Este documento describe los polimorfismos, que son variaciones en la secuencia de ADN entre individuos. Explica que los polimorfismos de nucleótido simple (SNP) constituyen hasta el 90% de las variaciones genómicas humanas y pueden ocurrir cada 1,300 bases. También describe cómo los SNPs pueden afectar la respuesta a enfermedades y cómo se detectan utilizando métodos como PCR en tiempo real.

1. UNIVERSIDAD TECNICA
PARTICULAR DE LOJA
GENETICA CLINICA Y PATOLOGIA MOLECULAR

2. POLIMORFISMOS
un polimorfismo es una variación en la secuencia de un lugar
determinado del ADN entre los individuos de una población.
los polimorfismos se
distinguen
terminológicamente de las
mutaciones por
su frecuencia.
Un polimorfismo puede
consistir en la sustitución de
una simple base nitrogenada
(por ejemplo, la sustitución
de una A (adenina) por una C
(citosina)
afectan nuestro fenotipo
(Estatura: alta/baja; Cabello:
claro/oscuro; Color de ojos

3. Tipos de polimorfismo
Polimorfismos en el
número de repetición
en tandem VNTR
Polimorfismo de
nucleótido
simple SNP
Polimorfismos de
longitud de
fragmentos de
restricción RFLP

4. POLIMORFISMO DE
NUCLEÓTIDO SIMPLE SNP
Los SNP constituyen
hasta el 90% de
todas las
variaciones
genómicas
humanas, y
aparecen cada
1,300 bases , a lo
largo del genoma
humano
Dos tercios de los
SNP corresponden a
la sustitución de una
citosina (C) por una
timina (T).
Estas variaciones en
la secuencia del
ADN pueden afectar
a la respuesta de los
individuos a
enfermedades,
bacterias, virus,
productos químicos,
fármacos

5. Clasificación de los SNPs

6. Los SNP que tienen implicaciones funcionales
sobre los niveles de expresión
génica se denominan SNP reguladores (rSNP)
los que alteran la traducción de los ARN
mensajeros (ARNm), el corte y empalme, la
eficiencia para potenciar o inhibir el corte y
empalme, la estabilidad de los ARNm y la
función de las proteínas (sin alterar su estructura)
se denominan SNP ARN estructurales (srSN
la importancia funcional de los rSNP y srSNP en
el desarrollo de enfermedades comunes como
hipertensión arterial (HTA), obesidad, artritis
reumatoide, enfermedad arterial corona

7. Algunos SNPs están localizados en zonas que
codifican proteínas y otros en zonas no
codificantes.
Los SNPs ofrecen análisis genéticos basados
en el análisis de SNPs, que puedan revelar
información acerca del riesgo de padecer
ciertas enfermedades, como Parkinson,
diabetes, trastorno bipolar, etc

8. DETECCIÓN
Polimorfismo
en la longitud
de fragmentos
de restricción
(SNP-RFLP),
electroforesis en
gel para
visualizar
fragmentos de
ADN
HPLC
PCR
• Electroforesis
capilar
• Polimorfismo
de
conformación
de cadena
simple.
Existen una gran variedad de métodos analíticos que permiten descubrir
nuevos SNP e identificar SNP conocidos en las secuencias de ADN. Entre los
más destacados, podemos encontrar los siguientes

9. Nomenclatura
Entre la gran variedad de SNP que existen, mostraremos algunos a modo
de ejemplo para luego mostrar la asociación entre una patología y
numerosos SNPs lo cual nos indica que puede haber multitud de SNPs
asociados a una misma enfermedad:
rs6311 y
rs6313, SNP
en el gen
HTR2A
(receptor de
serotonina)
del
cromosoma
13 humano
rs3091244 es
un ejemplo de
SNP trialélico
en el gen CRP
(relacionado
con procesos
de inflamación)
del cromosoma
1 en humanos
Un SNP en el
gen F5 es
responsable
de un tipo de
trombosis
debido a la
presencia del
factor V
Leiden
El gen TAS2R38
determina la
percepción del
sabor de la
feniltiocarbami
da y tiene
descritos hasta
seis SNP

10. Dentro de diversas patologías ,como es el Cáncer de páncreas,
pueden existir numerosos SNPs que se consideran factores de
riesgo para padecer la enfermedad
Rs1561927 en una
región no génica
entre PVT1 and
LINC00977. Pero su
desequilibrio de
ligamiento esta
asociado con otro
SNPs implicado en
cáncer ovárico
Rs7190458 en el
ultimo exón de
BCAR1. La proteina
adaptadora BCAR1
coordina el ciclo
celular, organización
del citoesqueleto y
migración celular.

11. PCR en tiempo real
Método basado en la aplicación de la técnica de
PCR y en la creación de dos sondas alelo específicas, las
cuales emiten una señal fluorescente al unirse al
templado. Este tipo de análisis es más utilizado hoy en
día porque ya existen sondas prediseñadas para un
sinnúmero de polimorfismos.

12. • Bibliografia:
• (bustin SA, 2005; 34: 597-601.10 FOY)Bustin SA, Benes V, Nolan T, Pfaffl MW. Quantitative real-
time RT-PCR-a perspective. J Mol Endocrinol. 2005; 34: 597-601.10. Foy