Este documento describe la realización de una simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el programa SnapGene y los datos de un artículo científico. Se analizan conceptos como el software SnapGene, el sitio web NCBI, ADN, ARN y la técnica de electroforesis. Luego se describe la metodología donde se descargan 13 secuencias bacterianas del NCBI y se simula la electroforesis en SnapGene. Finalmente, se muestran los resultados y conclusiones sobre el comportamiento de los fragmentos de ADN.
Este documento presenta una introducción a los métodos ópticos de análisis. Explica que los métodos ópticos se dividen en espectroscópicos y no espectroscópicos. Los espectroscópicos incluyen técnicas como la absorción y emisión que producen espectros basados en transiciones entre niveles de energía atómicos o moleculares. También describe conceptos clave como los espectros electromagnéticos, los niveles de energía en moléculas y los procesos de absorción y
El documento describe los grupos de cationes metálicos y sus reacciones de identificación. El Grupo I incluye plata, mercurio y plomo, cuyos cationes precipitan como cloruros con ácido clorhídrico diluido. El Grupo II se subdivide en Grupo IIA, que incluye mercurio, plomo, bismuto, cobre y cadmio cuyos sulfuros precipitan con ácido sulfhídrico, y Grupo IIB, que incluye arsénico, antimonio y estaño cuyos
Este documento presenta el procedimiento experimental para determinar la constante de producto de solubilidad (Kps) de una reacción. Se utilizaron soluciones de Pb(NO3)2 a diferentes concentraciones y una solución de NaCl. Se midieron volúmenes y se calcularon concentraciones de iones para determinar el Kps. Los resultados mostraron que se pudo calcular el Kps experimentalmente y que la temperatura afecta la solubilidad de una solución.
El documento define y explica varios métodos electroquímicos como la potenciometría, conductimetría, electrolisis, voltamperometría y polarografía. Estos métodos se utilizan para determinar la concentración de especies químicas en solución mediante la medición y aplicación de corrientes y potenciales eléctricos.
La espectroscopia de absorción atómica es un método analítico que determina elementos en muestras mediante la atomización del analito y la absorción de radiación a una longitud de onda específica. Utiliza un nebulizador y quemador de llama para crear un vapor atómico del analito y una fuente de radiación como una lámpara de cátodo hueco para medir la absorción. Proporciona resultados altamente sensibles y específicos para cada elemento.
El documento describe varios métodos electroquímicos como la potenciometría, conductimetría, electrogravimetría y voltametría. La potenciometría mide el potencial de una celda electroquímica para determinar la concentración de analitos utilizando la ecuación de Nernst. La conductimetría mide la conductividad de una solución, que depende de la concentración iónica. La electrogravimetría separa iones mediante electrólisis y cuantificación por peso. La voltametría estudia la corriente
El documento describe varios métodos analíticos para determinar las propiedades físico-químicas de la leche, incluyendo la acidez titulable, prueba de alcohol, identificación de neutralizantes, sacarosa, cloruros, grasa, lactosa, fosfatasa y almidón. Se explican los principios, procedimientos y significados de los resultados de cada prueba para evaluar la calidad y pureza de la leche.
Este documento presenta una introducción a los métodos ópticos de análisis. Explica que los métodos ópticos se dividen en espectroscópicos y no espectroscópicos. Los espectroscópicos incluyen técnicas como la absorción y emisión que producen espectros basados en transiciones entre niveles de energía atómicos o moleculares. También describe conceptos clave como los espectros electromagnéticos, los niveles de energía en moléculas y los procesos de absorción y
El documento describe los grupos de cationes metálicos y sus reacciones de identificación. El Grupo I incluye plata, mercurio y plomo, cuyos cationes precipitan como cloruros con ácido clorhídrico diluido. El Grupo II se subdivide en Grupo IIA, que incluye mercurio, plomo, bismuto, cobre y cadmio cuyos sulfuros precipitan con ácido sulfhídrico, y Grupo IIB, que incluye arsénico, antimonio y estaño cuyos
Este documento presenta el procedimiento experimental para determinar la constante de producto de solubilidad (Kps) de una reacción. Se utilizaron soluciones de Pb(NO3)2 a diferentes concentraciones y una solución de NaCl. Se midieron volúmenes y se calcularon concentraciones de iones para determinar el Kps. Los resultados mostraron que se pudo calcular el Kps experimentalmente y que la temperatura afecta la solubilidad de una solución.
