Los virus. Evidencias científicas SARS-CoV-2

Los virus
Evidencias cientíﬁcas
SARS-CoV-2
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D. José Alcamí
Coordinador del Grupo de Análisis Cientíﬁco del Coronavirus
Instituto de Salud Carlos III
Creative Commons Music by Jason Shaw on Audionautix.com
Foto de iBERdiaz
Organiza:
Colabora:
Jueves, 20 agosto 2020

Organiza:
Colabora:

SARS-COV-2. VIROLOGÍA!
COVID-19 una epidemia más en el antropoceno
Genoma, estructura y ciclo biológico de SARS-CoV-2
El origen de SARS-CoV-2 ¿Crónica de una muerte anunciada?
Respuesta inmune frente a SARS-CoV-2 - La katana del Samurai
Vacunas para SARS-CoV-2 ¿Cuando, cómo y para quién?
Lecciones de una pandemia
Tratamientos para COVID-19, ciencia y circo mediáLco

COVID-19. Una epidemia más en el antropoceno!

2014
Ebola virus
11.300 deaths
2020
2019-
COVID-19 Coronavirus
>750.000 deaths
2014
2019

ZOONOSIS
MUTACION DE UN VIRUS à SALTO INTERESPECIE à SALTO INTRAESPECIE
HIV-1 M
HIV-1 N
HIV-1 O
HIV-1 P
HIV-1 M
EL EJEMPLO DEL VIH

PROPAGACION POR LAS RUTAS COMERCIALES Y MIGRATORIAS
EL EJEMPLO DEL VIH
I.P.
30 años de SIDA
EL SKY LINE DEL SIDA
Los años de plomo

El leve aleteo de las alas de una mariposa se puede sen1r al otro lado del mundo (Proverbio Chino)
”Predic1bilidad: el aleteo de una mariposa en Brasil ¿hace aparecer un tornado en Texas?
Edward Norton Lorenz

”Predic1bilidad: el aleteo de un murciélago en China puede hacer aparecer un tornado en China, Europa, América…”
El leve aleteo de las alas de una mariposa murciélago se puede sen1r al otro lado del mundo (Proverbio mío)
La mutación de un virus
es el aleteo de la mariposa

”Predic1bilidad: el aleteo de un murciélago en China puede hacer aparecer un tornado en todo el mundo”
El leve aleteo de las alas de una mariposa murciélago se puede sen1r al otro lado del mundo (Proverbio mío)
La mutación de un virus
es el aleteo de la mariposa
Lo demás es la huella del hombre

Salto interespecie

•  Diseminacion
•  Ignicion epidémica

De Epidemia a Pandemia

Principales hitos en la pandemia de COVID-19
1 de diciembre
El primer paciente ingresa en Wuhan
31 de diciembre
China informa a la OMS de la existencia
de 27 casos de neumonía en Wuhan
9 de enero
La OMS comunica el aislamiento de
un nuevo Coronavirus
12 de enero
La OMS recomienda no viajar a China
30 de enero
La OMS declara “emergencia de salud
pública de alcance internacional”

ENE
FEB
DIC
8 de diciembre
El doctor Li Wenliang alerta de los
casos de neumonía en Wuhan
1 de enero
Se cierra el mercado de marisco de Wuhan
27 de diciembre
Un lavado bronquial mandado para
estudio genético muestra la presencia
de coronavirus
7 de enero
Se obtiene la secuencia del nuevo coronavirus
20 de enero
Un comité médico llega a Wuhan
19 de enero
El alcalde celebra una comida con 10.000 vecinos
23 de enero
Confinamiento de la provincia de Hubei

