4. Elementos fundamentales de la
vida
Todos los seres vivos
comparten características
químicas fundamentales.
5. Elementos fundamentales de la
vida
Elemento % Función
Oxígeno 65/0,06 Respiración celular
Carbono 18/0,02 Esqueleto de las moléculas orgánicas
Hidrógeno 10/91 Participa en transformación de Σ
Nitrógeno 3/0.04 Componente de proteínas, Ac.
nucleicos y Clorofila.
Calcio 1,5 Componente estructural
Fósforo 1 Componente de Ac. nucleicos y
Fosfolípidos
K, S, Na, Mg, Cl, Fe 1
Oligoelementos (I, Mn, Cu, Zn, Co, F,
Mo, Se, B, Si, etc.
trazas
6. Átomos
Los átomos son partículas
básicas de los elementos que
conservan la propiedad de
éste.
Partícula Carga Ubicación
Protón Positiva Núcleo
Neutrón Neutra Núcleo
Electrón Negativa Alrededor del
núcleo
Los electrones participan en los cambios químicos.
7. Los átomos forman moléculas
y compuestos.
H2O -> 70%
C6H12O6
Moléculas
8. Moléculas
Inorgánicas: moléculas que contienen
cualquier elemento.
Orgánicas: ”moléculas fabricadas por
organismos vivos”. Contienen C-H. Grandes
y complejas la mayoría.
9. Moléculas inorgánicas: Agua
Principal solvente
Disuelve moléculas polares (hidrofílicas:
azúcares y Aa, O2 y CO2)
Provee el medio adecuado en la célula para las
reacciones químicas de la vida.
Efecto organizador de moléculas hidrofóbicas.
Interviene en muchas reacciones químicas.
10. Moléculas orgánicas
Las moléculas biológicas se unen/separan al
eliminar/agregar agua (deshidratación/hidrólisis)
HO OH HO OH
O
HO OH
+
H2O
11. Carbohidratos / Hidratos de carbono
Metano CH4: Cuando el átomo de carbón tiene cuatro
enlaces simples con otros átomos, la molécula es un
tetraedro.
12. Carbohidratos / Hidratos de carbono
Etano C2H6: una molécula puede
tener más de un grupo
tetraedro de átomos unidos
por enlaces simples.
Etileno C2H4: Cuando dos átomos
de carbón se unen por un
enlace doble, todos los
átomos unidos a los C están
en el mismo plano. La
molécula es plana
13. La diversidad molecular incrementa por la variación del
esqueleto de C
Longitud Ramificació
n
Etano Propano Butano 2-metilpropano
Enlaces
dobles
Anillos
(isobutano)
1-Butano 2-Butano Ciclohexano Benceno
14. ISÓMEROS
Isómeros
estructurales
Isómeros
geométricos
Enantiómeros: difieren en el arreglo
espacial alrededor de un carbón
asimétrico, resultando en moléculas
que son imágenes espejo. Son
designados como L y D isómeros
(latín: levo y dextro). Los enantiómeros
no pueden sobreponerse uno sobre
otro.
21. Proteínas
Cadenas de Amino ácidos (20)
-Oligopéptidos (<10 Aa)
-Polipéptidos (>10 Aa)
-Proteína (>50 Aa)
Radical: -hidrobóficos
-hidrofílicos
-básicos
-ácidos
Se unen por el grupo amino - carboxilo
H
H
N
R
C
H
C
O
O H
22. Proteínas
Estructura primaria
Secuencia lineal de Aa mediante enlaces
peptídicos.
Estructura secundaria
Interacción entre el H del grupo amino y el
CO= del grupo carboxilo creando puentes
de hidrógeno. Pueden haber 2 estructuras:
hélice u hoja.
23. Proteínas
Estructura terciaria
Se crean puentes disulfuro (cisteina), enlaces eléctricos,
puentes de H2 e interacción hidrófobas.
Estructura cuaternaria
Enlaces no covalentes (débiles)
de 2 o más polipéptidos de
estructura terciaria
24.
25. ENZIMAS
Catalizadores: aceleran las reacciones.
No permiten que sucedan reacciones.
energéticamente desfavorables.
No cambian el punto de equilibrio de una reacción.
No se consumen en las reacciones que promueven.
Altamente específicas.
Su actividad es regulada por las mismas reacciones
que activan las moléculas.
No todas son proteínas.
26. Ácidos Nucleicos
Cadenas largas de nucleótidos formados
de:
-1 azúcar (ribosa o desoxiribosa)
-1 grupo fosfato
-1 base nitrogenada
*adenina
*guanina
*citosina
*timina
*uracilo
27. Ácidos Nucleicos
Unión de
nucleótidos
mediante enlaces
covalentes entre
Fosfato y Azúcar
A diferencia de la materia sin vida de tamaño similar, los seres vivos son muy complejos y están organizados. Pensemos en un grano de sal o el océano… el primero puede estar organizado pero no es complejo, el segundo es complejo (tiene muchos elementos) pero no está organizado.
Un ser vivo tiene muchas moléculas y están organizadas.
La organización de la vida tiene dos dimensiones: una vertical que es estructural y jerárquico que va desde los átomos hasta la biosfera; y una horizontal referida a la gran diversidad de especies de ahora y a los largo de toda la historia.
Miremos cada uno de estos niveles….
