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BIOQUÍMICA
CQU 310
Instituto de Ciencias Naturales
Enzimas I
Clase 7
MATERIAL PROPIEDAD DE UDLA.
AUTORIZADA SU UTILIZACIÓN SÓLO PARA FINES ACADÉMICOS.
Bioquímica/clase 07
2019
Resultados de aprendizaje:
Identificar la clasificación, función y regulación de las enzimas
analizando factores físicos y químicos del medio.
Bioquímica/clase 07
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Bioquímica/clase 07
2019
ENZIMAS
Bioquímica/clase 07
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ENZIMAS
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Bioquímica/clase 07
2019
ENZIMAS
Características de las enzimas:
Proteínas con actividad catalítica.
Aumentan la velocidad de los procesos bioquímicos en un
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Alto grado de especificidad, tanto por sus sustratos como
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No modifica Keq.
Disminuyen la energía de activación del estado
estacionario
Se encuentran en bajas concentraciones (mM)
Las enzimas reconocen selectivamente a su sustrato, uniéndose
este al sitio activo.
La especificidad es controlada por la estructura del sustrato que
es reconocida por la enzima.
Interacciones Enzima – Sustrato son del tipo No Covalente
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Bioquímica/clase 07
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ESPECIFICIDAD
El resultado de un reconocimiento molecular
El sustrato (pequeño) se une a la enzima (grande) mediante
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Puentes de Hidrógeno, Van der Waals, iónicas y en algunas
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MODO DE ACCIÓN DE LAS ENZIMAS
Cambios energéticos ocurren durante la reacción:
E +S <---> [ES]<---> E + P
Las enzimas velocidad de reacción porque la Ea.
(La Ea es la energía requerida para el alineamiento de los grupos que participan en la reacción, el reordenamiento de
enlaces y otras transformaciones necesarias para que la dirección procesa en un sentido determinado)
MODELOS DE UNIÓN DEL SUSTRATO A
CENTRO ACTIVO DE LA ENZIMA
Bioquímica/clase 07
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Modelos
Unión enzima al sustrato
Fischer: “Llave y Cerradura”
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Enzima  cerradura
Sustrato  llave
Fischer: “Llave y Cerradura”
El sustrato encaja perfectamente en el centro activo gracias a
complementariedad molecular y electrostática con la enzima.
MODELOS DE UNIÓN DEL SUSTRATO A
CENTRO ACTIVO DE LA ENZIMA
Koshland: “Ajuste inducido”
Tanto la enzima como el sustrato sufren alteración en su estructura por
el hecho físico de la unión.
Bioquímica/clase 07
2019
Sitio activo de la quimotripsina.
Bioquímica/clase 07
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Ejemplo de sitio activo
- Enzima digestiva que hidroliza proteínas
- La estructura primaria de esta enzima consta de 245
aminoácidos.
- Esta enzima consta de tres cadenas polipeptídicas: A, B y C.
- Los enlaces disúlfuro unen las cadenas A, B y C entre sí.
- Los aminoácidos del Sitio Activo son tres: His, Asp y Ser.
”Lehninger Principles of Biochemistry” 3th.ed. Nelson, DL
and Cox, M.M. Worth Publishers, 2000.)
MODELO MOLECULAR DEL SITIO ACTIVO
Bioquímica/clase 07
2019
Sitio activo de la quimotripsina.
- La enzima tiene un aspecto globular, dado por el plegamiento de las
subunidades A, B y C.
- Parte del sitio activo se muestra en naranja.
- Los grupos funcionales que componen el sitio activo están en rojo
- La mayor parte del sustrato esta en verde
La enzima b-lactamasa
y su sitio activo
Bioquímica/clase 07
2019http://zl.elsevier.es/es/revista/enfermedades-infecciosas-microbiologia-clinica-28/antibioticos-betalactamicos-13133636-formacion-medica-continuada-2009
Ejemplo de sitio activo
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PROTEICOS DE LAS ENZIMAS
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la enzima
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Moléculas orgánicas que
acompañan la enzima cuando
cataliza la reacción
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Cobre, Cu + o Cu 2+ Oxidación / reducción
Cinc, Zn 2+ Ayuda a unir el NAD+
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”Lehninger Principles of Biochemistry” 3th.ed. Nelson, DL
and Cox, M.M. Worth Publishers, 2000.)
