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AMINOACIDOS Y PROTEINAS
• Aminoacidos
• Son unidades estructurales básicas que
  forman las proteínas.
• Se han descrito mas de 100 aapero solo 22 de
  ellos participan en la síntesis de proteínas.
AMINOACIDOS (aa)

        • Los aa difieren entre si
          por el grupo R (grupo
          sustitutivo).
        • R: adjudican diferentes
          propiedades a cada
          uno de los aa y
          determinan su función
          biológica.
Aminoacidos
Clasificación de los aa
• En función de la naturaleza de su cadena
  lateral:
• Aaalifáticos cuyo R no es polar: Son muy poco
  reactivos, y fuertemente hidrofóbicos(excepto
  la Gly, cuya cadena lateral es un átomo de
  hidrógeno).
• Aaalifáticos cuyo R es polar pero no tiene
  carga:serina, treonina, cisteina,
  prolinaasparraginay glutamina.
Clasificación de los aa
• En función de la naturaleza de su cadena
  lateral:
• Aaalifáticos cuyo R es polar y se encuentra en
  estado de ion positivo:lisina, argininae
  histidina.
• Aaalifáticos cuyo R es polar y se encuentra en
  estado de ion negativo: aspartatoy glutamato.
• Aminoácidos aromáticos: Fenilalanina,
  tirosina, triptofano
Estructura de los aminoácidos
• Por su estructura, los aa se ionizan en solucion acuosa
  de manera que pueden funcionar como ácidos y como
  bases (anfoliticos).
•  aa que poseen un g. amino y un g. carboxilo (Gly,
   Los
  Leu, Ile) se convierten en iones dipolares
  (Zwitteriones).
• Estos iones en slns acuosas son eléctricamente
  neutros y no emigran ni se someten a campos
  eléctricos.
•  ionizacion de un aa depende del pH de la solución.
   La
• Punto isolectrico: pH en el cual la molécula no tiene
  carga neta
Clasificacionde los aasegún R
Clasificacion de los aa según R
Nomenclatura de los aa
•   Alanina Ala A         •   Metionina* Met M
•   Arginina Arg    R     •   Fenilalanina* Phe F
•   Asparragina Asn N     •   Prolina Pro P
•   Ac. Aspartico Asp D   •   Serina Ser S
•   Cisteina Cys C        •   Treonina* Thr T
•   Glutamina Gln Q       •   Triptofano* Trp W
•   Ac. Glutamico Glu E   •   Tirosina Tyr Y
•   Glicina Gly G         •   Valina* Val V
•   Histidina + His H
•   Isoleucina* Ile   I   • +: Esencial en la niñez
•   Leucina * Leu L       • *: Esencial durante toda la
                            vida
•   Lisina*Lys K
Estructura de los aa
          • Se presentan en dos formas
            isomericas, imágenes
            especulares no superponibles.
          •  isomeros de la serie L
              Los
            poseen el grupo alfa amino a
            la izquierda.
          •  aa que se encuentran en
              Los
            las proteínas son de la serie L y
            tienen mayor participación
            metabólica celular.
          •  aa de la serie D participan
              Los
            en las paredes celulares
            bacterianas.
FORMACION DE PEPTIDOS Y
          POLIPEPTIDOS
• Los aase unen o polimerizan por medio de
  enlaces peptídicos: la unión química entre el
  grupo carboxilde un aacon el grupo amino de
  otro aa, con la liberación de una molécula de
  agua.
•  rx+ importante de los aaes la formación
    La
  de un enlace peptídicoya que este enlace
  carece de carga a cualquier pH de interés
  fisiológico.
ENLACE PEPTIDICO
PEPTIDOS Y POLIPEPTIDOS
• La unión de dos o más aahasta un máximo de
  100 mediante enlaces peptídicosda lugar a los
  péptidos:
•  aa= dipéptido
   2
•  aa=tripeptido, etc
   3
• Menos de 100 aaoligopeptido
•  de 100 aapolipéptidohasta 10000
   Mas
•  de 10000 aaProteínas
   Mas
Resumen:
• Los 22 aacomunmenteencontradoscomoresiduosen
  lasproteinascontienen:
• un grupocarboxilo
• un grupoamino
• un sustituyenteR distintivoen el atomode carbono.
• Los atomosde C alfason asimetricosexceptoen el
  casode la glicina, en todoslos aapuedenexistiren 2
  formasesteroisomericas:
• L
• D
• Solamentelos estereoisomerosL, con
  unaconfiguracionrelacionadacon la
  configuracionabsolutade la moleculade
  referenciaL-Gliceraldehidose
  encuentranformandoparte de lasproteinas
• Se puedenencontraraminoacidospococomunes,
  comoconstituyentesde proteinas:
  pormodificacionde residuosde
  aacomunesdespuesde la sintesisde lasproteinas,
  o comometabolitoslibres
• Los aminoacidosson clasificadosen 5 tipos,
  segunsugrupoR, en base de la polaridady cargaa
  pH 7
• Los aa varian en sus propiedades acido basicas
  y tienen curvas de titulacion caracteristicas.
• Los aa monoaminocarboxilicos (grupos R no
  ionizables) son acidos diproticos
  (H3NCH(R)COOH) cuando el pH se
  incrementa.
• Los aa con grupos R ionizables tienen especies
  ionicas adicionales, dependiendo del pH del
  medio.
PROTEINAS
Son cadenas de aa, su peso molecular va de 5,000 a 400,000 daltons, pudiendo llegar
hasta un millonde daltons.
El enlace peptídicoes un enlace covalente se requiere de ácidos fuertes para romperlo,
en el organismo solamente se rompe por enzimas proteasas
Eje peptídico: a lo largo de este eje de grupos carboxilos se acomodan las cadenas
laterales de los aaque conforman la proteína.

 Las proteinas son las macromoleculas biologicas mas abundantes ya que se
 encuentran en todas las celulas asi como en todas las partes de las celulas
 Se pueden encontrar en gran variedad de formas, en miles de diferentes tipos.

 Su rango de tamaño varia desde peptidos muy pequeños hasta grandes polimeros
 con pesos moleculares de millones que pueden encontrarse en una sola celula

Las proteinas exhiben una enorme diversidad de funciones biologicas y son los
productos principales de las vias de transmision de informacion del organismo.
Las proteinas son los instrumento smoleculares por medio de los cuales se expresa y
regula la informacion genetica
El estudio de su estructura y funciones desde el siglo XIX ha sido elemento basico para
la comprension del funcionamiento celular.
• ALGUNAS FUNCIONES
  GENERALES:
• 1.Componentes
  estructurales: colágeno del
  pelo
• 2.Transportadores de
  sustancias: hemoglobina
• 3.Hormonas: insulina
• 4.Catalizadores de
  rxsbioquímicas: enzimas
• 5.Componentes del
  esqueleto intracelular o
  citoesqueleto:
  microtubulosy filamentos
• 6.Elementos de la
  contraccionmuscular:
  actinay miosina
Clasificación de las proteínas

Desde un punto de vista químico, existen dos grandes grupos de proteínas:
1.proteínas simples:
formadas exclusivamente por aminoácidos, como es el caso de la ubiquitina, una
proteasa intracelular formada por 53 AA.
1.proteínas conjugadas:
que contienen además de la cadena polipeptídicaun componente no
aminoacídicollamado grupo prostético, que puede ser un azúcar, un lípido, un ácido
nucleico o simplemente un ión inorgánico.
La proteína en ausencia de su grupo prostético no es funcional, y se llama
apoproteína.
La proteína unida a su grupo prostético es funcional, y se llama
holoproteína(holoproteína= apoproteína+ grupo prostético).
Son proteínas conjugadas la hemoglobina, la mioglobina, los citocromos, etc.
Clasificación
• En cuanto a su formamolecular, podemos distinguir:
• 1.proteínas globulares: la cadena polipeptídicaaparece
  enrollada sobre sí misma dando lugar a una estructura
  más o menos esférica y compacta. Ejm: Mioglobinay
  Hemoglobina
• 2.proteínas fibrosas: si hay una dimensión que
  predomina sobre las demás, se dice que la proteína es
  fibrosa. Las proteínas fibrosas, por lo general, tienen
  funciones estructurales.
• Protde la piel, el pelo, la seda.
• Son siempre alargadas
• Son menos abundantes que las globulares
Estructura 1º
• Acomodamiento de las
  cadenas de aa(orden
  secuencial de aa), estabilizado
  por enlaces peptidicos,
  puentes disulfuros(cisteina). Al
  alterar este orden también se
  altera el tipo, las propiedades
  de la proteína.
• Ejm: Insulina, vasopresina,
• colecistoquinina, gastrina,
  secretina (Hhdel sistema
  digestivo)
•   Son rearreglosespeciales originados por el

Estructura 2º       establecimiento de puentes de H entre los
                    grupos q conforman los enlaces
                    peptidicosde los aacercanos.
                •    Αhelice: esun ordenamientohelicoidalen
                    el queel g. R de los aase orientahaciael
                    exterior de la helice.
                •   -Se estabilizaporla formacionde puentesde
                    H entre los componentesdel enlace
                    peptidicode aacercanosen la estruct1 de
                    la proteina.
                •   -Ejm: proteinasfibrosas: colageno,
                    alfaqueratina.
                •    βlaminar:
                •   -El esqueleto se ordena en forma de
                    zigzag.
                •   -Los grupos R de aase orientan en
                    direcciones opuestas con un
                    patronalternante y hacia afuera
                •   -se estabiliza por puentes de H.
                •   -Los aano tienenqueestarproximosen la
                    estructura1
                •   -Tipicade proteinasfibrosas: fibroina(seda)
Estructura 3º
• Esunamodificaciónenelespacio,esel
  plegamientotridimensionaltotaldel
  acadenadeunaproteínaoseaquesef
  ormaunaproteínatridimensional,en
  laestructuraterciariaseencuentrans
  egmentosdeestructura2ºy1º.
• Estaconformaciónfacilitalasolubilid
  adenaguayasírealizarfuncionesdetr
  ansporte,enzimáticas,hormonales,
  etc.
• Ejm:mioglobina
Estructura 4º
• Es el nivel mas complejo de
  organización.
• Se refiere a interacciones no
  covalentes que unen varias cadenas
  polipeptidicas en una sola molécula.
  Ejm: la hemoglobina q tiene 4 cadenas.
• Cada una de estas cadenas
  polipeptídicas recibe el nombre de
  protómero.
• El número de protómeros (cadenas)
  varía desde dos como en la
  hexoquinasa, cuatro como en la
  hemoglobina, o muchos como la
  cápsida del virus de la poliomielitis,
  que consta de 60 unidades proteicas.
Estructura 4º
• Esta conformación se mantiene estable gracias a
  la existencia de enlaces entre los radicales Rde
  los aminoácidos. Aparecen varios tipos de
  enlaces:
• los puentes de hidrógeno
• lospuentes eléctricosentre aade carga diferente
  llamados tambien“atracciones electrostáticas”
• las interacciones hidrófobasformación de un
  núcleo hidrofobitoo interface hidrofobico
• el puente disulfuro
DESNATURALIZACION
• Los agentes que provocan la desnaturalización de una
  proteína se llaman agentes desnaturalizantes. Se
  distinguen agentes físicos(calor) y
  químicos(detergentes, disolventes orgánicos, pH,
  fuerza iónica).
• Como en algunos casos el fenómeno de la
  desnaturalización es reversible, es posible precipitar
  proteínas de manera selectiva mediante cambios en:
• (1) la polaridad del disolvente
• (2) la fuerza iónica
• (3) el pH
• (4) la temperatura
Propiedades              ESTADO NATIVO

