Existen varios tipos de PCR, incluyendo PCR anidada que utiliza el producto de una primera amplificación como molde para una segunda, PCR in situ que se realiza en secciones histológicas para visualizar los productos en el sitio de amplificación, y PCR múltiple que amplifica múltiples secuencias en una sola reacción utilizando varios pares de iniciadores. Otras variantes son PCR con transcriptasa inversa que utiliza ARN como molde inicial y PCR tiempo real que permite cuantificar la cantidad de ADN o ARN presente en la muestra

1. Tipos de PCR
PCR ANIDADA: En esta variante de PCR, el producto de una amplificación es
utilizado como molde para realizar una segunda amplificación con iniciadores que se
ubican dentro de la primera secuencia amplificada. Este tipo de PCR es altamente
específica 5.
PCR IN SITU: Es una PCR que se realiza en preparaciones fijadas sobre un
portaobjeto. Consiste en una reacción de PCR en secciones histológicas o células,
donde los productos generados pueden visualizarse en el sitio de amplificación. Se
realiza para ello una primera amplificación del ADN blanco y luego detección mediante
hibridación in situ convencional con sondas de ADN/ARN. De esta manera puede
detectarse cantidades pequeñísimas del material genético 6
PCR MULTIPLEX
Es una PCR en la cual se amplifica más de una secuencia en una misma reacción.
Emplea dos o más pares de iniciadores en un único tubo de reacción con el fin de
amplificar simultáneamente múltiples segmentos de ADN. Consiste en combinar en
una única reacción todos los pares de iniciadores de los sistemas que queremos
amplificar simultáneamente, junto con el resto de los reactivos de la reacción en
cantidades suficientes. La ventaja de esta PCR es que se obtiene la información de
varios loci en una sola reacción, utilizando menor cantidad de molde para el análisis y
menor cantidad de reactivos. Se puede generar rápidamente la construcción de una
base de datos 7 .
PCR con transcriptasa inversa: Es una variante de la PCR en la que usamos ARN
como molde inicial en vez de ADN, y emplea una transcriptasa inversa (como Tth)
para realizar la síntesis de un ADN complementario al ARN (ADNc). De esta forma, el
desarrollo inicial de una RT-PCR sería: 1er paso: retrotranscripción a partir del ARN.
2º paso: amplificación a partir de la primera hebra de ADNc.
PCR TIEMPO REAL
Es una reacción de PRC cuya principal característica es que permite cuantificar la
cantidad de ADN o ARN presente en la muestra original 9. Se puede dividir en:
a-Técnica basada en fluorocromos no específicos.
b-Técnica basada en sondas específicas.