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Pronóstico
Epidemiológico
Fit 612
G. Mora
¿Qué factores determinan
la variabilidad?
El atributo mas importante
de una epidemia es la
variabilidad, es decir es
dinámica
Factores del Sistema Epidemiológico
Una epidemia resulta de la interacción de los factores epidemiológicos
La agresividad del patógeno (cantidad) contribuye con la
velocidad
Evento
Patogénesis
Periodo
Patogénesis
Condiciones
Favorables
Germinación
22 °C, sin radiación solar,
mojado foliar de 7 h
Periodo Latencia 17 a 25 °C
Periodo Incubación 19 a 26 °C Periodo Generación 17 a 26 °C
Tiempo de
ocurrencia
Germinación 1 - 5 horas Periodo Latencia
26 – 50 días
Periodo Incubación 17 – 42 días Periodo Generación 26 – 62 días
Hoja
Germinación Hoja nueva (0 – 20 días) Periodo Latencia Hoja madura (30 – 60 días)
Periodo Incubación Hoja madura (0 – 30 días) Periodo Generación Hoja madura (40 – 80 días)
Germinación Colonización Multiplicación
Deposición Infección Clorosis Liberación de inóculo
Incubación (Pi)
Latencia (Pl)
Generación (Pg)
Penetración 1° Síntoma visual Inicio
esporulación
Finaliza
esporulación
3%5%
30%
Incremento de
velocidad
Epidemia 1982
a 1984
Incremento
de velocidad
epidemia
Con datos de Méndez, I. 1984
Una curva de daño es variable durante el ciclo(s) del cultivo
Una epidemia tiene variabilidad en su forma y velocidad
Predio 1 (780msnm):
cantidad inicial daño: 3-30%
Cantidad final: 25-100%
Predio 2 (1100msnm):
cantidad inicial daño: 0.05%
Cantidad final: 2.5-4%
1. Una epidemia tiene también variabilidad a nivel predio
Caso Tapachula, Chiapas 1982-84
Epidemia: Curva de daño con parámetros que miden su variabilidad e
intensidad. Ejemplo: Coatepeque, Guatemala
0
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
20.AGO.09
15.SEP.09
03.OCT.09
15.OC.09
30.OCT.09
15.NOV.09
27.NOV.09
22.DIC.09
22.ENE.10
20.FEB.10
29.FEB.10
08.MAR.10
25.MAR.10
10.ABR.10
01.MAY.10
15.MAY.10
30.MAY.10
15.JUN.10
19.JUL.10
Yf = 9.68ABCPE = 6150
% Ciclo cultivo
Ymax = 46.7
Y0 = 1.1
Velocidad=
0.38%día
Área bajo la curva de daño
Daño máximo (Incidencia, severidad,
hojas con roya, número de pústulas, etc.)
Daño Final (Incidencia,
severidad,
hojas con roya,
número de pústulas,
etc.)
Velocidad de epidemia.
Incremento promedio diario
Daño inicial (Incidencia,
severidad,
hojas con roya,
número de pústulas, etc.)
2. Una epidemia tiene también variabilidad regional
0
10
20
30
40
50
60
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
#HOJASCONROYAEN20
RAMAS/10PLANTAS
INCIDENCIAYSEVERIDADDEROYA%
INCIDENCIA SEVERIDAD # T. H. ROYA
0
10
20
30
40
50
60
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
INCIDENCIAYSEVERIDADDEROYA%
#HOJASCONROYAEN20RAMAS/10
PLANTAS
# T. H. ROYA INCIDENCIA SEVERIDAD
Incidencia
Incidencia
Caso Guatemala 2009
¿Cómo podemos restituir
el balance?
Una epidemia implica un
desbalance productiv0
¿Cómo podemos
pronosticar la ocurrencia
de la roya del café?
La base es entender la
variabilidad
Antecedente Caso Colombia: Aplicación con base en la curva
epidemiológica regional y con base en fenología
Meta es definir umbrales manejo.
Por ejemplo: Cultivo del apio en Florida
Número de esporas/día Número de
aplicaciones/semana
0-100 1
100-300 2
300-500 3
>500 3-7
¿Podemos tener este tipo de pronóstico para roya del cafeto?
Ejemplos de modelos de
pronóstico casos:
1. Fusarium y Lasiodiplodia-Mango
2. Colletotrichum sp-cítricos
Caso
1. Selección de los factores y variables epidemiológicas
Caso : Mango
Brasil y México
Daniela Lopez (Embrapa Brasil)
Gustavo Mora A (CP Mexico)
PETROLINA
CASA NOVA
LAGOA
GRANDE
CURAÇÁ
JUAZEIRO
SOBRADINHO
COPAFRUIT
UPA AGRÍCOLA
FRUITFORT
BOA ESPERANÇA
NOVA FRONTEIRA
SÃO FRANCISCO
AGUISA (ABARÉ, BA)
AGRODAN (IBÓ, PE)
2. Planeación regional: Número y localización de trampas
de esporas y estaciones meteorológicas
Valle de San Francisco, Petrolina Brasil
MONITORAMENTO DE ESPOROS NA CULTURA DA MANGUEIRA
EMPRESA: Nova Fronteira
Data Patógeno/Total diário do número de esporos
da Alternária Alternária Colletotrichum Fusarium Lasiodiplodia Oidium
Coleta alternata solani
14/03/02 0 1 0 0 0 0
15/03/02 0 0 0 0 0 0
16/03/02 1 4 0 0 2 0
17/03/02 2 5 0 0 0 0
18/03/02 0 3 0 0 3 0
19/03/02 0 3 0 0 10 0
20/03/02 0 0 0 0 1 0
3. Medición de variables:
• Número de esporas diárias
• Registro diário de temperatura, lluvia, etc.
• Medición de daño (p.e. incidencia)
Fluctuación de esporas de Lasiodiplodia
0
50
100
150
200
250
300
350
400
450
500
04/07/01
11/07/01
18/07/01
25/07/01
01/08/01
08/08/01
15/08/01
22/08/01
29/08/01
05/09/01
12/09/01
19/09/01
26/09/01
SFrancisco UPA Fruitfort
Importancia de la Calidad del Dato en Evaluaciones
Morte descendente da mangueira
0
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
abr-01
jun-01
ago-01
out-01
dez-01
fev-02
abr-02
jun-02
ago-02
out-02
dez-02
fev-03
abr-03
jun-03
data
%ramos/infl.afetadas
0
100
200
300
400
500
600
700
800
epidemias vegetativas epidemias florais floração
0
50
100
150
200
250
300
abr-01
jun-01
ago-01
out-01
dez-01
fev-02
abr-02
jun-02
ago-02
out-02
dez-02
fev-03
abr-03
jun-03
data
no.esporosLasiodiplodia/dia
Muerte Regresiva del Mango
Importancia de la Calidad del Dato en Evaluaciones
%inflorescenciasafectadas
Fecha
No.esporasdeLasiodiplodia
Fecha
Epidemia en flores FloraciónEpidemia Vegetativas
Inc = Esp14 (0.0011) + T3014 (0.0030) + HR14 (0.0018)
0.01
0 5 13 18 23 26 31 36 41 47 50
0,010
0,015
0,020
0,025
0,030
0,035
54
Inc = Esp14 (0.0011) + T3014 (0.0030) + HR14 (0.0018)
(0.0011) + (0.0030) + (0.0018) =
(0.0011) + (0.0030) + (0.0018) =
0.01 0 10.5 0.019
2.72 1 5.5 0.016
(0.0011) + (0.0030) + (0.0018) =0.01 3 4.5 0.017
R2=0.93 (p=0001)
Error=7%
CPm=3.0
Dias
Incidencia(arcsininc1/2)
Inc = Esp21 (0.00073) + Tmax21 (0.00014)
R2=0.42 (P=001)
Error 58%
0.00
0.01
0.02
0.03
0.04
0.05
0.06
Sep Nov En1 En3 Feb2 Mar May
IncidencianoAcumulada
Criterio de inicio de
control químico
0.00
100
200
300
0.00
0.20
0.40
0.60
0.80
JunAgoNovEn1En3Feb2
NúmerodeEsporasVelocidaddeViento
Criterio de Poda
Previo a Brotación
r2=0.24 (P=059
(Petrolina BR9
Aplicación del criterio fenológico en el control
Control
Integrado
10
20
30
40
0.00.0
10
20
30
40
50
70
Control
Productor
Sep Oct Nov Dec En1 En2 En3 En4
Vegetative Blossom
50
Sep Oct Nov Dec En1 En2 En3 En4
Vegetative Blossom
PorcentagedeBrotesEnfermos
Promedio
Yo=6%
Poda
Poda
Control Químico
Promedio
ABCPE=300
Control Químico
Promedio
ABCPE=100
Manejo
Promedio
Yo=3.5%
Caso 2. Cítricos
Caída de Fruto Pequeño
Daño severo de la enfermedad Tachuelas adheridas a la rama
Monitoreo del patógeno. Trampas esporas de
volumétrica o succión
4. Definición de Variables en un Modelo
probabilístico
Variables Simbolos
Independientes
No. de esporas no acumuladas de Colletotrichum sp. Esp1-8
No. de esporas acumuladas de Colletotrichum sp. Esp21-8
Temperatura mínima Tmin1-8
Temperatura máxima Tmax1-8
Humedad Relativa Máxima HRmax1-8
Humedad Relativa Máxima acumulada HRmax21-8
Dependientes
Porcentaje de incremento de enfermedad Yt-Yt-1
Reyes, 2002
1. Relación daño con esporas y clima
0
5
10
15
20
25
30
0
5
10
15
20
25
30IncidenciaabsolutaEsporasHR(%)
T(ºC)
3 5 7 9 11 13 15 17 19 21 23 25 27 29 31
10
30
50
70
90
10
15
20
25
30
Tiempo (Días)
19c / 6
90% / 6
Inf.
