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BASES GENETICAS
JORGE ALEJANDRO SALAZAR HERNANDEZ
RESIDENTE DE PEDIATRIA 1 AÑO
¿QUE ES UN GEN ? • ES LA UNIDAD
MINIMA DE
HERENCIA
BIOLOGICA
• UN
FRAGMENTO
DE ADN
• OCUPA UN
LUGAR EN EL
CROMOSOMA
(LOCUS)
• ESTA FORMADO
POR ACIDOS
NUCLEICOS (UN
AZUCAR UNA
BASE
NITROGENADA
Y UN FOSFATO )
ESTA FORMADO POR
DOS CADENAS DE
POLINUCLEOTIDOS,
SON ANTIPARALELAS Y
COMPLEMENTARIAS
UNA ES 5’-3’ Y LA OTRA
ES 3’-5’
EL DNA CODIFICANTE O
GEN SERA LA CADENA
5’-3’ Y LA TEMPLADA O
MOLDE SERA 3’-5’
(SINTESIS DE RNA)
TRANSCRIPCION LA SECUENCIA DE BASES
DEL ARN ES COMPLEMENTARTIA
A LA HELICE CODIFICADORA
EL HNRNA ES HECHO A IMAGEN Y
SEMEJANZA
DEL DNA CODIFICANTE
DE MANERA QUE CONTIENE
SECUENCIAS CODIFICANTES
COMO EXONES Y NO CODIFICANTES
COMO INTRONES
PARA QUE PUEDA TRANSFORMARCE EN RNA
MADURO DEBE HACER EL SPLICING
TRADUCCION
CONTAS DE 3 ETAPAS
INICIACION (COMPLEJO DE INICIO)
ELONGACION (LECTURA DE LOS DODONES
POR EL RIBOSOMA)
TERMINACION (CODON DE TERMINACION
UAA-UAG-UGA)
TERMINA LA SINTESIS DE PROTEINA Y
ES LIBERADA DEL RIBOSOMA
MCROLIDOS, AMINOGLUCOCIDOS, CLORANFENICOL, TETRACICLINASLINCOSAMIDAS Y LAS TOXINAS DE PSEUDOMONAS
Y CORINEBACTERIUM DIPHTHERIAE SON CLASICOS INHIBIDORES DE LA TRADUCCION
MUTACIONES GENICAS O PUNTUALES
TRANSICION
CUANDO UNA PURINA
ES REEMPLAZADA POR OTRA PURINA
TRANSVERSION
CUANDO UNA PURINA ES
REEMPLAZADA POR UNA PIRIMIDINA
SE CLASIFICAN EN:
SILENTE: OCURRE EN LA TERCERA BASE NITROGENADA DE UN CODON / SIGUE CODIFICANDO PARA EL MISMO AMINOACIDO
MISSENSE:OCURRE EN LA PRIMERA O SEGUNDA BASE NITROGENENADA / EL CODON MUTANTE CODIFICA PARA OTRO
AMINOACIDO
NONSENSE: OCURRE EN LA PRIMERA O SEGUNDA BASE NITROGENENADA Y DA ORIGEN A UN CODON STOP / PROTEINA
INCOMPLETA
ENFERMEDADES MONOGENICAS
• SON AQUELLAS QUE OCURREN POR MUTACIONES EN UN SLO GEN,
DENTRO DE ESTAS ENCONTRAMOS LAS ENFERMEDADES
MENDELIANAS (1 DE CADA 100 RN)
• SE CALSIFICAN EN LOS PATRONES:
• AUTOSOMICO DOMINANTE
• AUTOSOMICO RECESIVO
• RECESIVO LIGADO AL CROMOSOMA X
• DOMINANTE LIGADO AL CROMOSOMA X
• PATRON DE HERENCIA MITOCONDRIAL
Es necesario abordar los aspectos críticos de una evaluación inicial de las complicaciones potencialmente
mortales que requieren atención y tratamiento inmediatos. Y lo que es más importante, las formas
cuidadosas y sensibles de comunicar esas preocupaciones a la familia son vitales para el cuidado de estos
bebés en el contexto de las familias
Los puntos clave en la comunicación inicial
con la familia incluyen los siguientes:
• Primero felicite a la familia por el nacimiento del bebé. Esto es muy
importante y tremendamente apreciado por las familias. Este es un
muy especial tiempo para la familia independientemente de que el
recién nacido finalmente tenga un diagnóstico genético.