FEB
MAR
ABR
11 de marzo
La OMS declara la Pandemia
5 de febrero
Wuhan alcanza los 10.000 casos
15 de febrero
China alcanza los 50.000 casos
Total de casos fuera de China 526
Países afectados 25
12 de febrero
Se suspende el Wold Mobile Congress
en Barcelona
9 de marzo
España alcanza los 1.000 casos
15 de marzo
Confinamiento en España
2 de marzo
El ECDC alerta de la situación en
Europa
CONFINAMIENTO EN
EUROPA
Italia 9 de marzo
Noruuega 12 de marzo
Portugal 13 de marzo
Austria 15 de marzo
Belgica 17 de marzo
Francia 17 de marzo
Grecia 23 de marzo
Alemania 23 de marzo
Inglaterra 23 de marzo
J. Alcamí y E.López-Collazo E. Coronavirus ¿la úlVma Pandemia? Oberón libros, Editorial Anaya 2020

CHINA
-Confinamiento de Hubei
- Cierre del país
89.926 casos
4.710 muertos JAPÓN
-No confinamiento
- Detección precoz. Cuarentena
- Control de contactos
- Cierre de fronteras
56.685 Casos
1.115 muertos
COREA DEL SUR
-No confinamiento
- Detección precoz. Cuarentena
15.761 Casos
306 muertos
NUEVA ZELANDA
- Confinamiento PRECOZ
1.293 casos
22 muertos AUSTRALIA
23,559 casos
421 muertos
COVID-19. Una epidemia más en el antropoceno. Cifras a 18 de agosto!

FRANCIA-ESPAÑA-ITALIA
BELGICA-AUSTRIA
-Confinamiento
- Cierre del país
SUECIA
-No confinamiento
- Opción inmunidad de grupo
PORTUGAL
ALEMANIA
- Confinamiento LIGHT
- Detección precoz.
REINO UNIDO
- Cambio a confinamiento light
- Prima la economía
ESTADOS UNIDOS
- Según estados
- Confinamiento light
- Confinamiento
BRASIL
- Aquí no pasa nada
224.014 Casos
9.232 muertos
ESPAÑA
-342.813 Casos
-28.617 muertos
54.102 Casos
1.778 muertos
3.340.197 Casos
107.852 muertos
5.354.013 Casos
168.999 muertos
84.2894 Casos
5.783 muertos
FRANCIA
-205.066 Casos
-30.2780 muertos
ITALIA
-253.915 Casos
-35.396 muertos
BELGICA
-78.230 Casos
-9.939 muertos
318.4880 Casos
41.366 muertos
SUDAFRICA
-587.345 Casos
-11.839 muertos

FRANCIA-ESPAÑA-ITALIA
BELGICA-AUSTRIA
-Confinamiento
- Cierre del país
SUECIA
-No confinamiento
PORTUGAL
ALEMANIA
- Confinamiento LIGHT
- Detección precoz.
REINO UNIDO
- Cambio a confinamiento light
ESTADOS UNIDOS
- Según estados
- Confinamiento light
- Confinamiento
BRASIL
- Aquí no pasa nada
224.014 Casos
9.232 muertos
ESPAÑA
-342.813 Casos
-28.617 muertos
54.102 Casos
1.778 muertos
3.340.197 Casos
107.852 muertos
5.354.013 Casos
168.999 muertos
84.2894 Casos
5.783 muertos
FRANCIA
-205.066 Casos
-30.2780 muertos
ITALIA
-253.915 Casos
-35.396 muertos
BELGICA
-78.230 Casos
-9.939 muertos
318.4880 Casos
41.366 muertos
SUDAFRICA
-587.345 Casos
-11.839 muertos
PAIS Muertes/106
PAIS Muertes/106
Bélgica 870 Colombia 296
Perú 821 Canadá 239
Reino Unido 626 Irán 235
España 612 Sudáfrica 199
Italia 586 Portugal 174
Suecia 569 Argentina 127
Chile 561 Rusia 107
EEUU 522 Finlandia 60
Brasil 518 Noruega 48
Francia 454 Indonesia 22
México 452 Australia 16
Panamá 428 Japón 8
Irlanda 364 Korea del sur 5
Bolivia 363 Nueva Zelanda 4
Países Bajos 360 China 3
Muertes COVID-19 por millón de habitantes (18 de agosto de 2020)

