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Taxonomía Bacteriana
Maestra Altagracia Jiménez Díaz
Taxonomía
Ciencia que trata de los principios, métodos y
fines de la clasificación, generalmente científica;
se aplica, en especial, dentro de la biología para
la ordenación jerarquizada y sistemática de los
grupos de animales y de vegetales.
• "la taxonomía se ocupa de la clasificación de los
seres vivos, encuadrándolos en categorías
como orden, familia o género"
La taxonomía es la ciencia de la clasificación biológica
La clasificación, que es la ordenación de los seres vivos en grupos o
taxones en función de semejanzas o parentesco evolutivo.
Comprende tres partes independientes pero relacionadas:
La nomenclatura, que se ocupa de asignar nombres a los grupos
taxonómicos de acuerdo con normas establecidas.
La identificación, es el proceso para determinar que un aislamiento
particular pertenece a un taxón reconocido.
(es el lado práctico de la taxonomía)
TAXONOMÍA BACTERIANATAXONOMÍA BACTERIANA
TAXONOMÍA BACTERIANA
• 1- CLASIFICACIÓN
• La categoría taxonómica básica en la clasificación es la
ESPECIE, integrada por un grupo de individuos que
comparten cierto número de características destacadas
ó presentan un gran parecido.
• Las agrupaciones de individuos de la misma especie se
denominan en microbiología cepas ó clones. Una cepa
es un cultivo puro derivado de un solo aislamiento. Clon
es un cultivo puro formado por los
descendientes de una sola bacteria.
TAXONOMÍA BACTERIANA
• 1- CLASIFICACIÓN
• La categoría taxonómica básica en la clasificación es la
ESPECIE, integrada por un grupo de individuos que
comparten cierto número de características destacadas
ó presentan un gran parecido.
• Las agrupaciones de individuos de la misma especie se
denominan en microbiología cepas ó clones. Una cepa
es un cultivo puro derivado de un solo aislamiento. Clon
es un cultivo puro formado por los
descendientes de una sola bacteria.
• 2- TIPOS DE CLASIFICACIONES
• 2.1. Clasificaciones artificiales
• Las primeras clasificaciones bacterianas
se basan en la ordenación con fines
prácticos de las diferentes especies
creadas por la agrupación de cepas
caracterizadas por su igualdad o
semejanza de algunas características
básicas:
• 2.2. Clasificación numérica
• Consiste en determinar un gran número de
características independientes, 100 a 120, de todas las
cepas en estudio y se establece por comparación de los
datos obtenidos un coeficiente de semejanza que en el
caso de dos cepas idénticas será del 100 %.
• Gracias a los ordenadores esta técnica se ha
simplificado mucho y con ella se han confirmado la
mayoría de las especies consideradas como tales por
los métodos clásicos.
• 2.3. Clasificaciones con base genética
• La primera utilizada tiene en cuenta la
proporción de bases nitrogenadas del
ADN cromosómico bacteriano: G-C y A-T.
Si dos especies bacterianas difieren en su
contenido G+C en más de un 10 % no
pueden considerarse afines.
• Más adecuado para precisar pequeñas
diferencias de unas especies bacterianas
a otras, es el método de hibridación
molecular.
• Este método permite establecer el grado
de homología en la secuencia de bases
del ADN y los datos obtenidos se
emplearon en la clasificación adoptada en
la última edición (1984) del Manual de
Bergey .
• El Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology es un
tratado que se ocupa de la clasificación, taxonomía e
identificación de las bacterias.
• Se divide en cuatro volúmenes y las bacterias se
distribuyen en secciones. Las distintas secciones se han
constituido sobre la base de caracteres descriptivos
morfológicos y metabólicos, por ejemplo: espiroquetas,
cocos y bacilos aerobios gramnegativos, cocos
grampositivos etc.
3- NOMENCLATURA
• Existe un código internacional de
nomenclatura de las bacterias que refleja
la necesidad de que las bacterias reciban
nombres fijos que eviten confusión ó error
y se constituyan como nombres latinos o
latinizados.
• Según este código el nombre de especie
es una combinación binaria que consta
del nombre del género seguido de un
único epíteto específico, por ejemplo,
• Propiedades visibles. forma, color, tamaño, tinción,
movilidad, presencia de cápsula y morfología de las
colonias.
• Características metabólicas
• Formación de productos químicos característicos
• Nutrición
• Presencia de macromoléculas artificiales ( antígenos )
• Relaciones ecológicas: producción de enfermedades,
parasitismo...
•
• El GÉNERO está formado por un grupo
de especies relacionadas .Un grupo de
géneros estrechamente relacionados
constituyen una FAMILIA.
