Factores que Afectan la Actividad Enzimática
Concentración/Actividad de Enzima

Temperatura (Energía calorífica/cinética)
  Afecta enlaces débiles (puentes de hidrógeno, interacciones
  hidrofóbicas).
  Temperatura óptima; desnaturalización/renaturalización.
  Enzimas termorresistentes.

pH (Concentración de iones hidrógeno, protones, H+)
  Afecta ionización de grupos; patrón de cargas positivas y negativas.
  pH óptimo.

Concentración de Sustrato

Inhibidores Enzimáticos

Factores Regulatorios
Efecto de la Concentración/Actividad de Enzima
Las enzimas utilizan cuatro factores o mecanismos
principales para acelerar la velocidad de reacción:

1. Proximidad y orientación
    El sustrato se acerca al sitio activo a una distancia
    suficiente y orientación adecuada para la reacción.

2. Tensión y distorsión
   Modelo llave-cerradura vs modelo de ajuste inducido.
   El sustrato induce un cambio conformacional en la
   enzima, la cual a su vez tensiona al sustrato para transformarlo.

3. Catálisis ácido-base
   Grupos R y prostéticos ionizados realizan la catálisis. Depende del
   pH.

4. Catálisis covalente
   Complejo enzima-sustrato covalente (transitorio).
Efecto de la Concentración/Actividad de Enzima
Efecto de la Concentración/Actividad de Enzima
                 Modelo llave-cerradura
                       -Emil Fischer
                       -Inicios siglo XX.
                       -Rígido, eventualmente abandonado

                 Modelo del ajuste inducido
                       -Modelo actual
                       -Daniel Koshland
                       -Analogía mano-guante
                       -Dinámico
                       -Sustrato induce cambios
                         conformacionales en enzima y
                         viceversa.
Modelo del Ajuste Inducido
       (Hexocinasa de Levadura y Glucosa)




Conformación Abierta         Conformación Cerrada
Efecto de la Concentración/Actividad de Enzima
Efecto del pH
Efecto de la Concentración de Sustrato




                                        [S]
                           V = Vmax
                                      [S] + Km




V


                     [S]
Cinética Enzimática
               k1           kcat
      E+S             ES            E+P
               k2

                      Ecuación de Michaelis-Menten
             [S]      V= Velocidad de reacción
V = Vmax
           [S] + Km   Vmax = Velocidad máxima

                      [S] = Conc. de sustrato

                      Km = Constante de Michaelis
                           Medida de la afinidad de la
                            enzima por el sustrato.
Efecto de la Concentración de Sustrato
Efecto de la Concentración de Sustrato




                                   Km (mM)

                                   25
                                   0.4
                                   0.05
                                   1.5
                                   9
                                   108
                                   2.5
                                   4.0
                                   5.0
Efecto de la Concentración de Sustrato




  Representación de       Representación doble recíproca
  Michaelis-Menten        de Lineweaver-Burk

  Difícil calcular Vmax   Permite calcular Vmax

                          1       Km      1   1
              [S]             =             +
V = Vmax                  V       Vmax   [S] Vmax
           [S] + Km
                          y =      m     x +      b
Efecto de Inhibidores

Inhibidor enzimático
        -Compuesto químico que inhibe la actividad de una enzima.
        -Algunos son agentes farmacológicos, uso terapéutico.
        -Algunos son herramientas de investigación para dilucidar
         los mecanismos de acción de las enzimas.
        -Algunos son tóxicos, venenos (naturales y artificiales).
        -Reguladores del metabolismo (naturales).
Efecto de Inhibidores – Inhibición Competitiva
Efecto de Inhibidores Competitivos
   Sobre la Cinética Enzimática
Efecto de Inhibidores – Inhibición Competitiva


El inhihidor se parece al sustrato (análogo del sustrato)

El inhibidor se une al sitio activo de la enzima

Afecta la unión del sustrato (compite con él)

Afecta Km (afinidad)

No afecta Vmax
No afecta la capacidad de la enzima de transformar al S en P

Es Reversible: Si se elimina al inhibidor, la inhibición cesa
               Al aumentar la [S], la inhibición disminuye
Efecto de Inhibidores No Competitivos
     Sobre la Cinética Enzimática
Efecto de Inhibidores – Inhibición No Competitiva


El inhihidor no se parece al sustrato

El inhibidor no se une al sitio activo sino a otro sitio de la enzima
o incluso al complejo enzima-sustrato.