El fracaso de la estrategia
“ONE HEALTH”
en la COVID-19

ü Virus de la bronquiLs aviar (1937)
ü Primer coronavirus humano fue aislado de la nasofaringe de un paciente (B814) por
Tyrrell y Binoe (1965)
ü Fotograﬁado por primera vez por June Almeida en la Universidad de Toronto 1965)
Descubrimiento de los coronavirus
Almeida, June D.; Tyrrell, D. A. J. (1967).
"The Morphology of Three Previously Uncharacterized Human Respiratory Viruses that Grow in Organ Culture".
Journal of General Virology. 1 (2): 175–178

Tang D, Comish P, Kang R (2020) The hallmarks of COVID-19 disease. PLoS Pathog 16 (5): e1008536. h[ps://doi.org/10.1371/journal.

SR Weiss. Forty years with coronavirus. J. Exp. Med 2020

SARS-COV-2. VIROLOGÍA!

SARS and MERS: recent insights into emerging coronaviruses DE WIT ET AL. NAT REV MICROBIOL 2016;14:523-534

Nature Medicine 2015
El origen d e SA RS-CoV-2 ¿Crónica de una muerte anunciada?!

« Además de las interacciones entre disLntas especies de coronavirus en los
murcielagos, las interacciones entre murciélagos y animales o murciélagos y
humanos, y la presencia de murciélagos vivos en mercados de animales y
restaurantes en el sur de China, son factores importantes para la transmisión de los
coronavirus entre especies que puede provocar brotes epidémicos devastadores a
nivel global »

Global Epidemiology of Bat Coronaviruses by Wong et al. in Viruses 2019 11 (2),174


SARS and MERS: recent insights into emerging coronaviruses DE WIT ET AL. NAT REV MICROBIOL 2016;14:523-534

El origen de SARS-CoV-2 ¿Crónica de una muerte anunciada?!
Zhang et al., 2020, Current Biology 30, 1–6 hmps://doi.org/10.1016/j.cub.2020.03.022

Hipótesis sobre el origen de SARS-CoV-2
Los coronavirus mutan y se
recombinan en el murciélago
Beta
Se genera un precursor de
SARS-CoV-2, versión Beta
Hipótesis 1. Salta a un
mamífero intermediario no
idenLﬁcado en el que muta
y genera el SARS-CoV-2
Hipótesis 2. Salta al hombre
donde se propaga mal.
Infecta pocos sujetos en los
que muta y genera el SARS-
CoV-2
SARS
CoV-2
¿?
Al incorporar en su espícula
las mutaciones y la zona de
corte por Furina aumenta su
capacidad de propagación
PANDEMIA COVID-19

Hipótesis sobre el origen de SARS-CoV-2
Los coronavirus mutan y se
recombinan en el murciélago
Beta
Se genera un precursor de
SARS-CoV-2, versión Beta
Hipótesis 1. Salta a un
mamífero intermediario no
idenLﬁcado en el que muta
y genera el SARS-CoV-2
Hipótesis 2. Salta al hombre
donde se propaga mal.
Infecta pocos sujetos en los
que muta y genera el SARS-
CoV-2
SARS
CoV-2
¿?
Al incorporar en su espícula
las mutaciones y la zona de
corte por Furina aumenta su
capacidad de propagación
PANDEMIA COVID-19
J. Alcamí y E. López-Collazo E. Coronavirus ¿la úlVma Pandemia? Oberón libros, Editorial Anaya 2020

Síntomas de la COVID-19!
Principales síntomas y alteraciones en COVID-19
Generales
- Fiebre
- Cansancio
- Dolores musculares
- Dolor de cabeza
DigesLvos
- Diarrea
Respiratorios
- Tos
- Dolor de garganta
- Diﬁcultad respiratoria
Neurológicos
- Pérdida del gusto y olfato