• Las categorías taxonómicas superiores se
definen de igual manera y son las
siguientes: ORDEN, CLASE, DIVISIÓN Y
REINO.
♦ Al preparar un sistema de clasificación, se ubican todos los
microorganismos en grupos homogéneos, que a su vez pertenecen a
otro grupo más extenso siguiendo una estructura jerárquica sin
superposiciones.
♦ Una categoría de cualquier rango une grupos de nivel inferior en
función de propiedades comunes.
♦ En la taxonomía bacteriana los niveles o rangos utilizados son los
siguientes (en orden ascendente):
● ESPECIE
● GÉNERO
● FAMILIA
● ORDEN
● CLASE
● REINO
● DOMINIO
El grupo taxonómico básico es la ESPECIE
Definición de especie
ESPECIE es un grupo de poblaciones naturales que se reproducen entre si
y que están aisladas de otros grupos desde el punto de vista de la
reproducción.
ESPECIE BACTERIANA es una colección de cepas que comparten numerosas
propiedades estables y que difieren de forma significativa de otros grupos de
cepas.
Una CEPA es una población de microorganismos que desciende de un único
organismo o de un aislamiento en cultivo puro.
Cada especie se asigna a un GÉNERO, el siguiente rango de la jerarquía
taxonómica.
Un GÉNERO es un grupo bien definido de una o más especies que está
claramente separado de otros géneros.
Para los taxónomos que trabajan con organismos superiores
Para los microbiólogos
NOMENCLATURA
☻Los microbiólogos asignan nombre a los microorganismos de acuerdo
con el SISTEMA BINOMIAL del botánico sueco Carl Von Linneo.
☻ El nombre latinizado y en cursiva consta de dos partes:
El primer nombre, escrito con mayúscula, es el nombre genérico.
El segundo nombre, en minúscula, es el epíteto de la especie.
Escherichia coli
☻ A menudo se abrevia el nombre genérico con una letra mayúscula
E. coli
ESTRUCTURACIÓN JERÁRQUICA EN TAXONOMÍA
Rango Nombre taxonómico
Dominio
Phylum o
Reino
Clase
Orden
Familia
Género
Especie
Bacteria
Proteobacteria
γ-Proteobacteria
Enterobacteriales
Enterobacteriaceae
Shigella
S. dysenteriae
SISTEMAS DE CLASIFICACIÓN
☺Las características taxonómicas de los microorganismos se utilizan
para formar un sistema de clasificación.
☺ Existen dos formas generales para elaborar un sistema de clasificación:
SISTEMA FENÉTICO
☺ Los microorganismos se agrupan en función de semejanzas en sus
características fenotípicas.
☺Los microorganismos que comparten muchas características forman un
único taxón.
SISTEMA FILOGENÉTICO
☺Los microorganismos se agrupan en función de probables relaciones
evolutivas.
☺Es difícil de realizar para las bacterias debido a la falta de registros fósiles.
PRINCIPALES CARACTERÍSTICAS APLICADAS EN TAXONOMÍA BACTERIANA
CARACTERÍSTICAS
CLÁSICAS
MORFOLÓGICAS Forma celular
Tamaño de las células
Morfología de las colonias
Características ultraestructurales
Tinción
Cilios y flagelos
Mecanismo de movilidad
Forma y localización de endoesporas
Inclusiones celulares
color
FISIOLOGICAS Y
METABÓLICAS
Fuentes de C y N
Componentes de la pared celular
Fuentes de energía
Productos de fermentación
Tipo nutricional
Temperatura de crecimiento
Luminiscencia
Mecanismo de conversión de energía
Movilidad
Tolerancia osmótica
Relaciones con el oxígeno
pH óptimo de crecimiento
Pigmentos fotosintéticos
Necesidad y tolerancia a la sal
Metabolitos secundarios
Sensibilidad a antibióticos
ECOLÓGICAS
Ciclo vital
Relaciones simbióticas
Patogenicidad
Preferencia de hábitat
Necesidad de temperatura; pH;
Necesidad de oxígeno
Necesidad de concentración osmótica
GENÉTICAS
Posibilidad de recombinación por
Conjugación o
Transformación
Plásmidos
Identificación de una bacteria entérica
mediante técnicas microbiológicas clásicas
utilizando exclusivamente criterios
fenotípicos.
La mayoría de los pasos a seguir
requieren que el microorganismo crezca
en cultivo puro.