Latentes
Inf.
Activas
Inc = 0.021 espo3 + 0.016 Tmi2
R2 = 0.93
Cp = 1.09
VIF = 14.3
Modelos generados para predecir la ocurrencia
14.29*4.151.09550.910.93Inc=0.021espo3+0.016Tmi2
3.57*1.01.62120.690.72Inc=0.004HRmax7
4.35*1.00.46200.740.77Inc=0.017Tmi7
5.55*1.00.00760.800.82Inc=0.021Tmi6
16.66*1.00.75110.930.94Inc=0.024Tmi4
10.00*1.00.66860.890.90Inc=0.023Tmi3
5.00*1.01.00.780.80Inc=0.026espo3
4.76*1.00.21740770.79Inc=0.025espo2
VIFdVIFeCpRa2bR2Modeloa
¿Qué avances se
tienen en pronóstico
local de roya del
cafeto en relación
brote actual?
El Cafeto Patógeno Clima
Manejo
del
Cultivo
El Marco Racional Epidemiológico
Variables
Fenología Esporas
Patogénesis
Daño
Temperatura
Humedad Relativa
Punto de Rocío
Variedad
Sombra
Edad, otras
Productos
Impactos productivo Indicadores epidémicos
El daño ocurre en ciclos
La explosividad de una epidemia= a) mas ciclos
b) ciclos cortos
Evento
Patogénesis
Periodo
Patogénesis
Germinación Colonización Multiplicación
Deposición Infección Clorosis Liberación de inóculo
Incubación (Pi)
Latencia (Pl)
Generación (Pg)
Penetración 1° Síntoma visual Inicio
esporulación
Finaliza
esporulación
CHIAPAS: Curva epidémica y clima. Caso Municipio A. A. Corzo: A 14 marzo, 2014
Pérdida estimada 28.7%
Tapachula 8.5%
65% Severidad Máxima
Periodo Sostenido Daño: Fruto en Desarrollo a cosecha
20-22oC
>90%HR
CHIAPAS: Curva epidémica caso Parcela: A.A.Corzo – Gilberto Vázquez (pf.chi.ang.7 )
65% Severidad Máxima
20-22oC
>90%HR
VERACRUZ : Ejemplo curva epidémica y clima. Caso Soteapan: hasta 14 marzo, 2014
65% Severidad Máxima
Periodo reducido Daño:Fruto maduro
>22oC
Indicadores Epidemiológicos: Puebla
Pronostico con base en cantidad de inoculo estimado con cantidad
pústulas senescentes (viejas( y nuevas
INÓCULO 1º
SOROS
SENESCENTES
INÓCULO 2º
SOROS NUEVOS
HOJAS CON ROYA
- Inóculo 1°; lesiones necróticas del año anterior, que pueden o no esporular al borde.
- Inóculo 2°; pústulas de color naranja-amarillo de diámetro variable que puede o no estar esporulando.
G. Calderón, 2012. Datos no publ.
Aloinfección
Autoinfección
Aplicación formal de relaciones de variables:
1. Modelos de pronóstico a nivel parcelario y localidad en Guatemala
Modelo
Var.
Indep.
R2 R2
aj. Cp VIF LOCALIDAD
HROY = 4.54SSEN2 SSEN2 0.86 0.84 8.93 1.00 R3 ESCUINTLA
HROY = 2.69SSEN4 SSEN4 0.68 0.67 0.05 1.00 R2 SAMAYAC
HROY = 1.71SSEN1 +
1.69SSEN4
SSEN1,
SSEN4
0.94 0.93 1.78 1.09 R1 EL QUETZAL
HROY = 2.71SSEN1 SSEN1 0.98 0.97 -1.76 1.00 R1 EL PALMAR 1
HROY = 2.27SSEN2 SSEN2 0.92 0.91 5.20 1.00 R1 EL TUMBADOR
HROY = Hojas con roya en ramas laterales
SSEN = Soros senescentes por hoja (con sus lag 1, 2, 3 y 4, estos son a cada 15 días)
G. Calderón y Col. 2012. Datos no
publicados
Modelo de Pronóstico con base en Densidad de Inóculo
Modelo Var. Indep. R2 R2
aj. C(p) VIF LOCALIDAD
No. Hojas Roya = 2.27 (SSEN2)
SEN2 es No. Soros Senescentes en 30 días
SSEN2 0.92 0.91 5.20 1.00 R1 EL TUMBADOR
G. Calderón et al., 2012
Datos no publicados
*
*
*
---------------------- region=1 local=ElTumba -----------------------------
Trazado de hroy*dias. El símbolo usado es '*'.
Trazado de hroyest*dias. El símbolo usado es 'o'.
hroy |
100 |
|
|
| o
| o
|
| o o o
|
| o o o
50 | o
| o*
| o *
| *
| * * *
| o *
|
|
| * * * * * *
0 |*** ** *o o*o o
-|------------------|------------------|--
0 200 400
días
Epidemia Campo
Epidemia pronóstico
R2= 0.91
Región 1 El Tumbador
La variabilidad parcelaria se
debe integrar a variabilidad
regional
¿Cómo podemos pronosticar
la ocurrencia de la roya del
café a nivel regional?
Incidencia
Severidad
Soros
Hojas
con roya
Condiciones
Favorables
Hrs
favorables
#
mojados
Mm
lluvia
T°
HR
PP
Datos
estaciones
El modelo epidemiológico aplicado en ventanas
inductivas caso Guatemala
Condiciones
Favorables
Fenología
EdadFollaje
Problema: La defoliación factor de subestimación del
efecto de clima
Fluctuación del número de hojas con roya en el tiempo, respecto a
la brotación y desarrollo de hojas en la planta. Esto permitió
corregir por defoliación. Se calculó incrementos absolutos.
-30
-20
-10
0
10
20
30
-100
-80
-60
-40
-20
0
20
40
60
80
100
#HOJASEN20RAMAS/10PL.
S/AC. H.T. S/AC. H.R.
0
10
20
30
40
50
60
70
80
#HOJASEN20RAMAS/10PL
H.T. H.R.
