Este documento presenta información sobre los biocatalizadores, en particular las enzimas. Explica las propiedades y características de las enzimas, incluyendo su estructura, especificidad, mecanismos de acción y tipos de reacciones catalizadas. También describe los modelos de unión enzima-sustrato y los pasos de las reacciones enzimáticas, así como los factores que afectan la velocidad de las reacciones catalizadas por enzimas.
En esta presentación se explica los posibles destinos que tiene el exceso de aminoácidos en el organismo, especialmente su oxidación para la producción de ATP. El ciclo de la urea se explica en otra presentación. Más materiales en www.profesorjano.org
En esta presentación se explica los posibles destinos que tiene el exceso de aminoácidos en el organismo, especialmente su oxidación para la producción de ATP. El ciclo de la urea se explica en otra presentación. Más materiales en www.profesorjano.org
Una enzima es una proteína que cataliza las reacciones
bioquímicas del metabolismo. Las enzimas actúan sobre
las moléculas conocidas como sustratos y permiten el
desarrollo de los diversos procesos celulares
Una enzima es una proteína que cataliza las reacciones
bioquímicas del metabolismo. Las enzimas actúan sobre
las moléculas conocidas como sustratos y permiten el
desarrollo de los diversos procesos celulares
BIOQUIMICA ENZIMAS
Estudiante de Medicina
"Todas las reacciones en nuestro cuerpo estan mediadas por enzimas, que son catalizadores que aumentan la velocidad de las reacciones sin presentar cambios en el proceso"
3. BIOCATALIZADORES: ENZIMAS
1. Enzimas y reacciones enzimáticas
2. Mecanismo de las reacciones enzimáticas.
3. Cinética enzimática.
4. Factores que influyen en la velocidad de las reacciones
enzimáticas.
5. Mecanismos para aumentar la eficacia enzimática.
6. Regulación de la actividad enzimática.
a. Activación enzimática.
b.Inhibición enzimática.
7. Clasificación de las enzimas.
4. BIOCATALIZADORES:
ENZIMAS
Introducción
Concepto de VIDA:
Sistemas de baja entropía:
Necesidad de las enzimas
(metabolismo)
Mecanismos
autorreplicativos (ADN,
ARN)
Importancia BIOLÓGICA
Necesidad de la catálisis
Concepto de enzima
8. ENZIMAS. DEFINICIÓN
Los enzimas ejercen su acción biológica uniéndose selectivamente a determinadas
moléculas: SUSTRATOS
Inducen modificaciones químicas en los sustratos por ruptura, formación o
redistribución de sus enlaces covalentes o por introducción o pérdida de grupos
funcionales.
Son biocatalizadores de las reacciones que constituyen el metabolismo S + E
-------P
Intervienen a concentraciones muy bajas.
Aceleran las reacciones sin sufrir modificaciones.
Hacen que las reacciones se canalicen hacia rutas que sean útiles en lugar de
hacia reacciones colaterales que despilfarren energía.
Hacen que pueda regularse la producción de distintas sustancias según las
necesidades
9. ENZIMAS.
CARACTERÍSTICAS
No forman parte del producto.
No se consumen.
Son necesarios en pequeña cantidad.
Eficacia muy alta. No hay productos secundarios.
Especificidad enzimática de grupo (absoluta, actúan sobre un
grupo único sobre una única molécula) de reacción y de estereo
especificidad (actúan sobre un isómero y no sobre otro).
La acción enzimática se caracteriza por la formación de un
complejo que representa el estado de transición.
12. La región de la enzima que se une al
sustrato recibe el nombre de centro
activo.
EL CENTRO ACTIVO DE LOS ENZIMAS
13. Aminoácidos estructurales.
Son los que no establecen enlaces químicos
con el sustrato Son los más abundantes y los
responsables de la forma de la enzima.
Por ejemplo, en la lisozima de 129
aminoácidos, 124 son estructurales y sólo 5
no lo son.
Aminoácidos de fijación.
Son los que establecen enlaces débiles con el
sustrato y lo fijan.
Se encuentran en el centro activo de la
enzima
Aminoácidos catalizadores.
Son los que al establecer enlaces, débiles o
fuertes (covalentes), con el sustrato, provocan
la rotura de alguno de sus enlaces.
Son los responsables de su transformación.