• Señale los aspectos positivos sin ser demasiado o falsamente
tranquilizador
• Sea honesto acerca de sus preocupaciones. Las familias aprecian la
honestidad y la honestidad genuina del proveedor neonatal genera
confianza.
• No mencione inicialmente diagnósticos o síndromes específicos por
su nombre a menos que haya mucha confianza en el diagnóstico.
Cuando exista alguna incertidumbre, es preferible hablar en términos
generales. Las palabras iniciales utilizadas por los médicos neonatales
tienden a quedar grabadas en la mente de los padres incluso si
finalmente son refutadas.
• Evaluar el nivel educativo y cognitivo de la familia y utilizar palabras
que tengan sentido para ellos. Los términos científicos rara vez son
útiles inicialmente y solo crean ansiedad adicional.
• Asegúrele a la familia que los mantendrá informados y actualizados (y
hágalo).
• Solicitar su permiso para que un especialista, como un genetista
clínico, evalúe a su recién nacido.
• Trate al recién nacido como cualquier otro bebé “típico” o “normal”.
Las familias son muy sensibles al lenguaje corporal y la elección de
palabras, lo que sin querer puede revelar su sentimiento subyacente
sobre su recién nacido.
• Evite separar al recién nacido de los padres, en la medida de lo
posible. La mayoría de los síndromes dismórficos no representan una
amenaza inmediata para la salud del recién nacido, a menos que
existan malformaciones importantes que requieran una estrecha
vigilancia y/o manejo.
Los avances en genética molecular y la disponibilidad, cada vez a costos más accesibles, de las nuevas tecnologías
permiten cada día acceder a ellas con mayor facilidad.
Sin embargo, aun en muchas oportunidades son los estudios más clásicos los que nos permiten realizar diagnósticos
certeros
Cariograma Es el primer estudio citogenético del que se dispuso y hasta hoy se
mantiene como el examen de elección para el diagnóstico de aneuploidías. Es
también el único examen que permite la detección certera de alteraciones
cromosómicas balanceadas.
• síndrome de Down (trisomía 21), síndrome de Edwards (trisomía 18),
síndrome de Patau (trisomía 13) y síndrome de Turner (monosomía X o 45, X),.
• Indicaciones de estudio cromosómico en recién nacidos:
•Recién nacidos con un síndrome cromosómico clásico.
•Recién nacidos con múltiples malformaciones congénitas (más de dos no
relacionadas).
•Recién nacidos con trastornos de la diferenciación sexual.
•Hijos de padres portadores de alteraciones cromosómicas.
•Sospecha prenatal de aneuploidía.
• Fish Es una técnica de citogenética molecular que marca secuencias nucleotídicas a
través de sondas unidas a un fluorocromo.
• Se usa habitualmente para el diagnóstico rápido de aneuploidías y de síndromes de
microdeleción y para el diagnóstico de sexo genético en recién nacidos con trastornos
de la diferenciación sexual (sondas para gen SRY y para cromosoma X).
• Las ventajas de esta técnica son: de bajo costo, capacidad de detección de
alteraciones pequeñas y rapidez de ejecución ya que no requiere cultivos celulares.
• Su mayor desventaja es la sospecha diagnóstica que debe ser precisa puesto que se
requiere del uso de sondas específicas para cada diagnóstico. También es importante
señalar que no detecta alteraciones de tamaños menores a 50 Kb, y puede llevar a un
subdiagnóstico.
• Indicaciones de estudio de FISH en recién nacidos
•Diagnóstico rápido de aneuploidías.
•Estudio de microdeleciones.
•Asignación de sexo genético en recién nacidos con trastorno de la diferenciación
sexual.