CAMBIO ABSOLUTO CAMBIO ABSOLUTO CORREGIDO
Datos climáticos: Fundamental para la aplicación del
concepto. Red de estaciones climáticas de ANACAFE
Área de monitoreo de roya del café en los años 2009 - 2010
El concepto de ventana= Cambio estacional absoluto
de daño (en un año productivo)
0
10
20
30
40
50
60
70
80
IncrementoAbs.Núm.hojas
H.R. H.T.
V1
# días
ABCPE
V2 V3
Ciclo de producción
Tejido+inoculo
Noclimainductivo
Tejido+inoculo
Climainductivo
Tejido+inoculo
Climainductivo
ABCPE
Ventana Inductiva= f(V1,V2,V3)
El concepto de Ventana= Periodo estacional inductivo de
daño en función a variables de clima
# días
0
10
20
30
40
50
60
70
80
#HOJAS
H.R. H.T.
ABCPE
Tejido+inóculo
Climainductivo
ABCPE
V1
Ventana Inductiva= f (V1, V2, V3)
T (20-22ºC) y HR(>90%)
Núm. de eventos lluvia (mojado)
Total de precipitación
Vi
Germinación Colonización Multiplicación
Deposición Infección Clorosis Liberación de inóculo
Penetración 1° Síntoma visual Inicio
esporulación
Finaliza
0
2
4
6
8
10
12
0.0
27.3
54.7
Frecuencia
Clases
Horas Favorables t° 20-22°c y HR > 90% m
0
2
4
6
8
10
12
0.0
26.5
53.0
Frecuencia
Clases
Eventos de mojado (numero de precipitacione
0
2
4
6
8
10
12
14
16
0.0
123.6
247.3
Frecuencia
Clases
Mm de Lluvia Coatepeque, 536 m
Vi= (Clase TH)(Frec.)
+ (Clase M)(Freqc.)
+(Clase P)(Frec.)
VI= V1+V2+V3
Modelo Aditivo
Modelo Ponderativo
Vi= 1.5(Clase TH)(Frec.)
+ (Clase M)(Freqc.)
+2(Clase P)(Frec.)
VI= V1+V2+V3
¿Cómo podemos aplicar el
pronóstico de variables
climáticas en la estimación
de ventanas inductivas en
estudios regionales?
Validación del Modelo
• Se compararon Mapas de ventanas inductivas regionales con
Mapas de Incidencia y Severidad.
• Los datos de incidencia fueron obtenidos mediante encuesta a
técnicos regionales de ANACAFE. La severidad se estimó
mediante el modelo siguiente.
y = 0.0066x2 - 0.3131x + 6.1746
R² = 0.8631
0
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
0 20 40 60 80 100
SEVERIDAD
INCIDENCIA
*Variable estimada con datos de Calderón (2009-2010) bajo
el modelo de regresión lineal simple:
y = 0,660x + 0,991
r² = 0,774
Dónde:
y = Hojas Roya
x = Incidencia
Mapa de intensidad de severidad de roya del cafeto.
Guatemala 2012
Pronóstico regional con ventanas de Inductividad Climática
Ver: 13marzo13
Evidencia de incremento de horas favorables en el tiempo.
Coatepeque, Quetzaltenango (600 msnm)
0.0000
0.0005
0.0010
0.0015
0.0020
0.0025
0.0030
0.0035
0.0040
0.0045
-400
-360
-320
-280
-240
-200
-160
-120
-80
-40
0
40
80
120
160
200
240
280
320
360
400
2007
2008
2009
2010
2011
2012
DESPLAZAMIENTO DE MEDIA
Incidencia 2009-2010
318 000 mediciones/6 años
¿Qué avances se
tienen en pronóstico
regional de roya del
cafeto en relación
brote actual?
Severidad Oct-12
Severidad Nov-12
Mapas de intensidad de daño. Chiapas
Defoliación Oct-12
Defoliación Nov-12
Comportamiento de la roya Chiapas. Muestreo Nov-Dic 2012
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
ACACOYAGUA
AMATENANGODELAFRONTERA
CACAHOATAN
ELPORVENIR
ESCUINTLA
HUIXTLA
MOTOZINTLA
OCOZOCOAUTLADEESPINOSA
TAPACHULA
TUZANTAN
UNIONJUAREZ
%dedaño
Incidencia Severidad Defoliación
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
BOURBON CATUAI CATURRA TYPICA
%dedaño
Incidencia Severidad Defoliación
Por municipio
Por variedad
Gráficos de Muestreo Nov-Dic 2012
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
Intensivo Organico ( certificado
)
Semintensivo Tradicional
%dedaño
Incidencia Severidad Defoliación
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
Desarrollo Madurez fisiologica
%dedaño
Incidencia Severidad Defoliación
Por Manejo del Cultivo
Por fenología
Gráficos de Muestreo Nov-Dic 2012
0
50
100
150
200
250
8
13
17
22
26
31
35
40
45
Frecuencia
Clases
Histograma de Frecuencias Edad
> 50%
Modelo de Pronóstico generado a partir de Muestreo Nov-Dic 2012
0.08 0.08 0.08 0.09
0.14
0.33
0.64
1.00 1.00
0.0
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
0.8
0.9
1.0
0
20
40
60
80
100
120
140
0
14
29
43
57
71
86
100
114
Frecuencia
Clases
Histograma de Frecuencias Incidencia
0.07 0.08
0.22
0.67
0.89
0.99 1.00 1.00 1.00
0.0
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
0.8
0.9
1.0
0
20
40
60
80
100
120
140
160
180
0
11
21
32
43
54
64
75
86
Frecuencia
Clases
Histograma de Frecuencias Severidad
0.00
0.04
0.13
0.63
0.77
0.93 0.93
1.00 1.00
0.0
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
0.8
0.9
1.0
0
20
40
60
80
100
120
140
160
180
200
0
14
29
43
57
71
86
100
114
Frecuencia
Clases
Histograma de Frecuencias Defoliación
Variable Modelo y=1-e[-(t/b)c] Sig r2
Incidencia
y=1-e[-(t/175.8) 5.5] 0.98
Severidad
y=1-e[-(t/89.4) 3.05] 0.99
Defoliación
y=1-e[-(t/99.67) 2.75] 0.97
Modelos de pronóstico
y=1-e[-(t/175.8) 5.5]
y=1-e[-(t/89.4) 3.05] y=1-e[-(t/99.67) 2.75]
¿Cómo se integra esta
información al Plan
Estratégico para el Manejo
Preventivo de la roya?
1. Determinación del Número de Parcelas Centinela por Estado
1
Escalar Muestreo
1
Considerar Fracción de Ha 2
Municipio
Sup_Café (has) Pond_Superf Pond_Foco Pond_Prec Pond_Altura Pond_Temp Fact_Pond Log Fact_Pond No. Sitios Ni
Log
Parcelas centinela
ACAPONETA
36
1
1
1
2
1
2.0
0.3
5.13
5.1 0.7873
0
COMPOSTELA
6120
4
1
1
3
2
24.0
1.4
61.54 61.5 1.7961
0
HUAJICORI
21.00
1
1
3
2
3
18.0
1.3
46.15 46.2 1.6735
0
NAYAR EL
313.42
2
1
3
2
3
36.0
1.6
92.31 92.3 1.9699
1
RUIZ
2848.32
3
1
4
2
2
48.0
1.7
123.08 123.1 2.0937
1
SAN BLAS
3847
4
1
4
2
2
64.0
1.8
164.10 164.1 2.2178
1
SANTA MARIA DEL ORO
27.00
1
1
1
3
2
6.0
0.8
15.38 15.4 1.2144
0
SANTIAGO IXCUINTLA
2,445.00
3
1
4
2
2
48.0
1.7
123.08 123.1 2.0937
1
TEPIC
931
2
1
3
3
2
36.0
1.6
92.31 92.3 1.9699
1
XALISCO
3513
4
1
3
3
3
108.0
2.0
276.92 276.9 2.4439
2
20101.74
390.0
14.0
1000
1000
7
No. Hectáreas
Cercanía
de Foco
Altitud
Temp. Prec.
