ligando)  Un dominio transmembrana  Un dominio intracelular (citoplasmático), con actividad enzimática.
  • 29.
  • 30. Estructura del complejo PE/PPE de Mycobacterium tuberculosis
  • 31. Desnaturalización  Pérdida de las estructuras de orden superior (secundaria, terciaria y cuaternaria), quedando la cadena Estado nativo polipeptídica sin ninguna estructura tridimensional fija Estado desnaturalizado
  • 32. Desnaturalización  La estructura nativa y la desnaturalizada tan sólo tienen en común la estructura primaria. Los demás niveles de organización estructural desaparecen en la estructura desnaturalizada.  La desnaturalización provoca :  Cambios en las propiedades hidrodinámicas de la proteína: aumenta la viscosidad y disminuye el coeficiente de difusión  Disminución de su solubilidad, ya que los residuos hidrofóbicos del interior aparecen en la superficie  Pérdida de las propiedades biológicas
  • 34. Videos recomendados  Estructura de Proteínas (Protein structure) http://www.youtube.com/watch?v=iaHHgEoa2c8  Plegamiento de Proteínas (Protein folding) http://www.youtube.com/watch?v=fvBO3TqJ6FE  Alfa hélice http://www.youtube.com/watch?v=eUS6CEn4GSA  Hoja Plegada (Beta sheet) http://www.youtube.com/watch?v=wM2LWCTWlrE