También están en el centro activo
EN UNA ENZIMA SE PUEDEN DISTINGUIR TRES TIPOS DE
AMINOÁCIDOS
S
14. ENZIMAS
COFACTOR
Inorgánicos: oligoelementos iónicos metales que
se encuentran en pequeñas cantidades, como el Zn,
Mg, K.. Se pueden integrar directamente en el centro
activo. Sirven de puente E-S
ej. ( Fe2+
↔ Fe3+
)
Orgánicos
Grupo prostético: Enlace covalente . Ej.
Grupo Hemo de los citocromos
Coenzimas: Enlaces reversibles. Son
moléculas tipo vitaminas. No son específicos del
enzima, pero sí del tipo de reacción,
transportando grupos funcionales:-El H : NAD,
NADP, FAD, FMN (sobre DH)-transfiere grupos
acilo (=acetilo) –COCH3 : Coenzima A- transfiere
grupos fosfatos : ATP
Holoenzima o enzima activa
= Apoenzima + Cofactor
16. ENZIMAS: COFACTORES
COENZIMAS: moléculas orgánicas que se unen al
apoenzima.
No son específicas de un solo tipo de apoenzima,
(algunas coenzimas se unen a más de 100 tipos de apoenzimas,
cada una con una función diversa)
Se alteran durante la reacción enzimática, pero una
vez acabada ésta se regeneran rápidamente
volviendo de nuevo a ser funcionales.
Especializados en el transporte de electrones y
protones, reduciéndose y oxidándose permitiendo que
se den las reacciones metabólicas:
N A D +
+ 2 H +
+ 2 e- =>N A D H + H +
N A D P +
+ 2 H +
+ 2 e- => N A D P H + H +
FA D +
+ 2 H +
+ 2 e- =>FA DH 2
Transfiere grupos acilo (=acetilo) –COCH3 => Co A
Trasfieren grupos fosfatos : ATP
19. ENZIMAS
Papel de:
Apoenzima
Soporte,
Debilita enlaces
Cofactor
Lleva a cabo la catálisis.
Puente de unión ES.
Conformación: moldeando
definitivamente al enzima.
20. ENZIMAS : PROPIEDADES
Proteicas:
solubilidad, desnaturalización, PI, etc.
Especificidad
De Reacción: para cada tipo de reacción química, incluso realizada por un mismo
sustrato, existe una enzima diferente (una enzima cataliza una sola reacción
química o un grupo de reacciones estrechamente relacionadas)
De Sustrato: Sobre un tipo de sustrato
Absoluta (sólo actúan sobre un tipo de sustrato)
Relativa (reconocen el grupo funcional)
EA EB EC
Reversibilidad: A B C P
Eficacia: ↓[ ] (las necesidades enzimáticas son muy bajas y cantidades mínimas de
enzima pueden transformar grandes cantidades de sustrato)
Catalizadores: no se consumen en el trascurso de las reacciones, la misma molécula
puede actuar repetidamente.
Recuperación: se alteran y se destruyen con el tiempo, por lo que se deben de renovar
de forma periódica.
21. Especificidad
En nuestro cuerpo, los monosacáridos tienen forma
D y los aminoácidos proteicos forma L ¿Por qué?
Porque las enzimas de nuestro cuerpo sólo
catalizan reacciones sobre monosacáridos
D o aminoácidos L
ENZIMAS : PROPIEDADES
22. Recuperación:
Enzima:
E + S ES E + P
El “E” se recupera íntegramente
Coenzima:
Deshidrogenasa
Ej: AH2 + FAD A + FADH2
(El FADH2 necesita reciclarse)
ENZIMAS : PROPIEDADES
24. Las reacciones bioquímicas se inicia
con la rotura de los enlaces entre los
átomos de las moléculas de los
reactivos, para formar nuevos enlaces
que originan las moléculas de los
productos.
Estado de transición o estado activado:
estado en que los reactivos están
debilitados o rotos, pero en los que aún no
se han formado los nuevos.
Energía de activación, es la energía
necesaria para que los reactivos se
transformen en productos para que la
reacción química tenga lugar.
Presencia de catalizadores: ↓ la E. de
activación.
CATÁLISIS ENZIMÁTICA. MECANISMOS DE
LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS
Sustrato (reactivo) =>
Producto
25. Reacciones exotérmicas, exergónica: las moléculas que van
a reaccionar poseen una energía interna mayor que los productos que se
desprenden de la misma se libera energía.
CATÁLISIS ENZIMÁTICA. MECANISMOS DE
LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS
Reacciones espontáneas , la energía de activación es tan baja que se obtiene
de la propia energía cinética de las moléculas o incluso de la luz que índice en
el lugar de la reacción.