No afecta la unión del sustrato; no afecta Km (afinidad)

Sí afecta Vmax
Afecta la capacidad de la enzima de transformar al S en P

Es Reversible: Si se elimina al inhibidor, la inhibición cesa

Ejem.: Regulación alostérica de enzimas.
Efecto de Inhibidores – Inhibición Irreversible


                  El inhihidor no se parece al sustrato

                  El inhibidor modifica irreversiblemente
                  a la enzima, reacciona con ella

                  Envenena a la enzima

                  La inhibición permanece aún después
                  de eliminar al inhibidor
http://bcs.wiley.com/he-
bcs/Books?action=index&itemId=047119350X&itemTypeId=BKS&bcsId=1847




                       Seleccionen la Tabla de Contenido
http://higheredbcs.wiley.com/legacy/college/voet/047119350X/animated_figur
es/html/chap14_anim.html




                                          Échenle un
                                          ojo a estos puntos
Reacciones Enzimáticas de Dos Sustratos
Aprox. 60% de las reacciones bioquímicas conocidas involucran
dos sustratos y resultan en dos productos.


                                E
                 A+B                  P+Q
        E = Casi siempre transferasa u óxido-reductasa.

Ejemplos:
       Hidrólisis de un polipéptido por la tripsina: Transferencia
       del grupo carbonilo de uno de los péptidos desde el
       átomo de N del otro péptido hacia una molécula de
       agua.

       La alcohol deshidrogenasa transfiere un ión hidruro
       desde el etanol hacia el NAD+
Terminología de Reacciones Enzimáticas
1. Los sustratos se designan como A, B, C y D en el orden en
   que se añaden a la enzima.
2. Los productos se designan P, Q, R y S en el orden en que
   dejan la enzima.
3. Las formas estables de la enzima se designan como E, F y G,
   donde E es la enzima libre. Una forma estable de la enzima es
   aquélla que por sí misma no es capaz de convertirse en otra
   forma estable de la enzima.
4. Los números de reactantes y productos en una reacción dada
   se especifican, en ese orden, por los términos Uni (uno), Bis
   (dos), Ter (tres) y Cuad (cuatro).

  Ejem.:
  Una reacción que requiere un sustrato y da tres productos es
  una reacción Uni Ter.

  Una reacción que requiere dos sustratos y da dos productos
  es una reacción Bis Bis.

  Hay muchos ejemplos de reacciones muy complejas.
Tipos de Reacciones Bis Bis
1. Reacciones Secuenciales (o de un solo desplazamiento)

  Todos los sustratos deben combinarse con la enzima antes
  de que pueda ocurrir una reacción y se puedan liberar
  productos.

  El grupo transferido (X) es pasado de A (= PX) a B, dando P y
  Q (= BX).

       a) Con mecanismo ordenado:
              Orden obligatorio de adición de sustratos

       b) Con mecanismo al azar
              Sin preferencia por un orden de adición de
              sustratos

2. Reacciones Ping Pong ( o de doble desplazamiento)

  Uno o más productos son liberados antes de que todos los
  sustratos se hayan incorporado a la reacción.
Reacciones Bis Bis Ordenadas


    A        B              P         Q



E       EA       EAB   EPQ      EQ        E


Reacciones típicas de deshidrogenasas
(óxido-reductasas) dependientes de NAD+ y NADP+
Reacciones Bis Bis al Azar

      A        B                    P        Q


          EA                            EP

E                  EAB - EPQ                       E
          EB                            EQ


      B        A                    Q        P
    Reacciones de algunas deshidrogenasas
    (óxido-reductasas) y cinasas (transferasas).
Reacciones Ping Pong


