Un microhábitat se define como el volumen de suelo donde las condiciones físico-químicas determinan el comportamiento de las células, poblaciones o comunidades de microorganismos. Cuando las plantas se introducen, la situación de los microorganismos cambia drásticamente, ya que las plantas suministran los principales sustratos energéticos al suelo. Las plantas se comunican con el suelo y los microorganismos a través de los exudados radiculares, cuya composición depende de factores como la especie de plant

1. EL MICROHÁBITAT
La suma total de las interacciones, las condiciones y los
microorganismos de un lugar concreto conforman un
microhábitat. Se puede definir funcionalmente un
microhábitat, como el volumen de suelo en el que las
condiciones físico-químicas definen el comportamiento de
las células, poblaciones o comunidades de
microorganismos que en respuesta modifican ese
ambiente o medio.
Cuando en el sistema se introducen las plantas la
situación de los microorganismos cambia drásticamente.
Las plantas son los principales suministradores de
sustratos energéticos al suelo.

2. EL LENGUAJE DE LAS PLANTAS
Las plantas para comunicarse con el suelo y los
microorganismos para su desarrollo lo hacen a través de los
exudados; son estos compuestos liberados que hemos
detallado; y lógicamente dependen :
· La especie de la planta.
· Las condiciones de crecimiento o estado fisiológico
· El medio de cultivo
· La edad de la planta
· Las condiciones ambientales como: temperatura, radiación
solar, contenido de nutrientes en el suelo, etc.
· Y dependen fuertemente de nuestros manejos foliares ; así
una aplicación foliar de potasio , incrementara el contenido de
azucares de los exudados ; o una aplicación de
bioestimulantes con animoácidos o nitrógeno, hará crecer el
contenido de animoácidos en los exudados.-
La variedad de exudados presentes en la rizosfera afecta a la
composición y actividad microbiana.

3. FACTORES QUE AFECTAN A LA ECOLOGÍA
MICROBIANA DE LA RIZOSFERA
Algunos plaguicidas y abonos químicos han mostrado ser
directamente tóxicos para la micro biota, al igual que lo es la quema
de rastrojos.
Por tanto la fertilización y abonado no deben considerarse únicamente
en términos de las necesidades de los cultivos, sino también en
términos de las necesidades de los microorganismos edáficos y de su
ecosistema. Uno de los grandes causantes de la disminución de la
población de microorganismos, es la exagerada fertilización
nitrogenada y las fertilizaciones de base en algunos cultivos; tb lo es,
el uso de fertilizantes duros (nitratos, sulfatos, fosfatos ) por
contraposición de nutrientes mas elaborados y digeribles por las
plantas; como el caso del uso de aportes de nitrógenos en forma
amidica, en contraposición a nitratos o sales de amonio (Urea) ; la
ausencia del uso de fertilizantes del tipo mono grano; el uso de
transportadores o polioles, es otra fórmula benéfica al manejo
sustentable de suelos con riqueza biótica.