26. Reacciones endotérmicas, endergónicas: es necesaria la
aportación de energía. Los reactivos tienen menor energía que los
productos que se aporta en forma de nuevos enlaces necesitan energía.
CATÁLISIS ENZIMÁTICA. MECANISMOS DE
LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS
En la reacciones no espontáneas, sin embargo, esta energía es tan alta que no
se produce si no se aplica calor.
27. Proceso:
Sin
Catalizador
Con Catalizador
CATÁLISIS ENZIMÁTICA. MECANISMOS DE
LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS
La acción de las enzimas
consisten en rebajar la
energía de activación
para llegar fácilmente al
estado de transición y
permitir que la reacción
se lleve a cabo.
Favorecen la
aproximación de las
moléculas a sus
reactivos. No se
consumen, ayudan a que
se produzca la reacción.
29. Todas las reacciones metabólicas necesitan de
la participación de enzimas.
CATÁLISIS ENZIMÁTICA. MECANISMOS DE
LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS
30. Modelos
Llave cerradura (A)
Ajuste inducido (B)
1890 Fischer. Modelo de la llave-
cerradura.
Centro activo de la apoenzima posee,
por sí mismo, una forma
complementaria a la del sustrato.
1890 Fischer. Modelo de la llave-
cerradura.
Centro activo de la apoenzima posee,
por sí mismo, una forma
complementaria a la del sustrato.
Modelo de ajuste inducido.
El centro activo tiene la
capacidad de cambiar su forma
según sea la del sustrato.
Modelo de ajuste inducido.
El centro activo tiene la
capacidad de cambiar su forma
según sea la del sustrato.
CATÁLISIS ENZIMÁTICA. MECANISMOS DE
LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS
32. Las reacciones bioquímicas se inicia con la
rotura de los enlaces entre los átomos de
las moléculas de los reactivos, para formar
nuevos enlaces que originan las moléculas
de los productos.
Estado de transición o estado activado:
estado en que los reactivos están debilitados o
rotos, pero en los que aún no se han formado
los nuevos
Velocidad de reacción: V =[ P ] / t
FACTORES:
Tª (no en seres vivos ⇐ s.
Isotérmicos)
Presencia de catalizadores: ↓ la E. de
activación (es la energía necesaria
para que los reactivos se
transformen en productos para
CATÁLISIS ENZIMÁTICA. MECANISMOS DE
LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS
Sustrato (reactivo) =>
Producto
33. A: Fijación especifica: se une a la apoenzima
formando el complejo ES.
CARACTERÍSTICAS: altamente grado de
especificidad (para cada sustrato y de reacción
se necesita una enzima concreta). Reversible y
lenta.
El centro activo presenta una forma
espacial característica en la que se
acopla al sustrato.
B: Liberación del producto: Enzima +
Producto. El cofactor lleva a cabo la reacción o
los aa de reacción o catalíticos del centro activo
de la apoenzima y se obtiene el producto final.
CARACTERÍSTICAS: etapa rápida e
irreversible.
El Producto se libera del centro activo. El
apoenzima se libera (se une a otras moléculas
de S). La coenzima puede liberarse intacta o
liberarse quedando modificada.
CATÁLISIS ENZIMÁTICA. MECANISMOS DE
LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS
34. Todas las reacciones metabólicas necesitan de
la participación de enzimas.
Síntesis
Degradación
CATÁLISIS ENZIMÁTICA. MECANISMOS DE
LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS
35. ENZIMAS: CINÉTICA ENZIMÁTICA
Al aumentar la [S] =>
aumenta la velocidad de la
reacción. (mientras existe
enzima libre)
Cuando la [E ]se satura por
la [S] => la velocidad se
mantiene constante y es
máxima.
V máxima => Kd = [E][S]/
[ES]
(Para calcular la Kd , se
tiene que conocer la [S] y
[ES], valores que no se
pueden establecer
directamente. Cuando la
velocidad de la reacción es
Velocidad: V =[ P ]/ t
Gráfica Hipérbola
rectangular
1 U ≡ µmol S/min ≡ µmol
P/min
36. KM (Cte de Michaelis-Menten): [S] con la que la
reacción alcanza la mitad de la Vmáx .