SE LLAMA
desnaturalizaciónde las
proteínas a la pérdida      •   DENATURALIZACION
de las estructuras de       •   RENATURALIZACION

orden
superior(secundaria,
terciaria y cuaternaria),
quedando la cadena
polipeptídicareducida a         ESTADO DESNATURALIZADO
un polímero estadístico
sin ninguna estructura
tridimensional fija
Propiedades
• La desnaturalización provoca diversos
  efectosen la proteína:
• 1.cambios en las propiedades
  hidrodinámicasde la proteína: aumenta la
  viscosidad y disminuye el coeficiente de
  difusión
• 2.una drástica disminución de su solubilidad,
  ya que los residuos hidrofóbicosdel interior
  aparecen en la superficie
• 3 pérdida de las propiedades biológicas
PROTEINAS COMO CATALIZADORES
             ENZIMAS
• son proteínas que catalizan reacciones químicas
  en los seres vivos.
• son catalizadores: sustancias que, sin consumirse
  en una reacción, aumentan notablemente su
  velocidad.
• No hacen factibles las reacciones imposibles, sino
  que sólamente aceleran las que
  espontáneamente podrían producirse.
• Los enzimas son catalizadores específicos: cada
  enzima cataliza un solo tipo de reacción, y casi
  siempre actúa sobre un único sustrato o sobre
  un grupo muy reducido de ellos.
• En una reacción catalizada por    • Efecto del pH
  un enzima:                        • Según el pH del medio, los
• La sustancia sobre la que actúa     grupos R de las enz pueden
  el enzima se llamasustrato.         tener carga eléctrica positiva,
• El sustrato se une a una región     negativa o neutra.
  concreta del enzima,              • Hay un pH en el cual la
  llamadacentro activo.               conformación será la más
• Una vez formados                    adecuada para la actividad
  losproductosla enzima puede         catalítica. Este es el llamadopH
  comenzar un nuevo ciclo de          óptimo.
  reacción                          • La mayoría de los enzimas son
• Los factores que influyen de        muy sensibles a los cambios
  manera más directa sobre la         de pH. (amortiguadores
  actividad de un enzima son:         fisiologicos)
• 1.pH
• 2.Temperatura
• 3.Cofactores
• Efecto de la Tº              • Efecto de los cofactores
• los aumentos de                Casi un tercio de los
  temperatura aceleran las       enzimas conocidos
  reacciones químicas            requieren cofactores para
                                 su función.
• La temperatura a la cual
  la actividad catalítica es   • Los cofactores pueden ser
  máxima se llama                iones inorgánicos como el
  temperatura óptima             Fe++, Mg++, Mn++, Zn++
                                 etc.
                               • Cuando el cofactor es una
                                 molécula orgánica se
                                 llama coenzima.
                               • Muchos de estos
                                 coenzimas se sintetizan a
                                 partir de vitaminasEfecto
                                 de los cofactores
Función de los Cofactores
• Alterar la estructura
  tridimensional de la
  enzima
• Intervenir como otro
  sustrato
Coenzimas y sus vitaminas de
               procedencia
• NAD                             • Clasificación
  (nicotinamidaadenindinucleoti
  do)                             • En función de su acción
• VitB3 (ac. nicotinico)            catalítica específica, los
• CoA                               enzimas se clasifican en 6
• Ac. Pantotenico                   grandes grupos o clases:
• FMN (flavin adenin              • Clase 1: OXIDORREDUCTASAS
  mononucleotido)                 • Clase 2: TRANSFERASAS
• VitB2 (riboflavina)             • Clase 3: HIDROLASAS
• FAD (flavin adenin              • Clase 4: LIASAS
  dinucleotido)                   • Clase 5: ISOMERASAS
• VitB2 (riboflavina)             • Clase 6: LIGASAS
• TPP (tiamina pirofosfato)
• VitB1 (tiamina)
Clase 2: TRANSFERASASCatalizan la
transferencia de un grupo químico (distinto del hidrógeno) de un sustrato a
                           otro. Ejm: Quinasas
Clase 3: HIDROLASAS
• Catalizan las reacciones                • Clase 4: LIASAS
  de hidrólisis: (rupturas
  hidroliticas. Ejm                       • Formación de dobles
  proteinasas                               enlaces por eliminación
•   lactosa + agua ↔glucosa + galactosa
                                            de un grupo qq o
                                            adición de grupos a
                                            dobles enlaces. Ejem:
                                            aldehido liasas
Clase 5: ISOMERASAS
• Catalizan la
  interconversión de
  isómeros: rearreglos de
  átomos dentro de una
  molécula. Son ejemplos
  la fosfotriosa isomerasa
  y la fosfoglucosa
  isomerasa
Clase 6: LIGASAS
• Reacciones en las que se   • Nomenclatura
  unen dos moléculas         • nombres particulares
• Formación de enlaces qq,   • nombre sistemático:
  utilizando ATP u otros       consta actualmente de 3
  nucleótidos como fuente      partes:
  de energía. Ejem:          • 1.el sustrato preferente
  polimerasas
                             • 2.el tipo de reacción
                               realizado
                             • 3.terminación "asa“
                             • Ejm: glucosa fosfato
                               isomerasa
                             • -
• Nomenclatura
• Cuando la acción típica del enzima es la hidrólisis del
  sustrato, el segundo componente del nombre se omite y
  por ejemplo: lactasa
• código de la comisión enzimática: El nombre de cada
  enzima puede ser identificado por un código numérico,
  encabezado por las letras EC (enzymecommission),
  seguidas de 4 números separados por puntos. El 1º
  número indica a cual de las seis clases pertenece el
  enzima, el 2º se refiere a distintas subclases dentro de
  cada grupo, el 3º y el 4º se refieren a los grupos químicos
  específicos
• que intervienen en la reacción.
Regulación de la actividad enzimática
•   Homeostasis: eq dinámico del medio interno.
•   1.Modificación de la [S]
•   2.Modificación de la [E]
•   3.Adicion covalente
•   4.Regulación alosterica
•   5.Activación por proteolisis (zimógeno)
•   6.Cambios en el pH
•   7.Cambios en la temperatura
Modificación de la [S]
•  la menos compleja.
   Es
• Ocurre al ↑o ↓la *S+
• Bajas [S] es indicador
  de disminución de la
  actividad enzimática
•  sup: velocidad de
   Fig
  rx enzimatica a 6
  diferentes [S]
Modificación de la [E]
• Es mas compleja: requiere la
  síntesis de novo de enzimas      • Regulación enzimática
  (inducción enzimática)           • Mantenimiento de un estado
• La síntesis proteica requiere      ordenado
  tiempo y mucha energía           • Conservación de energía
• Cuando la [S] aumenta por        • Respuesta a las variaciones
  encima de ciertos valores y si     ambientales
  aparecen nuevos sustratos
  (antes ausentes) se deben
  sintetizar nuevas enzimas.
                                   •   El control se realiza por:
• La inducción enzimática es
  estimulada por hormonas          •   1.Control genético
  (larga duración)                 •   2.Modificación covalente
• Represión enzimática:            •   3.Regulación alostérica
  disminución de la síntesis de    •   4.Activación de zimógenos
  enzimas
• ** de acuerdo a las
  necesidades celulares
Control genético
• La modificacionde la [Enzima]es realizada de acuerdo a las
  necesidades celulares por medio de 2 mecanismos:
• Inducción enzimática:mas compleja: requiere la síntesis de
  novode enzimas:
• Requiere tiempo y mucha energía
• Cuando la [S] aumenta por encima de ciertos valores y si
  aparecen nuevos sustratos (antes ausentes) se deben
  sintetizar nuevas enzimas.
• La inducción enzimática es estimulada por hormonas (larga
  duración)
• Represión enzimática:disminución de la síntesis de enzimas
• Aminoácidos y
• 2. Adición covalente          • 3. Regulación alosterica
• la actividad enz puede ↑o     • Las enz reguladas por
  ↓por a adición covalente        alosterismo existen en dos
  de un grupo químico a la        estados:
  enzima                        • 1.T o tenso
• Es transitoria y reversible   • 2.L o laxo
• Con mayor frecuencia: g.      • Hay 2 tipos de reguladores
  fosfatos, g. metilo y la        alostericos:
  adenosina                     • 1.Efectores o activadores
• Adición o remoción de g. qq     alostericos
  funcionan como mxs de         • 2.Inhibidores alostericos
  control
                                • Ciertas sust se unen en
                                  sitios diferentes del sitio
                                  activo (sitio alosterico)
                                • Ejm: ATP, NADH, citrato, etc.
4. Activación de zimógenos
• Las enz son sintetizadas como
  moléculas inactivas llamadas
  zimógenos o proenzimas.
• Para activarse, los zimógenos
  sufren un ataque hidrolítico
  que origina la liberación de
  uno o varios péptidos
• Si estas enzimas se sintetizan
  directamente en forma activa
  destruirían la propia célula que
  las produce
• EJ: enzimas digestivas:
• 28Aminoácidos y Proteínas
INHIBICIÓN ENZIMATICA
Medio importante para regular las rutas metabólicas
Tx clínicos se fundamentan en la inhibición enzimática
Permite diseñar técnicas bioquímicas

  Clases de inhibidores
  Inhibición reversible:
  1.Competitivos
  2.Acompetitivos
  3.No competitivos
  Inhibición Irreversible: venenos enzimáticos

  Inhibidores competitivos
  Se unen de forma reversible a la enzima libre
  para formar complejo EI
  El S y el I compiten por el mismo lugar en la
  enzima
  La actividad de la enzima ↓
  El efecto puede invertirse: ↑ la * S +
  Reducen la afinidad de la enzima por el S
  Tienen una estructura semejante al S
Modo de acción de las enzimas: conceptos importantes
Energía libre de Gibbs(ΔG): cantidad de energia capaz de realizar un trabajo durante una
reaccion a T` y P` cte.
Energía de activación(Ea): barrera energética por encima de la cual una molécula de un
producto intermedio debe pasar para que se lleve a cabo una reacción.
Estado de transición: es un estado que posee mayor cantidad de E libre que los
reactantes y que los productos.
Sitio o centro activo de una enzima
Lugar de la estructura proteica donde se da la interaccion con el sustrato (3 lugares).
Es una estructura dinamica y transitoria.
Hay dos modelos sobre la forma en que el sustrato se une al centro activo de la
enzima:
1.Modelo llave –cerradura
2.Modelo del ajuste inducido