Toda la vida está constituida sobre un fundamento químico que se basa en los elementos: un átomo es la partícula más pequeña que conserva las propiedades de un elemento.
La unión de átomos forman las moléculas, conocidas como las moléculas de la vida (ADN, ARN, lípidos, proteínas, etc).
Dos o más átomos iguales o diferentes que se unen y forman una molécula.
Las moléculas de la vida son complejas (proteínas, ADN, ARN, lípidos...)
Sólo las células vivas las pueden fabricar.
La isomería es una propiedad de ciertos compuestos químicos que con igual fórmula química, es decir, iguales proporciones relativas de los átomos que conforman su molécula, presentan estructuras moleculares distintas y, por ello, diferentes propiedades. Por ejemplo, el alcohol etílico o etanol y el éter dimetílico son isómeros cuya fórmula molecular es C2H6O.
Ácido carboxílico (Ác. Acético) el cual da el sabor al vinagre. H3C-CO-OH
Ketonas (Acetona) el grupo carbonilo está en medio del esqueleto de C. H3C-CO-CH3
Aldehydos (Propanol) el grupo carbonilo está al final del esqueleto de C. H3C-CH2-CO-H
Fosfato (Glicerol fosfato) hace que la molécula tenga una parte aniónica (ión cargado negativamente). Puede transferir energía entre moléculas orgánicas. H2COH-HCOH-HCOH-OPO3
Tioles (Tioetanol) H3C-CH2-SH Dos grupos sulfidrilos pueden interactuar para ayudar a estabilizar la estructura de las proteínas.
Cada una de estas cadenas polipeptídicas recibe el nombre de protómero.
El número de protómeros varía desde dos, como en la hexoquinasa; cuatro, como en la hemoglobina, o muchos, como la cápsida del virus de la poliomielitis, que consta de sesenta unidades proteicas.
Las proteínas determinan la forma y la estructura de las células y dirigen casi todos los procesos vitales. Las funciones de las proteínas son específicas de cada una de ellas y permiten a las células mantener su integridad, defenderse de agentes externos, reparar daños, controlar y regular funciones, etc.
Ribozima: molécula del ARN que catalizan reacciones que ocurren en el procesamiento de información genética para el uso de la célula, pueden ser cruciales durante la evolución temprana de la vida.
Complementariedad entre purinas y pirimidinas
Un punto fundamental es que las purinas y pirimidinas son complementarias entre sí, es decir, forman parejas de igual manera que lo harían una llave y su cerradura; son los denominados apareamientos de Watson y Crick. La adenina y la timina son complementarias (A=T), uniéndose gracias a dos puentes de hidrógeno, mientras que la guanina y la citosina (G≡C) se unen mediante tres puentes de hidrógeno. Dado que en el ARN no existe timina, la complementariedad se establece entre adenina y uracilo (A=U) mediante dos puentes de hidrógeno. La complementariedad de las bases es la clave de la estructura del ADN y tiene importantes implicaciones, pues permite procesos como la replicación del ADN, la transcripción de ADN a ARN y la traducción del ARN en proteínas.
No todos los nucleótidos son parte de las moléculas de DNA o RNA, algunos existen simplemente en la célula y están presentes como parte de otras moléculas.
Los nucleótidos cíclicos como el AMP-c son mensajeros intracelulares que llevan información de la membrana celular a otras moléculas contenidas en la célula. El AMP-c estimula las reacciones esenciales en el citoplasma o el núcleo.
La única diferencia entre el ATP y el AMP (adenosín monofosfato) es la unión de dos grupos fosfato adicionales. Aunque esta diferencia en la fórmula puede parecer pequeña, es la clave del funcionamiento del ATP en los seres vivos.
Los enlaces que unen los tres grupos fosfato son relativamente débiles, y pueden romperse con cierta facilidad por hidrólisis. Los productos de la reacción más común son el ADP -adenosín di fosfato- un grupo fosfato y energía. Esta energía al desprenderse, puede ser utilizada para producir otras reacciones químicas
Con la adición de una molécula de agua al ATP, un grupo fosfato se separa de la molécula. Los productos de la reacción son el ADP, un grupo fosfato libre y energía. Alrededor de unas 7 Kcalorías de energía se liberan por cada mol de ATP hidrolizado. La reacción puede ocurrir en sentido contrario si se aportan las 7 Kcalorías por mol necesarias.
La función del ATP es suministrar energía hidrolizándose a ADP y Pi. Esta energía puede usarse para: obtener energía química: por ejemplo para la síntesis de macromoléculas;
transporte a través de las membranas
trabajo mecánico: por ejemplo la contracción muscular, movimiento de cilios y flagelos, movimiento de los cromosomas, etc.
Los coenzimas son cofactores orgánicos no proteicos, termoestables, que unidos a una apoenzima constituyen la holoenzima o forma catalíticamente activa de la enzima. Tienen en general baja masa molecular (al menos comparada con la apoenzima) y son claves en el mecanismo de catálisis, por ejemplo, aceptando o donando electrones o grupos funcionales, que transportan de un enzima a otro.
A diferencia de las enzimas, las coenzimas se modifican y consumen durante la reacción química; por ejemplo, el NAD+ se reduce a NADH cuando acepta dos electrones (y un protón) y por tanto se agota; cuando el NADH libera sus electrones se recupera el NAD+, que de nuevo puede actuar como coenzima.