El documento presenta un examen de bioquímica que incluye varias secciones: 1) identificación de compuestos biológicos, 2) formulación de compuestos complejos, 3) funciones moleculares, y 4) estructura y función de la rodopsina de calamar. El examen requiere que los estudiantes identifiquen compuestos, formulen moléculas como trisacáridos y nucleótidos, relacionen tipos de compuestos con funciones celulares, y analicen la estructura y mecanismo de acción de

1. Departamento de Biología y Geología Noviembre 2009
Examen de bioquímica
Nombre y Apellidos Curso
1- (2.5) Identificación de compuestos
Entre las hojas entregadas en este examen hay una en la que aparecen una serie de
compuestos químicos biológicos.
La primera parte del ejercicio consiste identificar o formular los compuestos que se citan a
continuación utilizando el siguiente criterio:
- Si existe el compuesto en la hoja escribir en el espacio correspondiente el nombre.
- Si no está, pero se puede formular la molécula, poner " FORMULA " y desarrollarla por detrás de este folio.
- Si no puede existir el tipo de molécula requerido escribir " NO EXISTE "
- Poner la función principal de cada uno de estos compuestos
Nombre Función
1.1- Nucleótido
1.2- Ácido fosfórico
1.3- Aldotetrosa
1.4- Aminoácido aromático
1.5- Ácido graso saturado
1.6- Terpeno
1.7- Ácido biliar
1.8 Señala sobre la hoja, coloreándolos, los compuestos que respondan a los siguientes
grupos:
- Ácidos grasos - Monosacáridos - Esteroides
– Aminoácidos - Terpenos - Nucleótidos
– Prostaglandinas
1.9 Nombra químicamente los siguientes compuestos:
Glicerina Isoleucina Ácido laúrico
2 - (2.5) Formulación de compuestos complejos
Formular dos de la tres siguientes moléculas propuestas
2.1 - Un trisacárido
2.2 - El péptido Trp-Gly-Gly-Phe-COOH
2.3 – El nucleótido dGDP
nota: Se piden fórmulas químicas, no esquemas.

2. 3- (1.5) Funciones moleculares
Rellena la siguiente tabla con el tipo de compuesto que corresponde con la función celular que
se indican. Explica muy resumidamente su mecanismo de acción
Función celular Tipo de compuesto Acción
Mensajero intracelular
Mensajero intercelular
(hormona)
Impermeabilizante
Formación de
membranas celulares
Estabilizador de
membranas celulares
Trasportador de
membrana celular
Información genética
Formación de paredes
celulares
Biocatalizadores
Disolvente
Síntesis de proteínas
Nota : El las celdas con posiblilidad para varios compuestos hay que señalar compuestos diferentes

3. 4 – (3.5) Estructura de una proteína: Rodopsina de calamar.
La rodopsina es una proteína transmembranal de gran tamaño formada por una cadena de
aminoácidos (opsina) que atraviesa siete veces la membrana celular y que se encuentra unida
reversiblemente a una molécula llamada retinal. En la rodopsina el retinal se encuentra en una forma
angulosa llamada cis-retinal.
Cuando sobre el cis-retinal de la rodopsina
incide un fotón se producen los siguientes procesos :
- El fotón es absorbido por el cis-retinal (anguloso)
convirtiéndolo en trans-retinal (molécula lineal).
- El trans-retinal se separa de la cadena de
aminoácidos dejando la opsina libre.
- La opsina modifica a una proteína ligada a la
membrana llamada Proteína G.
- La proteína G activa una serie de enzimas que alteran el estado eléctrico de la célula
4.1 - Clasifica esta proteína según todos los criterios que conozcas.
4.2 - Describe con detalle su estructura tridimensional (primaria, secundaria, ...)
4.3 - Señala sobre el esquema que figura a
continuación cómo quedarán colocados los
restos de aminoácidos polares y apolares y por
qué.
4.4 - Trata de explica cómo puede la separación
del retinol de la opsina hacer que esta
modifique a otra proteína de la membrana
4.5 - ¿Cómo está unido el retinol a la proteína?
4.6 - La rodopsina de calamar lleva unida dos
cadenas hidrocarbonadas de ácido palmítico
¿Para qué puede servirle a la proteína? ¿Qué
tipo de enlace llevan estas moléculas?
4.7 - Esta proteína tiene un puente bisulfuro ¿Qué
es un puente bisulfuro? ¿Para qué sirve?
¿Entre qué aminoácidos se produce? ¿Dónde
se encuentra en esta proteína?
4.8 - Contempla dos cambios en la secuencia de
aminoácidos de la opsina, uno que afecte poco
a la función de la proteína y otro que la afecte
de manera importante. Indica el aminoácido cambiado, por cual se ha cambiado y la
consecuencia.

4. 4.9 - ¿Qué tipo de molécula es el retinal? ¿En qué se diferencia la forma cis-retilnal de la forma
trans-retinal? ¿Son estables estas formas en la célula?
4.10 - El retinol es una vitamina. ¿En qué se diferencian el retinol y el retinal? . Explica por qué si no
tomamos retinol en la dieta sufrimos ceguera nocturna (además de otras alteraciones) y si lo
hacemos, con muy escasa cantidad, recuperamos la visión normal.
Rodopsinade calamar
• Ver la poteína en NCBI Structure
• Rodopsina.cgi
Secuencia
grdlrdnetw wynpsiivhp hwrefdqvpd avyyslgifi gicgiigcgg ngiviylftk
tkslqtpanm fiinlafsdf tfslvngfpl mtiscflkkw ifgfaackvy gfiggifgfm
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vlcncsfdyi srdsttrsni lcmfilgffg piliiffcyf nivmsvsnhe kemaamakrl
nakelrkaqa ganaemrlak isivivsqfl lswspyavva llaqfgplew vtpyaaqlpv
mfakasaihn pmiysvshpk freaisqtfp wvltccqfdd keteddkdae teipagessd
aapsadaaqm ke
Estructura espacial Estructura espacial

5. X - Preguntas adicionales para los alumnos con el primer examen
suspenso o casi
• Desarrollar completamente las moléculas desarrolladas en el apartado 2
• Desarrollar completamente la molécula de AMPc
• ¿Cuantos carbonos asimétricos tiene cada una de estas moléculas?
• ¿Cuantos isómeros ópticos tendrán?
• Desarrollar los siguientes isómeros de la leucina (C6 H13 O2 N)
– Un isómero de función
– Un isómero de posición
– Dos isómeros ópticos (formular dos enantiómeros)
Nota : Hay que desarrollar completamente las fórmulas metionina y los isómeros pedidos
• Indica en la hoja de los compuestos el que sea:
- el más soluble y el más insoluble en agua
- el de mayor punto de fusión y el de menor punto de fusión
– el más ácido y el más básico.
Razonar las respuestas.

6. Fórmulas