PRINCIPALES CARACTERÍSTICAS APLICADAS EN TAXONOMÍA BACTERIANA
CARACTERÍSTICAS
MOLECULARES
COMPARACIÓN DE
PROTEÍNAS
HIBRIDACIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS
SECUENCIACIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS
COMPOSICIÓN DE ÁCIDOS
NUCLÉICOS
(CONTENIDO EN G+C)
Estructura secundaria del ARNr 16/18 S de los tres Dominios
☺ Los puntos rojos señalan posiciones en las que arqueas y bacterias suelen diferir
Bacteria Archaea Eucarya
Árbol filogenético de todos los seres vivos
Característica Bacteria Archaea Eukarya
- Estructura celular procariótica
- ADN circular
- Histonas
- Núcleo rodeado de membrana
Sí
Sí
No
Ausente
Sí
Sí
Sí
Ausente
No
No
Sí
Presente
- Pared celular de peptidoglicano
- Lípidos de membrana
- Ribosomas
- Intrones
Sí
Enlaces éster
70S
No
No
Enlaces éter
70S
No
No
Enlaces éster
80S
Sí
- Plásmidos
- Sensibilidad de ribosomas a la
toxina diftérica
- Sensibilidad a cloranfenicol,
estreptomicina y kanamicina
Si
No
Sí
Sí
Sí
No
Raro
Sí
No
- Metanogénesis
- Reducción desasimilativa de
sulfatos y férrico
- Nitrificación
- Desnitrificación
No
Sí
Sí
Sí
Sí
Sí
No
Sí
No
No
No
No
- Fijación de nitrógeno
- Fotosíntesis oxigénica
- Quimiolitotrofía
- Vesículas de gas
- Sintesis de gránulos de reserva
de carbono (β-hidroxialcanoatos)
- Crecimiento por encima de 80º
Sí
Sí
Sí
Sí
Sí
Sí
Sí
No
Sí
Sí
Sí
Sí
No
Sí (en cloroplastos)
No
No
No
No
Resumen de las principales características diferenciales entre Bacteria, Archaea y Eukarya
Arbol filogenético de los principales linajes de Bacteria basado
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  • 2.
  • 3.
  • 4. Taxonomía Ciencia que trata de los principios, métodos y fines de la clasificación, generalmente científica; se aplica, en especial, dentro de la biología para la ordenación jerarquizada y sistemática de los grupos de animales y de vegetales. • "la taxonomía se ocupa de la clasificación de los seres vivos, encuadrándolos en categorías como orden, familia o género"
  • 5. La taxonomía es la ciencia de la clasificación biológica La clasificación, que es la ordenación de los seres vivos en grupos o taxones en función de semejanzas o parentesco evolutivo. Comprende tres partes independientes pero relacionadas: La nomenclatura, que se ocupa de asignar nombres a los grupos taxonómicos de acuerdo con normas establecidas. La identificación, es el proceso para determinar que un aislamiento particular pertenece a un taxón reconocido. (es el lado práctico de la taxonomía) TAXONOMÍA BACTERIANATAXONOMÍA BACTERIANA
  • 6. TAXONOMÍA BACTERIANA • 1- CLASIFICACIÓN • La categoría taxonómica básica en la clasificación es la ESPECIE, integrada por un grupo de individuos que comparten cierto número de características destacadas ó presentan un gran parecido. • Las agrupaciones de individuos de la misma especie se denominan en microbiología cepas ó clones. Una cepa es un cultivo puro derivado de un solo aislamiento. Clon es un cultivo puro formado por los descendientes de una sola bacteria.
  • 7. TAXONOMÍA BACTERIANA • 1- CLASIFICACIÓN • La categoría taxonómica básica en la clasificación es la ESPECIE, integrada por un grupo de individuos que comparten cierto número de características destacadas ó presentan un gran parecido. • Las agrupaciones de individuos de la misma especie se denominan en microbiología cepas ó clones. Una cepa es un cultivo puro derivado de un solo aislamiento. Clon es un cultivo puro formado por los descendientes de una sola bacteria.
  • 8. • 2- TIPOS DE CLASIFICACIONES • 2.1. Clasificaciones artificiales • Las primeras clasificaciones bacterianas se basan en la ordenación con fines prácticos de las diferentes especies creadas por la agrupación de cepas caracterizadas por su igualdad o semejanza de algunas características básicas:
  • 9. • 2.2. Clasificación numérica • Consiste en determinar un gran número de características independientes, 100 a 120, de todas las cepas en estudio y se establece por comparación de los datos obtenidos un coeficiente de semejanza que en el caso de dos cepas idénticas será del 100 %. • Gracias a los ordenadores esta técnica se ha simplificado mucho y con ella se han confirmado la mayoría de las especies consideradas como tales por los métodos clásicos.