Afinidad por el S (especificidad): ↑ KM ⇒ ↓
Afinidad
ENZIMAS: CINÉTICA ENZIMÁTICA
37. KM (Cte de Michaelis-Menten)
Afinidad por el S (especificidad): ↑ KM ⇒ ↓ Afinidad
[ ]
[ ]SK
SV
V
m
o
+
⋅
= max
KM = K2 + K3
K1
⇒
ENZIMAS: CINÉTICA ENZIMÁTICA
38. Tomando los inversos en los dos miembros de la ecuación =>
Ecuación de Lineweaver-Burk modificaron la fórmula de la Vo aplicando los
valores inversos, la gráfica se transformó en una línea recta muy útil para el estudio
cinético de las enzimas.
[ ]
[ ]SK
SV
V
m
o
+
⋅
= max
⇒
ENZIMAS: CINÉTCA ENZIMÁTICA
39. ENZIMAS: CINÉTICA ENZIMÁTICA
KM (Cte de Michaelis-Menten)
Importancia
Km = [ S ] fisiológica ⇒ V enzimática a [ ]
fisiológica
Afinidad por el S (especificidad): ↑ KM ⇒ ↓
Afinidad
Km a partir de la ecuación de Vo de M-M
41. ENZIMAS: CINÉTICA ENZIMÁTICA
Enzimas con la
misma Vmáx y
diferente KM
(Si catalizan la
misma reacción y
sobre el mismo S
serán
isoenzimas)
KM (Cte de Michaelis-Menten)
43. ENZIMAS: Factores que influyen en la
velocidad
Concentración de sustrato
Concentración de enzima
pH
Temperatura
44. ENZIMAS: Factores que influyen en la
velocidad
Influencia de la concentración del SUSTRATO
Exponencial (Hipérbole) : al aumentar la [S] => más
centros activos ocupados => la velocidad de la reacción
aumenta hasta que se saturan todos los centros activos =>
velocidad es máxima y constante.
45. ENZIMAS: Factores que influyen en la
velocidad
Influencia de la concentración de ENZIMA.
Proporcional (lineal)
46. ENZIMAS: Factores que influyen en la
velocidad
Influencia del pH.
Cada enzima tiene un
pH óptimo de
actuación, valorar
superiores o
inferiores disminuyen
su velocidad de
reacción. Se llega
incluso a
desnaturalizar la
enzima.
47. ENZIMAS: Factores que influyen en la
velocidad
Intestino (jugo pancreático) Estómago (jugo gástrico)
¿ A qué se deben estas diferencias en el pH óptimo de las siguientes
enzimas?
48. ENZIMAS: Factores que influyen en la
velocidad
Influencia de la
temperatura.
Existe una temperatura
óptima de funcionamiento
de las enzimas, y valores
inferiores o superiores
disminuyen la velocidad de
reacción. Las Tª inferiores
a la óptima disminuye el
número de vibraciones
moleculares y las
superiores pueden
provocar la
desnaturalización de la
enzima.
49. ENZIMAS: MECANISMOS PARA AUMENTAR
LA EFICACIA ENZIMÁTICA
Los procesos metabólicos
en los seres vivos se
organizan en rutas
metabólicas, de manera
que el producto de una
reacción es el sustrato de
la reacción siguiente.
Optimizar esta compleja
red de reacciones se
consigue
50. ENZIMAS: Mecanismos para aumentar la
eficacia enzimática
1.Compartimentación:
es la ventaja de los
organismos eucariotas:
mayor concentración de
enzimas (al encontrarse
en las membranas
biológicas )y varias
reacciones diferentes
simultáneamente.
51. ENZIMAS: Mecanismos para aumentar la
eficacia enzimática
2. Complejos multienzimáticos: Agrupación de enzimas
que realizan reacciones consecutivas de una misma ruta
metabólica, permiten realizar el proceso con gran
rapidez.
Ej. piruvato deshidrogensa-descarboxilasa :
1. Descarboxilasa
2. Deshidrogenasa
3. Activación (sintasa)
52. ENZIMAS: Mecanismos para aumentar la
eficacia enzimática
3. Isozimas: Enzimas diferentes que actúan sobre la
misma reacción pero con diferente KM. Su velocidad
es diferente. Se localizan en orgánulos donde se
precisan una determinada velocidad.
Lactato deshidrogensa
Ácido pirúvico ==> Ácido láctico
La del músculo esquelético tiene
una KM menor que la del
miocardio (indica que tiene más
afinidad, por lo tanto en
condiciones anaeróbicas su
acción es más rápida))
53. ENZIMAS: Mecanismos para aumentar la
eficacia enzimática
4. Reacciones en
cascada: El producto de
una reacción enzimática
actúa como enzima de
otra reacción,
produciéndose un
efecto multiplicativo en
la generación de
producto. Ejemplo: la
coagulación sanguínea.
