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Interpretación Informe de resultados
Sesión Final #PictureYourMicrobes
A tener en cuenta…
El análisis es una fotografía en el tiempo.
La técnica utilizada sólo permite identificar bacterias hasta el nivel de género.
No existen valores “normales” que faciliten la interpretación clínica.
Hay microorganismos en % muy bajos que pueden no estar reflejados en los resultados.
Un mismo género de bacterias puede incluir especies que tengan funciones totalmente opuestas.
Principales filotipos
Hay otros filos importantes en menor cantidad…
además de virus, hongos y parásitos
Firmicutes/Bacteroidetes
Géneros analizados
En las muestras encontramos entre
100 a 200 géneros diferentes
Alistipes spp.
Filo Bacteroidetes
Especies descritas ~ 13 especies.
Función Comensal. Resistente a las sales biliares
Rol en salud Efecto protector frente a colitis y trastornos
Rol en enfermedad Aumento en su abundancia se relaciona con
síndrome de fatiga crónica, depresión.
Dieta Relacionada con ingesta de carne.
Akkermansia spp.
Filo Verrucomicrobia
Especies
descritas
2 especies (Sólo 1 en humanos)
Función
Degradación de mucina (Mantenimiento de la
mucosa intestinal)
Rol en salud
Efecto protector frente a obesidad y
de Diabetes Tipo 2.
Rol en
enfermedad
Esclerosis múltiple (Niveles elevados).
Dieta Relacionada con ingesta de polifenoles
Bacteroides spp.
Filo Bacteroidetes
Especies descritas Más de 50 especies.
Función Obtención de nutrientes de la dieta. Inmunomodulador
Rol en salud
Estimulación, maduración y mantenimiento del Sistema
immune.
Rol en enfermedad
Niveles elevados están relacionados con mayor riesgo de
síndrome metabólico (adiposidad corporal y resistencia a
insulina).
Patógeno oportunista.
Dieta
Dieta rica en productos animales con ausencia de fibras
vegetales.
Bifidobacterium spp.
Filo Actinobacteria
Especies descritas Más de 50 especies
Función Uso como probiótico. Inmunomodulador.
Rol en salud
Efecto positivo en el mantenimiento del tránsito
intestinal. Sistema inmunitario.
Rol en
enfermedad
No se ha descrito
Dieta Alimentos fermentados.
Faecalibacterium spp.
Filo Firmicutes
Especies descritas Una especie (Faecalibacterium prausnitzii)
Función
Descomponen los carbohidratos complejos
(almidones resistentes). Mantenimiento de la
mucosa intestinal. Inmunomodulador.
Rol en salud Efecto protector frente a enfermedad de Crohn.
Rol en
enfermedad
Asma (Niveles disminuidos), obesidad (niveles
elevados).
Dieta Legumbres y cereales integrales sin procesar
Prevotella spp.
Filo Bacteroidetes
Especies descritas ~ 50 especies
Función Obtener vitaminas de las frutas y vegetales.
Rol en salud Comensal. Mejora el metabolismo de la glucosa.
Rol en enfermedad
Enfermedades autoinmunes, resistencia a la insulina
diabetes (Cambios en la abundancia de algunas
especies)
Inflamación intestinal (Niveles elevados)
Dieta
Alimentación rica en carbohidratos, particularmente
fibra
Lactobacillus spp.
Filo Firmicutes
Especies descritas ~17 especies
Función Uso como probiótico. Inmunomodulador.
Rol en salud
Prevención de la diarrea, incluyendo la diarrea
infecciosa y la diarrea causada por el uso de
antibióticos
Rol en
enfermedad
No se ha descrito.
Dieta Alimentos fermentados.
Roseburia spp.
Filo Firmicutes
Especies descritas ~ 5 especies.
Función
Fermenta carbohidratos indigeribles
ácidos grasos de cadena corta (acetato,
y butirato)
Rol en salud
Regula los niveles de glucosa, teniendo n efecto
protector frente al desarrollo de diabetes.
Rol en
enfermedad
Niveles elevados están implicados en el
de síndrome del intestino irritable, obesidad, y
alergias.
Dieta Alimentos ricos en fibra.
Ruminococcus spp.
Filo Firmicutes
Especies descritas En reclasificación…
Función
Descomposición de la celulosa de la dieta.
de metabolitos y ácidos grasos de cadena corta
(AGCC).
Rol en salud Inmunomodulador.
Rol en enfermedad
Niveles bajos asociados con Enfermedad
intestinal y enfermedad de Parkinson.