  • 10. • 2.3. Clasificaciones con base genética • La primera utilizada tiene en cuenta la proporción de bases nitrogenadas del ADN cromosómico bacteriano: G-C y A-T. Si dos especies bacterianas difieren en su contenido G+C en más de un 10 % no pueden considerarse afines.
  • 11. • Más adecuado para precisar pequeñas diferencias de unas especies bacterianas a otras, es el método de hibridación molecular. • Este método permite establecer el grado de homología en la secuencia de bases del ADN y los datos obtenidos se emplearon en la clasificación adoptada en la última edición (1984) del Manual de Bergey .
  • 12. • El Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology es un tratado que se ocupa de la clasificación, taxonomía e identificación de las bacterias. • Se divide en cuatro volúmenes y las bacterias se distribuyen en secciones. Las distintas secciones se han constituido sobre la base de caracteres descriptivos morfológicos y metabólicos, por ejemplo: espiroquetas, cocos y bacilos aerobios gramnegativos, cocos grampositivos etc.
  • 13. 3- NOMENCLATURA • Existe un código internacional de nomenclatura de las bacterias que refleja la necesidad de que las bacterias reciban nombres fijos que eviten confusión ó error y se constituyan como nombres latinos o latinizados. • Según este código el nombre de especie es una combinación binaria que consta del nombre del género seguido de un único epíteto específico, por ejemplo,
  • 14. • Propiedades visibles. forma, color, tamaño, tinción, movilidad, presencia de cápsula y morfología de las colonias. • Características metabólicas • Formación de productos químicos característicos • Nutrición • Presencia de macromoléculas artificiales ( antígenos ) • Relaciones ecológicas: producción de enfermedades, parasitismo... •
  • 15. • El GÉNERO está formado por un grupo de especies relacionadas .Un grupo de géneros estrechamente relacionados constituyen una FAMILIA. • Las categorías taxonómicas superiores se definen de igual manera y son las siguientes: ORDEN, CLASE, DIVISIÓN Y REINO.
  • 16. ♦ Al preparar un sistema de clasificación, se ubican todos los microorganismos en grupos homogéneos, que a su vez pertenecen a otro grupo más extenso siguiendo una estructura jerárquica sin superposiciones. ♦ Una categoría de cualquier rango une grupos de nivel inferior en función de propiedades comunes. ♦ En la taxonomía bacteriana los niveles o rangos utilizados son los siguientes (en orden ascendente): ● ESPECIE ● GÉNERO ● FAMILIA ● ORDEN ● CLASE ● REINO ● DOMINIO El grupo taxonómico básico es la ESPECIE
  • 17.
  • 18.
  • 19. Definición de especie ESPECIE es un grupo de poblaciones naturales que se reproducen entre si y que están aisladas de otros grupos desde el punto de vista de la reproducción. ESPECIE BACTERIANA es una colección de cepas que comparten numerosas propiedades estables y que difieren de forma significativa de otros grupos de cepas. Una CEPA es una población de microorganismos que desciende de un único organismo o de un aislamiento en cultivo puro. Cada especie se asigna a un GÉNERO, el siguiente rango de la jerarquía taxonómica. Un GÉNERO es un grupo bien definido de una o más especies que está claramente separado de otros géneros. Para los taxónomos que trabajan con organismos superiores Para los microbiólogos
  • 20. NOMENCLATURA ☻Los microbiólogos asignan nombre a los microorganismos de acuerdo con el SISTEMA BINOMIAL del botánico sueco Carl Von Linneo. ☻ El nombre latinizado y en cursiva consta de dos partes: El primer nombre, escrito con mayúscula, es el nombre genérico. El segundo nombre, en minúscula, es el epíteto de la especie. Escherichia coli ☻ A menudo se abrevia el nombre genérico con una letra mayúscula E. coli
  • 21. ESTRUCTURACIÓN JERÁRQUICA EN TAXONOMÍA Rango Nombre taxonómico Dominio Phylum o Reino Clase Orden Familia Género Especie Bacteria Proteobacteria γ-Proteobacteria Enterobacteriales Enterobacteriaceae Shigella S. dysenteriae
  • 22. SISTEMAS DE CLASIFICACIÓN ☺Las características taxonómicas de los microorganismos se utilizan para formar un sistema de clasificación. ☺ Existen dos formas generales para elaborar un sistema de clasificación: SISTEMA FENÉTICO ☺ Los microorganismos se agrupan en función de semejanzas en sus características fenotípicas. ☺Los microorganismos que comparten muchas características forman un único taxón. SISTEMA FILOGENÉTICO ☺Los microorganismos se agrupan en función de probables relaciones evolutivas. ☺Es difícil de realizar para las bacterias debido a la falta de registros fósiles.
