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BIOMOLECULAS
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• El agua es el solvente biológico en la Tierra
• Todos los organismos vivos requieren agua más
que ninguna otra substancia
• La mayoría de las células están rodeadas por
agua, y ellas mismas tienen una composición de
agua del 70-95% de su peso fresco
• La abundancia de agua es la principál razón de
que la Tierra sea habitable
El Agua: La Molécula que Sustenta Toda la Vida
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La polaridad de las moléculas de agua resulta en la
formación de enlaces puentes de hidrógeno
• El agua es una molécula polar: extremos
opuestos poseen densidad de carga eléctrica
opuesta
• La polaridad de las moléculas de agua les
permite formar uniónes puentes de hidrógeno
entre ellas y con otras moléculas polares
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• Propiedades del agua que facilitan un ambiente
apto para la vida:
Cohesión
Capacidad de moderar la temperatura
Expansión al congelarse
Versatilidad como solvente
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Cohesión
• Colectivamente, las uniónes P de H mantienen a
las moléculas de agua juntas, fenómeno
denominado cohesión
• La cohesión ayuda al transporte de agua contra
la gravedad en las plantas
• La adhesión de las moléculas de agua (por P de
H) a las paredes celulares del tejido de
conducción de agua (xilema) de las plantas,
también ayuda a contrarrestar la gravedad
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• La tensión superficiál es una medida de cuán
dificil es romper la superficie de un líquido
• La tensión superficiál está relacionada con la
cohesión
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Moderación de la Temperatura
• El agua absorve calor del aire caliente y entrega
calor almacenado al aire más frío
• El agua puede absorver o liberar grandes
cantidades de calor variando levemente su propia
temperatura
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Calor y Temperatura
• La energía cinética es la energía de movimiento
• El Calor es una medida de la cantidad total de
energía cinética debida al movimiento
molecular
• La Temperatura es una medida de la intensidad
del Calor debida a la energía cinética promedio
de las moléculas
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El Agua posee elevado Calor Específico
• El calor específico de una substancia es la
cantidad de calor que debe ser absorbida o
perdida por 1 g de esa substancia para cambiar
su temperatura en 1ºC
• El elevado calor específico del agua minimiza
las fluctuaciones de temperatura manteniendo
estas dentro de límites compatibles con la vida
– El agua absorve calor cuando se rompen
uniones P de H
– El agua libera calor cuando se forman P de H
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Enfriamiento por Evaporación
• La vaporización es una transición de fases,
desde la fase líquida a la fase gaseosa
• El calor de vaporización es la cantidad de calor
que una substancia debe absorver de para que 1
g de la misma pase de la fase líquida a la fase
gaseosa
• Vaporización:
• Ebullición (todo el liq., = > temp. ebull.)
• Evaporación (sup. del líq., temp. < ebull.).
~Transpiración
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Enfriamiento por evaporación
• A medida que un líquido se evapora, la superficie
restante del mismo se enfria, fenómeno
denominado enfriamiento por evaporación
• El enfriamiento por evaporación del agua ayuda
a estabilizar la temperatura en los organismos y
en los cuerpos de agua
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Aislación de los Cuerpos de Agua por el Hielo
Flotante
• El hielo flota en agua líquida debido a que es
menos denso. Esto se debe a que las uniónes P
de H en el agua sólida son más ordenadas
• Si el hielo se hundiera los cuerpos de agua se
congelarían completamente en determinados
ambientes, haciendo la vida imposible
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El Solvente de la Vida
• El agua es un solvente versatil debido a su
polaridad
• Esto se debe a su capacidad de formar uniónes P
de H con otras substancias polares
• Cuando un compuesto iónico se disuelve en
agua cada ión se rodea de una esfera de
moléculas de agua, denominada capa de
hidratación
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Na+
Cl–
Cl–
+
+
+
+
–
–
–
–
–
–
–
–
–
–
–
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• El agua también puede disolver compuestos
polares no iónicos
• Aún macromoléculas, como por ej. proteínas,
pueden disolverse en agua, si poseen regiones
iónicas y polares
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Lysozyme molecule
in a nonaqueous environment.
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Lysozyme molecule in a aqueous environment.
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Compuestos Hidrofílicos e Hidrofóbicos
• Un compuesto hidrofílico es aquél que tiene
afinidad por el agua. Compuestos iónicos y
polares
• Un compuesto hidrofóbico es aquél que no tiene
afinidad por el agua. Compuestos no polares
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Concentración de Solutos en Soluciones Acuosas
• La mayor parte de las reacciones bioquímicas
ocurren en medio acuoso
• Las reacciones químicas dependen de las
colisiones entre las moléculas y por lo tanto de la
concentración de solutos en una solución acuosa
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La disociación del agua produce condiciones de acidéz
o alcalinidad que afectan a los organismos vivos
• Un átomo de H en un enlace P de H entre dos
moléculas de H2O puede cambiar su posición de
una molécula a la otra:
– El H deja su e- y es transferido como protón o
ión (catión) hidrógeno (H+)
– La molécula con el H+ extra es ahora un ión
(catión) hidronio (H3O+)
– La molécula que perdió el H+ es ahora un ión
(anión) hidroxilo u oxhidrilo(OH-)
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• El proceso puede ser descripto en una forma más
simple, como la disociación de una molécula de
H2O en H+ y OH- :
H2O = H+ + OH−
2H2O = H3O+ + OH−
• Aunque estadísticamente rara, la disociación de
moléculas de H2O tiene un efecto significativo
sobre los organismos
• Cambios en las concentraciones de H+ y OH-
pueden afectar la química de las células
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Cambios en las concentraciones de H+ y OH-
• Las concentraciones de H+ y OH- son iguales en
H2O pura:
H2O = H+ + OH−
• El agregado de ciertos solutos, denominados
ácidos y bases, modifica las concentraciones de
H+ y OH-
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Acidos y Bases
• Un ácido es una substancia que incrementa la
[H+] (en realidad [H3O+]) de una solución acuosa
(sensu Arrhenius)
• Una base es una substancia que reduce la
concentración de H+ de una solución acuosa
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La Escala de pH
• El pH de una solución está determinado por la
[H+] (en realidad [H3O+])
• pH= –log [H+]
• Soluciones ácidas tienen valores de pH<7
• Soluciones básicas tienen valores de pH>7
• La mayoría de los fluidos biológicos tienen valores
de pH en el rango 6-8
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pH Scale
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
Oven cleaner
Household bleach
Household ammonia
Milk of magnesia
Seawater
Pure water
Human blood
Urine
Black coffee
Tomato juice
Vinegar, beer, wine,
cola
Digestive (stomach)
juice, lemon juice
Battery acid
Neutral
[H+] = [OH–]
Increasingly
Acidic
[H
+
]
>
[OH
–
]
Increasingly
Basic
[H
+
]
<
[OH
–
]
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Buffers
• El pH interno de la mayoría de las células vivas
debe permanecer cercano a 7
• Los buffers son soluciones acuosas que
consisten en un par ácido-base y tienen la
propiedad de minimizar los cambios de pH
frente a la adición de cantidades relativamente
pequeñas de ácidos o bases fuertes
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• Los 6 grupos funcionales más importantes en la
química de la vida:
– Hidroxilo
– Carbonilo
– Carboxilo
– Amino
– Sulfidrilo
– Fosfato
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STRUCTURE
(may be written HO—)
NAME OF COMPOUNDS
Alcohols (their specific names
usually end in -ol)
Ethanol, the alcohol present in
alcoholic beverages
FUNCTIONAL PROPERTIES
Is polar as a result of the
electronegative oxygen atom
drawing electrons toward itself.
Attracts water molecules, helping
dissolve organic compounds such
as sugars
EXAMPLE
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STRUCTURE
NAME OF COMPOUNDS
Ketones if the carbonyl group is
within a carbon skeleton
EXAMPLE
Acetone, the simplest ketone
A ketone and an aldehyde may
be structural isomers with
different properties, as is the case
for acetone and propanal.