Superficie
Café
P. centinela= LogFact_Pond/(Sup_Café^( ∑Fact_Pond)) *((t)*(2))
Factor
Operativo
1
Escalar Muestreo 1
Considerar Fracción de Ha 2
Municipio Sup_Café (has) Pond_Superf Pond_Foco Pond_Prec Pond_Altura Pond_Temp Fact_Pond Log Fact_Pond No. Sitios Ni Log Parcelas centinela
ACAPONETA 36 1 1 1 2 1 2.0 0.3 5.13 5.1 0.7873 0
COMPOSTELA 6120 4 1 1 3 2 24.0 1.4 61.54 61.5 1.7961 0
HUAJICORI 21.00 1 1 3 2 3 18.0 1.3 46.15 46.2 1.6735 0
NAYAR EL 313.42 2 1 3 2 3 36.0 1.6 92.31 92.3 1.9699 1
RUIZ 2848.32 3 1 4 2 2 48.0 1.7 123.08 123.1 2.0937 1
SAN BLAS 3847 4 1 4 2 2 64.0 1.8 164.10 164.1 2.2178 1
SANTA MARIA DEL ORO 27.00 1 1 1 3 2 6.0 0.8 15.38 15.4 1.2144 0
SANTIAGO IXCUINTLA 2,445.00 3 1 4 2 2 48.0 1.7 123.08 123.1 2.0937 1
TEPIC 931 2 1 3 3 2 36.0 1.6 92.31 92.3 1.9699 1
XALISCO 3513 4 1 3 3 3 108.0 2.0 276.92 276.9 2.4439 2
20101.74 390.0 14.0 1000 1000 7
No. Hectáreas
2. Determinación del Número de Parcelas Centinela por Estado
Soporte Estadístico
Estado
Sup. Café
(Ha)
Porcentaje de Error
2 (tecnicos)
1% 5% 10%
Chiapas 257367.99 94 68.7 37.6 48
Veracruz 156977.17 57.071 41.9 22.9 44
Oaxaca 154745.78 56.259 41.3 22.6 12
Puebla 71448.91 25.976 19.1 10.4 32
Guerrero 47161.75 17.146 12.6 6.9 36
Hidalgo 26333.26 9.574 7.0 3.8 14
Nayarit 20101.74 7.308 5.4 2.9 6
SLP 18379.5 6.682 4.9 2.7 10
Jalisco 3983 1.448 1.1 0.6 4
Colima 2573.5 0.936 0.7 0.4 6
n=[((N)*(ᵶ²)*(S²)/(N)*(d²)+(ᵶ²)*(S²))*(hai/hax)]*(Fact_Pond/∑Fact_Pond)
3. Criterios para selección de parcelas centinelas
1. Altitud.
2. Variedades susceptibles.
3. Manejo (orgánico y/o convencional).
4. Tipo de tecnificación.
5. Tipología de producción.
Mapa de producción café a nivel Nacional
Mapa de altitud y superficie de café
4. Metodología de Muestreo y Evaluación de Severidad en Planta y porcentaje de
Defoliación en Planta
• Seleccionar en el centro de cada parcela centinela (1 ha) un
bloque de 37 x 37 plantas, de tal forma que no se considere el
bordo de la parcela.
• Seleccionar una planta cada cuatro, es decir, una planta sí y tres
no, en total se evaluarán 100 plantas, las cuales se ilustran con
un recuadro azul en la siguiente diapositiva.
• Evaluar en las 100 plantas seleccionadas la Severidad en Planta
y el Porcentaje de Defoliación en Planta, en base a las escalas
diagramáticas específicas para este fin.
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
4. Metodología de Muestreo y Evaluación de Severidad en Planta y porcentaje de Defoliación en
Planta
1 2 1 0 1 2 3 0 2 0
3 4 1 2 3 2 2 3 1 1
1 2 2 2 1 4 3 1 2 0
1 3 1 1 1 2 3 0 2 3
0 2 1 0 1 2 3 0 2 3
Escalas de Severidad en Planta y porcentaje de Defoliación en Planta
0
(Sano)
1
(3%)
2
(10%)
3
(30%)
4
(60%)
0
(Sana)
1
(20%)
2
(40%)
3
(60%)
4
(>60%)
Severidad en planta
Porcentaje de defoliación
5. Metodología de Muestreo y Evaluación de Severidad en Hoja y
variables Fenológicas
• Seleccionar en el centro de cada parcela centinela (1 ha) un
bloque de 37 x 37 plantas.
• Dentro del bloque de 37 x 37 plantas establecer el método cinco
de oros compuesto, el cual consiste en seleccionar 5 puntos (4
esquinas y uno en el centro) en cada punto seleccionar cuatro
plantas, para un total de 20 plantas, el método 5 de oros
compuesto y las plantas a seleccionar se ilustran con el circulo
amarillo, recuadro azul.
• Evaluar en las 20 plantas seleccionadas las siguientes variables:
Severidad en Planta, Hoja, en base a las escalas diagramáticas
diseñadas para este fin, y las siguientes variables Fenológicas:
Fenología
• Hojas jóvenes
• Hojas viejas
• Brotación
• Floración
• Amarre de fruto
• Fruto Acuoso
• Fruto
Lechoso
• Fruto
Consistente
• Fruto Maduro
• Ramas
productivas
5. Metodología de Muestreo y Evaluación de Severidad en Hoja y variables Fenológicas
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
Ubicación para evaluación de variables FenológicasSeveridad en Hoja
1
0
3
2
1
0
3
2
Escala de Severidad en Hoja
Estrato alto
Estrato medio
Estrato bajo
No. de brotes/rama
seleccionada
No. de frutos
amarre/rama
No. de rama
productivas
No. de flores/rama
No. de frutos
acuosos/rama
No. de frutos
lechosos/rama
No. de frutos
consist./rama
No. de frutos
maduros/rama
Variables a evaluar
No. de brotes/rama
seleccionada
No. de frutos
amarre/rama
No. de rama
productivas
No. de flores/rama
No. de frutos
acuosos/rama
No. de frutos
lechosos/rama
No. de frutos
consist./rama
No. de frutos
maduros/rama
6. Metodología de Evaluación de Variables Fenológicas
Viento
dominante
Parcela centinela (1 ha)
37 plantas
37plantas
Borde de
parcela
Borde de
parcela
Trampas aerobiológicas
pasivas
Trampas aerobiológicas
pasivas
Estación Agroclimática
Trampa volumétrica
Datalogger
7. Monitoreo de esporas y evaluación de variables climáticas
500 ha
Parcela centinela
(1 ha)
Parcela
demostrativa
Investigación
participativa
Muestreo
dirigido
5 de oros
compuesto
Variables experimentales
Productos químicos
Nutrición
Manejo planta
Parcelas
Experimentales
Investigación
con productor
cooperante
Criterios Decisión
(UMB) Modelos de
Pronostico local y
regional
Parcelas
Experimentales
Investigación
con productor
cooperante
Parcela
demostrativa
Investigación
participativa
8. Distribución de parcelas
centinela y área de acción
Variables de daño
Severidad en Planta y Hoja
Variables Fenológicas
Defoliación
Muestreo
sistemático
Plataforma de Datos
Aprox. 50 parcelas
En Chiapas Méx.
Conclusiones
• La roya de cafeto en México por mas de 30 años se ha comportado
endémico con baja prevalencia. En 2010 se reportaron incrementos
atípicos de incidencia de roya en Colombia, Guatemala y Honduras.
• El incremento epidémico esta aparentemente asociado con
variaciones climática, principalmente incremento de precipitación.
• Es importante un programa de monitoreo y evaluación regional de la
roya que permita determinar las acciones fitosanitarias mas
adecuadas con bases biológicas y epidemiológicas.
• El uso de modelos de pronóstico a nivel local y regional con base en
variables de clima, hospedante y patógeno pueden optimizar las
acciones de vigilancia y control.
