Los grupos funcionales son conjuntos de átomos que determinan las propiedades y reactividad de las moléculas. Algunos grupos funcionales comunes en las biomoléculas son el carboxilo, que se encuentra en ácidos grasos y aminoácidos; el fosfato, que forma el enlace fosfodiéster en los ácidos nucleicos; y el metilo, que es no polar y se encuentra en la mayoría de las moléculas orgánicas.