Aldehydes if the carbonyl group is
at the end of the carbon skeleton
Acetone, the simplest ketone
Propanal, an aldehyde
FUNCTIONAL PROPERTIES
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STRUCTURE
NAME OF COMPOUNDS
Carboxylic acids, or organic acids
EXAMPLE
Has acidic properties because it is
a source of hydrogen ions.
Acetic acid, which gives vinegar
its sour taste
FUNCTIONAL PROPERTIES
The covalent bond between
oxygen and hydrogen is so polar
that hydrogen ions (H+) tend to
dissociate reversibly; for example,
Acetic acid Acetate ion
In cells, found in the ionic form,
which is called a carboxylate group.
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STRUCTURE
NAME OF COMPOUNDS
Amine
EXAMPLE
Because it also has a carboxyl
group, glycine is both an amine and
a carboxylic acid; compounds with
both groups are called amino acids.
FUNCTIONAL PROPERTIES
Acts as a base; can pick up a
proton from the surrounding
solution:
(nonionized)
Ionized, with a charge of 1+,
under cellular conditions
Glycine
(ionized)
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STRUCTURE
(may be written HS—)
NAME OF COMPOUNDS
Thiols
EXAMPLE
Ethanethiol
FUNCTIONAL PROPERTIES
Two sulfhydryl groups can
interact to help stabilize protein
structure
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STRUCTURE
NAME OF COMPOUNDS
Organic phosphates
EXAMPLE
Glycerol phosphate
FUNCTIONAL PROPERTIES
Makes the molecule of which it
is a part an anion (negatively
charged ion).
Can transfer energy between
organic molecules.
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Macromoléculas:
estructura y función
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• Dentro de las células moléculas orgánicas
pequeñas se unen para formar macromoléculas
• Las macromoleculas están formadas por miles de
átomos unidos por enlaces covalentes
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La mayoría de las macromoléculas son polímeros
construidos a partir de monómeros
• Un polímero es una molécula larga constituida por
muchas unidades similares denominadas
monómeros
• Tres de las cuatro clases de moléculas orgánicas
de la vida son polímeros:
– Carbohidratos
– Proteinas
– Acidos Nucleicos
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Síntesis y ruptura de polímeros
• Los monómeros forman moléculas más grandes
por medio de reacciones de condensación,
denominadas reacciones de deshidratación
• Los polímeros son desensamblados a monómeros
por medio de hidrólisis, una reacción que es
escencialmente la inversa de una reacción de
deshidratación
LE 5-2
Short polymer Unlinked monomer
Dehydration removes a water
molecule, forming a new bond
Dehydration reaction in the synthesis of a polymer
Longer polymer
Hydrolysis adds a water
molecule, breaking a bond
Hydrolysis of a polymer
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Diversidad de polímeros
• Cada célula posee miles de macromoléculas
diferentes
• La composición de macromoléculas varía entre
células de un mismo organismo, varía más entre
organismos de la misma especie, y varía aún más
entre especies distintas
• Una variedad inmensa de polímeros puede
formarse a partir de un pequeño grupo de
monómeros
1 2 3 HO
H
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Los carbohidratos sirven como combustible y como
materiál de construcción
• Los carbohidratos incluyen a los monosacáridos
y a sus polímeros
• Los carbohidratos más sencillos son los
monosacáridos o azúcares simples
• Los carbohidratos macromoleculares son los
polisacáridos, polímeros formados por muchos
monosacáridos
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Monosacáridos
• Los monosacáridos poseen formulas moleculares
que son normalmente múltiplos de CH2O
• La glucosa es el monosacárido más común
• Los monosacáridos son clasificados según la
ubicación del grupo carbonilo (aldehido o cetona)
y el número de C en el esqueleto carbonado
LE 5-3
Triose sugars
(C3H6O3)
Glyceraldehyde
Pentose sugars
(C5H10O5)
Ribose
Hexose sugars
(C5H12O6)
Glucose Galactose
Dihydroxyacetone
Ribulose
Fructose
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• Los monosacáridos son el combustible principal
de las células y son materia prima para la síntesis
de otras moléculas
• Aunque habitualmente son representados en
forma lineál, en realidad en solución acuosa
forman anillos
LE 5-4
Linear and
ring forms
Abbreviated ring
structure
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• Un disacárido se forma cuando una reacción de
deshidratación une a dos monosacáridos
• La unión covalente resultante se denomina unión
glicosídica
LE 5-5
Glucose
Maltose
Fructose Sucrose
Glucose Glucose
Dehydration
reaction in the
synthesis of maltose
Dehydration
reaction in the
synthesis of sucrose
1–4
glycosidic
linkage
1–2
glycosidic
linkage
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Polisacáridos
• Los polisacáridos, polimeros de monosacaridos,
poseen roles estructurales y de
almacenamiento
• La estructura y función de un polisacárido esta
determinada por sus monómeros constituyentes y
por la posición de sus enlaces glicosídicos
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Polisacáridos de almacenamiento o reserva
• El almidón, un polisacárido de almacenamiento de
las plantas, esta formado exclusivamente por
monómeros de glucosa
• Las plantas almacenan el exceso de almidón
como gránulos dentro de cloroplastos y otros
plástidos
LE 5-6a
Chloroplast Starch
1 µm
Amylose
Starch: a plant polysaccharide
Amylopectin
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• El glucógeno es el polisacárido de reserva de los
animales (y de los hongos)
• Los seres humanos y otros vertebrados
almacenan glucógeno, como gránulos,
principalmente en las células hepáticas y
musculares
LE 5-6b
Mitochondria Glycogen granules
0.5 µm
Glycogen
Glycogen: an animal polysaccharide
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Polisacáridos estructurales
• La celulosa es el componente principal de la
pared celular de las plantas
• En forma similar al almidón, la celulosa es un
plímero de glucosa, pero con diferentes uniones
glicosídicas
• La diferencia esta basada en dos formas distintas
del anillo de la glucosa: alfa () y beta ()
LE 5-7
a Glucose
a and b glucose ring structures
b Glucose
Starch: 1–4 linkage of a glucose monomers.
Cellulose: 1–4 linkage of b glucose monomers.
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• Polímeros con alfa glucosa son helicoidales
• Polímeros con beta glucosa son rectos
• En las estructuras rectas, los átomos de H en
una cadena pueden unirse con grupos OH de
otra cadena (puentes de H)
• Moléculas de celulosa paralelas, mantenidas
juntas de esta manera, se agrupan en
microfibrillas
LE 5-8
Cellulose
molecules
Cellulose microfibrils
in a plant cell wall
Cell walls Microfibril
Plant cells
0.5 µm
 Glucose
monomer
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• Las enzimas que digieren almidón, por hidrólisis
de uniones alfa, no pueden hidrolizar las uniones
beta de la celulosa (y vice versa)
• La celulosa en la comida humana pasa a través
del tracto digestivo como fibra insoluble
• Algunos microorganismos (algunas bacterias y
hongos) poseen enzimas que digieren celulosa
• Muchos animales hebívoros, desde vacas a
termitas, establecen relaciones simbióticas
mutualistas con algunos de estos microbios
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• La quitina, es otro polisacárido estructural, que
forma el exoesqueleto de los artrópodos
• La quitina también brinda soporte estructural a la
pared celular de los hongos
• La quitina puede utilizarse como hilo quirúrgico
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Los lipidos son un grupo diverso de moléculas
hidrofóbicas
• Los lípidos son la clase de moléculas biológicas
que no forman polimeros
• La característica unificadora de los lípidos es que
poseen poca o ninguna afinidad por el agua
• Los lípidos son hidrofóbicos porque están
constituidos fundamentalmente por cadenas
hidrocarbonadas formadas por uniones
covalentes no polares
• Los lípidos biológicamente más importantes son
los acilglicéridos, fosfolípidos y esteroides
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Acilglicéridos
• Los acilglicéridos están formados por dos tipos
de moléculas más pequeñas: glicerol y ácidos
grasos, unidos por uniones ester
• El glicerol es un alcohol de 3 C, con un grupo OH
unido a cada uno de ellos
• Un ácido graso consiste en un grupo carboxilo
(COOH) unido a una larga cadena
hidrocarbonada (usualmente 16-18 C)
LE 5-11a
Dehydration reaction in the synthesis of a fat
Glycerol
Fatty acid
(palmitic acid)
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• Los acilglicéridos se separan del agua
debido a que las moléculas de agua forman
puentes de hidrógeno entre si, excluyendo a
los acilglicéridos
• En un acilglicérido, tres acidos grasos se
unen al glicerol por uniones ester, formando
un triacilglicerol o triglicérido
LE 5-11b
Ester linkage
Fat molecule (triacylglycerol)
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• Los ácidos grasos varian en longitud (número de
C) y en el número y localización de dobles
enlaces
• Los ácidos grasos saturados poseen el máximo
número de átomos de H posible (no poseen
dobles enlaces)
• Los ácidos grasos insaturados poseen uno o
más dobles enlaces
• La función principal de los acilglicéridos es el
almacenamiento de energía
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• Los acilglicéridos formados por acidos grasos
saturados se denominan acilglicéridos
saturados o “grasas saturadas”
• La mayoría de los acilglicéridos de origen animal
son saturados
• Los acilglicéridos saturados son sólidos a
temperatura ambiente (grasas)
LE 5-12a
Saturated fat and fatty acid.