• El empleo de parcelas centinelas están concebidas para generar
instrumentos de decisión con un adecuado soporte racional y
operativo.
GRACIAS
Contacto: Dr. Gustavo Mora Aguilera
Coordinador SINAVEF-LAB
morag@colpo.mx
sinaveflab@gmail.com
Tel: (01-595) 95-20200
Ext. 1620-1614

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Epidemiología y pronóstico2014

  • 2. ¿Qué factores determinan la variabilidad? El atributo mas importante de una epidemia es la variabilidad, es decir es dinámica
  • 3. Factores del Sistema Epidemiológico Una epidemia resulta de la interacción de los factores epidemiológicos
  • 4. La agresividad del patógeno (cantidad) contribuye con la velocidad Evento Patogénesis Periodo Patogénesis Condiciones Favorables Germinación 22 °C, sin radiación solar, mojado foliar de 7 h Periodo Latencia 17 a 25 °C Periodo Incubación 19 a 26 °C Periodo Generación 17 a 26 °C Tiempo de ocurrencia Germinación 1 - 5 horas Periodo Latencia 26 – 50 días Periodo Incubación 17 – 42 días Periodo Generación 26 – 62 días Hoja Germinación Hoja nueva (0 – 20 días) Periodo Latencia Hoja madura (30 – 60 días) Periodo Incubación Hoja madura (0 – 30 días) Periodo Generación Hoja madura (40 – 80 días) Germinación Colonización Multiplicación Deposición Infección Clorosis Liberación de inóculo Incubación (Pi) Latencia (Pl) Generación (Pg) Penetración 1° Síntoma visual Inicio esporulación Finaliza esporulación
  • 5. 3%5% 30% Incremento de velocidad Epidemia 1982 a 1984 Incremento de velocidad epidemia Con datos de Méndez, I. 1984 Una curva de daño es variable durante el ciclo(s) del cultivo Una epidemia tiene variabilidad en su forma y velocidad Predio 1 (780msnm): cantidad inicial daño: 3-30% Cantidad final: 25-100% Predio 2 (1100msnm): cantidad inicial daño: 0.05% Cantidad final: 2.5-4% 1. Una epidemia tiene también variabilidad a nivel predio Caso Tapachula, Chiapas 1982-84
  • 6. Epidemia: Curva de daño con parámetros que miden su variabilidad e intensidad. Ejemplo: Coatepeque, Guatemala 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 20.AGO.09 15.SEP.09 03.OCT.09 15.OC.09 30.OCT.09 15.NOV.09 27.NOV.09 22.DIC.09 22.ENE.10 20.FEB.10 29.FEB.10 08.MAR.10 25.MAR.10 10.ABR.10 01.MAY.10 15.MAY.10 30.MAY.10 15.JUN.10 19.JUL.10 Yf = 9.68ABCPE = 6150 % Ciclo cultivo Ymax = 46.7 Y0 = 1.1 Velocidad= 0.38%día Área bajo la curva de daño Daño máximo (Incidencia, severidad, hojas con roya, número de pústulas, etc.) Daño Final (Incidencia, severidad, hojas con roya, número de pústulas, etc.) Velocidad de epidemia. Incremento promedio diario Daño inicial (Incidencia, severidad, hojas con roya, número de pústulas, etc.)
  • 7. 2. Una epidemia tiene también variabilidad regional 0 10 20 30 40 50 60 0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 #HOJASCONROYAEN20 RAMAS/10PLANTAS INCIDENCIAYSEVERIDADDEROYA% INCIDENCIA SEVERIDAD # T. H. ROYA 0 10 20 30 40 50 60 0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 INCIDENCIAYSEVERIDADDEROYA% #HOJASCONROYAEN20RAMAS/10 PLANTAS # T. H. ROYA INCIDENCIA SEVERIDAD Incidencia Incidencia Caso Guatemala 2009
  • 8. ¿Cómo podemos restituir el balance? Una epidemia implica un desbalance productiv0
  • 9. ¿Cómo podemos pronosticar la ocurrencia de la roya del café? La base es entender la variabilidad
  • 10. Antecedente Caso Colombia: Aplicación con base en la curva epidemiológica regional y con base en fenología
  • 11. Meta es definir umbrales manejo. Por ejemplo: Cultivo del apio en Florida Número de esporas/día Número de aplicaciones/semana 0-100 1 100-300 2 300-500 3 >500 3-7 ¿Podemos tener este tipo de pronóstico para roya del cafeto?
  • 12. Ejemplos de modelos de pronóstico casos: 1. Fusarium y Lasiodiplodia-Mango 2. Colletotrichum sp-cítricos
  • 13. Caso 1. Selección de los factores y variables epidemiológicas Caso : Mango Brasil y México Daniela Lopez (Embrapa Brasil) Gustavo Mora A (CP Mexico)
  • 14. PETROLINA CASA NOVA LAGOA GRANDE CURAÇÁ JUAZEIRO SOBRADINHO COPAFRUIT UPA AGRÍCOLA FRUITFORT BOA ESPERANÇA NOVA FRONTEIRA SÃO FRANCISCO AGUISA (ABARÉ, BA) AGRODAN (IBÓ, PE) 2. Planeación regional: Número y localización de trampas de esporas y estaciones meteorológicas Valle de San Francisco, Petrolina Brasil
  • 15. MONITORAMENTO DE ESPOROS NA CULTURA DA MANGUEIRA EMPRESA: Nova Fronteira Data Patógeno/Total diário do número de esporos da Alternária Alternária Colletotrichum Fusarium Lasiodiplodia Oidium Coleta alternata solani 14/03/02 0 1 0 0 0 0 15/03/02 0 0 0 0 0 0 16/03/02 1 4 0 0 2 0 17/03/02 2 5 0 0 0 0 18/03/02 0 3 0 0 3 0 19/03/02 0 3 0 0 10 0 20/03/02 0 0 0 0 1 0 3. Medición de variables: • Número de esporas diárias • Registro diário de temperatura, lluvia, etc. • Medición de daño (p.e. incidencia)
  • 16. Fluctuación de esporas de Lasiodiplodia 0 50 100 150 200 250 300 350 400 450 500 04/07/01 11/07/01 18/07/01 25/07/01 01/08/01 08/08/01 15/08/01 22/08/01 29/08/01 05/09/01 12/09/01 19/09/01 26/09/01 SFrancisco UPA Fruitfort Importancia de la Calidad del Dato en Evaluaciones
  • 17. Morte descendente da mangueira 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 abr-01 jun-01 ago-01 out-01 dez-01 fev-02 abr-02 jun-02 ago-02 out-02 dez-02 fev-03 abr-03 jun-03 data %ramos/infl.afetadas 0 100 200 300 400 500 600 700 800 epidemias vegetativas epidemias florais floração 0 50 100 150 200 250 300 abr-01 jun-01 ago-01 out-01 dez-01 fev-02 abr-02 jun-02 ago-02 out-02 dez-02 fev-03 abr-03 jun-03 data no.esporosLasiodiplodia/dia Muerte Regresiva del Mango Importancia de la Calidad del Dato en Evaluaciones %inflorescenciasafectadas Fecha No.esporasdeLasiodiplodia Fecha Epidemia en flores FloraciónEpidemia Vegetativas