• Mlpa La técnica de MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification)
permite el estudio de las variaciones del número de copias de genes asociados
a enfermedades.
• Existen kits específicos para cada enfermedad que se desee analizar, por ello,
cada kit contiene una mezcla de sondas especificas diseñadas de forma que
contienen una región específica y otra región universal para amplificarlas todas
juntas en una sola reacción de PCR.
• De esta forma se pueden detectar cambios en el número de copias desde
cromosomas completos hasta exones individuales.
• Esta técnica también se usa para detectar cambios en los patrones de
metilación del ADN (MS-MLPA) y es lo suficientemente sensible como para
discriminar aberraciones en genes causantes de enfermedades que tienen
pseudogenes (genes muy similares).
• Hibridación genómica comparativa (CGH array)Esta técnica permite detectar
variaciones en el número de copias del genoma, es decir, detecta la cantidad de
información genómica de un individuo. Es por lo tanto la técnica de elección
para el estudio de deleciones o duplicaciones submicroscópicas y permite
además detectar aneuploidías
Indicaciones del uso de CGH- array en recién nacidos
•Recién nacidos con múltiples malformaciones congénitas (con cariotipo
normal).
•Recién nacidos con síndromes dismórficos de etiología no precisada.
•Recién nacidos en los que el estudio cromosómico muestra cromosomas
marcadores.
•Recién nacido con retraso de crecimiento intrauterino, de etiología no
precisada, y con cariotipo normal.
Reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (RT-PCR) La
técnica de PCR en tiempo real (RT-PCR) permite la amplificación de un
segmento de ADN.
Con esto se logra obtener muchas copias de un gen y compararla con
un gen normal.
Es una técnica sensible, rápida y económica.
Su principal aplicación clínica es la genotipificación de agentes
infecciosos pero además es de gran utilidad en la detección de
mutaciones puntuales responsables de una enfermedad genética, con
poca o nula variabilidad genotípica como ocurre en la acondroplasia en
la que más del 98% de los pacientes presenta una única mutación
Southern Blot Es un método que permite detectar la presencia de una
secuencia específica, en una mezcla compleja de ADN.
Su principal aplicación en clínica es que permite determinar la
expansión de tripletes en algunas enfermedades genéticas (Corea de
Huntington, Síndrome de X-frágil).
Su utilidad en neonatología estaría solo en los casos en que existe un
riesgo aumentado, por antecedentes familiares, de presentar una
afección de este tipo, pero principalmente en el diagnóstico de distrofía
miotónica, en el periodo neonatal se manifiesta por un cuadro grave de
compromiso neurológico.
Secuenciación genómica Es un conjunto de métodos y técnicas
bioquímicas cuya finalidad es la determinación del orden de los
nucleótidos (A,C,G,T) en un fragmento de ADN.
Es una técnica que permite el diagnóstico de un gran número de
enfermedades monogénicas y es la técnica de elección para identificar
mutaciones puntuales.
• Existen dos técnicas básicas de secuenciación: secuenciación Sanger y
la secuenciación masiva o secuenciación de nueva generación (NGS).
• Secuenciación Sanger es la técnica de secuenciación más utilizada
para el estudio de segmentos específicos de ADN o de genes
pequeños.
• Es una técnica muy confiable, aunque su ejecución es lenta por lo que
no es la técnica de elección si se requiere secuenciar varios genes o
un gen grande en el que se han descrito varias mutaciones. Se utiliza
siempre para corroborar una alteración detectada por secuenciación
masiva.
• Indicación de secuenciación Sanger en neonatología
-Recién nacido en el que se sospecha fuertemente una afección
genética de baja heterogeneidad genotípica.
-Recién nacido con riesgo de presentar una afección genética
monogénica conocida, por antecedentes familiares.
• Secuenciación masiva Es una técnica que permite secuenciar en un
solo ensayo un gran número de genes, simplificando la metodología
de trabajo y aumentando la capacidad y velocidad de secuenciación.
• Es la tecnología más apropiada para el diagnóstico de enfermedades
con heterogeneidad génica y para la identificación de nuevos genes
asociados a enfermedades genéticas.