    A            P             B           Q



E       EA-FP           F          FB-EQ          E


    Reacciones de quimotripsina, transaminasas,
    y algunas flavoenzimas.
http://web.squ.edu.om/med-
lib/med_cd/e_cds/Biochemical%20Interactions/Lessons/OpenLessons.htm




                                    Seleccionen la Tabla de Contenido
http://web.squ.edu.om/med-
lib/med_cd/e_cds/Biochemical%20Interactions/Lessons/TOCscreen/TOC.htm




                                                            Échenle un
                                                            ojo a estos
                                                            dos puntos

Enzimas 2

  • 1.
    Factores que Afectanla Actividad Enzimática Concentración/Actividad de Enzima Temperatura (Energía calorífica/cinética) Afecta enlaces débiles (puentes de hidrógeno, interacciones hidrofóbicas). Temperatura óptima; desnaturalización/renaturalización. Enzimas termorresistentes. pH (Concentración de iones hidrógeno, protones, H+) Afecta ionización de grupos; patrón de cargas positivas y negativas. pH óptimo. Concentración de Sustrato Inhibidores Enzimáticos Factores Regulatorios
  • 2.
    Efecto de laConcentración/Actividad de Enzima Las enzimas utilizan cuatro factores o mecanismos principales para acelerar la velocidad de reacción: 1. Proximidad y orientación El sustrato se acerca al sitio activo a una distancia suficiente y orientación adecuada para la reacción. 2. Tensión y distorsión Modelo llave-cerradura vs modelo de ajuste inducido. El sustrato induce un cambio conformacional en la enzima, la cual a su vez tensiona al sustrato para transformarlo. 3. Catálisis ácido-base Grupos R y prostéticos ionizados realizan la catálisis. Depende del pH. 4. Catálisis covalente Complejo enzima-sustrato covalente (transitorio).
  • 3.
    Efecto de laConcentración/Actividad de Enzima
  • 4.
    Efecto de laConcentración/Actividad de Enzima Modelo llave-cerradura -Emil Fischer -Inicios siglo XX. -Rígido, eventualmente abandonado Modelo del ajuste inducido -Modelo actual -Daniel Koshland -Analogía mano-guante -Dinámico -Sustrato induce cambios conformacionales en enzima y viceversa.
  • 5.
    Modelo del AjusteInducido (Hexocinasa de Levadura y Glucosa) Conformación Abierta Conformación Cerrada
  • 6.
    Efecto de laConcentración/Actividad de Enzima
  • 7.
  • 8.
    Efecto de laConcentración de Sustrato [S] V = Vmax [S] + Km V [S]
  • 9.
    Cinética Enzimática k1 kcat E+S ES E+P k2 Ecuación de Michaelis-Menten [S] V= Velocidad de reacción V = Vmax [S] + Km Vmax = Velocidad máxima [S] = Conc. de sustrato Km = Constante de Michaelis Medida de la afinidad de la enzima por el sustrato.
  • 10.
    Efecto de laConcentración de Sustrato
  • 11.
    Efecto de laConcentración de Sustrato Km (mM) 25 0.4 0.05 1.5 9 108 2.5 4.0 5.0
  • 12.
    Efecto de laConcentración de Sustrato Representación de Representación doble recíproca Michaelis-Menten de Lineweaver-Burk Difícil calcular Vmax Permite calcular Vmax 1 Km 1 1 [S] = + V = Vmax V Vmax [S] Vmax [S] + Km y = m x + b
  • 13.
    Efecto de Inhibidores Inhibidorenzimático -Compuesto químico que inhibe la actividad de una enzima. -Algunos son agentes farmacológicos, uso terapéutico. -Algunos son herramientas de investigación para dilucidar los mecanismos de acción de las enzimas. -Algunos son tóxicos, venenos (naturales y artificiales). -Reguladores del metabolismo (naturales).
  • 14.
    Efecto de Inhibidores– Inhibición Competitiva
  • 15.
    Efecto de InhibidoresCompetitivos Sobre la Cinética Enzimática