  • 18. Inc = Esp14 (0.0011) + T3014 (0.0030) + HR14 (0.0018)
  • 19. 0.01 0 5 13 18 23 26 31 36 41 47 50 0,010 0,015 0,020 0,025 0,030 0,035 54 Inc = Esp14 (0.0011) + T3014 (0.0030) + HR14 (0.0018) (0.0011) + (0.0030) + (0.0018) = (0.0011) + (0.0030) + (0.0018) = 0.01 0 10.5 0.019 2.72 1 5.5 0.016 (0.0011) + (0.0030) + (0.0018) =0.01 3 4.5 0.017 R2=0.93 (p=0001) Error=7% CPm=3.0 Dias Incidencia(arcsininc1/2)
  • 20. Inc = Esp21 (0.00073) + Tmax21 (0.00014) R2=0.42 (P=001) Error 58%
  • 21. 0.00 0.01 0.02 0.03 0.04 0.05 0.06 Sep Nov En1 En3 Feb2 Mar May IncidencianoAcumulada Criterio de inicio de control químico 0.00 100 200 300 0.00 0.20 0.40 0.60 0.80 JunAgoNovEn1En3Feb2 NúmerodeEsporasVelocidaddeViento Criterio de Poda Previo a Brotación r2=0.24 (P=059 (Petrolina BR9
  • 22. Aplicación del criterio fenológico en el control Control Integrado 10 20 30 40 0.00.0 10 20 30 40 50 70 Control Productor Sep Oct Nov Dec En1 En2 En3 En4 Vegetative Blossom 50 Sep Oct Nov Dec En1 En2 En3 En4 Vegetative Blossom PorcentagedeBrotesEnfermos Promedio Yo=6% Poda Poda Control Químico Promedio ABCPE=300 Control Químico Promedio ABCPE=100 Manejo Promedio Yo=3.5%
  • 23. Caso 2. Cítricos Caída de Fruto Pequeño Daño severo de la enfermedad Tachuelas adheridas a la rama
  • 24. Monitoreo del patógeno. Trampas esporas de volumétrica o succión
  • 25. 4. Definición de Variables en un Modelo probabilístico Variables Simbolos Independientes No. de esporas no acumuladas de Colletotrichum sp. Esp1-8 No. de esporas acumuladas de Colletotrichum sp. Esp21-8 Temperatura mínima Tmin1-8 Temperatura máxima Tmax1-8 Humedad Relativa Máxima HRmax1-8 Humedad Relativa Máxima acumulada HRmax21-8 Dependientes Porcentaje de incremento de enfermedad Yt-Yt-1 Reyes, 2002
  • 26. 1. Relación daño con esporas y clima 0 5 10 15 20 25 30 0 5 10 15 20 25 30IncidenciaabsolutaEsporasHR(%) T(ºC) 3 5 7 9 11 13 15 17 19 21 23 25 27 29 31 10 30 50 70 90 10 15 20 25 30 Tiempo (Días) 19c / 6 90% / 6 Inf. Latentes Inf. Activas Inc = 0.021 espo3 + 0.016 Tmi2 R2 = 0.93 Cp = 1.09 VIF = 14.3
  • 27. Modelos generados para predecir la ocurrencia 14.29*4.151.09550.910.93Inc=0.021espo3+0.016Tmi2 3.57*1.01.62120.690.72Inc=0.004HRmax7 4.35*1.00.46200.740.77Inc=0.017Tmi7 5.55*1.00.00760.800.82Inc=0.021Tmi6 16.66*1.00.75110.930.94Inc=0.024Tmi4 10.00*1.00.66860.890.90Inc=0.023Tmi3 5.00*1.01.00.780.80Inc=0.026espo3 4.76*1.00.21740770.79Inc=0.025espo2 VIFdVIFeCpRa2bR2Modeloa
  • 28. ¿Qué avances se tienen en pronóstico local de roya del cafeto en relación brote actual?
  • 29. El Cafeto Patógeno Clima Manejo del Cultivo El Marco Racional Epidemiológico Variables Fenología Esporas Patogénesis Daño Temperatura Humedad Relativa Punto de Rocío Variedad Sombra Edad, otras Productos Impactos productivo Indicadores epidémicos
  • 30. El daño ocurre en ciclos La explosividad de una epidemia= a) mas ciclos b) ciclos cortos Evento Patogénesis Periodo Patogénesis Germinación Colonización Multiplicación Deposición Infección Clorosis Liberación de inóculo Incubación (Pi) Latencia (Pl) Generación (Pg) Penetración 1° Síntoma visual Inicio esporulación Finaliza esporulación
  • 31. CHIAPAS: Curva epidémica y clima. Caso Municipio A. A. Corzo: A 14 marzo, 2014 Pérdida estimada 28.7% Tapachula 8.5% 65% Severidad Máxima Periodo Sostenido Daño: Fruto en Desarrollo a cosecha 20-22oC >90%HR
  • 32. CHIAPAS: Curva epidémica caso Parcela: A.A.Corzo – Gilberto Vázquez (pf.chi.ang.7 ) 65% Severidad Máxima 20-22oC >90%HR
  • 33. VERACRUZ : Ejemplo curva epidémica y clima. Caso Soteapan: hasta 14 marzo, 2014 65% Severidad Máxima Periodo reducido Daño:Fruto maduro >22oC
  • 35. Pronostico con base en cantidad de inoculo estimado con cantidad pústulas senescentes (viejas( y nuevas INÓCULO 1º SOROS SENESCENTES INÓCULO 2º SOROS NUEVOS HOJAS CON ROYA - Inóculo 1°; lesiones necróticas del año anterior, que pueden o no esporular al borde. - Inóculo 2°; pústulas de color naranja-amarillo de diámetro variable que puede o no estar esporulando. G. Calderón, 2012. Datos no publ. Aloinfección Autoinfección
  • 36. Aplicación formal de relaciones de variables: 1. Modelos de pronóstico a nivel parcelario y localidad en Guatemala Modelo Var. Indep. R2 R2 aj. Cp VIF LOCALIDAD HROY = 4.54SSEN2 SSEN2 0.86 0.84 8.93 1.00 R3 ESCUINTLA HROY = 2.69SSEN4 SSEN4 0.68 0.67 0.05 1.00 R2 SAMAYAC HROY = 1.71SSEN1 + 1.69SSEN4 SSEN1, SSEN4 0.94 0.93 1.78 1.09 R1 EL QUETZAL HROY = 2.71SSEN1 SSEN1 0.98 0.97 -1.76 1.00 R1 EL PALMAR 1 HROY = 2.27SSEN2 SSEN2 0.92 0.91 5.20 1.00 R1 EL TUMBADOR HROY = Hojas con roya en ramas laterales SSEN = Soros senescentes por hoja (con sus lag 1, 2, 3 y 4, estos son a cada 15 días) G. Calderón y Col. 2012. Datos no publicados
  • 37. Modelo de Pronóstico con base en Densidad de Inóculo Modelo Var. Indep. R2 R2 aj. C(p) VIF LOCALIDAD No. Hojas Roya = 2.27 (SSEN2) SEN2 es No. Soros Senescentes en 30 días SSEN2 0.92 0.91 5.20 1.00 R1 EL TUMBADOR G. Calderón et al., 2012 Datos no publicados * * * ---------------------- region=1 local=ElTumba ----------------------------- Trazado de hroy*dias. El símbolo usado es '*'. Trazado de hroyest*dias. El símbolo usado es 'o'. hroy | 100 | | | | o | o | | o o o | | o o o 50 | o | o* | o * | * | * * * | o * | | | * * * * * * 0 |*** ** *o o*o o -|------------------|------------------|-- 0 200 400 días Epidemia Campo Epidemia pronóstico R2= 0.91 Región 1 El Tumbador
  • 38. La variabilidad parcelaria se debe integrar a variabilidad regional ¿Cómo podemos pronosticar la ocurrencia de la roya del café a nivel regional?