El documento define y explica varios métodos electroquímicos como la potenciometría, conductimetría, electrolisis, voltamperometría y polarografía. Estos métodos se utilizan para determinar la concentración de especies químicas en solución mediante la medición y aplicación de corrientes y potenciales eléctricos.
La espectroscopia de absorción atómica es un método analítico que determina elementos en muestras mediante la atomización del analito y la absorción de radiación a una longitud de onda específica. Utiliza un nebulizador y quemador de llama para crear un vapor atómico del analito y una fuente de radiación como una lámpara de cátodo hueco para medir la absorción. Proporciona resultados altamente sensibles y específicos para cada elemento.
El documento describe varios métodos electroquímicos como la potenciometría, conductimetría, electrogravimetría y voltametría. La potenciometría mide el potencial de una celda electroquímica para determinar la concentración de analitos utilizando la ecuación de Nernst. La conductimetría mide la conductividad de una solución, que depende de la concentración iónica. La electrogravimetría separa iones mediante electrólisis y cuantificación por peso. La voltametría estudia la corriente
El documento describe varios métodos analíticos para determinar las propiedades físico-químicas de la leche, incluyendo la acidez titulable, prueba de alcohol, identificación de neutralizantes, sacarosa, cloruros, grasa, lactosa, fosfatasa y almidón. Se explican los principios, procedimientos y significados de los resultados de cada prueba para evaluar la calidad y pureza de la leche.
Este documento describe el análisis de metales pesados en alimentos mediante espectrofotometría de absorción atómica. Explica que los metales pesados se encuentran de forma natural en los alimentos y pueden contaminarlos. La espectrofotometría de absorción atómica es una técnica precisa y sensible para medir bajas concentraciones de metales como el cadmio y el plomo, que son tóxicos incluso en pequeñas cantidades. El documento proporciona detalles sobre cómo preparar las muestras
1) El documento presenta una hoja de trabajo de análisis inorgánico II que incluye 10 ejercicios resueltos relacionados con equilibrio químico heterogéneo y gravimetría.
2) Se pide calcular solubilidades, identificar si mezclas forman soluciones saturadas, insaturadas o sobresaturadas, y realizar cálculos gravimétricos para determinar masas y porcentajes de compuestos.
3) Los ejercicios involucran reacciones químicas como precipitaciones, transformaciones y
Este documento describe los procesos de fermentación y catabolismo de carbohidratos en organismos organótrofos. Explica que la fermentación implica la oxidación parcial de sustratos orgánicos como la glucosa para regenerar el NAD+, resultando en la formación de productos como ácido láctico, etanol o glicerol. También describe las vías metabólicas principales como la glicólisis y la vía de la pentosa fosfato, así como los mecanismos de regulación y tipos de fermentación como la homoláct
Este documento describe el método de gravimetría para análisis químico, específicamente la precipitación. Explica que el analito se precipita formando un compuesto poco soluble que puede separarse por filtración y pesarse. También detalla las condiciones óptimas para la precipitación como diluir la solución y calentarla, así como los requisitos para el precipitado y su aplicación en el análisis de compuestos en la agricultura como sulfato, silicio y cloruro.
La técnica de absorción atómica permite cuantificar metales presentes en diferentes matrices a través de la descomposición de las muestras en átomos mediante una llama u horno de grafito. Existen tres métodos principales: atomización por llama, horno de grafito y generador de hidruros, cada uno apto para determinar diferentes elementos en diferentes concentraciones.