54. ENZIMAS: REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD
ENZIMÁTICA
Necesidad de regulación y modos
Regulación por KM
Activación:
cationes (Ca2+
, Mg2+
), el sustrato,
etc.
Inhibición:
Reversible
I. Competitiva: ↑ Km
Irreversible
I. No competitiva: ↓Vmax
I. Acompetitiva: ↑ Km
↓Vmax
56. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
ACTIVACIÓN: La enzima permanece
inactiva, en reposo hasta que aparece o
se une al activador correspondiente:
Cationes: elementos como el Ca++
o el
Mg++
son importantes activadores
enzimáticos.
Moléculas orgánicas, que al unirse a
la enzima correspondiente activan su
proceso de transformación en
producto.
El propio sustrato, La enzima
permanece inactiva hasta que aparece
el sustrato; si no hay sustrato no es
necesaria la actividad de la enzima,
por tanto el sustrato activa su propia
metabolización.
Nota: No confundir con un cofactor,
el activador no se une al centro
activo
57. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
INHIBICIÓN: Sustancias que disminuyen
o anulan la actividad de las enzimas.
Son variados: iones libres, moléculas
orgánicas, el producto final de la reacción
enzimática (feed-back o retroinhibición).
Reversible: el inhibidor se une a la enzima
de forma no covalente bloqueando a la
enzima temporalmente, hasta que la enzima se
libera del inhibidor y vuelve a funcionar
normalmente
I. Competitiva:
Km (de la E por el S)(mientras
que Km (de la E por el I )
Vmáx = Constante (el inhibidor no
interfiere con la velocidad de
58. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
Reversible:
I. Competitiva: El inhibidor
compite con el sustrato por el
área activa de la enzima (análogo
metabólico, u forma espacial debe
tener gran semejanza con el S) .
Si el centro activo es ocupado por
el S hay reacción, si es ocupado
por el I no se produce, porque el
S no puede acoplarse.
↑ Km (aumenta la KM aparente
de la E por el S)
Vmáx Constante
59. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
Inhibición competitiva: la Km aparente del
sustrato aumentará en presencia del inhibidor (es decir, será
precisa una [S] superior para alcanzar 1/2 vmáx). Por lo tanto, en la
cinética se refleja como una disminución de la afinidad de E por S.
El inhibidor compite con el
sustrato
La velocidad máxima no
esta afectada
La KM se altera
Se supera con el aumento
de la [S].
60. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
La Vmax
permanece
constante
La KM
aumenta
61. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
Vmax cte
↑ Km
Ejemplo:
[I1] <[I2] =>
-1/ [KM] = -1 =>[KM] = 1 mM con I2
-1/ [KM] = -2 => [KM] = 0,5 mM con I1
-1/ [KM] = -3 =>[KM] = 0,33 mM con S (sin I)
1 mM>0,5>0,33mM
KM (aparente con I2)(menos afinidad)>KM
(aparente con I1)> KM (aparente con S)
(más afinidad9 =>
A medida que [I] => KM ,aparente
de la E por el S, (tiene menos afinidad
por la E)
[I1]
[I2]
63. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
¿Por qué es
reversible?
Revierte si
aumentamos la
concentración
de sustrato
Se puede
neutralizar si se
añade una
concentración de
sustrato suficiente
para desplazar al
inhibidor.
Inhibición competitiva:
64. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
Reversible:
I. No Competitiva: El inhibidor
se une a la enzima en una zona
diferente del centro activo. Esta
unión modifica la conformación
espacial de la enzima que
disminuye su actividad.
↓Vmax (no se descompone el
complejo ES a la misma
velocidad para liberar el
producto de la reacción)
65. ENZIMAS: Regulación de la
Actividad enzimática
complejo
ESI
La unión al INC puede permitir o no la unión del S,
pero el complejo resultante, siempre es inactivo
El inhibidor no competitivo puede combinarse con la enzima libre (E) o con
el complejo enzima sustrato (ES), e interfiere en la acción de ambos:
E + I <===> EI
ES + I <===> ESI
66. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
Inhibición no competitiva
La velocidad máxima
se disminuye
La KM es normal
No se supera con el
aumento de [S]
67. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
Reversible:
I. No Competitiva:
↓Vmáx
68. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
Inhibición no competitiva:
La Vmax
disminuye
La Km
constante
69. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
Inhibición no competitiva:
En presencia del I => la vmáx
(es decir, no puede ser
compensada su presencia por
elevadas [S]) pero la Km
aparente no varía (o sea, que a
la misma [S] se alcanza la 1/2
vmáx correspondiente a la
presencia del inhibidor). En
realidad la afinidad de E por S
sí ha disminuido realmente
(aunque no "aparentemente").
70. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
Ejemplo:
[I1] <[I2] => [KM] = cte
Vmáx disminuye a medida que aumenta
la [I]
INC:
↓Vmáx
Km cte
[I2]
[I1]
71. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
No revierte
aunque
aumentemos la
concentración
de sustrato
Inhibición no competitiva:
72.
73. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
INHIBICIÓN:
Irreversible: son
compuestos que se
unen irreversiblemente
a determinados grupos
del centro activo y
anulan su capacidad
catalítica.Ej: venenos y
toxinas
I. Acompetitiva:
KM Vmax
Siempre se forma
el complejo
ESI,
pero inactivo
74. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
Inhibición
irreversible
El I no se combina con la E libre.
Se combina con el complejo
enzima-sustrato => forma el
complejo (E-S-I), el cual no se
transforma en el producto
habitual de la reacción:
ES + I <===> ESI
75. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
Inhibición Acompetitiva: con un aumento de I aumenta la KM aparente
en la misma proporción que la vmáx disminuye (como el I se une al complejo
ES, su presencia se manifiesta también a elevadas [S], por lo que
disminuye vmáx).
¿Por qué es
irreversible? No revierte aunque
aumentemos la
concentración de
sustrato
76. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
Inhibición Acompetitiva: aumenta la Km
y Vmax, pero el cociente Km/Vmax no se
altera.
77. ENZIMAS: Regulación de la
Actividad enzimática
Inhibición Acompetitiva: ¿Por qué es
irreversible?
No revierte
aunque
aumentemos
la
concentració
n de sustrato
79. ENZIMAS: Regulación de la Actividad enzimática
IC:
Vmáx cte
↑ KM
INC:
↓Vmáx
KM cte
IA:
↓Vmáx
↑ KM
Inhibición
80. ENZIMAS: NOMENCLATURA
Se conocen ± 2.000 enzimas
Para nombrarlas:
Término que alude al sustrato y al tipo de
reacción catalizada
Sufijo –ASA
En ocasiones no se usa esta denominación, sino
la antigua, sobre todo en las enzimas digestivas
(ej. Pepsina, tripsina)
81. 1. NOMENCLATURA ANTIGUA: SUFIJO -asa
• Nombre de la fuente u origen del enzima: Pancreasa
• Nombre del sustrato: Proteasa
• Tipo de reacción catalizada: Hidrolasa
2. NOMENCLATURA ACTUAL:
Enzyme Commission [E.C.] de la IUBMB
• Clasificación de enzimas (6 clases)
• Asignación de código E.C.: 1.1.1.1
• Nombre sistemático:
Sustrato-coenzima-Tipo de Reacción -asa
Etanol NAD+
Oxidorreductasa
1. NOMENCLATURA ANTIGUA: SUFIJO -asa
• Nombre de la fuente u origen del enzima: Pancreasa
• Nombre del sustrato: Proteasa
• Tipo de reacción catalizada: Hidrolasa
2. NOMENCLATURA ACTUAL:
Enzyme Commission [E.C.] de la IUBMB
• Clasificación de enzimas (6 clases)
• Asignación de código E.C.: 1.1.1.1
• Nombre sistemático:
Sustrato-coenzima-Tipo de Reacción -asa
Etanol NAD+
Oxidorreductasa
82. ENZIMAS: CLASIFICACIÓN
Según el tipo de
reacción que
catalizan:
Oxidorreductasas
Transferasas
Hidrolasas
Liasas
Isomerasas
Ligasas o sintasas
83. CLASE TIPO DE REACCIÓN CATALIZADA
1. OXIDO-REDUCTASAS Transferencia de electrones
20 subclases Sred + S’ox ↔ Sox + S’red
2. TRANSFERASAS Transferencia de grupos
9 subclases S-grupo + S’ ↔ S’-grupo + S
3. HIDROLASAS Rotura hidrolítica de enlaces
11 subclases A-B + H2O ↔ A-H + B-OH
4. LIASAS Rotura de enlaces A-B → A+B
7 subclases Salida de grupos CX-CY → C=C + X-Y
Adición a dobles enlaces C=C + XY → CX-CY
5. ISOMERASAS Cambios internos
6 subclases Transferencias internas de grupos
6. LIGASAS Formación de enlaces mediante reacciones de
5 subclases condensación con gasto de energía (ATP)