  • 39. Incidencia Severidad Soros Hojas con roya Condiciones Favorables Hrs favorables # mojados Mm lluvia T° HR PP Datos estaciones El modelo epidemiológico aplicado en ventanas inductivas caso Guatemala Condiciones Favorables Fenología EdadFollaje
  • 40. Problema: La defoliación factor de subestimación del efecto de clima Fluctuación del número de hojas con roya en el tiempo, respecto a la brotación y desarrollo de hojas en la planta. Esto permitió corregir por defoliación. Se calculó incrementos absolutos. -30 -20 -10 0 10 20 30 -100 -80 -60 -40 -20 0 20 40 60 80 100 #HOJASEN20RAMAS/10PL. S/AC. H.T. S/AC. H.R. 0 10 20 30 40 50 60 70 80 #HOJASEN20RAMAS/10PL H.T. H.R. CAMBIO ABSOLUTO CAMBIO ABSOLUTO CORREGIDO
  • 41. Datos climáticos: Fundamental para la aplicación del concepto. Red de estaciones climáticas de ANACAFE Área de monitoreo de roya del café en los años 2009 - 2010
  • 42. El concepto de ventana= Cambio estacional absoluto de daño (en un año productivo) 0 10 20 30 40 50 60 70 80 IncrementoAbs.Núm.hojas H.R. H.T. V1 # días ABCPE V2 V3 Ciclo de producción Tejido+inoculo Noclimainductivo Tejido+inoculo Climainductivo Tejido+inoculo Climainductivo ABCPE Ventana Inductiva= f(V1,V2,V3)
  • 43. El concepto de Ventana= Periodo estacional inductivo de daño en función a variables de clima # días 0 10 20 30 40 50 60 70 80 #HOJAS H.R. H.T. ABCPE Tejido+inóculo Climainductivo ABCPE V1 Ventana Inductiva= f (V1, V2, V3) T (20-22ºC) y HR(>90%) Núm. de eventos lluvia (mojado) Total de precipitación Vi Germinación Colonización Multiplicación Deposición Infección Clorosis Liberación de inóculo Penetración 1° Síntoma visual Inicio esporulación Finaliza
  • 44. 0 2 4 6 8 10 12 0.0 27.3 54.7 Frecuencia Clases Horas Favorables t° 20-22°c y HR > 90% m 0 2 4 6 8 10 12 0.0 26.5 53.0 Frecuencia Clases Eventos de mojado (numero de precipitacione 0 2 4 6 8 10 12 14 16 0.0 123.6 247.3 Frecuencia Clases Mm de Lluvia Coatepeque, 536 m Vi= (Clase TH)(Frec.) + (Clase M)(Freqc.) +(Clase P)(Frec.) VI= V1+V2+V3 Modelo Aditivo Modelo Ponderativo Vi= 1.5(Clase TH)(Frec.) + (Clase M)(Freqc.) +2(Clase P)(Frec.) VI= V1+V2+V3
  • 45. ¿Cómo podemos aplicar el pronóstico de variables climáticas en la estimación de ventanas inductivas en estudios regionales?
  • 46.
  • 47. Validación del Modelo • Se compararon Mapas de ventanas inductivas regionales con Mapas de Incidencia y Severidad. • Los datos de incidencia fueron obtenidos mediante encuesta a técnicos regionales de ANACAFE. La severidad se estimó mediante el modelo siguiente. y = 0.0066x2 - 0.3131x + 6.1746 R² = 0.8631 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 0 20 40 60 80 100 SEVERIDAD INCIDENCIA
  • 48. *Variable estimada con datos de Calderón (2009-2010) bajo el modelo de regresión lineal simple: y = 0,660x + 0,991 r² = 0,774 Dónde: y = Hojas Roya x = Incidencia Mapa de intensidad de severidad de roya del cafeto. Guatemala 2012
  • 49. Pronóstico regional con ventanas de Inductividad Climática Ver: 13marzo13
  • 50. Evidencia de incremento de horas favorables en el tiempo. Coatepeque, Quetzaltenango (600 msnm) 0.0000 0.0005 0.0010 0.0015 0.0020 0.0025 0.0030 0.0035 0.0040 0.0045 -400 -360 -320 -280 -240 -200 -160 -120 -80 -40 0 40 80 120 160 200 240 280 320 360 400 2007 2008 2009 2010 2011 2012 DESPLAZAMIENTO DE MEDIA Incidencia 2009-2010 318 000 mediciones/6 años
  • 51. ¿Qué avances se tienen en pronóstico regional de roya del cafeto en relación brote actual?
  • 52. Severidad Oct-12 Severidad Nov-12 Mapas de intensidad de daño. Chiapas
  • 54. Comportamiento de la roya Chiapas. Muestreo Nov-Dic 2012 0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 ACACOYAGUA AMATENANGODELAFRONTERA CACAHOATAN ELPORVENIR ESCUINTLA HUIXTLA MOTOZINTLA OCOZOCOAUTLADEESPINOSA TAPACHULA TUZANTAN UNIONJUAREZ %dedaño Incidencia Severidad Defoliación 0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 BOURBON CATUAI CATURRA TYPICA %dedaño Incidencia Severidad Defoliación Por municipio Por variedad
  • 55. Gráficos de Muestreo Nov-Dic 2012 0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 Intensivo Organico ( certificado ) Semintensivo Tradicional %dedaño Incidencia Severidad Defoliación 0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 Desarrollo Madurez fisiologica %dedaño Incidencia Severidad Defoliación Por Manejo del Cultivo Por fenología
  • 56. Gráficos de Muestreo Nov-Dic 2012 0 50 100 150 200 250 8 13 17 22 26 31 35 40 45 Frecuencia Clases Histograma de Frecuencias Edad > 50%
  • 57. Modelo de Pronóstico generado a partir de Muestreo Nov-Dic 2012 0.08 0.08 0.08 0.09 0.14 0.33 0.64 1.00 1.00 0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 1.0 0 20 40 60 80 100 120 140 0 14 29 43 57 71 86 100 114 Frecuencia Clases Histograma de Frecuencias Incidencia 0.07 0.08 0.22 0.67 0.89 0.99 1.00 1.00 1.00 0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 1.0 0 20 40 60 80 100 120 140 160 180 0 11 21 32 43 54 64 75 86 Frecuencia Clases Histograma de Frecuencias Severidad 0.00 0.04 0.13 0.63 0.77 0.93 0.93 1.00 1.00 0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 1.0 0 20 40 60 80 100 120 140 160 180 200 0 14 29 43 57 71 86 100 114 Frecuencia Clases Histograma de Frecuencias Defoliación Variable Modelo y=1-e[-(t/b)c] Sig r2 Incidencia y=1-e[-(t/175.8) 5.5] 0.98 Severidad y=1-e[-(t/89.4) 3.05] 0.99 Defoliación y=1-e[-(t/99.67) 2.75] 0.97 Modelos de pronóstico y=1-e[-(t/175.8) 5.5] y=1-e[-(t/89.4) 3.05] y=1-e[-(t/99.67) 2.75]
  • 58. ¿Cómo se integra esta información al Plan Estratégico para el Manejo Preventivo de la roya?