Stearic acid
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• Los acilglicéridos formados por ácidos grasos
insaturados se denominan acilglicéridos
insaturados o “grasas insaturadas”
• Los acilglicéridos de plantas y de pescado
usualmente son insaturados
• Los acilglicéridos de plantas y de pescado son
líquidos a temperatura ambiente (aceites)
LE 5-12b
Unsaturated fat and fatty acid.
Oleic acid
cis double bond
causes bending
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.
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Grasas trans: Se obtienen a partir de la hidrogenación de los aceites vegetales, por
lo cual pasan de ser insaturadas a saturadas, y a poseer la forma espacial de trans,
por eso se llaman ácidos grasos trans. Son mucho más perjudiciales que las grasas
saturadas presentes en la naturaleza (con forma cis), ya que son altamente
aterogénicas y pueden contribuir a elevar los niveles de lipoproteínas LDL y los
triglicéridos, haciendo descender peligrosamente los niveles de lipoproteínas HDL.
Ejemplos de alimentos que contienen estos ácidos grasos son: la manteca vegetal,
margarina y cualquier alimento elaborado con estos ingredientes
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Serie omega 3. El primer doble enlace está
situado en posición 3
Serie omega 6. El primer doble enlace está situado en
posición 6
Grasas poliinsaturadas (formadas por ácidos grasos de las series
omega-3, omega-6).
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Fosfolípidos
• En un fosfolípido, dos ácidos grasos y un grupo
fosfato están unidos al glicerol por uniones ester
• Las dos cadenas de ácidos grasos (“colas”) son
hidrofóbicas, pero el grupo fosfato y sus
uniones forman una “cabeza” hidrofílica
LE 5-13
Structural formula Space-filling model Phospholipid symbol
Hydrophilic
head
Hydrophobic
tails
Fatty acids
Choline
Phosphate
Glycerol
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• Cuando los fosfolípidos son agregados al agua,
estos se autoensamblan en una bicapa, con las
“colas” hidrofóbicas orientadas hacia el interior de
la misma
• Esta estructura de bicapa fosfolipídica es
característica de las membranas biológicas (ej.
membrana plasmática, sistema de
endomembranas, membranas de organelas)
• Los fosfolípidos son el componente principal de
todas las membranas celulares
LE 5-14
WATER
Hydrophilic
head
Hydrophobic
tails
WATER
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Esteroides
• Los esteroides son lipidos characterizados por un
equeleto carbonado formado por cuatro anillos
fusionados
• El colesterol, un esteroide importante, es un
componente de las membranas celulares
animales
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Las proteínas poseen estructuras diversas, lo que
resulta en un amplio rango de funciones
• Las proteínas representan más del 50% del peso
seco de la mayoría de las células
• Las funciones de las proteínas incluyen: soporte
estructural, almacenamiento, transporte,
comunicación celular, movimiento, defensa
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• Las enzimas son un tipo de proteínas que actuan
como catalizadores, aumentando la velocidad de
las reacciones bioquímicas
• Las enzimas pueden llevar a cabo sus funciones
repetidamente
LE 5-16
Substrate
(sucrose)
Enzyme
(sucrose)
Fructose
Glucose
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Polipéptidos
• Los polipéptidos son polímeros de aminoácidos
• Una proteína puede estar formada por uno o más
polipéptidos
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Aminoácidos
• Los aminoácidos son moléculas orgánicas que
se caracterizan por poseer un grupo carboxilo y
un grupo amino
• Los aminoácidos difieren en sus propiedades
debido a sus cadenas laterales distintivas,
denominadas grupos R
• Las células utilizan 20 aminoácidos para fabricar
miles de proteínas distintas
LE 5-UN78
Amino
group
Carboxyl
group
 carbon
LE 5-17a
Isoleucine (Ile)
Methionine (Met) Phenylalanine (Phe) Tryptophan (Trp) Proline (Pro)
Leucine (Leu)
Valine (Val)
Alanine (Ala)
Nonpolar
Glycine (Gly)
LE 5-17b
Asparagine (Asn) Glutamine (Gln)
Threonine (Thr)
Polar
Serine (Ser) Cysteine (Cys) Tyrosine (Tyr)
LE 5-17c
Electrically
charged
Aspartic acid (Asp)
Acidic Basic
Glutamic acid (Glu) Lysine (Lys) Arginine (Arg) Histidine (His)
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Polímeros de aminoácidos
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• Aminoácidos unidos por uniones peptídicas
(uniones amida):
Péptidos (2-50 aa),
Polipéptidos (>50~1000 aa)
• Cada polipéptido posee una única secuencia
lineal de aminoácidos (idem péptidos)
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Conformación y función de las proteínas
• Una proteína funcional consiste en uno o más
polipéptidos doblados, plegados y enrrollados en
una forma característica
• La secuencia de aminoácidos determina la
estructura 3-D (conformación) de una proteína
• La conformación (estructura 3-D) de una
proteína determina su función
LE 5-19
A ribbon model
Groove
Groove
A space-filling model
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Los cuatro niveles de organización estructural de
las proteínas
• La estructura primaria de una proteína corresponde
a su secuencia única de aminoácidos
• Algunas regiones de la cadena polipeptídica
presentan enrrollamientos y plegamientos
característicos que determinan su estructura
secundaria
• La estructura terciaria está determinada por
interacciones entre varios grupos R de aminoácidos
• La estructura cuaternaria existe en proteínas
formadas por más de un polipéptido
LE 5-20
Amino acid
subunits
 pleated sheet
+H3N
Amino end
 helix
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• La estructura primaria, la secuencia de
aminoácidos en una proteína, es semejante al
orden de letras en una palabra larga
• La estructura primaria esta determinada por
información genética heredada
LE 5-20a
Amino acid
subunits
Carboxyl end
Amino end
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• Los enrrollamientos y pliegues de la estructura
secundaria resultan de enlaces puente de
hidrógeno entre constituyentes repetitivos del
esqueleto polipeptídico
• Estucturas secundarias típicas son un
enrrollamiento llamado alfa hélice y una
estructura plegada denominada hoja plegada
beta
LE 5-20b
Amino acid
subunits
 pleated sheet
 helix
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Two types of β sheet
structures. (A) An
antiparallel β sheet . (B) A
parallel β sheet. Both of
these structures are
common in proteins.