Dieta Fibra vegetal.
• Clostridium spp.
• Agathobacter spp.
• Eubacterium spp.
• Erysipelatoclostridium spp.
• Parabacteroides spp.
• Bilophila spp.
• Enterobacterias: (Escherichia, Proteus, Klebsiella)
• Fusobacterium spp.
Otros géneros
Firmicutes
Bacteroidetes
Proteobacteria
Fusobacteria
#PictureYourMicrobes
Lecciones aprendidas
• No hay una definición “clínica” de cómo es una microbiota normal.
• Los desequilibrios en la microbiota producen enfermedades, más no se conoce una bacteria o grupo de
bacterias específicos responsable de las mismas.
• La disbiosis intestinal puede ser causa de cambios en diversos grupos de bacterias, no siempre es causada
por las mismas.
• Los análisis de la microbiota son una fotografía del estado actual de la microbiota y debe interpretarse con
responsabilidad.
• La dieta equilibrada mejora la diversidad de la microbiota.
• El consumo de probióticos y prebióticos debe integrarse en la dieta para mejorar la salud intestinal.
• Azad, Md Abul Kalam, Manobendro Sarker, Tiejun Li, and Jie Yin. 2018. “Probiotic Species in the Modulation of Gut Microbiota: An Overview.” BioMed Research International
2018 (May): 9478630.
• Goldstein, Ellie J. C., Kerin L. Tyrrell, and Diane M. Citron. 2015. “Lactobacillus Species: Taxonomic Complexity and Controversial Susceptibilities.” Clinical Infectious Diseases:
An Official Publication of the Infectious Diseases Society of America 60 Suppl 2 (May): S98–107.
• Gorvitovskaia, Anastassia, Susan P. Holmes, and Susan M. Huse. 2016. “Interpreting Prevotella and Bacteroides as Biomarkers of Diet and Lifestyle.” Microbiome 4 (April): 15.
• Jeffery, I. B., and P. W. O’Toole. 2013. “Diet-Microbiota Interactions and Their Implications for Healthy Living.” Nutrients 5 (1): 234–52.
• Magne, Fabien, Martin Gotteland, Lea Gauthier, Alejandra Zazueta, Susana Pesoa, Paola Navarrete, and Ramadass Balamurugan. 2020. “The Firmicutes/Bacteroidetes Ratio: A
Relevant Marker of Gut Dysbiosis in Obese Patients?” Nutrients 12 (5). https://doi.org/10.3390/nu12051474.
• Parker, Bianca J., Pamela A. Wearsch, Alida C. M. Veloo, and Alex Rodriguez-Palacios. 2020. “The Genus Alistipes: Gut Bacteria With Emerging Implications to Inflammation,
Cancer, and Mental Health.” Frontiers in Immunology 11 (June): 906.
• Rinninella, Emanuele, Pauline Raoul, Marco Cintoni, Francesco Franceschi, Giacinto Abele Donato Miggiano, Antonio Gasbarrini, and Maria Cristina Mele. 2019. “What Is the
Healthy Gut Microbiota Composition? A Changing Ecosystem across Age, Environment, Diet, and Diseases.” Microorganisms 7 (1).
https://doi.org/10.3390/microorganisms7010014.
• Tamanai-Shacoori, Zohreh, Imen Smida, Latifa Bousarghin, Olivier Loreal, Vincent Meuric, Shao Bing Fong, Martine Bonnaure-Mallet, and Anne Jolivet-Gougeon. 2017.
“Roseburia Spp.: A Marker of Health?” Future Microbiology 12 (February): 157–70.
• Tomova, Aleksandra, Igor Bukovsky, Emilie Rembert, Willy Yonas, Jihad Alwarith, Neal D. Barnard, and Hana Kahleova. 2019. “The Effects of Vegetarian and Vegan Diets on
Gut Microbiota.” Frontiers in Nutrition 6 (April): 47.
• Zafar, Hassan, and Milton H. Saier Jr. 2021. “Gut Bacteroides Species in Health and Disease.” Gut Microbes 13 (1): 1–20.
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Guía microbiota

  • 1. Glosario de términos Interpretación Informe de resultados Sesión Final #PictureYourMicrobes
  • 2. A tener en cuenta… El análisis es una fotografía en el tiempo. La técnica utilizada sólo permite identificar bacterias hasta el nivel de género. No existen valores “normales” que faciliten la interpretación clínica. Hay microorganismos en % muy bajos que pueden no estar reflejados en los resultados. Un mismo género de bacterias puede incluir especies que tengan funciones totalmente opuestas.