CLASE TIPO DE REACCIÓN CATALIZADA
1. OXIDO-REDUCTASAS Transferencia de electrones
20 subclases Sred + S’ox ↔ Sox + S’red
2. TRANSFERASAS Transferencia de grupos
9 subclases S-grupo + S’ ↔ S’-grupo + S
3. HIDROLASAS Rotura hidrolítica de enlaces
11 subclases A-B + H2O ↔ A-H + B-OH
4. LIASAS Rotura de enlaces A-B → A+B
7 subclases Salida de grupos CX-CY → C=C + X-Y
Adición a dobles enlaces C=C + XY → CX-CY
5. ISOMERASAS Cambios internos
6 subclases Transferencias internas de grupos
6. LIGASAS Formación de enlaces mediante reacciones de
5 subclases condensación con gasto de energía (ATP)
Clasificación de los EnzimasClasificación de los Enzimas
International Union of Biochemistry and Molecular Biology [IUBMB]
84. Esta gráfica representa la variación de la velocidad de reacción frente a la
concentración del sustrato; ¿A qué se debe que la curva alcance una meseta y la
velocidad no sigua aumentando para mayores concentraciones de sustrato
Se alcanza la concentración
saturante de sustrato
donde todas las enzimas
están formando complejos
ES
TEST DE REPASO
85. A) Explica como calcularías el valor de Km para una enzima frente a un
sustrato, si conoces la velocidad de reacción para distintas concentraciones
de sustrato.
B) ¿Qué efecto tendría sobre la Km la presencia de un inhibidor enzimático
reversible? Razona la respuesta
A) Graficamente
B) I. competitiva
Km Km´
TEST DE REPASO
86. Dibuja la estructura terciaria de una enzima unida a su sustrato, sobre este dibujo
indica lo siguiente:
A.¿Dónde actuaría un inhibidor competitivo?
En el centro activo, es un análogo metabólico
A.¿Dónde actuaría un inhibidor no competitivo?
En región diferente al c. activo
A.¿Cuál de los dos tiene un efecto reversible?
El I. competitivo
A.¿cómo conseguirías revertir el proceso inhibitorio? Razona las respuestas.
Añadiendo más sustrato, hasta la V max. (saturación).
E
S
Ic
Inc
Centro
activo
87. Define el concepto de cofactor enzimático
Grupo molecular no proteico que complementa al enzima ( a nivel del c. activo)
¿Qué papel juega el cofactor en el proceso catalítico?
Aporta g. funcionales al c. activo:
Interviene directamente en la catálisis ,
Une ES,
Moldea definitivamente el E.U
Cita algún ejemplo de cofactor enzimático:
FAD, NAD+, cationes, grupo prostético, etc.
Define los siguientes conceptos referidos a enzimas:
Km:
Concentración de sustrato necesaria para alcanzar la mitad de la velocidad
mázima de un proceso enzimático.
Catálisis:
Disminución de la energía de activación por la acción de un catalizador (3 etapas)
con el fin de aumentar la velocidad.
Velocidad del proceso enzimático:
V = [ P ] / tiempo, en moles / L / minuto.
TEST DE REPASO
88. Un enzima ha perdido eficiencia
catalítica en la transformación de
un sustrato “S” en un producto
“P” al estar sometida aquella a la
acción de un inhibidor
competitivo, bajo estas
circunstancias ¿de qué forma se
verían afectadas la Vmax y la Km
de la enzima? ¿cómo
solucionarías el problema?.
Razona tu respuesta.
↑Km ⇒ ↓la afinidad por el S.
La Vmax. No varía
Podemos revertir el proceso
añadiendo sustrato
TEST DE REPASO
89. Una determinada concentración de enzima cataliza la conversión de un
sustrato S en un producto P a una velocidad máxima de 3 µ M/min, en estas
condiciones de ensayo ¿qué incremento de valor tendrá la Vmax del
proceso si duplicamos la concentración del sustrato? Razona la respuesta.
Ninguno ya que todo el enzima estará formando complejos ES (saturación) y se
habrá alcanzado la V max.