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• La estructura terciaria está determinada por
interacciónes entre grupos R
• Estas interacciones entre grupos R incluyen
uniónes puente de hidrógeno, uniones iónicas,
interacciones hidrofóbicas, e interacciones de van
der Waals
• Uniones covalentes denominadas puentes
disulfuro pueden reforzar la estructura terciaria
LE 5-20d
Hydrophobic
interactions and
van der Waals
interactions
Polypeptide
backbone
Disulfide bridge
Ionic bond
Hydrogen
bond
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• La estructura cuaternaria resulta cuando dos o
más cadenas polipeptídicas (subunidades)
forman una proteína.
• Dichas subunidades se asocian entre sí mediante
uniones puente de hidrógeno, uniónes iónicas,
interacciones hidrofóbicas, interacciones de van
der Waals. Pueden existir uniones covalentes de
tipo puente disulfuro entre residuos de cisteína
situados en cadenas polipeptídicas distintas
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El colágeno es una proteína fibrosa formada por
tres cadenas polipéptídicas enrrolladas como
una cuerda
La hemoglobina es una proteína globular
formada por cuatro cadenas polipeptídicas: dos
alfa y dos beta
LE 5-20e
 Chains
 Chains
Hemoglobin
Iron
Heme
Collagen
Polypeptide chain
Polypeptide
chain
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Anemia falciforme: un simple cambio en la
estructura primaria
• Un simple cambio en la estructura primaria puede
afectar la conformación de una proteína y por lo
tanto su capacidad funcional
• La anemia falciforme, una enfermedad hereditaria
de la sangre, resulta de una única sustitución de
un aminoácido en la subunidad beta de la
hemoglobina
LE 5-21a
Red blood
cell shape
Normal cells are
full of individual
hemoglobin
molecules, each
carrying oxygen.
10 µm 10 µm
Red blood
cell shape
Fibers of abnormal
hemoglobin deform
cell into sickle
shape.
LE 5-21b
Primary
structure
Secondary
and tertiary
structures
1 2 3
Normal hemoglobin
Val His Leu
4
Thr
5
Pro
6
Glu Glu
7
Primary
structure
Secondary
and tertiary
structures
1 2 3
Sickle-cell hemoglobin
Val His Leu
4
Thr
5
Pro
6
Val Glu
7
Quaternary
structure
Normal
hemoglobin
(top view)








Function Molecules do
not associate
with one
another; each
carries oxygen.
Quaternary
structure
Sickle-cell
hemoglobin
Function Molecules
interact with
one another to
crystallize into
a fiber; capacity
to carry oxygen
is greatly reduced.
Exposed
hydrophobic
region
 subunit  subunit
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Qué determina la conformación de una proteína?
• Además de la estructura primaria, condiciones
físicas y químicas pueden afectar la conformación
• Alteraciones en el pH, concentración de sales,
temperatura, y otros factores ambientales, pueden
modificar la conformación nativa de una
proteína
• Esta pérdida de la conformación nativa se
denomina desnaturalización
• Una proteína desnaturalizada es biológicamente
inactiva
LE 5-22
Denaturation
Renaturation
Denatured protein
Normal protein
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THE REFOLDING OF A DENATURED PROTEIN
(A) This experiment demonstrates that the conformation of a protein is determined
solely by its amino acid sequence. (B) The structure of urea. Urea is very soluble in
water and unfolds proteins at high concentrations
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El problema del plegamiento de las proteínas
• Es dificil de predecir la conformación de una
proteína en base a su estructura primaria
• La mayoría de las proteínas probablemente
transitan varios estados en su camino a una
conformación estable
• Las chaperonas son proteínas que ayudan al
correcto plegamiento de otras proteínas
LE 5-23a
Chaperonin
(fully assembled)
Hollow
cylinder
Cap
LE 5-23b
Polypeptide
Correctly
folded
protein
An unfolded poly-
peptide enters the
cylinder from one
end.
Steps of Chaperonin
Action:
The cap comes
off, and the
properly folded
protein is released.
The cap attaches, causing
the cylinder to change
shape in such a way that
it creates a hydrophilic
environment for the
folding of the polypeptide.
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• Los científicos utilizan cristalografía de rayos X
para determinar la conformación de una proteína
• Otro método es la espectroscopía por resonancia
magnética nuclear (NMR), la cuál no requiere de
la cristalización de la proteína
LE 5-24a
Photographic film
Diffracted X-rays
X-ray
source
X-ray
beam
X-ray
diffraction pattern
Crystal
LE 5-24b
Nucleic acid
3D computer model
X-ray diffraction pattern
Protein
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Los ácidos nucleicos almacenan y transmiten la
información hereditaria
• La secuencia de aminoácidos de un polipéptido
está programada en una unidad hereditaria
denominada gen
• Los genes están formados por DNA, un ácido
nucleico
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Los roles de los Acidos Nucleicos
• Existen dos tipos de ácidos nucleicos :
– Acido desoxirribonucleico (DNA)
– Acido ribonucleico (RNA)
• El DNA provee instrucciones para su propia
replicación
• El DNA dirige la síntesis de RNA mensajero
(mRNA) y, a través del mRNA, controla la síntesis
de proteinas
• La síntesis de proteinas ocurre en los ribosomas
LE 5-25
NUCLEUS
DNA
CYTOPLASM
mRNA
mRNA
Ribosome
Amino
acids
Synthesis of
mRNA in the nucleus
Movement of
mRNA into cytoplasm
via nuclear pore
Synthesis
of protein
Polypeptide
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La estructura de los Acidos Nucleicos
• Los ácidos nucleicos son polímeros
denominados polinucleótidos
• Cada polinucleótido está formado por
monómeros llamados nucleótidos
• Cada nucleótido en un polinucleótido consiste en
una base nitrogenada, un azúcar pentosa , y un
grupo fosfato
• La porción de un nucleótido sin el grupo fosfato
se denomina nucleosido
LE 5-26a
5 end
3 end
Nucleoside
Nitrogenous
base
Phosphate
group
Nucleotide
Polynucleotide, or
nucleic acid
Pentose
sugar
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Nucleótidos
• Los nucleótidos estan formados por
nucleosidos y grupos fosfato
• Nucleosido = base nitrogenada + azúcar pentosa
• Existen dos familias de bases nitrogenadas :
– Las Pirimidinas poseen un anillo de 6
átomos
– Las Purinas poseen un anillo de 6 átomos
unido a un anillo de 5 átomos
• En el DNA, el azúcar pentosa es la desoxirribosa
• En el RNA, la pentosa es la ribosa
LE 5-26b
Nitrogenous bases
Pyrimidines
Purines
Pentose sugars
Cytosine
C
Thymine (in DNA)
T
Uracil (in RNA)
U
Adenine
A
Guanine
G
Deoxyribose (in DNA)
Nucleoside components
Ribose (in RNA)
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A
G
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T
U
C
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Polímeros de Nucleótidos
• Los nucleótidos están unidos formando un
polinucleótido
• Nucleótidos adyacentes están unidos por uniones
covalentes que se forman entre el grupo –OH en el
C3´ de un nucleótido y el fosfato en el C5´ del
nucleótido siguiente
• Estas uniones crean el esqueleto de pentosa-
fostato con bases nitrogenadas como apéndices
• La secuencia de bases a lo largo del DNA o mRNA
es única para cada gen
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La doble hélice del DNA
• Una molécula de DNA está formada por dos
polinucleótidos enrrollados alrededor de un eje
imaginario, formando una doble hélice
• En la doble hélice de DNA, los dos esqueletos
corren en direcciones 5´ a 3´ opuestas uno
respecto del otro, en un ordenamiento
denominado antiparalelo
• Una molécula de DNA incluye a muchos genes
• Las bases nitrogenadas en el DNA forman
puentes de H en una forma complementaria: A
siempre con T, y G siempre con C
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LE 5-27
Sugar-phosphate
backbone
3 end
5 end
Base pair (joined by
hydrogen bonding)
Old strands
Nucleotide
about to be
added to a
new strand
5 end
New
strands
3 end
5 end
3 end
5 end
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RNA
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mRNA
tRNA
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rRNA
snRNA
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El DNA y las Proteínas como registro de la
Evolución
• La secuencia lineal de nucleótidos en las
moléculas de DNA son pasadas de los padres a
la descendencia
• Dos especies cercanamente emparentadas son
más similares en su secuencia de DNA que
especies más distantemente relacionadas
• La biología molecular puede ser utilizada para
estudiar relaciones evolutivas

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Biomoléculas

  • 1. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings BIOMOLECULAS
  • 2. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • El agua es el solvente biológico en la Tierra • Todos los organismos vivos requieren agua más que ninguna otra substancia • La mayoría de las células están rodeadas por agua, y ellas mismas tienen una composición de agua del 70-95% de su peso fresco • La abundancia de agua es la principál razón de que la Tierra sea habitable El Agua: La Molécula que Sustenta Toda la Vida
  • 3. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings La polaridad de las moléculas de agua resulta en la formación de enlaces puentes de hidrógeno • El agua es una molécula polar: extremos opuestos poseen densidad de carga eléctrica opuesta • La polaridad de las moléculas de agua les permite formar uniónes puentes de hidrógeno entre ellas y con otras moléculas polares