Modelo llave cerradura
Propuesto por el bioqq alemán E. Fisher 1884
Plantea una interacción relativamente rígida entre los 2 componentes.
La enzima permanece sin transformaciones estructurales ni funcionales
Supone que la estructura del sustrato y la del sitio activo son complementarias
Modelo del ajuste inducido
• Propuesto por D. Koschland en
  1958
• La enzima sufre un cambio
  conformacional (al interactuar
  con el S) que permite una
  relación mas estrecha entre
  ambos
• Es el mas aceptado actualmente
• Cuando se logra la interacción E-S
  en por lo menos 3 puntos se ve
  favorecida la rx
• La E y el S sufren cambios
  conformacionales
• Al final de la rx la E recupera su
  estructura original
Cinética enzimática
• Los principios generales de las reacciones químicas se
  aplican también a las reacciones enzimáticas
• En una reacción de orden cero, la velocidad de formación
  del producto es independiente de la concentración de
  sustrato.
• En una reacción de primer ordenla velocidad de formación
  de los productos es directamente proporcional a la
  concentración del sustrato.
• Una reacción de segundo ordenes aquella en la que la
  velocidad de formación del producto depende:
• 1. de la concentración de dos sustratos (como en una
  reacción de condensación)
• 2. del cuadrado de la concentración de un único sustrato
  (reacción de dimerización)
Cinetica enzimatica
• Estudio cuantitativo de la catálisis enzimática parte de
  la bioqqque se encarga de estudiar las velocidades de
  rxde las enzimas y como estas se modifican al variar
  ciertas condiciones
• Velocidad de reacción: cambio en la concentración de
  sustratos o productos por unidad de tiempo.
• Cinetica enzimatica
• Las enzimas son catalizadores biológicos , Cinética
  enzimática:.
• Teoría general de la acción enzimática: la E se combina
  con su S para formar el complejo E-S (unión reversible)
  luego este se rompe: por un lado se libera la E y por el
  otro se origina el ProductoFactor
• Enzimas alostéricas
                                • Catálisis
• Son proteínas con varias
  subunidades                   • Efectos de proximidad y
                                  tensión
• Su actividad es afectada
  por moléculas efectoras       • Efectos electrostáticos
  que se unen a                 • Catálisis acidobásica
• otros lugares alostéricos o   • Catálisis covalente
  reguladores
• Catalizan pasos               • La actividad optima de la
  reguladores claves de las       enzima depende de:
  rutas bioquímicas             • Temperatura
• Representación de la          • pH
  velocidad de rx son
  sigmoideas                    • Presencia de cofactores
                                • [S]
                                • [E]
• El estudio de la Bioquímica muestra la interacción
  de las moléculas inanimadas que constituyen a
  los organismos vivos, para mantener y perpetuar
  la vida por medio de las leyes físicas y químicas.

• La Bioquimica describe en terminos moleculares:
• estructuras
• mecanismos
• procesos quimicos
• Que son compartidos por todos los organismos
  así como los principios organizacionales para la
  vida en todas sus diversas formas:
• La logica molecular de la vida
Características de los seres vivos
• 1.Alto grado de complejidad química y
  organizaciónmicroscópica
• Las estructurasinternasde
  lascélulasestanformadaspor miles de moleculas.
• Cadaestructuratiene:
• •secuenciacaracterísticade subunidades
• •estructuratridimensional
• •selecciónde complementosde uniónen la célula,
  altamenteespecífica
• 2.Sistemasde extracción,        • 3.Capacidad de
  transformacióny utilizaciónde     autoreplicaciónde manera
  energíadel medioambiente.         precisa
• Los organismosvivosson          • Una sola bacteria, colocada en
  capacesde:                        un medio nutritivo, puede
• construiry                        originar un billón de células
  mantenersusestructuras            “hijas” en 24 horas.
• realizartrabajomecánico,        • Cada célula contiene miles de
  químico, osmóticoy eléctrico.     diferentes moléculas, algunas
• La materiainnimadapor el          extremadamente complejas;
  contrario,                        Sin embargo, cada bacteria es
• tiendea decaera un estadomás      una copia fiel de la original, su
                                    construcción es dirigida
• desordenado, en equilibriocon   • enteramente por la
• sualrededor.                    • información contenida
                                  • dentro del material
                                  • genético de la célula
                                  • original.
4.Mechanismossensoriales y de respuesta para alteraciones en su alrededor
Se ajustan constantemente a estos cambios adaptando su quimica
interna = homeostasis

 5.Tienen funciones definidas para cada uno de sus componentes con
 interacciones reguladas entre ellos.
 Cierto tanto para las estructuras macroscopicacomo para las estructuras
 microscopicas y compuestos quimicos individuales.
 La interaccion entre los componentes quimicos de un organismo es dinamica: los
 cambios en un componente causan la coordinacion o la compensacion en otro.
 La colección de moleculas conlleva un programa cuyo fin es la reproduccion de
 este programa y la auto-perpetuacion de esa colección de moleculas; En resumen:
 La vida.
 6. Una historia de cambio evolucionario.
 Los organismos cambian sus estrategias de vida heredadas para sobrevivir en
 circunstancias nuevas.
 El resultado es una enorme diversidad de formas de vida, muy diferentes de
 forma superficial, pero fundamentalmente relacionadas por medio de sus
 ancestros compartidos.
VII. Bases Celulares de la Bioquimica 17 Todas las celulas:
•rodeadas por membrana plasmatica
•citosol que contiene metabolitos, coenzimas, iones inorganicos y enzimas
•un juego de genes contenido en un nucleoide(procariotas) o un nucleo (eucariotas)

 Bases Celulares de la Bioquimica
 Los quimiotrofos oxidan combustibles, transfiriendo electrones hacia buenos
 aceptores: organicos, inorganicos u oxigeno molecular
 Bases Celulares de la Bioquimica
 Las celulas procariotas contienen citosol, un nucleoide y plasmidos.
 Las celulas eucarioticas contienen un nucleo y son multi-compartimentadas,
 segregando ciertos procesos en organelos especificos, que pueden aislarse para ser
 estudiados.

  Bases Celulares de la Bioquimica
  Las proteinascitoesqueletalesse ensamblan en filamentos largos dando a la
  celulaforma y rigidez asicomo de viasde movimiento para los organelos.
  Bases Celulares de la Bioquimica
  Organizacion en Complejos supramoleculares:
  Unidos por medio de interacciones no covalentes, formando una jerarquia de
  estructuras, algunas visibles con el microscopio de luz.
• VIII. Bases Quimicasde • Bases Quimicasde la
  la Bioquimica              Bioquimica
• Debido a su versatilidad • En las celulas vivas se
  de union, el carbono       encuentran algunos
  puede producir un          cientos de pequeñas
  amplio espectro de         moleculas, las
  esqueletos C-C con         interconversiones de
  variedad de grupos         estas moleculas en las
  funcionales que otorgan    vias metabolicas
  las personalidades         centrales han sido
  biologicas y quimicas a    conservadas durante la
  las biomoleculas.          evolucion.
•   Bases Quimicasde la Bioquimica           •   Bases Químicas de la Bioquimica
•   Las proteínas y los ácidos               •   Las interacciones entre moléculas
                                                 biológicas son casi invariablemente
    nucleícosson polímeros lineales de           estereoespecificas: requieren un
    subunidades monoméricassimples               ensamble complementario entre las
•   Sus secuencias contienen información         moléculas interactuantes
    que les confiere su estructura           •    IX. Bases Geneticasde la
                                                 Bioquimica
    tridimensional y funciones biológicas    •   La información genética esta
    de gran importancia                          codificada en la secuencia linear de
•   Bases Quimicasde la Bioquimica               cuatro deoxi-rribonucléotidosen el
                                                 ADN.
•   La configuración molecular solamente     •   La doble cadena helicoidal del ADN
    puede ser cambiada por el                    contiene un “molde” interno para su
    rompimiento de uniones covalentes.           propia replicación y reparación.
•   Para un carbono quiral(4 sustituciones   •   moléculas interactuantes.
    diferentes), los grupos pueden           •   Bases Geneticasde la Bioquimica
    acomodarse de dos formas diferentes,     •   La estructura tridimensional única de
    generando estero isómeros con                cada proteína es producida por la
                                                 secuencia linear de aminoácidos
    distintas propiedades; Solamente un          codificada en el ADN del gen
    isómero es biológicamente activo.            especifico para esa proteína.
•   La conformación molecular es la          •   Macromoléculas individuales con
    posición de átomos en el espacio que         afinidades especiales por otras
                                                 macromoléculas se auto ensamblan
    puede ser cambiado por rotación del          en complejos supra moleculares.
    enlace sencillo sin ruptura del enlace
    covalente.
• X. Agua                            • La molécula de agua y sus
• Las propiedades físicas y            productos de ionización, H+ y
  químicas del agua afectan            OH-, influencian
  todos los aspectos de la             profundamente la estructura,
  estructura celular y sus             ensamblaje y propiedades de
  funciones, ya que las células se     todos los componentes
  encuentran adaptadas al              celulares: proteínas, ácidos
  medio acuoso.                        nucleícosy lípidos.
• Sustancia mas abundante en         • Las interacciones no
  los sistemas vivos, responsable      covalentes responsables por la
  del 70% o mas del peso de la         fuerza y la especificidad de
  mayoría de los organismos.           “reconocimiento” entre
• Las fuerzas de atracción entre       moléculas son decisivamente
  las moléculas del agua y su          influenciadas por las
  ligera tendencia a ionizarse         propiedades solventes del
  son de crucial importancia           agua, incluyendo su habilidad
  para la estructura y función de      de formar puentes de
  las bio-moleculas.                   hidrogeno entre sus moléculas
                                       y con solutos.
Interacciones DebilesNo Covalentes
         en Medios Acuosos
• Puentes de        • Puentes de Hidrogeno
                    • Los puentes de hidrogeno
  Hidrogeno           formados entre las moléculas de
                      agua, proveen las fuerzas
• Interacciones       cohesivas que dan la propiedad
                      de ser liquida a temperatura
  Electrostáticas     ambiente y favorecen el
                      ordenamiento extremo de las
• Interacciones       moléculas, típico del agua en
                      estado cristalino (hielo).
  Hidrofobicas      • El puente de hidrogeno es una
                      unión 10% covalente y 90%
• Fuerzas de Van      electrostática debido a las
                      superposiciones de los orbitales
  derWaals            de unión de los electrones
                      compartidos
Puentes de Hidrogeno
• El agua tiene puntos de    • arreglocasitetrahedricode
  fusion, ebullicion y         los pares de electronesen
  vaporizacion mayores que     los
  cualquier otro solvente      orbitalesexternosalreded
  comun.                       ordel atomode oxigeno
                             • los dos átomosde
                               hidrógenopresentancarga
                               spositivasparcialeslocaliza
                               das
                             • el atomode
                               oxigenopresentaunacarga
                               negativaparcial
• Estas propiedades inusuales son     • Los puentes de hidrogeno pueden
  consecuencia de atracciones           formarse fácilmente entre un
  entre las moléculas de agua           átomo electronegativo (aceptor
  adyacentes, que le dan su gran        de hidrogeno), usualmente
  cohesión interna                      oxigeno o nitrógeno con un solo
                                        par de electrones, y un átomo de
• Las bio-moleculaspolares son          hidrogeno unido por enlace
  fácilmente solubles en agua ya        covalente a otro átomo
  que pueden reemplazarlas              electronegativo (donador de
  interacciones agua-agua con           hidrogeno) en la misma molécula
  interacciones agua-soluto que         o en otra
  son mas energéticamente
  favorables                          •  átomos covalentemente
                                         Los
                                        unidos a Carbonos, no forman
• Las moléculas no polares              puentes de hidrogeno ya que casi
  interfieren con las interacciones     no hay diferencia entre la
  agua-agua, pero no pueden             electronegatividad del C y el H,
  formar interacciones agua-soluto      por lo que la unión es apenas
  y en medios acuosos las               polar
  moléculas no polares tienden a
  agruparse juntas
Interacciones electrostáticas entre
          agua y solutos cargado
•   El agua es un solvente polar.                 •   Agua como solvente. El agua disuelve
•   Fácilmente disuelve la mayoría de las             muchas sales cristalinas al hidratar sus iones.
    biomoleculaslas cuales por lo general son         La estructura laminada del NaCl cristalino es
    polares o tienen carga eléctrica.                 interrumpida cuando las moleculas de agua
•   Compuestos Hidrofilicos:                          se agrupan sobre los iones de Na+ y Cl-. Las
                                                      cargas ionicas son parcialmente neutralizadas
•   Los que se disuelven fácilmente en agua           y las atracciones electrostaticas necesarias
•   Hydro: Agua                                       para formar las laminas del cristal son
•   Philos: amante                                    debilitadas.
•   Compuestos Hidrofóbicos:                      •   Compuestos anfipáticos:
•   Los que no se disuelven fácilmente en agua,   •   Contienen regiones polares (cargadas) y
    como ceras y grasas que son solubles en           regiones no polares (sin carga).
    solventes no polares (cloroformo, benceno)    •   Cuando un compuesto anfipáticose mezcla
•   Hydro: Agua                                       con agua, la región hidrofílica(polar)
•   Phobia: Temor                                     interactúa favorablemente con el solvente y
                                                      tiende a disolverse, pero las regiones
                                                      hidrofóbicas(no polares) se agrupan juntas
                                                      para presentar la menor cantidad del área
                                                      hidrofóbicaal solvente acuoso y las regiones
                                                      polares se rearreglanpara maximizar su
                                                      interacción con el solvente
• Muchas moleculasson         • Ionizaciondel agua
  anfipaticas:                • El agua pura se encuentra
• Proteinas                     levemente ionizada,
• Pigmentos                     formando igual numero
• Vitaminas                     de iones hidrogeno o
                                hidronio (H3O+) y de
• Esteroles                     iones hidroxilo (OH-).
• Fosfolipidosde las          • La concentracion total de
  membranas                     iones hidrogeno de todas
• tienen regiones polares y     las fuentes es
  no polares                    experimentalmente
                                medible yse expresa
                                como el pH de la solucion
• Ionizacion del agua,          • El valor de 7 parael pH de
  Bases y Acidos debiles          unasolucionneutrase
• El producto iónico del          derivadel valor
  agua, Kw, es la base para       absolutodel
  la escala de pH. Esta es un     productoionicodel aguaa
  medio conveniente para          25 C.
  designar la concentración     • Solucionescon pH mayor
  de H en soluciones              que7 son alcalinaso
  acuosas.                        basicas, La
• El pH de una solución           concentracionde OH
  acuosa refleja en escala        esmayor quede H.
  logarítmica la                • Al contrario,
  concentración de iones          lassolucionescon pH
  hidrogeno:                      menorque7 son
• pH= log 1=-log [H].
• [H+]
La escala de pH es logarítmica, no aritmética.
 Cuando dos soluciones difieren en una unidad de pH significa que una de las soluciones
 tiene 10 veces la concentración de H+ respecto a la otra, pero no indica la magnitud
 absoluta de la diferencia
 Un refresco de cola (pH 3.0) o el vino tinto(pH 3.7) tiene una concentración de H+

