Las mutaciones pueden clasificarse de acuerdo a las células afectadas (somáticas o hereditables), el ADN afectado (genéticas o cromosómicas) y su origen (espontáneas o inducidas). Las mutaciones somáticas afectan a las células del cuerpo pero no se transmiten, mientras que las mutaciones hereditables afectan a las células reproductoras y pueden transmitirse a la descendencia.