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Mg. Débora Alvarado Iparraguirre
Lab. Microbiología Molecular y Biotecnología
Facultad de Ciencias Biológicas - UNMSM
   Los antibióticos son probablemente una de las más
    exitosas formas de quimioterapia en la historia de la
    medicina.
   Como resultado de su uso la tasa de muerte por
    infecciones en humanos declinó rápidamente.
   Para fines de los 1960’s la comunidad médica
    consideraba que las enfermedades infecciosas
    habían sido conquistadas.



                 Lab Microbiol Molecular y Biotecnología - UNMSM
Para 1997 la tasa de muerte por
                                     TBC fue de < 0.4 por 100,000.




                        Fig 13.2




Lab Microb Molecular y Biotecnol
UNMSM
   Alexander fleming reconoció el potencial peligro de la
    resistencia a antibiótico.
    En 1945, advirtió que el mal uso de la penicilina podía
    conducir a la selección y propagación de formas mutantes
    de bacterias resistentes a la droga…

   La primera bacteria resistente
    a la penicilina apareció varios
    años después.
     Su gen mutante codifica para la
      penicilinasa.




                       Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
Atlas and Bartha,
                                                               1998




El desarrollo de la resistencia a penicilina
fue increiblemente rápido en poblaciones
   de gonococos de 1980 hasta1990.
        Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
   Hay evidencia clara de que el uso de antibióticos
    selecciona la resistencia en la bacteria.
   Se ha encontrado que la incidencia de bacterias
    resistentes a antibióticos es mayor en pacientes
    que han sido tratados previamente con ese
    antibiótico.
     Ej. la incidencia de bacterias resistentes a isoniazida es
      21% en casos de recaída para TBC, pero solamente 8%
      en nuevos casos.


                      Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
Perez. 2007.




Acinetobacter isolates resistant to carbapenems Meropenem Yearly
    Susceptibility Test Information Collection [MYSTIC], 2004).
Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
Bacteria Susceptible


Bacteria Resistente




                          Mutaciones




                                                          XX
Transferencia Génica de
Resistencia

                              Nueva Bacteria Resistente
Son tres mecanismos:
1. Adquisición de genes de resistencia completos o
   genes complejos vía plásmidos y otros elementos
   transposables.
2. Recombinación de DNA de otra bacteria en el
   genoma por transformation.
3. Eventos mutacionales espontáneos en el
   cromosoma y/o el DNA accesorio.
              Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
Overview of plasmids
  and conjugative
   transfer in the
horizontal spread of
       genes



      Thomas & Nielsen,
                 2005.




 Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
Penicillin                   Methicillin Methicillin-
                    Penicillin-resistant           resistant
S. aureus
           [1950s]     S. aureus         [1970s] S. aureus (MRSA)

                                                       Vancomycin
                                     [1997]

                                                     [1990s]

Vancomycin                Vancomycin       Vancomycin-resistant
     -
               [ 2002 ]
   resistant              intermediate-     enterococci (VRE)
  S. aureus                 resistant
                            S. aureus
                             (VISA)
Linda Weigel and Fred
Tenover of CDC, Science
2002




           Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
Transformación
     natural de
      bacterias
    receptoras.




Thomas & Nielsen, 2005.
Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
Lab Microb Molecular y Biotecnol -UNMSM
   Los eventos mutacionales se asumen que son
    estocásticos, de manera que la tasa de mutación
    beneficiosa no ocurre a una mayor frecuencia que la
    que es neutra o desventajosa, y que las mutaciones no
    son dirigidas.
   Para las células bacterianas, hay una probabilidad
    finita de que una mutación confiera un fenotipo de
    resistencia, y a menos que se produzca una mutación
    revertiente, todos los descendientes de esa célula
    serán también resistentes.

                  Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
Plasmid                                Integron
                     transfer
     Homologous
                                                             action
                                                                              Point
     recombination
                                         Transposition                       mutation


   *10-1       10-2        10-3       10-4         10-5      10-6    10-7    10-8

   High frequency                                                      Low frequency

* As frequency per cell per generation


                            Lab Microb Molecular y Biotecnol UNMSM
   La evolución a través de la selección natural
    puede ocurrir remarcadamente rápido
    cuando las presiones selectivas son muy
    fuertes y las tasas reproductivas son muy
    rápidas.
     Algunas generaciones de bacterias sólo duran
      entre 15-20 minutos!.




                Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
Hospital




Ambientes              Ambientes
                       no clínicos
ecológicos en la
resistencia a
antibióticos.




Martinez, 2009.
                                                              Naturaleza


                   Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
Unidades de
                                            cuidado intensivo
                                                parecen tener
                                              particularmente
                                         altas incidencias de
                                            microorganismos
                                                 resistentes.




                                                 Atlas, 1997
Lab Microb Molecular y Biotecnol UNMSM
   Cantidades tremendas de
    antibióticos son producidas y
    liberadas al ambiente.
   Son utilizados 90 – 180 millones
    kg/año de antibióticos
    (suficiente para 25 BILLONES de
    tratamientos completos (~ 4 por
    humano/año!)


    Cerca de 10 veces más antibióticos son utilizados en
    agricultura que en el tratamiento humano. Levy (1997),
    estimó que era 30 veces más en animales que en personas).
                      Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
Lab Microb Molecular y Biotecnol UNMSM
Hawkey, 2009.




Flujo de los genes de resistencia a antibióticos en E.
                 coli en la biósfera.
Martinez, 2009.




                                           Mantenimiento de
                                              la resistencia a
                                                   antibióticos
                                              plataformas en
                                                  ausencia de
                                            presión selectiva
                                                 a antibiótico.


Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
   Los genes que codifican para la resistencia a
    antibióticos estuvieron en el pool génico humano
    antes de que éstos comenzaran a producir
    antibióticos.
   El análisis filogenético de varios grupos de genes
    de resistencia a antibióticos sugiere que el
    material genético de resistencia ha tenido una
    larga historia de selección y diversificación, aún
    antes de la “era antibiótica”.
                  Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
   Los β lactámicos son los antibióticos más ampliamente
    utilizados para un amplio rango de infecciones.
   Las β-Lactamasas rompen la molécula dentro de un
    mecanismo de resistencia primaria.
   Las β-Lactamasas son moléculas muy antiguas.
     Fevre et al. (2005), reportan que los genes de estas enzimas en
      Klebsiella oxytoca han evolucionado por más de 100 millones
      de años en su hospedero.
     Song et al. (2005), reportan una colección de genes antiguos
      en un estudio metagenómico del suelo congelado de Alaska.
   Estos genes codificaban otras funciones celulares.
   Algunas bacterias del suelo subsisten usando a
    los antibióticos como única fuente de carbono.
   En ambientes oligotróficos los antibióticos
    participan en señalamientos y tienen roles
    regulatorios en comunidades microbianas.
   Pseudomonas fluorescentes producen
    antibióticos en rizósfera para competir con otros
    microorganismos (fenazinas, lipopéptidos
    cíclicos, floroglucinoles, etc.).
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   Que las tasas de resistencia caigan cuando el uso de la
    Penicilina baja, sugiere que la resistencia impone un
    costo a la bacteria.
   Si el costo es alto, la bacteria no resistente tendría una
    ventaja en un ambiente libre de penicilina.
   Los costos de la resistencia sugiere que la suspensión del
    uso de un antibiótico dirigiría la evolución de las
    poblaciones de nuevo a un estado de no-resistencia.



                    Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
   A fines de los 80’s y principios
    de los 90’s los niveles de
    resistencia a la penicilina en S.
    pneumoniae en Islandia subió
    pronunciadamente.
     Cuando las autoridades de salud
      hicieron campaña para reducir el
      uso del antibiótico, el uso de la
      Penicilina descendió 13%
      bajando al mismo tiempo las
      tasas de resistencia bacteriana.
     Pero no se alcanzó la situación
      inicial…
                       Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
   La bacteria resistente puede también
    evolucionar para reducir o eliminar los costos
    de la resistencia y de esta manera no quedar
    fuera de competencia con las cepas no
    resistentes.
   Esto fue confirmado por Schrag et al.
    (1997)estudiando la sensibilidad-resistencia a la
    estreptomicina en E. coli.


                Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
   Los resultados de Schrag et al. (1997) sugieren
    que no hay garantía de que las poblaciones
    bacterianas puedan restaurar su vulnerabilidad
    con la restricción del uso de un antibiótico.




                 Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
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   Las compañías farmacéuticas tienen poco incentivo
    financiero para el desarrollo de nuevos antibióticos y
    en la gestión de la resistencia.
   Los nuevos antibióticos están protegidos por
    patentes por lo que los costos que generan el
    descubrimiento y desarrollo de los antibióticos así
    como el requisito de ensayos clínicos a largo plazo,
    son mayores que los beneficios.
     Muchas compañías farmacéuticas han abandonado el
      rubro de los antibióticos.
                      Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
Tendencias en el desarrollo de nuevos
antibacterianos
                                                                *R2 = 0.99

                            18
                            16
                            14
Total # New Antibacterial




                            12
                            10
                             8
                             6
                             4
Agents




                             2
                             0
                                 1983-1987    1988-1992       1993-1997      1998-2002

                            *p = 0.007 by linear regression
                                                                             Edwards , 2003
   Reducir la tasa de infección.
     Evitar por ej. huevos y carne crudos; lavado de las manos para
      disminuir la diseminación de la enfermedad).
   Uso limitado de jabones antibacterianos y desinfectantes.
   Los médicos deberían evitar la prescripción de antibióticos
    para infecciones virales.
     En lo posible utilizar drogas de espectro restringido.
   El uso de antibióticos en la alimentación animal debería ser
    eliminado.
   Técnicas de diagnóstico más precisos permitiría el uso de
    antibióticos con prudencia o limitar su uso.
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   2000 A.C. – Toma, come esta raíz.
   1000 D.C. –Esa raíz es idolatría. Toma, repite esta oración.
   1850 D.C. – Esa oración es superstición. Toma, bebe esta poción.
   1920 D.C. – Esa poción es aceite de serpiente. Toma, traga esta
    píldora.
   1945 D.C. – Esa píldora es inefectiva. Toma,aprovecha la penicilina.
   1955 D.C. – Ups....los bichos mutaron. Ahora tienes la tetraciclina.
   1960-1999 – 39 “ups“más ...Toma, aquí tienes antibióticos más
    poderosos.
   2000 D.C. – Los bichos ganaron! Toma, come esta raíz.
                                                        — Anónimo
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Evolution de la resistencia a antibióticos