  • 23. PRINCIPALES CARACTERÍSTICAS APLICADAS EN TAXONOMÍA BACTERIANA CARACTERÍSTICAS CLÁSICAS MORFOLÓGICAS Forma celular Tamaño de las células Morfología de las colonias Características ultraestructurales Tinción Cilios y flagelos Mecanismo de movilidad Forma y localización de endoesporas Inclusiones celulares color FISIOLOGICAS Y METABÓLICAS Fuentes de C y N Componentes de la pared celular Fuentes de energía Productos de fermentación Tipo nutricional Temperatura de crecimiento Luminiscencia Mecanismo de conversión de energía Movilidad Tolerancia osmótica Relaciones con el oxígeno pH óptimo de crecimiento Pigmentos fotosintéticos Necesidad y tolerancia a la sal Metabolitos secundarios Sensibilidad a antibióticos ECOLÓGICAS Ciclo vital Relaciones simbióticas Patogenicidad Preferencia de hábitat Necesidad de temperatura; pH; Necesidad de oxígeno Necesidad de concentración osmótica GENÉTICAS Posibilidad de recombinación por Conjugación o Transformación Plásmidos
  • 24. Identificación de una bacteria entérica mediante técnicas microbiológicas clásicas utilizando exclusivamente criterios fenotípicos. La mayoría de los pasos a seguir requieren que el microorganismo crezca en cultivo puro.
  • 25. PRINCIPALES CARACTERÍSTICAS APLICADAS EN TAXONOMÍA BACTERIANA CARACTERÍSTICAS MOLECULARES COMPARACIÓN DE PROTEÍNAS HIBRIDACIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS SECUENCIACIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS COMPOSICIÓN DE ÁCIDOS NUCLÉICOS (CONTENIDO EN G+C)
  • 26. Estructura secundaria del ARNr 16/18 S de los tres Dominios ☺ Los puntos rojos señalan posiciones en las que arqueas y bacterias suelen diferir Bacteria Archaea Eucarya
  • 27. Árbol filogenético de todos los seres vivos
  • 28. Característica Bacteria Archaea Eukarya - Estructura celular procariótica - ADN circular - Histonas - Núcleo rodeado de membrana Sí Sí No Ausente Sí Sí Sí Ausente No No Sí Presente - Pared celular de peptidoglicano - Lípidos de membrana - Ribosomas - Intrones Sí Enlaces éster 70S No No Enlaces éter 70S No No Enlaces éster 80S Sí - Plásmidos - Sensibilidad de ribosomas a la toxina diftérica - Sensibilidad a cloranfenicol, estreptomicina y kanamicina Si No Sí Sí Sí No Raro Sí No - Metanogénesis - Reducción desasimilativa de sulfatos y férrico - Nitrificación - Desnitrificación No Sí Sí Sí Sí Sí No Sí No No No No - Fijación de nitrógeno - Fotosíntesis oxigénica - Quimiolitotrofía - Vesículas de gas - Sintesis de gránulos de reserva de carbono (β-hidroxialcanoatos) - Crecimiento por encima de 80º Sí Sí Sí Sí Sí Sí Sí No Sí Sí Sí Sí No Sí (en cloroplastos) No No No No Resumen de las principales características diferenciales entre Bacteria, Archaea y Eukarya
  • 29. Arbol filogenético de los principales linajes de Bacteria basado en la comparación de secuencias de ARNr 16S
  • 30. Nomenclatura Los grupos o taxas mas utilizados en bacteriología son: Familia, genero y especies

Notas del editor

  1. Figure: 11-17 Caption: Example of methods that would be used for identification of a newly isolated enteric bacterium, using classic microbiological methods (the example given shows the procedures that would be used for identifying Escherichia coli). Note that most of the analyses here require that the organisms be grown in pure culture and that solely phenotypic criteria be used in the identification. A description of biochemical tests is presented in Chapter 24 (Section 24.2, Table 24.3, and Figure 24.7).
  2. Figure: 11-13 Caption: Universal phylogenetic tree as determined from comparative ribosomal RNA sequencing. Only a few key organisms or lineages are shown in each domain. For detailed domain trees refer to Figures 12.1, 13.1, and 14.11. Of the three domains, two (Bacteria and Archaea) contain only prokaryotic representatives. The location highlighted in red is the hypothetical root of the tree, which represents the position of the universal ancestor of all cells.