A un pH 7.5 una determinada enzima transforma, con rendimiento óptimo,
una determinada concentración de sustrato “S” en un producto “P”. Si
modificamos el pH hasta un valor de 6.4 ¿qué le ocurriría a la velocidad del
proceso? ¿qué le ocurriría al centro activo en estas condiciones de
reacción? Razona la respuesta:
a)la V disminuye.
b)la geometría del c. activo varía ⇒ se dificulta la interacción específica con el S.
Si el cambio de pH fuera MAYOR ⇒ desnaturalización del enzima ⇒ V = 0 ( enz.
No funcional)
TEST DE REPASO
91. Cuando se representa la cinética de catálisis
enzimática de una enzima frente a un sustrato,
en diferentes condiciones de pH y la misma Tª
de reacción, se obtiene el resultado de la
figura . Comenta el resultado obtenido y
razona el comportamiento de la enzima en el
ensayo teniendo en cuenta los criterios
estructurales.
pH 7,3 ⇒ máxima V (probablemente pH óptimo),
pH 6 ⇒ menor V.
pH 5: V mínima, comienza la desnaturalización.
A medida que aumenta el pH el enzima sufre
cambios conformacionales que afectan al c. activo
disminuyendo la velocidad. Si el cambio es
extremo ⇒ desnaturalización y V= 0.
TEST DE REPASO
92. TEST DE REPASO
En la figura se
representa la cinética
de determinado
proceso enzimático.
Indica el tipo de
inhibición y
características del
proceso.
93. En la figura se representa la cinética de determinado
proceso enzimático. Si en un ensayo aparte se reproduce
el mismo ensayo pero introduciendo a) un IC b) un INC c)
Un I A. ¿Cómo sería e cada caso la gráfica. Representa
la gráfica indicando en cada caso la Vmax del ensayo
a) ICompetitiva b) I no Competitiva c) I
Acompetitiva
IC:
Vmax cte
↑ Km
INC:
↓Vmax
Km cte
IA:
↓Vmax
↑ Km
94. El sustrato S es transformado por tres enzimas diferentes
en un mismo producto P. Indica en cada caso: el tipo de
enzima, la Km y la Vmax. Indica además que enzima tiene
mayor afinidad por el sustrato.
E1: normal
E2: Alostérica
E3: Alostérica
E1: Vmax 10
E2: Vmax 10
E3: Vmaz 2
E1: Km 1,4
E2: Km 3
E3: Km 1,4
E1 = E3 > E2
Afinidad
95. En un cultivo de bacterias, la velocidad de reacción de un enzima E fue de 20 µg/min
para una concentración de sustrato de 3 mM. Si la concentración de
sustrato es igual o superior a 7 mM, la velocidad no supera los 40 µg/min. Al añadir una
cierta cantidad de inhibidor competitivo, la velocidad de la reacción fue de 20 µg/min
para una concentración de sustrato de 8 mM. Calcúlese la Km, la Vmax y la Km´.
a)Vmax: Si para una [S] ≥ 7 mM la velocidad es 40 µg/min, la Vmax=40 µg/min
b) Km: ½ Vmax será 20 µg/min, como esta velocidad se consigue con una [S]
= 3 mM, la Km = 3 mM
Otra forma es utilizando la ecuación de Michaelis:
Km +3 = 120 / 20 Km = 6 – 3 = 3 mM/L
c) Como es un inhibidor competitivo Vmax = Vmax´= 40 µg/min y ½ Vmax´= 20 µg/min. Esta
velocidad se alcanza con una [S] de 8 mM en presencia de inhibidor, por lo tanto Km´= 8 mM.
Vo = Vmax [S] / Km + [S] 20 = 40 x 3 / Km + 3
TEST DE REPASO
96. •Elabora un texto coherente de no más de 10 líneas en el
que figuren las siguientes palabras: enzima, proteína,
sustrato, centro activo, velocidad de reacción.
Las enzimas, en su mayoría, son proteínas globulares que
basan su funcionalidad en la interacción específica a nivel
geométrico con otra sustancia llamada sustrato. Dicho
sustrato o reactivos del proceso químico se unen
específicamente a una región del enzima llamado centro
activo. Esta interacción tiene como consecuencia la
disminución de la energía de activación necesaria para el
proceso, lo que se traduce en un aumento de la velocidad
de reacción sin necesidad de recurrir a un aumento de la
Tª.
TEST DE REPASO