Di agnóstico d e la COVID- 19!
DiagnósVco de la COVID-19
3-10 días Semana 1 Semana 2 Semana 3 Semana 4 Semana 5 Semana 6
No síntomas Síntomas. Gravedad y duración variable
PCR en faringe posiLva PCR negaLva
AnLcuerpos IgG
AnLcuerpos igM
PCR en heces posiLva
PCR en secreciones bronquiales posiiva
AnLcuerpos negaLvos
IgM IgG

Infección
SARS-CoV-2
AsintomáLco Síntomas leves
Tracto respiratorio superior
Síntomas moderados
Tracto respiratorio inferior
Neumonía no complicada
Síntomas graves
Neumonía severa
Afectacion mulLorgánica
Sepsis viral
Tormenta de citocinas
Trombosis
DisVntos cuadros clínicos en pacientes con infección por SARS-CoV-2
Síntomas de la COVID-19!

Respuesta inmune frente a SARS-CoV-2 La katana del Samurai!
Vabret et al., Immunology of COVID-19: Current State of the Science, Immunity (2020) h[ps://doi.org/10.1016/j.immuni.2020.05.002
Cuadro inﬂamatorio mediado por células de inmunidad adquirida
Agotamiento del sistema inmune

Respuesta inmune frente a SARS-CoV-2 La katana del Samurai!
www.thelancet.com Published online April 17, 2020 h[ps://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30920-X
LA TORMENTA PERFECTA

COVID-19 LA TORMENTA PERFECTA!
Espectro muy variable de enfermedad
•  AsintomáLco 40-60%
•  PaucisintomáLcos 30-50%
•  Enfermedad grave 10%
•  Letalidad 1%
Muy transmisible
•  Número reproducLvo 2-4 (4-6)
•  Número reproducLvo epidémico 15-20
•  Los asintomáLcos transmiten
•  Superpropagación
Afecta a grupos especíﬁcos de población

La lucha contra el SA RS-CoV-2 à Prevención, fármacos y vacunas!
MEDIDAS PREVENTIVAS

MEDIDAS PREVENTIVAS à MASCARILLAS POR FAVOR

MEDIDAS PREVENTIVAS à LAVADO, HIGIENE DE SUPERFICIES

MEDIDAS PREVENTIVAS à DISTANCIA DE SEGURIDAD, DURO PERO NECESARIO

MEDIDAS PREVENTIVAS à DISTANCIA DE SEGURIDAD, DURO PERO NECESARIO
HACER MUCHA PEDAGOGÍA, NO BASTA DEMONIZAR

MEDIDAS PREVENTIVAS à LUCHA CONTRA LA INFODEMIA, BULOS, MENTIRAS, CONSPIRANOICOS

Tr atamiento frente a COVID-19. Ciencia y circo mediático !
Estrategias de desarrollo de fármacos
Reposicionamiento de fármacos ya aprobados
Farmacos frente
a otros coronavirus
Farmacos frente
a otros virus
Farmacos
seleccionados
por ordenador
AcLvidad
SARS-CoV-2
Tratamiento
Descubrimiento de nuevos fármacos
Diana viral Diseño de fármacos Toxicidad animal Estudios farmacológicos Ensayos clínicos

Tr atamiento frente a COVID-19. Ciencia y circo mediático !
ANTIVIRALES
•  Ribavirina
•  Interferones
•  Hidroxicloroquina
•  Remdesivir (¿?)
•  Kaletra
•  Darunavir
ANTI-INFLAMATORIOS (¿?)
•  AnLcuerpos anL-IL6
•  AnLcuerpos anL-IL1
•  Inhibidores de JAK-STAT
•  Inhibidores de Lrosin-cinasas
•  CorLcoides

T Zohar and G Alter, Nature Reviews Immunol 2020
Respuesta inmune frente a SARS-CoV-2 . Produccion de anticuerpos!