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  • 1. BASES GENETICAS JORGE ALEJANDRO SALAZAR HERNANDEZ RESIDENTE DE PEDIATRIA 1 AÑO
  • 2. ¿QUE ES UN GEN ? • ES LA UNIDAD MINIMA DE HERENCIA BIOLOGICA • UN FRAGMENTO DE ADN • OCUPA UN LUGAR EN EL CROMOSOMA (LOCUS) • ESTA FORMADO POR ACIDOS NUCLEICOS (UN AZUCAR UNA BASE NITROGENADA Y UN FOSFATO )
  • 3. ESTA FORMADO POR DOS CADENAS DE POLINUCLEOTIDOS, SON ANTIPARALELAS Y COMPLEMENTARIAS UNA ES 5’-3’ Y LA OTRA ES 3’-5’ EL DNA CODIFICANTE O GEN SERA LA CADENA 5’-3’ Y LA TEMPLADA O MOLDE SERA 3’-5’ (SINTESIS DE RNA)
  • 4. TRANSCRIPCION LA SECUENCIA DE BASES DEL ARN ES COMPLEMENTARTIA A LA HELICE CODIFICADORA EL HNRNA ES HECHO A IMAGEN Y SEMEJANZA DEL DNA CODIFICANTE DE MANERA QUE CONTIENE SECUENCIAS CODIFICANTES COMO EXONES Y NO CODIFICANTES COMO INTRONES PARA QUE PUEDA TRANSFORMARCE EN RNA MADURO DEBE HACER EL SPLICING
  • 5. TRADUCCION CONTAS DE 3 ETAPAS INICIACION (COMPLEJO DE INICIO) ELONGACION (LECTURA DE LOS DODONES POR EL RIBOSOMA) TERMINACION (CODON DE TERMINACION UAA-UAG-UGA) TERMINA LA SINTESIS DE PROTEINA Y ES LIBERADA DEL RIBOSOMA MCROLIDOS, AMINOGLUCOCIDOS, CLORANFENICOL, TETRACICLINASLINCOSAMIDAS Y LAS TOXINAS DE PSEUDOMONAS Y CORINEBACTERIUM DIPHTHERIAE SON CLASICOS INHIBIDORES DE LA TRADUCCION
  • 6. MUTACIONES GENICAS O PUNTUALES TRANSICION CUANDO UNA PURINA ES REEMPLAZADA POR OTRA PURINA TRANSVERSION CUANDO UNA PURINA ES REEMPLAZADA POR UNA PIRIMIDINA SE CLASIFICAN EN: SILENTE: OCURRE EN LA TERCERA BASE NITROGENADA DE UN CODON / SIGUE CODIFICANDO PARA EL MISMO AMINOACIDO MISSENSE:OCURRE EN LA PRIMERA O SEGUNDA BASE NITROGENENADA / EL CODON MUTANTE CODIFICA PARA OTRO AMINOACIDO NONSENSE: OCURRE EN LA PRIMERA O SEGUNDA BASE NITROGENENADA Y DA ORIGEN A UN CODON STOP / PROTEINA INCOMPLETA
  • 7. ENFERMEDADES MONOGENICAS • SON AQUELLAS QUE OCURREN POR MUTACIONES EN UN SLO GEN, DENTRO DE ESTAS ENCONTRAMOS LAS ENFERMEDADES MENDELIANAS (1 DE CADA 100 RN) • SE CALSIFICAN EN LOS PATRONES: • AUTOSOMICO DOMINANTE • AUTOSOMICO RECESIVO • RECESIVO LIGADO AL CROMOSOMA X • DOMINANTE LIGADO AL CROMOSOMA X • PATRON DE HERENCIA MITOCONDRIAL
  • 8.
  • 9.
  • 10.
  • 11.
  • 12.
  • 13.