  • 1. Mg. Débora Alvarado Iparraguirre Lab. Microbiología Molecular y Biotecnología Facultad de Ciencias Biológicas - UNMSM
  • 2. Los antibióticos son probablemente una de las más exitosas formas de quimioterapia en la historia de la medicina.  Como resultado de su uso la tasa de muerte por infecciones en humanos declinó rápidamente.  Para fines de los 1960’s la comunidad médica consideraba que las enfermedades infecciosas habían sido conquistadas. Lab Microbiol Molecular y Biotecnología - UNMSM
  • 3. Para 1997 la tasa de muerte por TBC fue de < 0.4 por 100,000. Fig 13.2 Lab Microb Molecular y Biotecnol UNMSM
  • 4. Alexander fleming reconoció el potencial peligro de la resistencia a antibiótico.  En 1945, advirtió que el mal uso de la penicilina podía conducir a la selección y propagación de formas mutantes de bacterias resistentes a la droga…  La primera bacteria resistente a la penicilina apareció varios años después.  Su gen mutante codifica para la penicilinasa. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 5. Atlas and Bartha, 1998 El desarrollo de la resistencia a penicilina fue increiblemente rápido en poblaciones de gonococos de 1980 hasta1990. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 6. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 7. Hay evidencia clara de que el uso de antibióticos selecciona la resistencia en la bacteria.  Se ha encontrado que la incidencia de bacterias resistentes a antibióticos es mayor en pacientes que han sido tratados previamente con ese antibiótico.  Ej. la incidencia de bacterias resistentes a isoniazida es 21% en casos de recaída para TBC, pero solamente 8% en nuevos casos. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 8. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 9. Perez. 2007. Acinetobacter isolates resistant to carbapenems Meropenem Yearly Susceptibility Test Information Collection [MYSTIC], 2004).
  • 10. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 11. Bacteria Susceptible Bacteria Resistente Mutaciones XX Transferencia Génica de Resistencia Nueva Bacteria Resistente
  • 12. Son tres mecanismos: 1. Adquisición de genes de resistencia completos o genes complejos vía plásmidos y otros elementos transposables. 2. Recombinación de DNA de otra bacteria en el genoma por transformation. 3. Eventos mutacionales espontáneos en el cromosoma y/o el DNA accesorio. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 13. Overview of plasmids and conjugative transfer in the horizontal spread of genes Thomas & Nielsen, 2005. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 14. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 15. Penicillin Methicillin Methicillin- Penicillin-resistant resistant S. aureus [1950s] S. aureus [1970s] S. aureus (MRSA) Vancomycin [1997] [1990s] Vancomycin Vancomycin Vancomycin-resistant - [ 2002 ] resistant intermediate- enterococci (VRE) S. aureus resistant S. aureus (VISA)
  • 16. Linda Weigel and Fred Tenover of CDC, Science 2002 Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 17. Transformación natural de bacterias receptoras. Thomas & Nielsen, 2005.
  • 18. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 19. Lab Microb Molecular y Biotecnol -UNMSM
  • 20. Los eventos mutacionales se asumen que son estocásticos, de manera que la tasa de mutación beneficiosa no ocurre a una mayor frecuencia que la que es neutra o desventajosa, y que las mutaciones no son dirigidas.  Para las células bacterianas, hay una probabilidad finita de que una mutación confiera un fenotipo de resistencia, y a menos que se produzca una mutación revertiente, todos los descendientes de esa célula serán también resistentes. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 21. Plasmid Integron transfer Homologous action Point recombination Transposition mutation *10-1 10-2 10-3 10-4 10-5 10-6 10-7 10-8 High frequency Low frequency * As frequency per cell per generation Lab Microb Molecular y Biotecnol UNMSM
  • 22. La evolución a través de la selección natural puede ocurrir remarcadamente rápido cuando las presiones selectivas son muy fuertes y las tasas reproductivas son muy rápidas.  Algunas generaciones de bacterias sólo duran entre 15-20 minutos!. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 23. Hospital Ambientes Ambientes no clínicos ecológicos en la resistencia a antibióticos. Martinez, 2009. Naturaleza Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 24. Unidades de cuidado intensivo parecen tener particularmente altas incidencias de microorganismos resistentes. Atlas, 1997 Lab Microb Molecular y Biotecnol UNMSM
  • 25. Cantidades tremendas de antibióticos son producidas y liberadas al ambiente.  Son utilizados 90 – 180 millones kg/año de antibióticos (suficiente para 25 BILLONES de tratamientos completos (~ 4 por humano/año!) Cerca de 10 veces más antibióticos son utilizados en agricultura que en el tratamiento humano. Levy (1997), estimó que era 30 veces más en animales que en personas). Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 26. Lab Microb Molecular y Biotecnol UNMSM
  • 27. Hawkey, 2009. Flujo de los genes de resistencia a antibióticos en E. coli en la biósfera.