Respuesta inmune frente a SARS-CoV-2 . Produccion de anticuerpos!
Respuestas de anVcuerpos
DF Robbiani et al. bioRxiv preprint doi: h[ps://doi.org/10.1101/2020.05.13.092619

Vacunas para SARS-CoV-2 ¿cuándo, cómo y para quién?!
Overview of PotenVal SARS-CoV-2 Vaccine Plaborms
Amanat and Krammer, SARS-CoV-2 Vaccines: Status Report, Immunity (2020), hmps://doi.org/10.1016/ j.immuni.2020.03.007

Vacunas para SARS-CoV-2 ¿cuándo, cómo y para quién?!
Fases en el desarrollo de vacunas
Desarrollo convencional
Modelos
animales
Fase II Fase III
0 6 9 24 15
Desarrollo acelerado
Modelos
animales
Fase I Fase II Fase III
Fase I
Voluntarios
(?)
Producción
12
Producción
SEIS PROTOTIPOS EN OTOÑO
-  Moderna/NIH à ARN
-  Pﬁzer/Biontech à ARN
-  PicoVacc à Virus inacLvado
-  Cansino à Adenovirus 5
-  Oxford/Astra Zéneca à ChimpAdeno
-  Janssen à Adenovirus 26

Lecciones de una pandemia y debates abiertos
Vulnerabilidad de nuestra especie frente a los virus

Impacto ambiental como fuente de epidemias

Que hemos sido arrogantes y supremacistas

Que economía y salud juegan en equipos diferentes

Debilidad tecnológica de Europa

Individualismo en los paises de la Unión Europea

Fallo de las estructuras nacionales e internacionales de Salud Pública
•  OMS
•  ECDC
•  CCDC
Epidemia que afecta más a los más vulnerables

Ha mostrado como toda guerra, solidaridad e insolidaridad

¿EL FUTURO?
Convivir con el virus es una elección que Vene un precio à brotes
La intensidad del brote depende de nosotros à No estamos igual que en marzo

¿EL FUTURO?
La intensidad del brote depende de nosotros

¿EL FUTURO?
La intensidad del brote depende de nosotros
•  Medidas de control
•  Deteccion precoz
•  Seguimiento de casos y contactos
•  UVlización de la tecnología
Enero Febrero Marzo Abril Mayo Junio Julio Agosto Sept Oct Nov Diciembre
Equilibrio muy frágil

¿EL FUTURO?
TODO ESTO PASARÁ
•  Vacunas
•  Tratamientos
APRENDER DE LO VIVIDO
No es salud frente a economía,SALUD=ECONOMÍA
IdenVﬁcar nuestras debilidades y reforzar lo que ha fallado
•  Salud Publica
•  Refuerzo del sistema sanitario
•  Apoyo a la invesVgación
•  Potenciar la biotecnología
•  Replantear la asistencia a la cuarta edad

PREPARARNOS PARA LAS SIGUIENTES PANDEMIAS
•  Lección de humildad à No somos inmunes a las infecciones

Lecciones de una pandemia. Esto no ha terminado todavía
«Escuchando los gritos de alegría que llegaban de la ciudad, Rieux recordaba
que esa alegría está siempre amenazada. Pues sabía lo que esta mulltud
alegre ignoraba y que se puede leer en los libros: que el bacilo de la peste no
muere ni desaparece jamás, que puede permanecer durante decenas de años
durmiendo en los muebles y la ropa, que espera pacientemente en las
habitaciones, las bodegas, los baúles, los pañuelos y los papeles, y que quizá
llegará un día en que, para desgracia y enseñanza de los hombres, la peste
despertará a sus ratas y las enviará a morir en una ciudad feliz».
Albert Camus, La peste.
“Los microbios siempre Lenen la úlLma palabra”
Louis Pasteur

Lecciones de una pandemia. Esto no ha terminado todavía
Blog personal
pepealcamicoronavirus.blogspot.com
@pepealcami

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