  • 16.
    Efecto de Inhibidores– Inhibición Competitiva El inhihidor se parece al sustrato (análogo del sustrato) El inhibidor se une al sitio activo de la enzima Afecta la unión del sustrato (compite con él) Afecta Km (afinidad) No afecta Vmax No afecta la capacidad de la enzima de transformar al S en P Es Reversible: Si se elimina al inhibidor, la inhibición cesa Al aumentar la [S], la inhibición disminuye
  • 17.
    Efecto de InhibidoresNo Competitivos Sobre la Cinética Enzimática
  • 18.
    Efecto de Inhibidores– Inhibición No Competitiva El inhihidor no se parece al sustrato El inhibidor no se une al sitio activo sino a otro sitio de la enzima o incluso al complejo enzima-sustrato. No afecta la unión del sustrato; no afecta Km (afinidad) Sí afecta Vmax Afecta la capacidad de la enzima de transformar al S en P Es Reversible: Si se elimina al inhibidor, la inhibición cesa Ejem.: Regulación alostérica de enzimas.
  • 19.
    Efecto de Inhibidores– Inhibición Irreversible El inhihidor no se parece al sustrato El inhibidor modifica irreversiblemente a la enzima, reacciona con ella Envenena a la enzima La inhibición permanece aún después de eliminar al inhibidor
  • 20.
  • 21.
  • 22.
    Reacciones Enzimáticas deDos Sustratos Aprox. 60% de las reacciones bioquímicas conocidas involucran dos sustratos y resultan en dos productos. E A+B P+Q E = Casi siempre transferasa u óxido-reductasa. Ejemplos: Hidrólisis de un polipéptido por la tripsina: Transferencia del grupo carbonilo de uno de los péptidos desde el átomo de N del otro péptido hacia una molécula de agua. La alcohol deshidrogenasa transfiere un ión hidruro desde el etanol hacia el NAD+
  • 23.
    Terminología de ReaccionesEnzimáticas 1. Los sustratos se designan como A, B, C y D en el orden en que se añaden a la enzima. 2. Los productos se designan P, Q, R y S en el orden en que dejan la enzima. 3. Las formas estables de la enzima se designan como E, F y G, donde E es la enzima libre. Una forma estable de la enzima es aquélla que por sí misma no es capaz de convertirse en otra forma estable de la enzima. 4. Los números de reactantes y productos en una reacción dada se especifican, en ese orden, por los términos Uni (uno), Bis (dos), Ter (tres) y Cuad (cuatro). Ejem.: Una reacción que requiere un sustrato y da tres productos es una reacción Uni Ter. Una reacción que requiere dos sustratos y da dos productos es una reacción Bis Bis. Hay muchos ejemplos de reacciones muy complejas.
  • 24.
    Tipos de ReaccionesBis Bis 1. Reacciones Secuenciales (o de un solo desplazamiento) Todos los sustratos deben combinarse con la enzima antes de que pueda ocurrir una reacción y se puedan liberar productos. El grupo transferido (X) es pasado de A (= PX) a B, dando P y Q (= BX). a) Con mecanismo ordenado: Orden obligatorio de adición de sustratos b) Con mecanismo al azar Sin preferencia por un orden de adición de sustratos 2. Reacciones Ping Pong ( o de doble desplazamiento) Uno o más productos son liberados antes de que todos los sustratos se hayan incorporado a la reacción.
  • 25.
    Reacciones Bis BisOrdenadas A B P Q E EA EAB EPQ EQ E Reacciones típicas de deshidrogenasas (óxido-reductasas) dependientes de NAD+ y NADP+
  • 26.
    Reacciones Bis Bisal Azar A B P Q EA EP E EAB - EPQ E EB EQ B A Q P Reacciones de algunas deshidrogenasas (óxido-reductasas) y cinasas (transferasas).
  • 27.
    Reacciones Ping Pong A P B Q E EA-FP F FB-EQ E Reacciones de quimotripsina, transaminasas, y algunas flavoenzimas.
  • 28.
  • 29.