  • 59. 1. Determinación del Número de Parcelas Centinela por Estado 1 Escalar Muestreo 1 Considerar Fracción de Ha 2 Municipio Sup_Café (has) Pond_Superf Pond_Foco Pond_Prec Pond_Altura Pond_Temp Fact_Pond Log Fact_Pond No. Sitios Ni Log Parcelas centinela ACAPONETA 36 1 1 1 2 1 2.0 0.3 5.13 5.1 0.7873 0 COMPOSTELA 6120 4 1 1 3 2 24.0 1.4 61.54 61.5 1.7961 0 HUAJICORI 21.00 1 1 3 2 3 18.0 1.3 46.15 46.2 1.6735 0 NAYAR EL 313.42 2 1 3 2 3 36.0 1.6 92.31 92.3 1.9699 1 RUIZ 2848.32 3 1 4 2 2 48.0 1.7 123.08 123.1 2.0937 1 SAN BLAS 3847 4 1 4 2 2 64.0 1.8 164.10 164.1 2.2178 1 SANTA MARIA DEL ORO 27.00 1 1 1 3 2 6.0 0.8 15.38 15.4 1.2144 0 SANTIAGO IXCUINTLA 2,445.00 3 1 4 2 2 48.0 1.7 123.08 123.1 2.0937 1 TEPIC 931 2 1 3 3 2 36.0 1.6 92.31 92.3 1.9699 1 XALISCO 3513 4 1 3 3 3 108.0 2.0 276.92 276.9 2.4439 2 20101.74 390.0 14.0 1000 1000 7 No. Hectáreas Cercanía de Foco Altitud Temp. Prec. Superficie Café P. centinela= LogFact_Pond/(Sup_Café^( ∑Fact_Pond)) *((t)*(2)) Factor Operativo 1 Escalar Muestreo 1 Considerar Fracción de Ha 2 Municipio Sup_Café (has) Pond_Superf Pond_Foco Pond_Prec Pond_Altura Pond_Temp Fact_Pond Log Fact_Pond No. Sitios Ni Log Parcelas centinela ACAPONETA 36 1 1 1 2 1 2.0 0.3 5.13 5.1 0.7873 0 COMPOSTELA 6120 4 1 1 3 2 24.0 1.4 61.54 61.5 1.7961 0 HUAJICORI 21.00 1 1 3 2 3 18.0 1.3 46.15 46.2 1.6735 0 NAYAR EL 313.42 2 1 3 2 3 36.0 1.6 92.31 92.3 1.9699 1 RUIZ 2848.32 3 1 4 2 2 48.0 1.7 123.08 123.1 2.0937 1 SAN BLAS 3847 4 1 4 2 2 64.0 1.8 164.10 164.1 2.2178 1 SANTA MARIA DEL ORO 27.00 1 1 1 3 2 6.0 0.8 15.38 15.4 1.2144 0 SANTIAGO IXCUINTLA 2,445.00 3 1 4 2 2 48.0 1.7 123.08 123.1 2.0937 1 TEPIC 931 2 1 3 3 2 36.0 1.6 92.31 92.3 1.9699 1 XALISCO 3513 4 1 3 3 3 108.0 2.0 276.92 276.9 2.4439 2 20101.74 390.0 14.0 1000 1000 7 No. Hectáreas
  • 60. 2. Determinación del Número de Parcelas Centinela por Estado Soporte Estadístico Estado Sup. Café (Ha) Porcentaje de Error 2 (tecnicos) 1% 5% 10% Chiapas 257367.99 94 68.7 37.6 48 Veracruz 156977.17 57.071 41.9 22.9 44 Oaxaca 154745.78 56.259 41.3 22.6 12 Puebla 71448.91 25.976 19.1 10.4 32 Guerrero 47161.75 17.146 12.6 6.9 36 Hidalgo 26333.26 9.574 7.0 3.8 14 Nayarit 20101.74 7.308 5.4 2.9 6 SLP 18379.5 6.682 4.9 2.7 10 Jalisco 3983 1.448 1.1 0.6 4 Colima 2573.5 0.936 0.7 0.4 6 n=[((N)*(ᵶ²)*(S²)/(N)*(d²)+(ᵶ²)*(S²))*(hai/hax)]*(Fact_Pond/∑Fact_Pond)
  • 61. 3. Criterios para selección de parcelas centinelas 1. Altitud. 2. Variedades susceptibles. 3. Manejo (orgánico y/o convencional). 4. Tipo de tecnificación. 5. Tipología de producción.
  • 62. Mapa de producción café a nivel Nacional
  • 63. Mapa de altitud y superficie de café
  • 64. 4. Metodología de Muestreo y Evaluación de Severidad en Planta y porcentaje de Defoliación en Planta • Seleccionar en el centro de cada parcela centinela (1 ha) un bloque de 37 x 37 plantas, de tal forma que no se considere el bordo de la parcela. • Seleccionar una planta cada cuatro, es decir, una planta sí y tres no, en total se evaluarán 100 plantas, las cuales se ilustran con un recuadro azul en la siguiente diapositiva. • Evaluar en las 100 plantas seleccionadas la Severidad en Planta y el Porcentaje de Defoliación en Planta, en base a las escalas diagramáticas específicas para este fin.
  • 65. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 4. Metodología de Muestreo y Evaluación de Severidad en Planta y porcentaje de Defoliación en Planta 1 2 1 0 1 2 3 0 2 0 3 4 1 2 3 2 2 3 1 1 1 2 2 2 1 4 3 1 2 0 1 3 1 1 1 2 3 0 2 3 0 2 1 0 1 2 3 0 2 3
  • 66. Escalas de Severidad en Planta y porcentaje de Defoliación en Planta 0 (Sano) 1 (3%) 2 (10%) 3 (30%) 4 (60%) 0 (Sana) 1 (20%) 2 (40%) 3 (60%) 4 (>60%) Severidad en planta Porcentaje de defoliación
  • 67. 5. Metodología de Muestreo y Evaluación de Severidad en Hoja y variables Fenológicas • Seleccionar en el centro de cada parcela centinela (1 ha) un bloque de 37 x 37 plantas. • Dentro del bloque de 37 x 37 plantas establecer el método cinco de oros compuesto, el cual consiste en seleccionar 5 puntos (4 esquinas y uno en el centro) en cada punto seleccionar cuatro plantas, para un total de 20 plantas, el método 5 de oros compuesto y las plantas a seleccionar se ilustran con el circulo amarillo, recuadro azul. • Evaluar en las 20 plantas seleccionadas las siguientes variables: Severidad en Planta, Hoja, en base a las escalas diagramáticas diseñadas para este fin, y las siguientes variables Fenológicas: Fenología • Hojas jóvenes • Hojas viejas • Brotación • Floración • Amarre de fruto • Fruto Acuoso • Fruto Lechoso • Fruto Consistente • Fruto Maduro • Ramas productivas
  • 68. 5. Metodología de Muestreo y Evaluación de Severidad en Hoja y variables Fenológicas 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 Ubicación para evaluación de variables FenológicasSeveridad en Hoja 1 0 3 2 1 0 3 2
  • 70. Estrato alto Estrato medio Estrato bajo No. de brotes/rama seleccionada No. de frutos amarre/rama No. de rama productivas No. de flores/rama No. de frutos acuosos/rama No. de frutos lechosos/rama No. de frutos consist./rama No. de frutos maduros/rama Variables a evaluar No. de brotes/rama seleccionada No. de frutos amarre/rama No. de rama productivas No. de flores/rama No. de frutos acuosos/rama No. de frutos lechosos/rama No. de frutos consist./rama No. de frutos maduros/rama 6. Metodología de Evaluación de Variables Fenológicas
  • 71. Viento dominante Parcela centinela (1 ha) 37 plantas 37plantas Borde de parcela Borde de parcela Trampas aerobiológicas pasivas Trampas aerobiológicas pasivas Estación Agroclimática Trampa volumétrica Datalogger 7. Monitoreo de esporas y evaluación de variables climáticas
  • 72. 500 ha Parcela centinela (1 ha) Parcela demostrativa Investigación participativa Muestreo dirigido 5 de oros compuesto Variables experimentales Productos químicos Nutrición Manejo planta Parcelas Experimentales Investigación con productor cooperante Criterios Decisión (UMB) Modelos de Pronostico local y regional Parcelas Experimentales Investigación con productor cooperante Parcela demostrativa Investigación participativa 8. Distribución de parcelas centinela y área de acción Variables de daño Severidad en Planta y Hoja Variables Fenológicas Defoliación Muestreo sistemático Plataforma de Datos Aprox. 50 parcelas En Chiapas Méx.
  • 73. Conclusiones • La roya de cafeto en México por mas de 30 años se ha comportado endémico con baja prevalencia. En 2010 se reportaron incrementos atípicos de incidencia de roya en Colombia, Guatemala y Honduras. • El incremento epidémico esta aparentemente asociado con variaciones climática, principalmente incremento de precipitación. • Es importante un programa de monitoreo y evaluación regional de la roya que permita determinar las acciones fitosanitarias mas adecuadas con bases biológicas y epidemiológicas. • El uso de modelos de pronóstico a nivel local y regional con base en variables de clima, hospedante y patógeno pueden optimizar las acciones de vigilancia y control. • El empleo de parcelas centinelas están concebidas para generar instrumentos de decisión con un adecuado soporte racional y operativo.
  • 74. GRACIAS Contacto: Dr. Gustavo Mora Aguilera Coordinador SINAVEF-LAB morag@colpo.mx sinaveflab@gmail.com Tel: (01-595) 95-20200 Ext. 1620-1614