Bioquímica/clase 07
2019
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“Las coenzimas reaccionan con la enzima de igual modo que el sustrato,
uniéndose al sitio activo. Se mueven de una enzima a otra agregando o
quitando grupos químicos del sustrato.”
COENZIMAS
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Bioquímica/clase 07
2019http://lecturer.ukdw.ac.id/dhira/Metabolism/Enzymes.html
Apoenzima + Cofactor/Coenzima → Holoenzima
Feduchi, E. Bioquímica conceptos esenciales 2011
ACOMPAÑANTES NO
PROTEICOS DE LAS ENZIMAS
Están permanentemente unidos a las enzimas
Molécula Papel en la reacción catalizada
Fe-S Oxido-reducción
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Aconitasa del ciclo de
Krebs. En rojo el grupo
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”Lehninger Principles of Biochemistry” 3th.ed. Nelson, DL
and Cox, M.M. Worth Publishers, 2000.)
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2019
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Bioquímica/clase 07
2019
CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS:
Clasificación de las enzimas
En función de su acción catalítica
específica, los enzimas se clasifican
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Clase
1
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3
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6
Bioquímica/clase 07
2019
CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS:
Clase 1: Oxidorreductasas:
Catalizan reacciones de oxido - reducción, es decir, transferencia de hidrógeno (H) o electrones (e-)
de un sustrato a otro, según la reacción general:
Ared + Box Aox + Bred
AH2 + B A + BH2
http://www.ehu.eus/biomoleculas/enzimas/enz13.htm#c1
Clase 2: Transferasas:
Catalizan la transferencia de un grupo químico (distinto del hidrógeno) de un sustrato a otro, según la
reacción:
A-B + C A + C-B
Bioquímica/clase 07
2019
Clase 3: Hidrolasas:
Catalizan las reacciones de hidrólisis:
http://www.ehu.eus/biomoleculas/enzimas/enz13.htm#c1
Clase 4: Liasas:
Catalizan reacciones de ruptura o soldadura de sustratos:
A-B + H2O AH + B-OH
A-B A + B
CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS:
Bioquímica/clase 07
2019
Clase 5: Isomerasas:
Catalizan la interconversión de isómeros:
http://www.ehu.eus/biomoleculas/enzimas/enz13.htm#c1
Clase 6: Ligasas:
Catalizan la unión de dos sustratos con hidrólisis simultánea de un nucleótido trifosfato (ATP, GTP,
etc.):
A B
A + B + XTP A-B + XDP + Pi
CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS:
Bioquímica/clase 07
2019
Referencias bibliográficas
Feduchi, E., Blasco, I., Romero, C. y Yañez, E.
Bioquímica conceptos esenciales Editorial Medica Panamericana
2011
Nelson, Cox Lehninger: Principios de Bioquímica
5º Edición, Omega Ediciones S.A 2009.
Mathews, Christopher Bioquímica
Pearson Education 2002 Editorial McGraw-Hill Interamericana.
2002
Voet, Voet, Pratt Fundamentos de Bioquímica
Editorial Panamericana 2003
McKee, Trudy McKee, James R.
Bioquímica Editorial McGraw-Hill Interamericana.
2003

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Clase 07 enzimas i 2019

  • 1. BIOQUÍMICA CQU 310 Instituto de Ciencias Naturales Enzimas I Clase 7
  • 2. MATERIAL PROPIEDAD DE UDLA. AUTORIZADA SU UTILIZACIÓN SÓLO PARA FINES ACADÉMICOS.
  • 3. Bioquímica/clase 07 2019 Resultados de aprendizaje: Identificar la clasificación, función y regulación de las enzimas analizando factores físicos y químicos del medio.