  • 4. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings
  • 5. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • Propiedades del agua que facilitan un ambiente apto para la vida: Cohesión Capacidad de moderar la temperatura Expansión al congelarse Versatilidad como solvente
  • 6. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Cohesión • Colectivamente, las uniónes P de H mantienen a las moléculas de agua juntas, fenómeno denominado cohesión • La cohesión ayuda al transporte de agua contra la gravedad en las plantas • La adhesión de las moléculas de agua (por P de H) a las paredes celulares del tejido de conducción de agua (xilema) de las plantas, también ayuda a contrarrestar la gravedad
  • 7. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings
  • 8. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • La tensión superficiál es una medida de cuán dificil es romper la superficie de un líquido • La tensión superficiál está relacionada con la cohesión
  • 9. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Moderación de la Temperatura • El agua absorve calor del aire caliente y entrega calor almacenado al aire más frío • El agua puede absorver o liberar grandes cantidades de calor variando levemente su propia temperatura
  • 10. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Calor y Temperatura • La energía cinética es la energía de movimiento • El Calor es una medida de la cantidad total de energía cinética debida al movimiento molecular • La Temperatura es una medida de la intensidad del Calor debida a la energía cinética promedio de las moléculas
  • 11. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings El Agua posee elevado Calor Específico • El calor específico de una substancia es la cantidad de calor que debe ser absorbida o perdida por 1 g de esa substancia para cambiar su temperatura en 1ºC • El elevado calor específico del agua minimiza las fluctuaciones de temperatura manteniendo estas dentro de límites compatibles con la vida – El agua absorve calor cuando se rompen uniones P de H – El agua libera calor cuando se forman P de H
  • 12. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Enfriamiento por Evaporación • La vaporización es una transición de fases, desde la fase líquida a la fase gaseosa • El calor de vaporización es la cantidad de calor que una substancia debe absorver de para que 1 g de la misma pase de la fase líquida a la fase gaseosa • Vaporización: • Ebullición (todo el liq., = > temp. ebull.) • Evaporación (sup. del líq., temp. < ebull.). ~Transpiración
  • 13. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Enfriamiento por evaporación • A medida que un líquido se evapora, la superficie restante del mismo se enfria, fenómeno denominado enfriamiento por evaporación • El enfriamiento por evaporación del agua ayuda a estabilizar la temperatura en los organismos y en los cuerpos de agua
  • 14. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Aislación de los Cuerpos de Agua por el Hielo Flotante • El hielo flota en agua líquida debido a que es menos denso. Esto se debe a que las uniónes P de H en el agua sólida son más ordenadas • Si el hielo se hundiera los cuerpos de agua se congelarían completamente en determinados ambientes, haciendo la vida imposible
  • 15. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings
  • 16. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings El Solvente de la Vida • El agua es un solvente versatil debido a su polaridad • Esto se debe a su capacidad de formar uniónes P de H con otras substancias polares • Cuando un compuesto iónico se disuelve en agua cada ión se rodea de una esfera de moléculas de agua, denominada capa de hidratación
  • 17. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Na+ Cl– Cl– + + + + – – – – – – – – – – –
  • 18. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • El agua también puede disolver compuestos polares no iónicos • Aún macromoléculas, como por ej. proteínas, pueden disolverse en agua, si poseen regiones iónicas y polares
  • 19. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Lysozyme molecule in a nonaqueous environment.
  • 20. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Lysozyme molecule in a aqueous environment.
  • 21. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Compuestos Hidrofílicos e Hidrofóbicos • Un compuesto hidrofílico es aquél que tiene afinidad por el agua. Compuestos iónicos y polares • Un compuesto hidrofóbico es aquél que no tiene afinidad por el agua. Compuestos no polares
  • 22. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Concentración de Solutos en Soluciones Acuosas • La mayor parte de las reacciones bioquímicas ocurren en medio acuoso • Las reacciones químicas dependen de las colisiones entre las moléculas y por lo tanto de la concentración de solutos en una solución acuosa
  • 23. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings La disociación del agua produce condiciones de acidéz o alcalinidad que afectan a los organismos vivos • Un átomo de H en un enlace P de H entre dos moléculas de H2O puede cambiar su posición de una molécula a la otra: – El H deja su e- y es transferido como protón o ión (catión) hidrógeno (H+) – La molécula con el H+ extra es ahora un ión (catión) hidronio (H3O+) – La molécula que perdió el H+ es ahora un ión (anión) hidroxilo u oxhidrilo(OH-)
  • 24. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings
  • 25. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • El proceso puede ser descripto en una forma más simple, como la disociación de una molécula de H2O en H+ y OH- : H2O = H+ + OH− 2H2O = H3O+ + OH− • Aunque estadísticamente rara, la disociación de moléculas de H2O tiene un efecto significativo sobre los organismos • Cambios en las concentraciones de H+ y OH- pueden afectar la química de las células
  • 26. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Cambios en las concentraciones de H+ y OH- • Las concentraciones de H+ y OH- son iguales en H2O pura: H2O = H+ + OH− • El agregado de ciertos solutos, denominados ácidos y bases, modifica las concentraciones de H+ y OH-
  • 27. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Acidos y Bases • Un ácido es una substancia que incrementa la [H+] (en realidad [H3O+]) de una solución acuosa (sensu Arrhenius) • Una base es una substancia que reduce la concentración de H+ de una solución acuosa
  • 28. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings La Escala de pH • El pH de una solución está determinado por la [H+] (en realidad [H3O+]) • pH= –log [H+] • Soluciones ácidas tienen valores de pH<7 • Soluciones básicas tienen valores de pH>7 • La mayoría de los fluidos biológicos tienen valores de pH en el rango 6-8
  • 29. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings pH Scale 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 Oven cleaner Household bleach Household ammonia Milk of magnesia Seawater Pure water Human blood Urine Black coffee Tomato juice Vinegar, beer, wine, cola Digestive (stomach) juice, lemon juice Battery acid Neutral [H+] = [OH–] Increasingly Acidic [H + ] > [OH – ] Increasingly Basic [H + ] < [OH – ]
  • 30. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Buffers • El pH interno de la mayoría de las células vivas debe permanecer cercano a 7 • Los buffers son soluciones acuosas que consisten en un par ácido-base y tienen la propiedad de minimizar los cambios de pH frente a la adición de cantidades relativamente pequeñas de ácidos o bases fuertes
  • 31. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings
  • 32. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • Los 6 grupos funcionales más importantes en la química de la vida: – Hidroxilo – Carbonilo – Carboxilo – Amino – Sulfidrilo – Fosfato
  • 33. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings STRUCTURE (may be written HO—) NAME OF COMPOUNDS Alcohols (their specific names usually end in -ol) Ethanol, the alcohol present in alcoholic beverages FUNCTIONAL PROPERTIES Is polar as a result of the electronegative oxygen atom drawing electrons toward itself. Attracts water molecules, helping dissolve organic compounds such as sugars EXAMPLE
  • 34. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings STRUCTURE NAME OF COMPOUNDS Ketones if the carbonyl group is within a carbon skeleton EXAMPLE Acetone, the simplest ketone A ketone and an aldehyde may be structural isomers with different properties, as is the case for acetone and propanal. Aldehydes if the carbonyl group is at the end of the carbon skeleton Acetone, the simplest ketone Propanal, an aldehyde FUNCTIONAL PROPERTIES
  • 35. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings STRUCTURE NAME OF COMPOUNDS Carboxylic acids, or organic acids EXAMPLE Has acidic properties because it is a source of hydrogen ions. Acetic acid, which gives vinegar its sour taste FUNCTIONAL PROPERTIES The covalent bond between oxygen and hydrogen is so polar that hydrogen ions (H+) tend to dissociate reversibly; for example, Acetic acid Acetate ion In cells, found in the ionic form, which is called a carboxylate group.