  • 14. Es necesario abordar los aspectos críticos de una evaluación inicial de las complicaciones potencialmente mortales que requieren atención y tratamiento inmediatos. Y lo que es más importante, las formas cuidadosas y sensibles de comunicar esas preocupaciones a la familia son vitales para el cuidado de estos bebés en el contexto de las familias
  • 15. Los puntos clave en la comunicación inicial con la familia incluyen los siguientes: • Primero felicite a la familia por el nacimiento del bebé. Esto es muy importante y tremendamente apreciado por las familias. Este es un muy especial tiempo para la familia independientemente de que el recién nacido finalmente tenga un diagnóstico genético. • Señale los aspectos positivos sin ser demasiado o falsamente tranquilizador • Sea honesto acerca de sus preocupaciones. Las familias aprecian la honestidad y la honestidad genuina del proveedor neonatal genera confianza.
  • 16. • No mencione inicialmente diagnósticos o síndromes específicos por su nombre a menos que haya mucha confianza en el diagnóstico. Cuando exista alguna incertidumbre, es preferible hablar en términos generales. Las palabras iniciales utilizadas por los médicos neonatales tienden a quedar grabadas en la mente de los padres incluso si finalmente son refutadas. • Evaluar el nivel educativo y cognitivo de la familia y utilizar palabras que tengan sentido para ellos. Los términos científicos rara vez son útiles inicialmente y solo crean ansiedad adicional. • Asegúrele a la familia que los mantendrá informados y actualizados (y hágalo). • Solicitar su permiso para que un especialista, como un genetista clínico, evalúe a su recién nacido.
  • 17. • Trate al recién nacido como cualquier otro bebé “típico” o “normal”. Las familias son muy sensibles al lenguaje corporal y la elección de palabras, lo que sin querer puede revelar su sentimiento subyacente sobre su recién nacido. • Evite separar al recién nacido de los padres, en la medida de lo posible. La mayoría de los síndromes dismórficos no representan una amenaza inmediata para la salud del recién nacido, a menos que existan malformaciones importantes que requieran una estrecha vigilancia y/o manejo.
  • 18.
  • 19.
  • 20.
  • 21.
  • 22.
  • 23.
  • 24.
  • 25.
  • 26.
  • 27.
  • 28. Los avances en genética molecular y la disponibilidad, cada vez a costos más accesibles, de las nuevas tecnologías permiten cada día acceder a ellas con mayor facilidad. Sin embargo, aun en muchas oportunidades son los estudios más clásicos los que nos permiten realizar diagnósticos certeros
  • 29. Cariograma Es el primer estudio citogenético del que se dispuso y hasta hoy se mantiene como el examen de elección para el diagnóstico de aneuploidías. Es también el único examen que permite la detección certera de alteraciones cromosómicas balanceadas. • síndrome de Down (trisomía 21), síndrome de Edwards (trisomía 18), síndrome de Patau (trisomía 13) y síndrome de Turner (monosomía X o 45, X),. • Indicaciones de estudio cromosómico en recién nacidos: •Recién nacidos con un síndrome cromosómico clásico. •Recién nacidos con múltiples malformaciones congénitas (más de dos no relacionadas). •Recién nacidos con trastornos de la diferenciación sexual. •Hijos de padres portadores de alteraciones cromosómicas. •Sospecha prenatal de aneuploidía.
  • 30. • Fish Es una técnica de citogenética molecular que marca secuencias nucleotídicas a través de sondas unidas a un fluorocromo. • Se usa habitualmente para el diagnóstico rápido de aneuploidías y de síndromes de microdeleción y para el diagnóstico de sexo genético en recién nacidos con trastornos de la diferenciación sexual (sondas para gen SRY y para cromosoma X). • Las ventajas de esta técnica son: de bajo costo, capacidad de detección de alteraciones pequeñas y rapidez de ejecución ya que no requiere cultivos celulares. • Su mayor desventaja es la sospecha diagnóstica que debe ser precisa puesto que se requiere del uso de sondas específicas para cada diagnóstico. También es importante señalar que no detecta alteraciones de tamaños menores a 50 Kb, y puede llevar a un subdiagnóstico. • Indicaciones de estudio de FISH en recién nacidos •Diagnóstico rápido de aneuploidías. •Estudio de microdeleciones. •Asignación de sexo genético en recién nacidos con trastorno de la diferenciación sexual.