  • 4. Bioquímica/clase 07 2019 Prácticamente todas las reacciones químicas que tienen lugar en los seres vivos están catalizadas por enzimas. La sustancia sobre la que actúa la enzima se llama sustrato Las enzimas están compuestas por muchos aminoácidos (generalmente entre 150 y 300 aminoácidos), pero sólo una fracción de ella constituye el sitio activo, que se pone en contacto con el sustrato para transformarlo en su correspondiente producto. Una vez formados los productos la enzima puede comenzar un nuevo ciclo de reacción. ENZIMAS Proteínas con actividad catalítica (Excepto las Ribozimas que son moléculas de RNA que actúan como catalizadores) ENZIMAS
  • 5. Sustrato (s) Producto (s) Enzima Las enzimas catalizan la reacción química en la cual el sustrato se convierte en producto E ES P E Bioquímica/clase 07 2019 ENZIMAS
  • 7. Bioquímica/clase 07 2019 ENZIMAS Características de las enzimas: Proteínas con actividad catalítica. Aumentan la velocidad de los procesos bioquímicos en un factor de 106 a 1016 veces. Alto grado de especificidad, tanto por sus sustratos como por sus productos. No modifica Keq. Disminuyen la energía de activación del estado estacionario Se encuentran en bajas concentraciones (mM)
  • 8. Las enzimas reconocen selectivamente a su sustrato, uniéndose este al sitio activo. La especificidad es controlada por la estructura del sustrato que es reconocida por la enzima. Interacciones Enzima – Sustrato son del tipo No Covalente http://personales.ya.com/geopal/g-b_1bach/ejercicios/act7tema6.htm Bioquímica/clase 07 2019 ESPECIFICIDAD
  • 9. El resultado de un reconocimiento molecular El sustrato (pequeño) se une a la enzima (grande) mediante interacciones débiles: Puentes de Hidrógeno, Van der Waals, iónicas y en algunas ocasiones interacciones Hidrofóbicas Bioquímica/clase 07 2019 ESPECIFICIDAD
  • 11. Bioquímica/clase 07 2019 MODO DE ACCIÓN DE LAS ENZIMAS Cambios energéticos ocurren durante la reacción: E +S <---> [ES]<---> E + P Las enzimas velocidad de reacción porque la Ea. (La Ea es la energía requerida para el alineamiento de los grupos que participan en la reacción, el reordenamiento de enlaces y otras transformaciones necesarias para que la dirección procesa en un sentido determinado)
  • 12. MODELOS DE UNIÓN DEL SUSTRATO A CENTRO ACTIVO DE LA ENZIMA Bioquímica/clase 07 2019 Modelos Unión enzima al sustrato Fischer: “Llave y Cerradura” Koshland: “Ajuste inducido”
  • 13. MODELOS DE UNIÓN DEL SUSTRATO A CENTRO ACTIVO DE LA ENZIMA Bioquímica/clase 07 2019 Enzima  cerradura Sustrato  llave Fischer: “Llave y Cerradura” El sustrato encaja perfectamente en el centro activo gracias a complementariedad molecular y electrostática con la enzima.
  • 14. MODELOS DE UNIÓN DEL SUSTRATO A CENTRO ACTIVO DE LA ENZIMA Koshland: “Ajuste inducido” Tanto la enzima como el sustrato sufren alteración en su estructura por el hecho físico de la unión. Bioquímica/clase 07 2019
  • 15. Sitio activo de la quimotripsina. Bioquímica/clase 07 2019 Ejemplo de sitio activo - Enzima digestiva que hidroliza proteínas - La estructura primaria de esta enzima consta de 245 aminoácidos. - Esta enzima consta de tres cadenas polipeptídicas: A, B y C. - Los enlaces disúlfuro unen las cadenas A, B y C entre sí. - Los aminoácidos del Sitio Activo son tres: His, Asp y Ser. ”Lehninger Principles of Biochemistry” 3th.ed. Nelson, DL and Cox, M.M. Worth Publishers, 2000.)
