Los administradores de la calidad del agua controlan la contaminación para asegurar que el agua sea adecuada para su uso. Deben conocer cuánto desecho puede tolerar un cuerpo de agua y las sustancias que se descargan en él. Algunas fuentes de contaminación son desechos industriales, urbanos, agrícolas y microorganismos patógenos. Los administradores miden parámetros como la demanda de oxígeno, nutrientes y sales para controlar la contaminación.