  • 31. • Mlpa La técnica de MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) permite el estudio de las variaciones del número de copias de genes asociados a enfermedades. • Existen kits específicos para cada enfermedad que se desee analizar, por ello, cada kit contiene una mezcla de sondas especificas diseñadas de forma que contienen una región específica y otra región universal para amplificarlas todas juntas en una sola reacción de PCR. • De esta forma se pueden detectar cambios en el número de copias desde cromosomas completos hasta exones individuales. • Esta técnica también se usa para detectar cambios en los patrones de metilación del ADN (MS-MLPA) y es lo suficientemente sensible como para discriminar aberraciones en genes causantes de enfermedades que tienen pseudogenes (genes muy similares).
  • 32. • Hibridación genómica comparativa (CGH array)Esta técnica permite detectar variaciones en el número de copias del genoma, es decir, detecta la cantidad de información genómica de un individuo. Es por lo tanto la técnica de elección para el estudio de deleciones o duplicaciones submicroscópicas y permite además detectar aneuploidías Indicaciones del uso de CGH- array en recién nacidos •Recién nacidos con múltiples malformaciones congénitas (con cariotipo normal). •Recién nacidos con síndromes dismórficos de etiología no precisada. •Recién nacidos en los que el estudio cromosómico muestra cromosomas marcadores. •Recién nacido con retraso de crecimiento intrauterino, de etiología no precisada, y con cariotipo normal.
  • 33. Reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (RT-PCR) La técnica de PCR en tiempo real (RT-PCR) permite la amplificación de un segmento de ADN. Con esto se logra obtener muchas copias de un gen y compararla con un gen normal. Es una técnica sensible, rápida y económica. Su principal aplicación clínica es la genotipificación de agentes infecciosos pero además es de gran utilidad en la detección de mutaciones puntuales responsables de una enfermedad genética, con poca o nula variabilidad genotípica como ocurre en la acondroplasia en la que más del 98% de los pacientes presenta una única mutación
  • 34. Southern Blot Es un método que permite detectar la presencia de una secuencia específica, en una mezcla compleja de ADN. Su principal aplicación en clínica es que permite determinar la expansión de tripletes en algunas enfermedades genéticas (Corea de Huntington, Síndrome de X-frágil). Su utilidad en neonatología estaría solo en los casos en que existe un riesgo aumentado, por antecedentes familiares, de presentar una afección de este tipo, pero principalmente en el diagnóstico de distrofía miotónica, en el periodo neonatal se manifiesta por un cuadro grave de compromiso neurológico.
  • 35. Secuenciación genómica Es un conjunto de métodos y técnicas bioquímicas cuya finalidad es la determinación del orden de los nucleótidos (A,C,G,T) en un fragmento de ADN. Es una técnica que permite el diagnóstico de un gran número de enfermedades monogénicas y es la técnica de elección para identificar mutaciones puntuales. • Existen dos técnicas básicas de secuenciación: secuenciación Sanger y la secuenciación masiva o secuenciación de nueva generación (NGS).
  • 36. • Secuenciación Sanger es la técnica de secuenciación más utilizada para el estudio de segmentos específicos de ADN o de genes pequeños. • Es una técnica muy confiable, aunque su ejecución es lenta por lo que no es la técnica de elección si se requiere secuenciar varios genes o un gen grande en el que se han descrito varias mutaciones. Se utiliza siempre para corroborar una alteración detectada por secuenciación masiva. • Indicación de secuenciación Sanger en neonatología -Recién nacido en el que se sospecha fuertemente una afección genética de baja heterogeneidad genotípica. -Recién nacido con riesgo de presentar una afección genética monogénica conocida, por antecedentes familiares.
  • 37. • Secuenciación masiva Es una técnica que permite secuenciar en un solo ensayo un gran número de genes, simplificando la metodología de trabajo y aumentando la capacidad y velocidad de secuenciación. • Es la tecnología más apropiada para el diagnóstico de enfermedades con heterogeneidad génica y para la identificación de nuevos genes asociados a enfermedades genéticas.