Amortiguadores y cambios de pH en sistemas biologicos
Amortiguadores:
Son sistemas acuosos que resisten cambios en pH cuando se adicionan pequeñas
cantidades de acidos(H) o bases (OH)
Una mezcla de una acido o base debilcon su sal resiste cambios de pH causado por la
adicionde H u OH
= Funcionan como amortiguadores
En las células y tejidos, Los sistemas de amortiguación de fosfato y de bicarbonato
mantienen los fluidos intray extra celulares dentro de su pH optimo o fisiológico,
usualmente cercano a 7.
Este es el pH en el cual las enzimas actúan de forma optima.

 Los fluidos intray extracelulares de los organismos multicelulares tienen un pH
 característicos y casi constante.
 Los sistemas amortiguadores fisiológicos son la primera línea de defensa ante los cambios
 de pH.
 El citoplasma contiene altas concentraciones de proteínas con aade grupos funcionales
 que actúan como ácidos o bases débiles.
• Los nucleotidos como el ATP, igual
  que muchas moleculas de bajo         • Fuerzas de Van derWaals
  peso molecular, contienen grupos     • Cuando dos átomos no cargados
  ionizables que proporcionan            se encuentran muy cerca, sus
  sistemas amortiguadores para el        nubes electrónicas se influencian
  citoplasma                             una a la otra, los dos núcleos
• Algunos organelos y                    tienden a juntarse, pero sus
  compartimentos altamente               nubes electrónicas comienzan a
  especializados tienen altas            repelerse.
  concentraciones de compuestos        • En el punto donde hay un balance
  con capacidades amortiguadoras.        exacto entre estas fuerzas de
                                         atracción y de repulsión entre los
                                         núcleos se le conoce como punto
                                         de contacto de Van derWaals
                                       • El agua es tanto el solvente en el
                                         cual ocurren las reacciones
                                         metabolicas asi como el reactante
                                         en muchos procesos bioquimicos:
                                       • hidrolisis
                                       • condensacion,
                                       • Reacciones de oxidacion-
                                         reduccion
LÍPIDOS:
                          • LIPIDOS : Componentes
• DEFINICION:Son un         estructurales
  grupo de                • ESTRUCTURA:
  compuestos, con         • Moléculas hidrofóbicasque
                            continen:
  estructuras diversas,   • Derivados de largas
  todos insolubles en       cadenas alifáticas : ACIDOS
                            GRASOS
  agua que pueden ser
                          • •Glicéridos
  extraidospor            • •Esfingolípidos
  compuestos no           • •Fosfoglicéridos
  polares, lo que les     • Sistemas de anillos de
                            hidrocarbonos: esteroides
  confiere sus            • Combinaciones: esteroles
  principales               éster, lípidos menores
  propiedades
  biológicas.
Perfil calórico recomendado

• Se define como el aporte        • CLASIFICACION FUNCIONAL
  energético de                     DE LOS LÍPIDOS
  macronutrientes (proteínas,     • Lípidos de almacenamiento
  hidratos de carbono y           • Lípidos estructuralesde
  lípidos) y alcohol (cuando se     membrana
  consume) a la ingesta
  calórica total.                 • Regulaciónde la función
                                    celular
                                  • Señalización
                                  • Cofactores
                                  • Pigmentos
                                  • Precursoresde sales biliares,
                                    hormonas y vitaminas
                                    liposolubles
• LÍPIDOS DE ALMACENAMIENTO
                                    • Propiedades físicas de los AG
• Son acidoscarboxilicoscon
  cadenas de hidrocarbonosde        • Solubilidad en agua: depende de
  entre 4 y 36 C, usualmente en       la longitud y el grado de
  numero par.                         insaturaciónde la cadena de
                                      hidrocarburos. Entre mas larga y
• Si la cadena no contiene dobles     menos dobles enlaces
  enlaces : Saturados                 estenpresentes en una cadena
• Si la cadena contiene dobles        menos soluble es en agua.
  enlaces : Insaturados             • Punto de fusión: Esta
• CH3(CH2)nCOOH                       determinado por su grado de
                                      insaturación, la longitud de la
                                      cadena y la presencia de
                                      ramificaciones:
                                    • A 25 ºC los AG saturados tienen
                                      una consistencia cerosa mientras
                                      que los insaturados con una
                                      longitud de cadena similar son
                                      aceites líquidos.
                                    • LÍPIDOS DE ALMACENAMIENTO
• AG omega-3 son benéficos para el corazón, entre sus
  efectos positivos:
• acciones antiinflamatorias
• acciones anticoagulantes
• disminución de los niveles de colesterol y triglicéridos
• reducción de la presión sanguínea.
• Se recomienda que el aporte calórico de la ingesta
  total de grasa no supere el 30-35% de la energía total
  consumida, y su distribucioncomo aportantespara la
  obtencionde la energía total debe ser:
• AGS: <10%,
• AGP: <7%
• AGM: >13%
Propiedades físicas de los AG
Solubilidad en agua: depende de la longitud y el grado de
insaturaciónde la cadena de hidrocarburos. Entre mas larga y
menos dobles enlaces estenpresentes en una cadena menos
soluble es en agua.
Punto de fusión: Esta determinado por su grado de
insaturación, la longitud de la cadena y la presencia de
ramificaciones:
A 25 ºC los AG saturados tienen una consistencia cerosa mientras
que los insaturados con una longitud de cadena similar son
aceites líquidos.
LÍPIDOS DE ALMACENAMIENTO
Efectos biológicos de los eicosanoides