  • 36. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings STRUCTURE NAME OF COMPOUNDS Amine EXAMPLE Because it also has a carboxyl group, glycine is both an amine and a carboxylic acid; compounds with both groups are called amino acids. FUNCTIONAL PROPERTIES Acts as a base; can pick up a proton from the surrounding solution: (nonionized) Ionized, with a charge of 1+, under cellular conditions Glycine (ionized)
  • 37. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings STRUCTURE (may be written HS—) NAME OF COMPOUNDS Thiols EXAMPLE Ethanethiol FUNCTIONAL PROPERTIES Two sulfhydryl groups can interact to help stabilize protein structure
  • 38. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings STRUCTURE NAME OF COMPOUNDS Organic phosphates EXAMPLE Glycerol phosphate FUNCTIONAL PROPERTIES Makes the molecule of which it is a part an anion (negatively charged ion). Can transfer energy between organic molecules.
  • 39. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Macromoléculas: estructura y función
  • 40. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • Dentro de las células moléculas orgánicas pequeñas se unen para formar macromoléculas • Las macromoleculas están formadas por miles de átomos unidos por enlaces covalentes
  • 41. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings La mayoría de las macromoléculas son polímeros construidos a partir de monómeros • Un polímero es una molécula larga constituida por muchas unidades similares denominadas monómeros • Tres de las cuatro clases de moléculas orgánicas de la vida son polímeros: – Carbohidratos – Proteinas – Acidos Nucleicos
  • 42. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Síntesis y ruptura de polímeros • Los monómeros forman moléculas más grandes por medio de reacciones de condensación, denominadas reacciones de deshidratación • Los polímeros son desensamblados a monómeros por medio de hidrólisis, una reacción que es escencialmente la inversa de una reacción de deshidratación
  • 43. LE 5-2 Short polymer Unlinked monomer Dehydration removes a water molecule, forming a new bond Dehydration reaction in the synthesis of a polymer Longer polymer Hydrolysis adds a water molecule, breaking a bond Hydrolysis of a polymer
  • 44. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Diversidad de polímeros • Cada célula posee miles de macromoléculas diferentes • La composición de macromoléculas varía entre células de un mismo organismo, varía más entre organismos de la misma especie, y varía aún más entre especies distintas • Una variedad inmensa de polímeros puede formarse a partir de un pequeño grupo de monómeros 1 2 3 HO H
  • 45. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Los carbohidratos sirven como combustible y como materiál de construcción • Los carbohidratos incluyen a los monosacáridos y a sus polímeros • Los carbohidratos más sencillos son los monosacáridos o azúcares simples • Los carbohidratos macromoleculares son los polisacáridos, polímeros formados por muchos monosacáridos
  • 46. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Monosacáridos • Los monosacáridos poseen formulas moleculares que son normalmente múltiplos de CH2O • La glucosa es el monosacárido más común • Los monosacáridos son clasificados según la ubicación del grupo carbonilo (aldehido o cetona) y el número de C en el esqueleto carbonado
  • 47. LE 5-3 Triose sugars (C3H6O3) Glyceraldehyde Pentose sugars (C5H10O5) Ribose Hexose sugars (C5H12O6) Glucose Galactose Dihydroxyacetone Ribulose Fructose
  • 48. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • Los monosacáridos son el combustible principal de las células y son materia prima para la síntesis de otras moléculas • Aunque habitualmente son representados en forma lineál, en realidad en solución acuosa forman anillos
  • 49. LE 5-4 Linear and ring forms Abbreviated ring structure
  • 50. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • Un disacárido se forma cuando una reacción de deshidratación une a dos monosacáridos • La unión covalente resultante se denomina unión glicosídica
  • 51. LE 5-5 Glucose Maltose Fructose Sucrose Glucose Glucose Dehydration reaction in the synthesis of maltose Dehydration reaction in the synthesis of sucrose 1–4 glycosidic linkage 1–2 glycosidic linkage
  • 52. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Polisacáridos • Los polisacáridos, polimeros de monosacaridos, poseen roles estructurales y de almacenamiento • La estructura y función de un polisacárido esta determinada por sus monómeros constituyentes y por la posición de sus enlaces glicosídicos
  • 53. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Polisacáridos de almacenamiento o reserva • El almidón, un polisacárido de almacenamiento de las plantas, esta formado exclusivamente por monómeros de glucosa • Las plantas almacenan el exceso de almidón como gránulos dentro de cloroplastos y otros plástidos
  • 54. LE 5-6a Chloroplast Starch 1 µm Amylose Starch: a plant polysaccharide Amylopectin
  • 55. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • El glucógeno es el polisacárido de reserva de los animales (y de los hongos) • Los seres humanos y otros vertebrados almacenan glucógeno, como gránulos, principalmente en las células hepáticas y musculares
  • 56. LE 5-6b Mitochondria Glycogen granules 0.5 µm Glycogen Glycogen: an animal polysaccharide
  • 57. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Polisacáridos estructurales • La celulosa es el componente principal de la pared celular de las plantas • En forma similar al almidón, la celulosa es un plímero de glucosa, pero con diferentes uniones glicosídicas • La diferencia esta basada en dos formas distintas del anillo de la glucosa: alfa () y beta ()
  • 58. LE 5-7 a Glucose a and b glucose ring structures b Glucose Starch: 1–4 linkage of a glucose monomers. Cellulose: 1–4 linkage of b glucose monomers.