  • 3. Principales filotipos Hay otros filos importantes en menor cantidad… además de virus, hongos y parásitos
  • 5. Géneros analizados En las muestras encontramos entre 100 a 200 géneros diferentes
  • 6. Alistipes spp. Filo Bacteroidetes Especies descritas ~ 13 especies. Función Comensal. Resistente a las sales biliares Rol en salud Efecto protector frente a colitis y trastornos Rol en enfermedad Aumento en su abundancia se relaciona con síndrome de fatiga crónica, depresión. Dieta Relacionada con ingesta de carne.
  • 7. Akkermansia spp. Filo Verrucomicrobia Especies descritas 2 especies (Sólo 1 en humanos) Función Degradación de mucina (Mantenimiento de la mucosa intestinal) Rol en salud Efecto protector frente a obesidad y de Diabetes Tipo 2. Rol en enfermedad Esclerosis múltiple (Niveles elevados). Dieta Relacionada con ingesta de polifenoles
  • 8. Bacteroides spp. Filo Bacteroidetes Especies descritas Más de 50 especies. Función Obtención de nutrientes de la dieta. Inmunomodulador Rol en salud Estimulación, maduración y mantenimiento del Sistema immune. Rol en enfermedad Niveles elevados están relacionados con mayor riesgo de síndrome metabólico (adiposidad corporal y resistencia a insulina). Patógeno oportunista. Dieta Dieta rica en productos animales con ausencia de fibras vegetales.
  • 9. Bifidobacterium spp. Filo Actinobacteria Especies descritas Más de 50 especies Función Uso como probiótico. Inmunomodulador. Rol en salud Efecto positivo en el mantenimiento del tránsito intestinal. Sistema inmunitario. Rol en enfermedad No se ha descrito Dieta Alimentos fermentados.
  • 10. Faecalibacterium spp. Filo Firmicutes Especies descritas Una especie (Faecalibacterium prausnitzii) Función Descomponen los carbohidratos complejos (almidones resistentes). Mantenimiento de la mucosa intestinal. Inmunomodulador. Rol en salud Efecto protector frente a enfermedad de Crohn. Rol en enfermedad Asma (Niveles disminuidos), obesidad (niveles elevados). Dieta Legumbres y cereales integrales sin procesar
  • 11. Prevotella spp. Filo Bacteroidetes Especies descritas ~ 50 especies Función Obtener vitaminas de las frutas y vegetales. Rol en salud Comensal. Mejora el metabolismo de la glucosa. Rol en enfermedad Enfermedades autoinmunes, resistencia a la insulina diabetes (Cambios en la abundancia de algunas especies) Inflamación intestinal (Niveles elevados) Dieta Alimentación rica en carbohidratos, particularmente fibra
  • 12. Lactobacillus spp. Filo Firmicutes Especies descritas ~17 especies Función Uso como probiótico. Inmunomodulador. Rol en salud Prevención de la diarrea, incluyendo la diarrea infecciosa y la diarrea causada por el uso de antibióticos Rol en enfermedad No se ha descrito. Dieta Alimentos fermentados.
  • 13. Roseburia spp. Filo Firmicutes Especies descritas ~ 5 especies. Función Fermenta carbohidratos indigeribles ácidos grasos de cadena corta (acetato, y butirato) Rol en salud Regula los niveles de glucosa, teniendo n efecto protector frente al desarrollo de diabetes. Rol en enfermedad Niveles elevados están implicados en el de síndrome del intestino irritable, obesidad, y alergias. Dieta Alimentos ricos en fibra.
  • 14. Ruminococcus spp. Filo Firmicutes Especies descritas En reclasificación… Función Descomposición de la celulosa de la dieta. de metabolitos y ácidos grasos de cadena corta (AGCC). Rol en salud Inmunomodulador. Rol en enfermedad Niveles bajos asociados con Enfermedad intestinal y enfermedad de Parkinson. Dieta Fibra vegetal.
  • 15. • Clostridium spp. • Agathobacter spp. • Eubacterium spp. • Erysipelatoclostridium spp. • Parabacteroides spp. • Bilophila spp. • Enterobacterias: (Escherichia, Proteus, Klebsiella) • Fusobacterium spp. Otros géneros Firmicutes Bacteroidetes Proteobacteria Fusobacteria
  • 16. #PictureYourMicrobes Lecciones aprendidas • No hay una definición “clínica” de cómo es una microbiota normal. • Los desequilibrios en la microbiota producen enfermedades, más no se conoce una bacteria o grupo de bacterias específicos responsable de las mismas. • La disbiosis intestinal puede ser causa de cambios en diversos grupos de bacterias, no siempre es causada por las mismas. • Los análisis de la microbiota son una fotografía del estado actual de la microbiota y debe interpretarse con responsabilidad. • La dieta equilibrada mejora la diversidad de la microbiota. • El consumo de probióticos y prebióticos debe integrarse en la dieta para mejorar la salud intestinal.