•   Prostaglandinas
•   Estimulación de músculo liso (intestino-utero)
•   Regulación de la producción de esteroides
•   Inhibición de la secreción gástrica
•   Sensibilización al dolor
•   Mediación de la respuesta inflamatoria en todos los tejido
•   Tromboxanos
•   Regulan la función de plaquetas
•   Leucotrienos (LTC4y LTD4)
•   Músculo liso (intestino, vías pulmonares y traquea)
•   Mediadores de anafilaxis
TRIACILGLICEROLES
                               • Almacenamiento de grasa:
                                 Funciones
• Adipocitos:                  • Producción de energía:
• Células animales               oxidación para generar ATP
  especializadas en el           e impulsar procesos
  almacenamiento de las          metabólicos
  grasas.                      • Producción de calor: oxidan
• Constituyen la mayor parte     TAG para producir calor en
  del tejido adiposo.            lugar de ATP (grasa parda en
                                 animales homeotermos)
• LÍPIDOS DE
  ALMACENAMIENTO               • Aislamiento: entorno frío,
                                 las capas de células
                                 adiposas actúan como
                                 aislante (ballenas)
                               • LÍPIDOS DE
                                 ALMACENAMIENTO
• Glicerofosfolipidos         • COLESTEROL:
• Muy abundantes en las         Importancia clínica
  membranas biológicas.       • Es poco soluble, tiende a
• Se derivan del acido          precipitar en el endotelio
  fosfatidico                   de los vasos sanguíneos
• El acfosfatidicose puede    • Se asocia con el bloqueo
  esterificar en el fosfato     de arterias (placas
  unido al C3 con una           ateromatosas)
  molecaltamente              • Resulta en:
  hidrofilicaa través de un   • -Aumento de presión
  enlace fosfodiester:          arterial
• colinaetanolamina           • -Formación de coágulos:
• serinainositoldifosfato,      infarto al miocardio
  fosfatidilglicerolLÍPIDOS   • -Derrames
• ESTEROIDES                         • ESTEROLES:
• Compuestos hexaprenoides(6           CALCIFEROLES
  unidades prenoides5 C)             • Vitamina D: mejora la
• Enorme importancia biológica         absorción de Ca+2por parte
• Esteroles: alcoholes esteroideos     del intestino.
• Colesterol                         • Ergocalciferol: VitD2(vegetal)
• Calciferoles (vitD)
                                     • Colecalciferol: VitD3(animal)
• Ácidos biliares
• Hormonas corticales:               • Puede ser sintetizada por el
• Glucoy mineralocorticoides           organismo
• Hormonas sexuales:                 • Deficiencia: Raquitismo: niños
• Estrógenos                           ; Osteomalacia: adultos
• Gestágenos
• Andrógenos
• Digitálicos: Txinsufcardiaca →
  Inhibición sobre la bomba de Na+
• ESTEROIDES: SALES          • Esteroides: Hormonas
  BILIARES                   • Estrógenos: Hhpropias
• Abundantes en la bilis       de la primera mitad del
• Acido cólico, acido          ciclo sexual femenino
  glicocólico (Gly), ácido     (estradiol)
  taurocólico (taurina),     • Andrógenos:
  litocólico                   Hhsexuales masculinas
• Producidos por el            (testosterona)
  hígado                     • Gestágenos: Hhde la 2`
• Actúan como agentes          mitad del ciclo sexual
  emulsionantes de los         femenino y del
  lípidos que llegan al        embarazo
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Aminoacidos y proteinas