  • 59. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • Polímeros con alfa glucosa son helicoidales • Polímeros con beta glucosa son rectos • En las estructuras rectas, los átomos de H en una cadena pueden unirse con grupos OH de otra cadena (puentes de H) • Moléculas de celulosa paralelas, mantenidas juntas de esta manera, se agrupan en microfibrillas
  • 60. LE 5-8 Cellulose molecules Cellulose microfibrils in a plant cell wall Cell walls Microfibril Plant cells 0.5 µm  Glucose monomer
  • 61. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • Las enzimas que digieren almidón, por hidrólisis de uniones alfa, no pueden hidrolizar las uniones beta de la celulosa (y vice versa) • La celulosa en la comida humana pasa a través del tracto digestivo como fibra insoluble • Algunos microorganismos (algunas bacterias y hongos) poseen enzimas que digieren celulosa • Muchos animales hebívoros, desde vacas a termitas, establecen relaciones simbióticas mutualistas con algunos de estos microbios
  • 62. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings
  • 63. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • La quitina, es otro polisacárido estructural, que forma el exoesqueleto de los artrópodos • La quitina también brinda soporte estructural a la pared celular de los hongos • La quitina puede utilizarse como hilo quirúrgico
  • 64. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings
  • 65. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Los lipidos son un grupo diverso de moléculas hidrofóbicas • Los lípidos son la clase de moléculas biológicas que no forman polimeros • La característica unificadora de los lípidos es que poseen poca o ninguna afinidad por el agua • Los lípidos son hidrofóbicos porque están constituidos fundamentalmente por cadenas hidrocarbonadas formadas por uniones covalentes no polares • Los lípidos biológicamente más importantes son los acilglicéridos, fosfolípidos y esteroides
  • 66. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Acilglicéridos • Los acilglicéridos están formados por dos tipos de moléculas más pequeñas: glicerol y ácidos grasos, unidos por uniones ester • El glicerol es un alcohol de 3 C, con un grupo OH unido a cada uno de ellos • Un ácido graso consiste en un grupo carboxilo (COOH) unido a una larga cadena hidrocarbonada (usualmente 16-18 C)
  • 67. LE 5-11a Dehydration reaction in the synthesis of a fat Glycerol Fatty acid (palmitic acid)
  • 68. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • Los acilglicéridos se separan del agua debido a que las moléculas de agua forman puentes de hidrógeno entre si, excluyendo a los acilglicéridos • En un acilglicérido, tres acidos grasos se unen al glicerol por uniones ester, formando un triacilglicerol o triglicérido
  • 69. LE 5-11b Ester linkage Fat molecule (triacylglycerol)
  • 70. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • Los ácidos grasos varian en longitud (número de C) y en el número y localización de dobles enlaces • Los ácidos grasos saturados poseen el máximo número de átomos de H posible (no poseen dobles enlaces) • Los ácidos grasos insaturados poseen uno o más dobles enlaces • La función principal de los acilglicéridos es el almacenamiento de energía
  • 71. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • Los acilglicéridos formados por acidos grasos saturados se denominan acilglicéridos saturados o “grasas saturadas” • La mayoría de los acilglicéridos de origen animal son saturados • Los acilglicéridos saturados son sólidos a temperatura ambiente (grasas)
  • 72. LE 5-12a Saturated fat and fatty acid. Stearic acid
  • 73. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • Los acilglicéridos formados por ácidos grasos insaturados se denominan acilglicéridos insaturados o “grasas insaturadas” • Los acilglicéridos de plantas y de pescado usualmente son insaturados • Los acilglicéridos de plantas y de pescado son líquidos a temperatura ambiente (aceites)
  • 74. LE 5-12b Unsaturated fat and fatty acid. Oleic acid cis double bond causes bending
  • 75. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings .
  • 76. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Grasas trans: Se obtienen a partir de la hidrogenación de los aceites vegetales, por lo cual pasan de ser insaturadas a saturadas, y a poseer la forma espacial de trans, por eso se llaman ácidos grasos trans. Son mucho más perjudiciales que las grasas saturadas presentes en la naturaleza (con forma cis), ya que son altamente aterogénicas y pueden contribuir a elevar los niveles de lipoproteínas LDL y los triglicéridos, haciendo descender peligrosamente los niveles de lipoproteínas HDL. Ejemplos de alimentos que contienen estos ácidos grasos son: la manteca vegetal, margarina y cualquier alimento elaborado con estos ingredientes
  • 77. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Serie omega 3. El primer doble enlace está situado en posición 3 Serie omega 6. El primer doble enlace está situado en posición 6 Grasas poliinsaturadas (formadas por ácidos grasos de las series omega-3, omega-6).
  • 78. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Fosfolípidos • En un fosfolípido, dos ácidos grasos y un grupo fosfato están unidos al glicerol por uniones ester • Las dos cadenas de ácidos grasos (“colas”) son hidrofóbicas, pero el grupo fosfato y sus uniones forman una “cabeza” hidrofílica
  • 79. LE 5-13 Structural formula Space-filling model Phospholipid symbol Hydrophilic head Hydrophobic tails Fatty acids Choline Phosphate Glycerol
  • 80. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • Cuando los fosfolípidos son agregados al agua, estos se autoensamblan en una bicapa, con las “colas” hidrofóbicas orientadas hacia el interior de la misma • Esta estructura de bicapa fosfolipídica es característica de las membranas biológicas (ej. membrana plasmática, sistema de endomembranas, membranas de organelas) • Los fosfolípidos son el componente principal de todas las membranas celulares
  • 82. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Esteroides • Los esteroides son lipidos characterizados por un equeleto carbonado formado por cuatro anillos fusionados • El colesterol, un esteroide importante, es un componente de las membranas celulares animales
  • 83. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings
  • 84. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Las proteínas poseen estructuras diversas, lo que resulta en un amplio rango de funciones • Las proteínas representan más del 50% del peso seco de la mayoría de las células • Las funciones de las proteínas incluyen: soporte estructural, almacenamiento, transporte, comunicación celular, movimiento, defensa
  • 85. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings
  • 86. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • Las enzimas son un tipo de proteínas que actuan como catalizadores, aumentando la velocidad de las reacciones bioquímicas • Las enzimas pueden llevar a cabo sus funciones repetidamente
  • 88. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Polipéptidos • Los polipéptidos son polímeros de aminoácidos • Una proteína puede estar formada por uno o más polipéptidos
  • 89. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Aminoácidos • Los aminoácidos son moléculas orgánicas que se caracterizan por poseer un grupo carboxilo y un grupo amino • Los aminoácidos difieren en sus propiedades debido a sus cadenas laterales distintivas, denominadas grupos R • Las células utilizan 20 aminoácidos para fabricar miles de proteínas distintas
  • 91. LE 5-17a Isoleucine (Ile) Methionine (Met) Phenylalanine (Phe) Tryptophan (Trp) Proline (Pro) Leucine (Leu) Valine (Val) Alanine (Ala) Nonpolar Glycine (Gly)
  • 92. LE 5-17b Asparagine (Asn) Glutamine (Gln) Threonine (Thr) Polar Serine (Ser) Cysteine (Cys) Tyrosine (Tyr)
  • 93. LE 5-17c Electrically charged Aspartic acid (Asp) Acidic Basic Glutamic acid (Glu) Lysine (Lys) Arginine (Arg) Histidine (His)
  • 94. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Polímeros de aminoácidos
  • 95. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • Aminoácidos unidos por uniones peptídicas (uniones amida): Péptidos (2-50 aa), Polipéptidos (>50~1000 aa) • Cada polipéptido posee una única secuencia lineal de aminoácidos (idem péptidos)
  • 96. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Conformación y función de las proteínas • Una proteína funcional consiste en uno o más polipéptidos doblados, plegados y enrrollados en una forma característica • La secuencia de aminoácidos determina la estructura 3-D (conformación) de una proteína • La conformación (estructura 3-D) de una proteína determina su función
  • 97. LE 5-19 A ribbon model Groove Groove A space-filling model
  • 98. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Los cuatro niveles de organización estructural de las proteínas • La estructura primaria de una proteína corresponde a su secuencia única de aminoácidos • Algunas regiones de la cadena polipeptídica presentan enrrollamientos y plegamientos característicos que determinan su estructura secundaria • La estructura terciaria está determinada por interacciones entre varios grupos R de aminoácidos • La estructura cuaternaria existe en proteínas formadas por más de un polipéptido
  • 99. LE 5-20 Amino acid subunits  pleated sheet +H3N Amino end  helix
  • 100. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • La estructura primaria, la secuencia de aminoácidos en una proteína, es semejante al orden de letras en una palabra larga • La estructura primaria esta determinada por información genética heredada
  • 102. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • Los enrrollamientos y pliegues de la estructura secundaria resultan de enlaces puente de hidrógeno entre constituyentes repetitivos del esqueleto polipeptídico • Estucturas secundarias típicas son un enrrollamiento llamado alfa hélice y una estructura plegada denominada hoja plegada beta
  • 103. LE 5-20b Amino acid subunits  pleated sheet  helix
  • 104. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Two types of β sheet structures. (A) An antiparallel β sheet . (B) A parallel β sheet. Both of these structures are common in proteins.
