La alanina es un aminoácido anfótero que puede actuar como ácido o base dependiendo del pH. En solución ácida predomina la forma catiónica ala+, en solución básica la forma aniónica ala-, y a pH 6.02 se encuentra mayoritariamente en su forma isoeléctrica alao. El punto isoeléctrico de la alanina, donde tiene carga neta cero, se calcula como el promedio de sus pKa que son 2.34 para el grupo carboxílico y 9.69 para el grupo amino.