  • 1. AMINOACIDOS Y PROTEINAS • Aminoacidos • Son unidades estructurales básicas que forman las proteínas. • Se han descrito mas de 100 aapero solo 22 de ellos participan en la síntesis de proteínas.
  • 2. AMINOACIDOS (aa) • Los aa difieren entre si por el grupo R (grupo sustitutivo). • R: adjudican diferentes propiedades a cada uno de los aa y determinan su función biológica.
  • 4. Clasificación de los aa • En función de la naturaleza de su cadena lateral: • Aaalifáticos cuyo R no es polar: Son muy poco reactivos, y fuertemente hidrofóbicos(excepto la Gly, cuya cadena lateral es un átomo de hidrógeno). • Aaalifáticos cuyo R es polar pero no tiene carga:serina, treonina, cisteina, prolinaasparraginay glutamina.
  • 5. Clasificación de los aa • En función de la naturaleza de su cadena lateral: • Aaalifáticos cuyo R es polar y se encuentra en estado de ion positivo:lisina, argininae histidina. • Aaalifáticos cuyo R es polar y se encuentra en estado de ion negativo: aspartatoy glutamato. • Aminoácidos aromáticos: Fenilalanina, tirosina, triptofano
  • 6. Estructura de los aminoácidos • Por su estructura, los aa se ionizan en solucion acuosa de manera que pueden funcionar como ácidos y como bases (anfoliticos). •  aa que poseen un g. amino y un g. carboxilo (Gly, Los Leu, Ile) se convierten en iones dipolares (Zwitteriones). • Estos iones en slns acuosas son eléctricamente neutros y no emigran ni se someten a campos eléctricos. •  ionizacion de un aa depende del pH de la solución. La • Punto isolectrico: pH en el cual la molécula no tiene carga neta
  • 8. Clasificacion de los aa según R
  • 9. Nomenclatura de los aa • Alanina Ala A • Metionina* Met M • Arginina Arg R • Fenilalanina* Phe F • Asparragina Asn N • Prolina Pro P • Ac. Aspartico Asp D • Serina Ser S • Cisteina Cys C • Treonina* Thr T • Glutamina Gln Q • Triptofano* Trp W • Ac. Glutamico Glu E • Tirosina Tyr Y • Glicina Gly G • Valina* Val V • Histidina + His H • Isoleucina* Ile I • +: Esencial en la niñez • Leucina * Leu L • *: Esencial durante toda la vida • Lisina*Lys K
  • 10. Estructura de los aa • Se presentan en dos formas isomericas, imágenes especulares no superponibles. •  isomeros de la serie L Los poseen el grupo alfa amino a la izquierda. •  aa que se encuentran en Los las proteínas son de la serie L y tienen mayor participación metabólica celular. •  aa de la serie D participan Los en las paredes celulares bacterianas.
  • 11. FORMACION DE PEPTIDOS Y POLIPEPTIDOS • Los aase unen o polimerizan por medio de enlaces peptídicos: la unión química entre el grupo carboxilde un aacon el grupo amino de otro aa, con la liberación de una molécula de agua. •  rx+ importante de los aaes la formación La de un enlace peptídicoya que este enlace carece de carga a cualquier pH de interés fisiológico.
  • 13. PEPTIDOS Y POLIPEPTIDOS • La unión de dos o más aahasta un máximo de 100 mediante enlaces peptídicosda lugar a los péptidos: •  aa= dipéptido 2 •  aa=tripeptido, etc 3 • Menos de 100 aaoligopeptido •  de 100 aapolipéptidohasta 10000 Mas •  de 10000 aaProteínas Mas
  • 14. Resumen: • Los 22 aacomunmenteencontradoscomoresiduosen lasproteinascontienen: • un grupocarboxilo • un grupoamino • un sustituyenteR distintivoen el atomode carbono. • Los atomosde C alfason asimetricosexceptoen el casode la glicina, en todoslos aapuedenexistiren 2 formasesteroisomericas: • L • D
  • 15. • Solamentelos estereoisomerosL, con unaconfiguracionrelacionadacon la configuracionabsolutade la moleculade referenciaL-Gliceraldehidose encuentranformandoparte de lasproteinas • Se puedenencontraraminoacidospococomunes, comoconstituyentesde proteinas: pormodificacionde residuosde aacomunesdespuesde la sintesisde lasproteinas, o comometabolitoslibres • Los aminoacidosson clasificadosen 5 tipos, segunsugrupoR, en base de la polaridady cargaa pH 7
  • 16. • Los aa varian en sus propiedades acido basicas y tienen curvas de titulacion caracteristicas. • Los aa monoaminocarboxilicos (grupos R no ionizables) son acidos diproticos (H3NCH(R)COOH) cuando el pH se incrementa. • Los aa con grupos R ionizables tienen especies ionicas adicionales, dependiendo del pH del medio.
  • 17. PROTEINAS Son cadenas de aa, su peso molecular va de 5,000 a 400,000 daltons, pudiendo llegar hasta un millonde daltons. El enlace peptídicoes un enlace covalente se requiere de ácidos fuertes para romperlo, en el organismo solamente se rompe por enzimas proteasas Eje peptídico: a lo largo de este eje de grupos carboxilos se acomodan las cadenas laterales de los aaque conforman la proteína. Las proteinas son las macromoleculas biologicas mas abundantes ya que se encuentran en todas las celulas asi como en todas las partes de las celulas Se pueden encontrar en gran variedad de formas, en miles de diferentes tipos. Su rango de tamaño varia desde peptidos muy pequeños hasta grandes polimeros con pesos moleculares de millones que pueden encontrarse en una sola celula Las proteinas exhiben una enorme diversidad de funciones biologicas y son los productos principales de las vias de transmision de informacion del organismo. Las proteinas son los instrumento smoleculares por medio de los cuales se expresa y regula la informacion genetica El estudio de su estructura y funciones desde el siglo XIX ha sido elemento basico para la comprension del funcionamiento celular.
  • 18. • ALGUNAS FUNCIONES GENERALES: • 1.Componentes estructurales: colágeno del pelo • 2.Transportadores de sustancias: hemoglobina • 3.Hormonas: insulina • 4.Catalizadores de rxsbioquímicas: enzimas • 5.Componentes del esqueleto intracelular o citoesqueleto: microtubulosy filamentos • 6.Elementos de la contraccionmuscular: actinay miosina
  • 19. Clasificación de las proteínas Desde un punto de vista químico, existen dos grandes grupos de proteínas: 1.proteínas simples: formadas exclusivamente por aminoácidos, como es el caso de la ubiquitina, una proteasa intracelular formada por 53 AA. 1.proteínas conjugadas: que contienen además de la cadena polipeptídicaun componente no aminoacídicollamado grupo prostético, que puede ser un azúcar, un lípido, un ácido nucleico o simplemente un ión inorgánico. La proteína en ausencia de su grupo prostético no es funcional, y se llama apoproteína. La proteína unida a su grupo prostético es funcional, y se llama holoproteína(holoproteína= apoproteína+ grupo prostético). Son proteínas conjugadas la hemoglobina, la mioglobina, los citocromos, etc.
  • 20. Clasificación • En cuanto a su formamolecular, podemos distinguir: • 1.proteínas globulares: la cadena polipeptídicaaparece enrollada sobre sí misma dando lugar a una estructura más o menos esférica y compacta. Ejm: Mioglobinay Hemoglobina • 2.proteínas fibrosas: si hay una dimensión que predomina sobre las demás, se dice que la proteína es fibrosa. Las proteínas fibrosas, por lo general, tienen funciones estructurales. • Protde la piel, el pelo, la seda. • Son siempre alargadas • Son menos abundantes que las globulares
  • 21. Estructura 1º • Acomodamiento de las cadenas de aa(orden secuencial de aa), estabilizado por enlaces peptidicos, puentes disulfuros(cisteina). Al alterar este orden también se altera el tipo, las propiedades de la proteína. • Ejm: Insulina, vasopresina, • colecistoquinina, gastrina, secretina (Hhdel sistema digestivo)
  • 22. Son rearreglosespeciales originados por el Estructura 2º establecimiento de puentes de H entre los grupos q conforman los enlaces peptidicosde los aacercanos. •  Αhelice: esun ordenamientohelicoidalen el queel g. R de los aase orientahaciael exterior de la helice. • -Se estabilizaporla formacionde puentesde H entre los componentesdel enlace peptidicode aacercanosen la estruct1 de la proteina. • -Ejm: proteinasfibrosas: colageno, alfaqueratina. •  βlaminar: • -El esqueleto se ordena en forma de zigzag. • -Los grupos R de aase orientan en direcciones opuestas con un patronalternante y hacia afuera • -se estabiliza por puentes de H. • -Los aano tienenqueestarproximosen la estructura1 • -Tipicade proteinasfibrosas: fibroina(seda)
  • 23. Estructura 3º • Esunamodificaciónenelespacio,esel plegamientotridimensionaltotaldel acadenadeunaproteínaoseaquesef ormaunaproteínatridimensional,en laestructuraterciariaseencuentrans egmentosdeestructura2ºy1º. • Estaconformaciónfacilitalasolubilid adenaguayasírealizarfuncionesdetr ansporte,enzimáticas,hormonales, etc. • Ejm:mioglobina
  • 24. Estructura 4º • Es el nivel mas complejo de organización. • Se refiere a interacciones no covalentes que unen varias cadenas polipeptidicas en una sola molécula. Ejm: la hemoglobina q tiene 4 cadenas. • Cada una de estas cadenas polipeptídicas recibe el nombre de protómero. • El número de protómeros (cadenas) varía desde dos como en la hexoquinasa, cuatro como en la hemoglobina, o muchos como la cápsida del virus de la poliomielitis, que consta de 60 unidades proteicas.
  • 25. Estructura 4º • Esta conformación se mantiene estable gracias a la existencia de enlaces entre los radicales Rde los aminoácidos. Aparecen varios tipos de enlaces: • los puentes de hidrógeno • lospuentes eléctricosentre aade carga diferente llamados tambien“atracciones electrostáticas” • las interacciones hidrófobasformación de un núcleo hidrofobitoo interface hidrofobico • el puente disulfuro
  • 26. DESNATURALIZACION • Los agentes que provocan la desnaturalización de una proteína se llaman agentes desnaturalizantes. Se distinguen agentes físicos(calor) y químicos(detergentes, disolventes orgánicos, pH, fuerza iónica). • Como en algunos casos el fenómeno de la desnaturalización es reversible, es posible precipitar proteínas de manera selectiva mediante cambios en: • (1) la polaridad del disolvente • (2) la fuerza iónica • (3) el pH • (4) la temperatura
  • 27. Propiedades ESTADO NATIVO SE LLAMA desnaturalizaciónde las proteínas a la pérdida • DENATURALIZACION de las estructuras de • RENATURALIZACION orden superior(secundaria, terciaria y cuaternaria), quedando la cadena polipeptídicareducida a ESTADO DESNATURALIZADO un polímero estadístico sin ninguna estructura tridimensional fija
  • 28. Propiedades • La desnaturalización provoca diversos efectosen la proteína: • 1.cambios en las propiedades hidrodinámicasde la proteína: aumenta la viscosidad y disminuye el coeficiente de difusión • 2.una drástica disminución de su solubilidad, ya que los residuos hidrofóbicosdel interior aparecen en la superficie • 3 pérdida de las propiedades biológicas
  • 29. PROTEINAS COMO CATALIZADORES ENZIMAS • son proteínas que catalizan reacciones químicas en los seres vivos. • son catalizadores: sustancias que, sin consumirse en una reacción, aumentan notablemente su velocidad. • No hacen factibles las reacciones imposibles, sino que sólamente aceleran las que espontáneamente podrían producirse. • Los enzimas son catalizadores específicos: cada enzima cataliza un solo tipo de reacción, y casi siempre actúa sobre un único sustrato o sobre un grupo muy reducido de ellos.
  • 30. • En una reacción catalizada por • Efecto del pH un enzima: • Según el pH del medio, los • La sustancia sobre la que actúa grupos R de las enz pueden el enzima se llamasustrato. tener carga eléctrica positiva, • El sustrato se une a una región negativa o neutra. concreta del enzima, • Hay un pH en el cual la llamadacentro activo. conformación será la más • Una vez formados adecuada para la actividad losproductosla enzima puede catalítica. Este es el llamadopH comenzar un nuevo ciclo de óptimo. reacción • La mayoría de los enzimas son • Los factores que influyen de muy sensibles a los cambios manera más directa sobre la de pH. (amortiguadores actividad de un enzima son: fisiologicos) • 1.pH • 2.Temperatura • 3.Cofactores
  • 31. • Efecto de la Tº • Efecto de los cofactores • los aumentos de Casi un tercio de los temperatura aceleran las enzimas conocidos reacciones químicas requieren cofactores para su función. • La temperatura a la cual la actividad catalítica es • Los cofactores pueden ser máxima se llama iones inorgánicos como el temperatura óptima Fe++, Mg++, Mn++, Zn++ etc. • Cuando el cofactor es una molécula orgánica se llama coenzima. • Muchos de estos coenzimas se sintetizan a partir de vitaminasEfecto de los cofactores
  • 32. Función de los Cofactores • Alterar la estructura tridimensional de la enzima • Intervenir como otro sustrato
  • 33. Coenzimas y sus vitaminas de procedencia • NAD • Clasificación (nicotinamidaadenindinucleoti do) • En función de su acción • VitB3 (ac. nicotinico) catalítica específica, los • CoA enzimas se clasifican en 6 • Ac. Pantotenico grandes grupos o clases: • FMN (flavin adenin • Clase 1: OXIDORREDUCTASAS mononucleotido) • Clase 2: TRANSFERASAS • VitB2 (riboflavina) • Clase 3: HIDROLASAS • FAD (flavin adenin • Clase 4: LIASAS dinucleotido) • Clase 5: ISOMERASAS • VitB2 (riboflavina) • Clase 6: LIGASAS • TPP (tiamina pirofosfato) • VitB1 (tiamina)
  • 34. Clase 2: TRANSFERASASCatalizan la transferencia de un grupo químico (distinto del hidrógeno) de un sustrato a otro. Ejm: Quinasas
  • 35. Clase 3: HIDROLASAS • Catalizan las reacciones • Clase 4: LIASAS de hidrólisis: (rupturas hidroliticas. Ejm • Formación de dobles proteinasas enlaces por eliminación • lactosa + agua ↔glucosa + galactosa de un grupo qq o adición de grupos a dobles enlaces. Ejem: aldehido liasas