  • 28. Martinez, 2009. Mantenimiento de la resistencia a antibióticos plataformas en ausencia de presión selectiva a antibiótico. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 29. Los genes que codifican para la resistencia a antibióticos estuvieron en el pool génico humano antes de que éstos comenzaran a producir antibióticos.  El análisis filogenético de varios grupos de genes de resistencia a antibióticos sugiere que el material genético de resistencia ha tenido una larga historia de selección y diversificación, aún antes de la “era antibiótica”. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 30. Los β lactámicos son los antibióticos más ampliamente utilizados para un amplio rango de infecciones.  Las β-Lactamasas rompen la molécula dentro de un mecanismo de resistencia primaria.  Las β-Lactamasas son moléculas muy antiguas.  Fevre et al. (2005), reportan que los genes de estas enzimas en Klebsiella oxytoca han evolucionado por más de 100 millones de años en su hospedero.  Song et al. (2005), reportan una colección de genes antiguos en un estudio metagenómico del suelo congelado de Alaska.  Estos genes codificaban otras funciones celulares.
  • 31. Algunas bacterias del suelo subsisten usando a los antibióticos como única fuente de carbono.  En ambientes oligotróficos los antibióticos participan en señalamientos y tienen roles regulatorios en comunidades microbianas.  Pseudomonas fluorescentes producen antibióticos en rizósfera para competir con otros microorganismos (fenazinas, lipopéptidos cíclicos, floroglucinoles, etc.). Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 32. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 33. Lab Microb Molecular y Biotecnol UNMSM
  • 34. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 35. Que las tasas de resistencia caigan cuando el uso de la Penicilina baja, sugiere que la resistencia impone un costo a la bacteria.  Si el costo es alto, la bacteria no resistente tendría una ventaja en un ambiente libre de penicilina.  Los costos de la resistencia sugiere que la suspensión del uso de un antibiótico dirigiría la evolución de las poblaciones de nuevo a un estado de no-resistencia. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 36. A fines de los 80’s y principios de los 90’s los niveles de resistencia a la penicilina en S. pneumoniae en Islandia subió pronunciadamente.  Cuando las autoridades de salud hicieron campaña para reducir el uso del antibiótico, el uso de la Penicilina descendió 13% bajando al mismo tiempo las tasas de resistencia bacteriana.  Pero no se alcanzó la situación inicial… Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 37. La bacteria resistente puede también evolucionar para reducir o eliminar los costos de la resistencia y de esta manera no quedar fuera de competencia con las cepas no resistentes.  Esto fue confirmado por Schrag et al. (1997)estudiando la sensibilidad-resistencia a la estreptomicina en E. coli. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 38. Los resultados de Schrag et al. (1997) sugieren que no hay garantía de que las poblaciones bacterianas puedan restaurar su vulnerabilidad con la restricción del uso de un antibiótico. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 39. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 40. Las compañías farmacéuticas tienen poco incentivo financiero para el desarrollo de nuevos antibióticos y en la gestión de la resistencia.  Los nuevos antibióticos están protegidos por patentes por lo que los costos que generan el descubrimiento y desarrollo de los antibióticos así como el requisito de ensayos clínicos a largo plazo, son mayores que los beneficios.  Muchas compañías farmacéuticas han abandonado el rubro de los antibióticos. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 41. Tendencias en el desarrollo de nuevos antibacterianos *R2 = 0.99 18 16 14 Total # New Antibacterial 12 10 8 6 4 Agents 2 0 1983-1987 1988-1992 1993-1997 1998-2002 *p = 0.007 by linear regression Edwards , 2003
  • 42.
  • 43. Reducir la tasa de infección.  Evitar por ej. huevos y carne crudos; lavado de las manos para disminuir la diseminación de la enfermedad).  Uso limitado de jabones antibacterianos y desinfectantes.  Los médicos deberían evitar la prescripción de antibióticos para infecciones virales.  En lo posible utilizar drogas de espectro restringido.  El uso de antibióticos en la alimentación animal debería ser eliminado.  Técnicas de diagnóstico más precisos permitiría el uso de antibióticos con prudencia o limitar su uso.
  • 44. Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM
  • 45. 2000 A.C. – Toma, come esta raíz.  1000 D.C. –Esa raíz es idolatría. Toma, repite esta oración.  1850 D.C. – Esa oración es superstición. Toma, bebe esta poción.  1920 D.C. – Esa poción es aceite de serpiente. Toma, traga esta píldora.  1945 D.C. – Esa píldora es inefectiva. Toma,aprovecha la penicilina.  1955 D.C. – Ups....los bichos mutaron. Ahora tienes la tetraciclina.  1960-1999 – 39 “ups“más ...Toma, aquí tienes antibióticos más poderosos.  2000 D.C. – Los bichos ganaron! Toma, come esta raíz. — Anónimo Lab Microb Molecular y Biotecnol - UNMSM

Notas del editor

  1. de
  2. 2
  3. Proc. R. Soc. B 276, 2521
  4. Aminov, 2009
  5. .
  6. p