  • 16. MODELO MOLECULAR DEL SITIO ACTIVO Bioquímica/clase 07 2019 Sitio activo de la quimotripsina. - La enzima tiene un aspecto globular, dado por el plegamiento de las subunidades A, B y C. - Parte del sitio activo se muestra en naranja. - Los grupos funcionales que componen el sitio activo están en rojo - La mayor parte del sustrato esta en verde
  • 17. La enzima b-lactamasa y su sitio activo Bioquímica/clase 07 2019http://zl.elsevier.es/es/revista/enfermedades-infecciosas-microbiologia-clinica-28/antibioticos-betalactamicos-13133636-formacion-medica-continuada-2009 Ejemplo de sitio activo
  • 18. Bioquímica/clase 07 2019 ACOMPAÑANTES NO PROTEICOS DE LAS ENZIMAS Acompañantes no proteicos de las Enzimas Cofactores Iones inorgánicos que acompañan la enzima cuando cataliza la reacción Grupos Prostéticos Ion o molécula orgánica que permanece fuertemente unido a la enzima Coenzimas Moléculas orgánicas que acompañan la enzima cuando cataliza la reacción
  • 19. IONES INORGANICOS que se unen temporalmente a las enzimas. Ion Metálico Papel en la reacción catalizada Hierro Fe 2+ o Fe 3+ Oxidación / reducción Cobre, Cu + o Cu 2+ Oxidación / reducción Cinc, Zn 2+ Ayuda a unir el NAD+ Ion Magnesio en la Enzima Enolasa ”Lehninger Principles of Biochemistry” 3th.ed. Nelson, DL and Cox, M.M. Worth Publishers, 2000.) Bioquímica/clase 07 2019 COFACTORES
  • 20. Moléculas pequeñas que tiene carbono, interaccionan débilmente durante la catálisis. La mayor parte de las coenzimas son vitaminas, muchas de las cuales deben ser incorporadas con la dieta. Molécula Papel en la reacción catalizada Vitamina _ - Biotina transporta -COO- Vitamina H o B7 - Coenzima A transporta -CH2-CH3 B5 - NAD y FAD transportan electrones B3 y B2 “Las coenzimas reaccionan con la enzima de igual modo que el sustrato, uniéndose al sitio activo. Se mueven de una enzima a otra agregando o quitando grupos químicos del sustrato.” COENZIMAS http://rstb.royalsocietypublishing.org/content/363/1504/2787
  • 21. Bioquímica/clase 07 2019http://lecturer.ukdw.ac.id/dhira/Metabolism/Enzymes.html Apoenzima + Cofactor/Coenzima → Holoenzima Feduchi, E. Bioquímica conceptos esenciales 2011 ACOMPAÑANTES NO PROTEICOS DE LAS ENZIMAS
  • 22. Están permanentemente unidos a las enzimas Molécula Papel en la reacción catalizada Fe-S Oxido-reducción Sitio activo de enzima Aconitasa del ciclo de Krebs. En rojo el grupo prostético Fe-S ”Lehninger Principles of Biochemistry” 3th.ed. Nelson, DL and Cox, M.M. Worth Publishers, 2000.) Bioquímica/clase 07 2019 GRUPOS PROSTÉTICOS
  • 23. Bioquímica/clase 07 2019 CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS: Clasificación de las enzimas En función de su acción catalítica específica, los enzimas se clasifican en 6 grandes grupos o clases: Oxidoreductasas Transferasas Hidrolasas Liasas Isomerasas Ligasas Clase 1 Clase 2 Clase 3 Clase 4 Clase 5 Clase 6
  • 24. Bioquímica/clase 07 2019 CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS: Clase 1: Oxidorreductasas: Catalizan reacciones de oxido - reducción, es decir, transferencia de hidrógeno (H) o electrones (e-) de un sustrato a otro, según la reacción general: Ared + Box Aox + Bred AH2 + B A + BH2 http://www.ehu.eus/biomoleculas/enzimas/enz13.htm#c1 Clase 2: Transferasas: Catalizan la transferencia de un grupo químico (distinto del hidrógeno) de un sustrato a otro, según la reacción: A-B + C A + C-B
  • 25. Bioquímica/clase 07 2019 Clase 3: Hidrolasas: Catalizan las reacciones de hidrólisis: http://www.ehu.eus/biomoleculas/enzimas/enz13.htm#c1 Clase 4: Liasas: Catalizan reacciones de ruptura o soldadura de sustratos: A-B + H2O AH + B-OH A-B A + B CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS:
  • 26. Bioquímica/clase 07 2019 Clase 5: Isomerasas: Catalizan la interconversión de isómeros: http://www.ehu.eus/biomoleculas/enzimas/enz13.htm#c1 Clase 6: Ligasas: Catalizan la unión de dos sustratos con hidrólisis simultánea de un nucleótido trifosfato (ATP, GTP, etc.): A B A + B + XTP A-B + XDP + Pi CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS:
  • 27. Bioquímica/clase 07 2019 Referencias bibliográficas Feduchi, E., Blasco, I., Romero, C. y Yañez, E. Bioquímica conceptos esenciales Editorial Medica Panamericana 2011 Nelson, Cox Lehninger: Principios de Bioquímica 5º Edición, Omega Ediciones S.A 2009. Mathews, Christopher Bioquímica Pearson Education 2002 Editorial McGraw-Hill Interamericana. 2002 Voet, Voet, Pratt Fundamentos de Bioquímica Editorial Panamericana 2003 McKee, Trudy McKee, James R. Bioquímica Editorial McGraw-Hill Interamericana. 2003