  • 105. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • La estructura terciaria está determinada por interacciónes entre grupos R • Estas interacciones entre grupos R incluyen uniónes puente de hidrógeno, uniones iónicas, interacciones hidrofóbicas, e interacciones de van der Waals • Uniones covalentes denominadas puentes disulfuro pueden reforzar la estructura terciaria
  • 106. LE 5-20d Hydrophobic interactions and van der Waals interactions Polypeptide backbone Disulfide bridge Ionic bond Hydrogen bond
  • 107. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • La estructura cuaternaria resulta cuando dos o más cadenas polipeptídicas (subunidades) forman una proteína. • Dichas subunidades se asocian entre sí mediante uniones puente de hidrógeno, uniónes iónicas, interacciones hidrofóbicas, interacciones de van der Waals. Pueden existir uniones covalentes de tipo puente disulfuro entre residuos de cisteína situados en cadenas polipeptídicas distintas
  • 108. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings El colágeno es una proteína fibrosa formada por tres cadenas polipéptídicas enrrolladas como una cuerda La hemoglobina es una proteína globular formada por cuatro cadenas polipeptídicas: dos alfa y dos beta
  • 109. LE 5-20e  Chains  Chains Hemoglobin Iron Heme Collagen Polypeptide chain Polypeptide chain
  • 110. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Anemia falciforme: un simple cambio en la estructura primaria • Un simple cambio en la estructura primaria puede afectar la conformación de una proteína y por lo tanto su capacidad funcional • La anemia falciforme, una enfermedad hereditaria de la sangre, resulta de una única sustitución de un aminoácido en la subunidad beta de la hemoglobina
  • 111. LE 5-21a Red blood cell shape Normal cells are full of individual hemoglobin molecules, each carrying oxygen. 10 µm 10 µm Red blood cell shape Fibers of abnormal hemoglobin deform cell into sickle shape.
  • 112. LE 5-21b Primary structure Secondary and tertiary structures 1 2 3 Normal hemoglobin Val His Leu 4 Thr 5 Pro 6 Glu Glu 7 Primary structure Secondary and tertiary structures 1 2 3 Sickle-cell hemoglobin Val His Leu 4 Thr 5 Pro 6 Val Glu 7 Quaternary structure Normal hemoglobin (top view)         Function Molecules do not associate with one another; each carries oxygen. Quaternary structure Sickle-cell hemoglobin Function Molecules interact with one another to crystallize into a fiber; capacity to carry oxygen is greatly reduced. Exposed hydrophobic region  subunit  subunit
  • 113. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Qué determina la conformación de una proteína? • Además de la estructura primaria, condiciones físicas y químicas pueden afectar la conformación • Alteraciones en el pH, concentración de sales, temperatura, y otros factores ambientales, pueden modificar la conformación nativa de una proteína • Esta pérdida de la conformación nativa se denomina desnaturalización • Una proteína desnaturalizada es biológicamente inactiva
  • 115. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings THE REFOLDING OF A DENATURED PROTEIN (A) This experiment demonstrates that the conformation of a protein is determined solely by its amino acid sequence. (B) The structure of urea. Urea is very soluble in water and unfolds proteins at high concentrations
  • 116. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings
  • 117. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings El problema del plegamiento de las proteínas • Es dificil de predecir la conformación de una proteína en base a su estructura primaria • La mayoría de las proteínas probablemente transitan varios estados en su camino a una conformación estable • Las chaperonas son proteínas que ayudan al correcto plegamiento de otras proteínas
  • 119. LE 5-23b Polypeptide Correctly folded protein An unfolded poly- peptide enters the cylinder from one end. Steps of Chaperonin Action: The cap comes off, and the properly folded protein is released. The cap attaches, causing the cylinder to change shape in such a way that it creates a hydrophilic environment for the folding of the polypeptide.
  • 120. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings • Los científicos utilizan cristalografía de rayos X para determinar la conformación de una proteína • Otro método es la espectroscopía por resonancia magnética nuclear (NMR), la cuál no requiere de la cristalización de la proteína
  • 121. LE 5-24a Photographic film Diffracted X-rays X-ray source X-ray beam X-ray diffraction pattern Crystal
  • 122. LE 5-24b Nucleic acid 3D computer model X-ray diffraction pattern Protein
  • 123. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings
  • 124. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Los ácidos nucleicos almacenan y transmiten la información hereditaria • La secuencia de aminoácidos de un polipéptido está programada en una unidad hereditaria denominada gen • Los genes están formados por DNA, un ácido nucleico
  • 125. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Los roles de los Acidos Nucleicos • Existen dos tipos de ácidos nucleicos : – Acido desoxirribonucleico (DNA) – Acido ribonucleico (RNA) • El DNA provee instrucciones para su propia replicación • El DNA dirige la síntesis de RNA mensajero (mRNA) y, a través del mRNA, controla la síntesis de proteinas • La síntesis de proteinas ocurre en los ribosomas
  • 126. LE 5-25 NUCLEUS DNA CYTOPLASM mRNA mRNA Ribosome Amino acids Synthesis of mRNA in the nucleus Movement of mRNA into cytoplasm via nuclear pore Synthesis of protein Polypeptide
  • 127. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings La estructura de los Acidos Nucleicos • Los ácidos nucleicos son polímeros denominados polinucleótidos • Cada polinucleótido está formado por monómeros llamados nucleótidos • Cada nucleótido en un polinucleótido consiste en una base nitrogenada, un azúcar pentosa , y un grupo fosfato • La porción de un nucleótido sin el grupo fosfato se denomina nucleosido
  • 128. LE 5-26a 5 end 3 end Nucleoside Nitrogenous base Phosphate group Nucleotide Polynucleotide, or nucleic acid Pentose sugar
  • 129. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Nucleótidos • Los nucleótidos estan formados por nucleosidos y grupos fosfato • Nucleosido = base nitrogenada + azúcar pentosa • Existen dos familias de bases nitrogenadas : – Las Pirimidinas poseen un anillo de 6 átomos – Las Purinas poseen un anillo de 6 átomos unido a un anillo de 5 átomos • En el DNA, el azúcar pentosa es la desoxirribosa • En el RNA, la pentosa es la ribosa
  • 130. LE 5-26b Nitrogenous bases Pyrimidines Purines Pentose sugars Cytosine C Thymine (in DNA) T Uracil (in RNA) U Adenine A Guanine G Deoxyribose (in DNA) Nucleoside components Ribose (in RNA)
  • 131. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings A G
  • 132. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings T U C
  • 133. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings
  • 134. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings Polímeros de Nucleótidos • Los nucleótidos están unidos formando un polinucleótido • Nucleótidos adyacentes están unidos por uniones covalentes que se forman entre el grupo –OH en el C3´ de un nucleótido y el fosfato en el C5´ del nucleótido siguiente • Estas uniones crean el esqueleto de pentosa- fostato con bases nitrogenadas como apéndices • La secuencia de bases a lo largo del DNA o mRNA es única para cada gen
  • 135. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings
  • 136. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings
  • 137. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings La doble hélice del DNA • Una molécula de DNA está formada por dos polinucleótidos enrrollados alrededor de un eje imaginario, formando una doble hélice • En la doble hélice de DNA, los dos esqueletos corren en direcciones 5´ a 3´ opuestas uno respecto del otro, en un ordenamiento denominado antiparalelo • Una molécula de DNA incluye a muchos genes • Las bases nitrogenadas en el DNA forman puentes de H en una forma complementaria: A siempre con T, y G siempre con C
  • 138. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings
  • 139. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings
  • 140. LE 5-27 Sugar-phosphate backbone 3 end 5 end Base pair (joined by hydrogen bonding) Old strands Nucleotide about to be added to a new strand 5 end New strands 3 end 5 end 3 end 5 end
  • 141. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings RNA
  • 142. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings mRNA tRNA
  • 143. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings rRNA snRNA
  • 144. Copyright © 2005 Pearson Education, Inc. publishing as Benjamin Cummings El DNA y las Proteínas como registro de la Evolución • La secuencia lineal de nucleótidos en las moléculas de DNA son pasadas de los padres a la descendencia • Dos especies cercanamente emparentadas son más similares en su secuencia de DNA que especies más distantemente relacionadas • La biología molecular puede ser utilizada para estudiar relaciones evolutivas