  • 17. • Azad, Md Abul Kalam, Manobendro Sarker, Tiejun Li, and Jie Yin. 2018. “Probiotic Species in the Modulation of Gut Microbiota: An Overview.” BioMed Research International 2018 (May): 9478630. • Goldstein, Ellie J. C., Kerin L. Tyrrell, and Diane M. Citron. 2015. “Lactobacillus Species: Taxonomic Complexity and Controversial Susceptibilities.” Clinical Infectious Diseases: An Official Publication of the Infectious Diseases Society of America 60 Suppl 2 (May): S98–107. • Gorvitovskaia, Anastassia, Susan P. Holmes, and Susan M. Huse. 2016. “Interpreting Prevotella and Bacteroides as Biomarkers of Diet and Lifestyle.” Microbiome 4 (April): 15. • Jeffery, I. B., and P. W. O’Toole. 2013. “Diet-Microbiota Interactions and Their Implications for Healthy Living.” Nutrients 5 (1): 234–52. • Magne, Fabien, Martin Gotteland, Lea Gauthier, Alejandra Zazueta, Susana Pesoa, Paola Navarrete, and Ramadass Balamurugan. 2020. “The Firmicutes/Bacteroidetes Ratio: A Relevant Marker of Gut Dysbiosis in Obese Patients?” Nutrients 12 (5). https://doi.org/10.3390/nu12051474. • Parker, Bianca J., Pamela A. Wearsch, Alida C. M. Veloo, and Alex Rodriguez-Palacios. 2020. “The Genus Alistipes: Gut Bacteria With Emerging Implications to Inflammation, Cancer, and Mental Health.” Frontiers in Immunology 11 (June): 906. • Rinninella, Emanuele, Pauline Raoul, Marco Cintoni, Francesco Franceschi, Giacinto Abele Donato Miggiano, Antonio Gasbarrini, and Maria Cristina Mele. 2019. “What Is the Healthy Gut Microbiota Composition? A Changing Ecosystem across Age, Environment, Diet, and Diseases.” Microorganisms 7 (1). https://doi.org/10.3390/microorganisms7010014. • Tamanai-Shacoori, Zohreh, Imen Smida, Latifa Bousarghin, Olivier Loreal, Vincent Meuric, Shao Bing Fong, Martine Bonnaure-Mallet, and Anne Jolivet-Gougeon. 2017. “Roseburia Spp.: A Marker of Health?” Future Microbiology 12 (February): 157–70. • Tomova, Aleksandra, Igor Bukovsky, Emilie Rembert, Willy Yonas, Jihad Alwarith, Neal D. Barnard, and Hana Kahleova. 2019. “The Effects of Vegetarian and Vegan Diets on Gut Microbiota.” Frontiers in Nutrition 6 (April): 47. • Zafar, Hassan, and Milton H. Saier Jr. 2021. “Gut Bacteroides Species in Health and Disease.” Gut Microbes 13 (1): 1–20. Referencias

Notas del editor

  1. https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fimmu.2020.00906/full Foto: https://microbiomology.org/microbe/alistipes/
  2. Ratio > 0,5% (entre 0.5 – 4 %) Foto: https://www.a-mansia.com/what-is-akkermansia-muciniphila/
  3. FOTO: https://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Bacteroides https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/19490976.2020.1848158
  4. Ratio: >0.5% FOTO: https://www.equisalud.com/es-es/componentes/bifidobacterium-bifidum/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5964481/
  5. Ratio >=5% FOTO: https://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Faecalibacterium_prausnitzii https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33709404/ https://www.hindawi.com/journals/ije/2018/4095789/
  6. FOTO: https://www.ecured.cu/Prevotella https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4828855/
  7. FOTO: https://prebioticosyprobioticos.com/microorganismos-probioticos/lactobacillus-paracasei/ https://academic.oup.com/cid/article/60/suppl_2/S98/379146
  8. FOTO: https://microbiomology.org/microbe/roseburia/ 3-15% of the total bacterial count in a healthy gut.
  9. FOTO: https://animalscience.tennessee.edu/?da_image=ruminococcus-flavefaciens