  • 36. Clase 5: ISOMERASAS • Catalizan la interconversión de isómeros: rearreglos de átomos dentro de una molécula. Son ejemplos la fosfotriosa isomerasa y la fosfoglucosa isomerasa
  • 37. Clase 6: LIGASAS • Reacciones en las que se • Nomenclatura unen dos moléculas • nombres particulares • Formación de enlaces qq, • nombre sistemático: utilizando ATP u otros consta actualmente de 3 nucleótidos como fuente partes: de energía. Ejem: • 1.el sustrato preferente polimerasas • 2.el tipo de reacción realizado • 3.terminación "asa“ • Ejm: glucosa fosfato isomerasa • -
  • 38. • Nomenclatura • Cuando la acción típica del enzima es la hidrólisis del sustrato, el segundo componente del nombre se omite y por ejemplo: lactasa • código de la comisión enzimática: El nombre de cada enzima puede ser identificado por un código numérico, encabezado por las letras EC (enzymecommission), seguidas de 4 números separados por puntos. El 1º número indica a cual de las seis clases pertenece el enzima, el 2º se refiere a distintas subclases dentro de cada grupo, el 3º y el 4º se refieren a los grupos químicos específicos • que intervienen en la reacción.
  • 39. Regulación de la actividad enzimática • Homeostasis: eq dinámico del medio interno. • 1.Modificación de la [S] • 2.Modificación de la [E] • 3.Adicion covalente • 4.Regulación alosterica • 5.Activación por proteolisis (zimógeno) • 6.Cambios en el pH • 7.Cambios en la temperatura
  • 40. Modificación de la [S] •  la menos compleja. Es • Ocurre al ↑o ↓la *S+ • Bajas [S] es indicador de disminución de la actividad enzimática •  sup: velocidad de Fig rx enzimatica a 6 diferentes [S]
  • 41. Modificación de la [E] • Es mas compleja: requiere la síntesis de novo de enzimas • Regulación enzimática (inducción enzimática) • Mantenimiento de un estado • La síntesis proteica requiere ordenado tiempo y mucha energía • Conservación de energía • Cuando la [S] aumenta por • Respuesta a las variaciones encima de ciertos valores y si ambientales aparecen nuevos sustratos (antes ausentes) se deben sintetizar nuevas enzimas. • El control se realiza por: • La inducción enzimática es estimulada por hormonas • 1.Control genético (larga duración) • 2.Modificación covalente • Represión enzimática: • 3.Regulación alostérica disminución de la síntesis de • 4.Activación de zimógenos enzimas • ** de acuerdo a las necesidades celulares
  • 42. Control genético • La modificacionde la [Enzima]es realizada de acuerdo a las necesidades celulares por medio de 2 mecanismos: • Inducción enzimática:mas compleja: requiere la síntesis de novode enzimas: • Requiere tiempo y mucha energía • Cuando la [S] aumenta por encima de ciertos valores y si aparecen nuevos sustratos (antes ausentes) se deben sintetizar nuevas enzimas. • La inducción enzimática es estimulada por hormonas (larga duración) • Represión enzimática:disminución de la síntesis de enzimas • Aminoácidos y
  • 43. • 2. Adición covalente • 3. Regulación alosterica • la actividad enz puede ↑o • Las enz reguladas por ↓por a adición covalente alosterismo existen en dos de un grupo químico a la estados: enzima • 1.T o tenso • Es transitoria y reversible • 2.L o laxo • Con mayor frecuencia: g. • Hay 2 tipos de reguladores fosfatos, g. metilo y la alostericos: adenosina • 1.Efectores o activadores • Adición o remoción de g. qq alostericos funcionan como mxs de • 2.Inhibidores alostericos control • Ciertas sust se unen en sitios diferentes del sitio activo (sitio alosterico) • Ejm: ATP, NADH, citrato, etc.
  • 44. 4. Activación de zimógenos • Las enz son sintetizadas como moléculas inactivas llamadas zimógenos o proenzimas. • Para activarse, los zimógenos sufren un ataque hidrolítico que origina la liberación de uno o varios péptidos • Si estas enzimas se sintetizan directamente en forma activa destruirían la propia célula que las produce • EJ: enzimas digestivas: • 28Aminoácidos y Proteínas
  • 45. INHIBICIÓN ENZIMATICA Medio importante para regular las rutas metabólicas Tx clínicos se fundamentan en la inhibición enzimática Permite diseñar técnicas bioquímicas Clases de inhibidores Inhibición reversible: 1.Competitivos 2.Acompetitivos 3.No competitivos Inhibición Irreversible: venenos enzimáticos Inhibidores competitivos Se unen de forma reversible a la enzima libre para formar complejo EI El S y el I compiten por el mismo lugar en la enzima La actividad de la enzima ↓ El efecto puede invertirse: ↑ la * S + Reducen la afinidad de la enzima por el S Tienen una estructura semejante al S
  • 46. Modo de acción de las enzimas: conceptos importantes Energía libre de Gibbs(ΔG): cantidad de energia capaz de realizar un trabajo durante una reaccion a T` y P` cte. Energía de activación(Ea): barrera energética por encima de la cual una molécula de un producto intermedio debe pasar para que se lleve a cabo una reacción. Estado de transición: es un estado que posee mayor cantidad de E libre que los reactantes y que los productos. Sitio o centro activo de una enzima Lugar de la estructura proteica donde se da la interaccion con el sustrato (3 lugares). Es una estructura dinamica y transitoria. Hay dos modelos sobre la forma en que el sustrato se une al centro activo de la enzima: 1.Modelo llave –cerradura 2.Modelo del ajuste inducido Modelo llave cerradura Propuesto por el bioqq alemán E. Fisher 1884 Plantea una interacción relativamente rígida entre los 2 componentes. La enzima permanece sin transformaciones estructurales ni funcionales Supone que la estructura del sustrato y la del sitio activo son complementarias
  • 47. Modelo del ajuste inducido • Propuesto por D. Koschland en 1958 • La enzima sufre un cambio conformacional (al interactuar con el S) que permite una relación mas estrecha entre ambos • Es el mas aceptado actualmente • Cuando se logra la interacción E-S en por lo menos 3 puntos se ve favorecida la rx • La E y el S sufren cambios conformacionales • Al final de la rx la E recupera su estructura original
  • 48. Cinética enzimática • Los principios generales de las reacciones químicas se aplican también a las reacciones enzimáticas • En una reacción de orden cero, la velocidad de formación del producto es independiente de la concentración de sustrato. • En una reacción de primer ordenla velocidad de formación de los productos es directamente proporcional a la concentración del sustrato. • Una reacción de segundo ordenes aquella en la que la velocidad de formación del producto depende: • 1. de la concentración de dos sustratos (como en una reacción de condensación) • 2. del cuadrado de la concentración de un único sustrato (reacción de dimerización)
  • 49. Cinetica enzimatica • Estudio cuantitativo de la catálisis enzimática parte de la bioqqque se encarga de estudiar las velocidades de rxde las enzimas y como estas se modifican al variar ciertas condiciones • Velocidad de reacción: cambio en la concentración de sustratos o productos por unidad de tiempo. • Cinetica enzimatica • Las enzimas son catalizadores biológicos , Cinética enzimática:. • Teoría general de la acción enzimática: la E se combina con su S para formar el complejo E-S (unión reversible) luego este se rompe: por un lado se libera la E y por el otro se origina el ProductoFactor
  • 50. • Enzimas alostéricas • Catálisis • Son proteínas con varias subunidades • Efectos de proximidad y tensión • Su actividad es afectada por moléculas efectoras • Efectos electrostáticos que se unen a • Catálisis acidobásica • otros lugares alostéricos o • Catálisis covalente reguladores • Catalizan pasos • La actividad optima de la reguladores claves de las enzima depende de: rutas bioquímicas • Temperatura • Representación de la • pH velocidad de rx son sigmoideas • Presencia de cofactores • [S] • [E]
  • 51. • El estudio de la Bioquímica muestra la interacción de las moléculas inanimadas que constituyen a los organismos vivos, para mantener y perpetuar la vida por medio de las leyes físicas y químicas. • La Bioquimica describe en terminos moleculares: • estructuras • mecanismos • procesos quimicos • Que son compartidos por todos los organismos así como los principios organizacionales para la vida en todas sus diversas formas: • La logica molecular de la vida
  • 52. Características de los seres vivos • 1.Alto grado de complejidad química y organizaciónmicroscópica • Las estructurasinternasde lascélulasestanformadaspor miles de moleculas. • Cadaestructuratiene: • •secuenciacaracterísticade subunidades • •estructuratridimensional • •selecciónde complementosde uniónen la célula, altamenteespecífica
  • 53. • 2.Sistemasde extracción, • 3.Capacidad de transformacióny utilizaciónde autoreplicaciónde manera energíadel medioambiente. precisa • Los organismosvivosson • Una sola bacteria, colocada en capacesde: un medio nutritivo, puede • construiry originar un billón de células mantenersusestructuras “hijas” en 24 horas. • realizartrabajomecánico, • Cada célula contiene miles de químico, osmóticoy eléctrico. diferentes moléculas, algunas • La materiainnimadapor el extremadamente complejas; contrario, Sin embargo, cada bacteria es • tiendea decaera un estadomás una copia fiel de la original, su construcción es dirigida • desordenado, en equilibriocon • enteramente por la • sualrededor. • información contenida • dentro del material • genético de la célula • original.
  • 54. 4.Mechanismossensoriales y de respuesta para alteraciones en su alrededor Se ajustan constantemente a estos cambios adaptando su quimica interna = homeostasis 5.Tienen funciones definidas para cada uno de sus componentes con interacciones reguladas entre ellos. Cierto tanto para las estructuras macroscopicacomo para las estructuras microscopicas y compuestos quimicos individuales. La interaccion entre los componentes quimicos de un organismo es dinamica: los cambios en un componente causan la coordinacion o la compensacion en otro. La colección de moleculas conlleva un programa cuyo fin es la reproduccion de este programa y la auto-perpetuacion de esa colección de moleculas; En resumen: La vida. 6. Una historia de cambio evolucionario. Los organismos cambian sus estrategias de vida heredadas para sobrevivir en circunstancias nuevas. El resultado es una enorme diversidad de formas de vida, muy diferentes de forma superficial, pero fundamentalmente relacionadas por medio de sus ancestros compartidos.
  • 55. VII. Bases Celulares de la Bioquimica 17 Todas las celulas: •rodeadas por membrana plasmatica •citosol que contiene metabolitos, coenzimas, iones inorganicos y enzimas •un juego de genes contenido en un nucleoide(procariotas) o un nucleo (eucariotas) Bases Celulares de la Bioquimica Los quimiotrofos oxidan combustibles, transfiriendo electrones hacia buenos aceptores: organicos, inorganicos u oxigeno molecular Bases Celulares de la Bioquimica Las celulas procariotas contienen citosol, un nucleoide y plasmidos. Las celulas eucarioticas contienen un nucleo y son multi-compartimentadas, segregando ciertos procesos en organelos especificos, que pueden aislarse para ser estudiados. Bases Celulares de la Bioquimica Las proteinascitoesqueletalesse ensamblan en filamentos largos dando a la celulaforma y rigidez asicomo de viasde movimiento para los organelos. Bases Celulares de la Bioquimica Organizacion en Complejos supramoleculares: Unidos por medio de interacciones no covalentes, formando una jerarquia de estructuras, algunas visibles con el microscopio de luz.
  • 56. • VIII. Bases Quimicasde • Bases Quimicasde la la Bioquimica Bioquimica • Debido a su versatilidad • En las celulas vivas se de union, el carbono encuentran algunos puede producir un cientos de pequeñas amplio espectro de moleculas, las esqueletos C-C con interconversiones de variedad de grupos estas moleculas en las funcionales que otorgan vias metabolicas las personalidades centrales han sido biologicas y quimicas a conservadas durante la las biomoleculas. evolucion.
  • 57. Bases Quimicasde la Bioquimica • Bases Químicas de la Bioquimica • Las proteínas y los ácidos • Las interacciones entre moléculas biológicas son casi invariablemente nucleícosson polímeros lineales de estereoespecificas: requieren un subunidades monoméricassimples ensamble complementario entre las • Sus secuencias contienen información moléculas interactuantes que les confiere su estructura • IX. Bases Geneticasde la Bioquimica tridimensional y funciones biológicas • La información genética esta de gran importancia codificada en la secuencia linear de • Bases Quimicasde la Bioquimica cuatro deoxi-rribonucléotidosen el ADN. • La configuración molecular solamente • La doble cadena helicoidal del ADN puede ser cambiada por el contiene un “molde” interno para su rompimiento de uniones covalentes. propia replicación y reparación. • Para un carbono quiral(4 sustituciones • moléculas interactuantes. diferentes), los grupos pueden • Bases Geneticasde la Bioquimica acomodarse de dos formas diferentes, • La estructura tridimensional única de generando estero isómeros con cada proteína es producida por la secuencia linear de aminoácidos distintas propiedades; Solamente un codificada en el ADN del gen isómero es biológicamente activo. especifico para esa proteína. • La conformación molecular es la • Macromoléculas individuales con posición de átomos en el espacio que afinidades especiales por otras macromoléculas se auto ensamblan puede ser cambiado por rotación del en complejos supra moleculares. enlace sencillo sin ruptura del enlace covalente.
