Mi canal en YT https://www.youtube.com/channel/UCPFK0oIUXZf2ZgN2HvAkr9Q Esta presentación expone los principales tipos de VNTR's: satélites, minisatélites y microsatélites. Así como algunas aplicaciones clínicas y prácticas de este tipo de ADN.

1. DNA Microsatélite
Mijail Alejandro Tapia Moreno

2. Glosario
 Polimorfismo: Es una variación en la secuencia de un
lugar determinado del ADN entre los individuos de una
población.
 Alelo: Es cada una de las formas alternativas que puede
tener un gen que se diferencian en su secuencia y que
se puede manifestar en modificaciones concretas de la
función de ese gen.

3. Distribución en cromosoma 22

4. VNTR (Variable Number
Tandem Repeat)

5. Tipos de repeticiones en tándem
 Satélites
 El conjunto de repeticiones en tándem de tipo satélite
comprende un total de 250 Mb del genoma humano. Son
secuencias de entre 5 y varios cientos de nucleótidos
que se repiten en tándem miles de veces generando
regiones repetidas con tamaños que oscilan entre 100
kb (100.000 nucleótidos) hasta varias megabases.

6. Tipos de repeticiones en satélites
 Hay principalmente 6 tipos de repeticiones de ADN satélite
 Satélite 1: secuencia básica de 42 nucleótidos. Situado en
los centrómeros de los cromosomas 3 y 4 .
 Satélite 2: la secuencia básica es ATTCCATTCG. Presente en
las proximidades de los centrómeros de los cromosomas 2 y
10.
 Satélite 3: la secuencia básica es ATTCC.
 Satélite alfa: secuencia básica de 171 nucleótidos. Forma
parte del ADN de los centrómeros cromosómicos.
 Satélite beta: secuencia básica de 68 nucleótidos. Aparece
en torno al centrómero en los cromosomas acrocéntricos.
 Satélite gamma: secuencia básica de 220 nucleótidos.
Próximo al centrómero de los cromosomas 8 y X.

7. Minisatélites
 Están compuestas por una unidad básica de secuencia
de 6-25 nucleótidos que se repite en tándem generando
secuencias de entre 100 y 20 000 pares de bases. Se
estima que el genoma humano contiene unos 30 000
minisatélites.
Se han relacionado con:
-Regulación de la expresión génica
-control de transcripción
-splicing alternativo
+Algunos minisatélites humanos (~10%) son
hipermutables, presentando una tasa media de mutación
entre el 0.5% y el 20% en las células de la línea
germinal, siendo así las regiones más inestables del
genoma humano conocidas hasta la fecha.

8. ¿Qué es un microsatélite?
Un DNA microsatélite, también conocido como SSR
(repeticiones de secuencias simples), son disposiciones de
repeticiones tándem de una sencuencia simple
(generalmente inferior a 10pb).

9. Características
 Están diseminados en la totalidad del genoma
 Un microsatélite esta típicamente conformado por un
motivo repetitivo, en el cual se encuentra contenido la
secuencia repetida, y dos regiones flanqueantes, las
cuales se encuentran a ambos lados del motivo
repetitivo.
 Constituyen más del 60% Mb en el genoma, es decir, el
2%.
 Las configuraciones de repeticiones más comunes son
las dinucleótidas y constituyen alrededor del .5% del
genoma.
ACGCGATCGATCACACACACAAGTCGCT =CA⁵
TGCGCTAGCTAGTGTGTGTGTTCAGCGA

10. Características
 Existen empero repeticiones tri y tetranucleótidos
, aunque son menos comunes que las dinucleótidas.
 Generalmente se encuentran en zonas no codificantes de
DNA.
 Son codominantes y poseen una alta tasa de
mutación, lo que los vuelve muy polimórficos. (Errores
en deslizamiento de DNA polimerasa)
 Contribuyen a la formación de alelos por las variaciones
en el número de repeticiones.

11. Clasificación de microsatélites
 Incluye el patrón del orden de los motivos:
Tipo Características
Puro o perfecto Un solo motivo repetido n veces en serie. ej:
(AC)9
Puro interrumpido Un solo motivo repetido n veces, donde se
intercalan nucleótidos entre las distintas
repeticiones. ej: (CA)2AA(CA)12
Compuestos Dos o más motivos repetidos en serie. ej:
(GT)2(TG)10
Compuestos
interrumpidos
Al menos uno de sus motivos presenta
nucleótidos intercalados. ej:
(CT)4(GT)2CTAT(GT)15
Complejos Combinaciones entre cualquiera de las clases
anteriores, sin ningún patrón de orden definido.
ej: (ACC)8+TG+(GA)12+(TTA)5+GC+(TTA)4

12. Medición poblacional
 Se obtiene bajo el fundamento de las repeticiones, es
decir, una persona puede tener microsatélites de
GCGCGCGC(GC⁴) y GCGCGCGCGC (GC⁵), mientras que
otra persona puede tener GC⁷ y GC⁸. Esta medición
puede ser usada para medir la diversidad de la
población.
 La variabilidad que presentan los microsatélites los hace
proclives a ser utilizados como marcadores
moleculares, basándose esta marcación no en la
repetición per se si no en la frecuencia de las
repeticiones.

13. ¿Cómo se identifican y amplifican
los microsatélites?
 Los microsatélites pueden ser amplificados para su
identificación mediante PCR. Usando las secuencias de
regiones flanqueantes como primers.
 Para visualizar y analizar este DNA se recurre al gel de
agarosa.
 Los fragmentos así producidos son separados de acuerdo
a su longitud en pares de base a través de una
electroforesis en gel de agarosa.
 Partiendo de la hipótesis de que en un microsatélite sólo
varía el número de repeticiones dentro del motivo
repetitivo; fragmentos que tienen el mismo tamaño,
tienen la misma secuencia, de manera que todos los
fragmentos de un mismo tamaño representarían un
alelo.

14. Fingerprinting de DNA
 Las técnicas de determinación de las huellas dactilares
genéticas utilizan los microsatélites, a partir de la
variación que se tiene en el número de copias de estas
repeticiones se puede detectar mediante PCR y
cebadores específicos y ulterior electroforesis en gel.
Cuando se examinan varios loci diferentes con
microsatélites, la probabilidad de que dos personas
tengan el mismo grupo de patrones se hace muy
pequeña, a menos que se trate de gemelos.

16. Aplicaciones del fingerprinting
 Medicina forense: Toma de una muestra, y comparación
mediante microsatélites, PCR y electroforesis de
coincidencias en varios loci muy variables. Esto puede
sugerir presencia de sospechoso en X lugar.
 Pruebas de paternidad.
 Identificación de cepas de bacterias patógenas (Anthrax
2001).
 Identificar restos humanos.

18.  “La ignorancia afirma o niega rotundamente; la ciencia
duda.”
 Voltaire (François Marie Arouet).