  • 58. • X. Agua • La molécula de agua y sus • Las propiedades físicas y productos de ionización, H+ y químicas del agua afectan OH-, influencian todos los aspectos de la profundamente la estructura, estructura celular y sus ensamblaje y propiedades de funciones, ya que las células se todos los componentes encuentran adaptadas al celulares: proteínas, ácidos medio acuoso. nucleícosy lípidos. • Sustancia mas abundante en • Las interacciones no los sistemas vivos, responsable covalentes responsables por la del 70% o mas del peso de la fuerza y la especificidad de mayoría de los organismos. “reconocimiento” entre • Las fuerzas de atracción entre moléculas son decisivamente las moléculas del agua y su influenciadas por las ligera tendencia a ionizarse propiedades solventes del son de crucial importancia agua, incluyendo su habilidad para la estructura y función de de formar puentes de las bio-moleculas. hidrogeno entre sus moléculas y con solutos.
  • 59. Interacciones DebilesNo Covalentes en Medios Acuosos • Puentes de • Puentes de Hidrogeno • Los puentes de hidrogeno Hidrogeno formados entre las moléculas de agua, proveen las fuerzas • Interacciones cohesivas que dan la propiedad de ser liquida a temperatura Electrostáticas ambiente y favorecen el ordenamiento extremo de las • Interacciones moléculas, típico del agua en estado cristalino (hielo). Hidrofobicas • El puente de hidrogeno es una unión 10% covalente y 90% • Fuerzas de Van electrostática debido a las superposiciones de los orbitales derWaals de unión de los electrones compartidos
  • 60. Puentes de Hidrogeno • El agua tiene puntos de • arreglocasitetrahedricode fusion, ebullicion y los pares de electronesen vaporizacion mayores que los cualquier otro solvente orbitalesexternosalreded comun. ordel atomode oxigeno • los dos átomosde hidrógenopresentancarga spositivasparcialeslocaliza das • el atomode oxigenopresentaunacarga negativaparcial
  • 61. • Estas propiedades inusuales son • Los puentes de hidrogeno pueden consecuencia de atracciones formarse fácilmente entre un entre las moléculas de agua átomo electronegativo (aceptor adyacentes, que le dan su gran de hidrogeno), usualmente cohesión interna oxigeno o nitrógeno con un solo par de electrones, y un átomo de • Las bio-moleculaspolares son hidrogeno unido por enlace fácilmente solubles en agua ya covalente a otro átomo que pueden reemplazarlas electronegativo (donador de interacciones agua-agua con hidrogeno) en la misma molécula interacciones agua-soluto que o en otra son mas energéticamente favorables •  átomos covalentemente Los unidos a Carbonos, no forman • Las moléculas no polares puentes de hidrogeno ya que casi interfieren con las interacciones no hay diferencia entre la agua-agua, pero no pueden electronegatividad del C y el H, formar interacciones agua-soluto por lo que la unión es apenas y en medios acuosos las polar moléculas no polares tienden a agruparse juntas
  • 62. Interacciones electrostáticas entre agua y solutos cargado • El agua es un solvente polar. • Agua como solvente. El agua disuelve • Fácilmente disuelve la mayoría de las muchas sales cristalinas al hidratar sus iones. biomoleculaslas cuales por lo general son La estructura laminada del NaCl cristalino es polares o tienen carga eléctrica. interrumpida cuando las moleculas de agua • Compuestos Hidrofilicos: se agrupan sobre los iones de Na+ y Cl-. Las cargas ionicas son parcialmente neutralizadas • Los que se disuelven fácilmente en agua y las atracciones electrostaticas necesarias • Hydro: Agua para formar las laminas del cristal son • Philos: amante debilitadas. • Compuestos Hidrofóbicos: • Compuestos anfipáticos: • Los que no se disuelven fácilmente en agua, • Contienen regiones polares (cargadas) y como ceras y grasas que son solubles en regiones no polares (sin carga). solventes no polares (cloroformo, benceno) • Cuando un compuesto anfipáticose mezcla • Hydro: Agua con agua, la región hidrofílica(polar) • Phobia: Temor interactúa favorablemente con el solvente y tiende a disolverse, pero las regiones hidrofóbicas(no polares) se agrupan juntas para presentar la menor cantidad del área hidrofóbicaal solvente acuoso y las regiones polares se rearreglanpara maximizar su interacción con el solvente
  • 63. • Muchas moleculasson • Ionizaciondel agua anfipaticas: • El agua pura se encuentra • Proteinas levemente ionizada, • Pigmentos formando igual numero • Vitaminas de iones hidrogeno o hidronio (H3O+) y de • Esteroles iones hidroxilo (OH-). • Fosfolipidosde las • La concentracion total de membranas iones hidrogeno de todas • tienen regiones polares y las fuentes es no polares experimentalmente medible yse expresa como el pH de la solucion
  • 64. • Ionizacion del agua, • El valor de 7 parael pH de Bases y Acidos debiles unasolucionneutrase • El producto iónico del derivadel valor agua, Kw, es la base para absolutodel la escala de pH. Esta es un productoionicodel aguaa medio conveniente para 25 C. designar la concentración • Solucionescon pH mayor de H en soluciones que7 son alcalinaso acuosas. basicas, La • El pH de una solución concentracionde OH acuosa refleja en escala esmayor quede H. logarítmica la • Al contrario, concentración de iones lassolucionescon pH hidrogeno: menorque7 son • pH= log 1=-log [H]. • [H+]
  • 65. La escala de pH es logarítmica, no aritmética. Cuando dos soluciones difieren en una unidad de pH significa que una de las soluciones tiene 10 veces la concentración de H+ respecto a la otra, pero no indica la magnitud absoluta de la diferencia Un refresco de cola (pH 3.0) o el vino tinto(pH 3.7) tiene una concentración de H+ Amortiguadores y cambios de pH en sistemas biologicos Amortiguadores: Son sistemas acuosos que resisten cambios en pH cuando se adicionan pequeñas cantidades de acidos(H) o bases (OH) Una mezcla de una acido o base debilcon su sal resiste cambios de pH causado por la adicionde H u OH = Funcionan como amortiguadores En las células y tejidos, Los sistemas de amortiguación de fosfato y de bicarbonato mantienen los fluidos intray extra celulares dentro de su pH optimo o fisiológico, usualmente cercano a 7. Este es el pH en el cual las enzimas actúan de forma optima. Los fluidos intray extracelulares de los organismos multicelulares tienen un pH característicos y casi constante. Los sistemas amortiguadores fisiológicos son la primera línea de defensa ante los cambios de pH. El citoplasma contiene altas concentraciones de proteínas con aade grupos funcionales que actúan como ácidos o bases débiles.
  • 66. • Los nucleotidos como el ATP, igual que muchas moleculas de bajo • Fuerzas de Van derWaals peso molecular, contienen grupos • Cuando dos átomos no cargados ionizables que proporcionan se encuentran muy cerca, sus sistemas amortiguadores para el nubes electrónicas se influencian citoplasma una a la otra, los dos núcleos • Algunos organelos y tienden a juntarse, pero sus compartimentos altamente nubes electrónicas comienzan a especializados tienen altas repelerse. concentraciones de compuestos • En el punto donde hay un balance con capacidades amortiguadoras. exacto entre estas fuerzas de atracción y de repulsión entre los núcleos se le conoce como punto de contacto de Van derWaals • El agua es tanto el solvente en el cual ocurren las reacciones metabolicas asi como el reactante en muchos procesos bioquimicos: • hidrolisis • condensacion, • Reacciones de oxidacion- reduccion
  • 67. LÍPIDOS: • LIPIDOS : Componentes • DEFINICION:Son un estructurales grupo de • ESTRUCTURA: compuestos, con • Moléculas hidrofóbicasque continen: estructuras diversas, • Derivados de largas todos insolubles en cadenas alifáticas : ACIDOS GRASOS agua que pueden ser • •Glicéridos extraidospor • •Esfingolípidos compuestos no • •Fosfoglicéridos polares, lo que les • Sistemas de anillos de hidrocarbonos: esteroides confiere sus • Combinaciones: esteroles principales éster, lípidos menores propiedades biológicas.
  • 68. Perfil calórico recomendado • Se define como el aporte • CLASIFICACION FUNCIONAL energético de DE LOS LÍPIDOS macronutrientes (proteínas, • Lípidos de almacenamiento hidratos de carbono y • Lípidos estructuralesde lípidos) y alcohol (cuando se membrana consume) a la ingesta calórica total. • Regulaciónde la función celular • Señalización • Cofactores • Pigmentos • Precursoresde sales biliares, hormonas y vitaminas liposolubles
  • 69. • LÍPIDOS DE ALMACENAMIENTO • Propiedades físicas de los AG • Son acidoscarboxilicoscon cadenas de hidrocarbonosde • Solubilidad en agua: depende de entre 4 y 36 C, usualmente en la longitud y el grado de numero par. insaturaciónde la cadena de hidrocarburos. Entre mas larga y • Si la cadena no contiene dobles menos dobles enlaces enlaces : Saturados estenpresentes en una cadena • Si la cadena contiene dobles menos soluble es en agua. enlaces : Insaturados • Punto de fusión: Esta • CH3(CH2)nCOOH determinado por su grado de insaturación, la longitud de la cadena y la presencia de ramificaciones: • A 25 ºC los AG saturados tienen una consistencia cerosa mientras que los insaturados con una longitud de cadena similar son aceites líquidos. • LÍPIDOS DE ALMACENAMIENTO
  • 70. • AG omega-3 son benéficos para el corazón, entre sus efectos positivos: • acciones antiinflamatorias • acciones anticoagulantes • disminución de los niveles de colesterol y triglicéridos • reducción de la presión sanguínea. • Se recomienda que el aporte calórico de la ingesta total de grasa no supere el 30-35% de la energía total consumida, y su distribucioncomo aportantespara la obtencionde la energía total debe ser: • AGS: <10%, • AGP: <7% • AGM: >13%
  • 71. Propiedades físicas de los AG Solubilidad en agua: depende de la longitud y el grado de insaturaciónde la cadena de hidrocarburos. Entre mas larga y menos dobles enlaces estenpresentes en una cadena menos soluble es en agua. Punto de fusión: Esta determinado por su grado de insaturación, la longitud de la cadena y la presencia de ramificaciones: A 25 ºC los AG saturados tienen una consistencia cerosa mientras que los insaturados con una longitud de cadena similar son aceites líquidos. LÍPIDOS DE ALMACENAMIENTO
  • 72. Efectos biológicos de los eicosanoides • Prostaglandinas • Estimulación de músculo liso (intestino-utero) • Regulación de la producción de esteroides • Inhibición de la secreción gástrica • Sensibilización al dolor • Mediación de la respuesta inflamatoria en todos los tejido • Tromboxanos • Regulan la función de plaquetas • Leucotrienos (LTC4y LTD4) • Músculo liso (intestino, vías pulmonares y traquea) • Mediadores de anafilaxis
  • 73. TRIACILGLICEROLES • Almacenamiento de grasa: Funciones • Adipocitos: • Producción de energía: • Células animales oxidación para generar ATP especializadas en el e impulsar procesos almacenamiento de las metabólicos grasas. • Producción de calor: oxidan • Constituyen la mayor parte TAG para producir calor en del tejido adiposo. lugar de ATP (grasa parda en animales homeotermos) • LÍPIDOS DE ALMACENAMIENTO • Aislamiento: entorno frío, las capas de células adiposas actúan como aislante (ballenas) • LÍPIDOS DE ALMACENAMIENTO
  • 74. • Glicerofosfolipidos • COLESTEROL: • Muy abundantes en las Importancia clínica membranas biológicas. • Es poco soluble, tiende a • Se derivan del acido precipitar en el endotelio fosfatidico de los vasos sanguíneos • El acfosfatidicose puede • Se asocia con el bloqueo esterificar en el fosfato de arterias (placas unido al C3 con una ateromatosas) molecaltamente • Resulta en: hidrofilicaa través de un • -Aumento de presión enlace fosfodiester: arterial • colinaetanolamina • -Formación de coágulos: • serinainositoldifosfato, infarto al miocardio fosfatidilglicerolLÍPIDOS • -Derrames
  • 75. • ESTEROIDES • ESTEROLES: • Compuestos hexaprenoides(6 CALCIFEROLES unidades prenoides5 C) • Vitamina D: mejora la • Enorme importancia biológica absorción de Ca+2por parte • Esteroles: alcoholes esteroideos del intestino. • Colesterol • Ergocalciferol: VitD2(vegetal) • Calciferoles (vitD) • Colecalciferol: VitD3(animal) • Ácidos biliares • Hormonas corticales: • Puede ser sintetizada por el • Glucoy mineralocorticoides organismo • Hormonas sexuales: • Deficiencia: Raquitismo: niños • Estrógenos ; Osteomalacia: adultos • Gestágenos • Andrógenos • Digitálicos: Txinsufcardiaca → Inhibición sobre la bomba de Na+
  • 76. • ESTEROIDES: SALES • Esteroides: Hormonas BILIARES • Estrógenos: Hhpropias • Abundantes en la bilis de la primera mitad del • Acido cólico, acido ciclo sexual femenino glicocólico (Gly), ácido (estradiol) taurocólico (taurina), • Andrógenos: litocólico Hhsexuales masculinas • Producidos por el (testosterona) hígado • Gestágenos: Hhde la 2` • Actúan como agentes mitad del ciclo sexual emulsionantes de los femenino y del lípidos que llegan al embarazo intestino (facilitan la (progesterona) absorción)