Los dispositivos de atomización debe efectuar la compleja tarea de convertir la especie del analito en átomos libres, iones elementales o ambos, en fase gaseosa. Estos dispositivos son clasificados en: Atomizadores Continuos y Atomizadores Discretos. En los primeros, las muestras se introducen de manera continua, como llamas y los plasmas, mientras que en los segundos, con un dispositivo como una jeringa o un automuestreador.
Este documento presenta información sobre la dicromatometría como método de análisis volumétrico. Describe las propiedades y aplicaciones del dicromato de potasio como oxidante en valoraciones redox, incluyendo la determinación de hierro en minerales como su principal uso. Explica los fundamentos teóricos de las titulaciones con dicromato, como su reacción con hierro (II) y la curva de titulación resultante. También resume protocolos experimentales para la determinación de hierro en muestras usando esta técnica.
El documento describe el método de electrogravimetría para separar y cuantificar iones en una sustancia mediante electrolisis. La electrogravimetría consiste en electrolizar una muestra y depositar los iones cuantitativamente en los electrodos. El metal depositado en el cátodo se pesa antes y después para calcular la cantidad original en la muestra. La técnica se puede usar con o sin control de potencial y permite determinar varios metales como cobre, plata y zinc.
El documento presenta los resultados de una práctica de laboratorio sobre la intoxicación por hierro en un cobayo. Se administró hierro por vía intraperitoneal al cobayo y se observó la sintomatología, incluyendo convulsiones y deceso en 1 hora y 11 minutos. Luego se realizaron disecciones y reacciones químicas para identificar el hierro en los órganos. El resumen incluye los objetivos, materiales, procedimiento y conclusiones clave de la práctica.
Este documento describe el método yodométrico de óxido-reducción para valorar soluciones estándar de tiosulfato de sodio y yodo. Explica cómo preparar soluciones de 0.1 N de cada uno y cómo estandarizarlas mediante titulaciones. El tiosulfato se estandariza con una solución de permanganato potásico y el yodo con el tiosulfato estandarizado previamente. Los cálculos muestran que la normalidad del tiosulfato fue de 0.030 N y la del yodo de 0.0728 N. Se con
Este documento presenta los detalles de una práctica de laboratorio sobre permanganimetría realizada por un equipo de 5 estudiantes de química analítica. La práctica incluye la preparación de una solución estándar de permanganato de potasio, su estandarización mediante oxalato de sodio y la determinación del porcentaje de peróxido de hidrógeno en un agua oxigenada mediante titulación con la solución de permanganato.
Este documento describe el método de espectroscopía de absorción atómica en llama para determinar la concentración de hierro en una muestra de vino blanco. Se realizaron rectas de calibración en agua y solución hidroalcohólica, obteniéndose concentraciones de hierro de 1.01 ppm y 0.90 ppm respectivamente. Sin embargo, el método de adición estándar determinó una concentración de 1.14 ppm, que es el valor adoptado al eliminar las interferencias de la matriz.
Los métodos electroquímicos incluyen potenciometría, conductimetría, electrogravimetría y polarografía. La potenciometría mide potenciales en celdas electroquímicas y se usa para determinar pH y detectar puntos de equivalencia en titulaciones. La conductimetría mide la conductividad de soluciones iónicas y se aplica en análisis de aguas, suelos y procesos industriales. La electrogravimetría determina la cantidad de analito mediante su conversión electrolítica en un producto que
La espectrometría de masas es una técnica analítica que permite identificar compuestos desconocidos, cuantificar compuestos conocidos y elucidar la estructura y propiedades químicas de moléculas. Se utiliza para estudiar compuestos orgánicos, inorgánicos y biológicos, obteniendo información cualitativa y cuantitativa. Existen diversas técnicas como cromatografía de gases, cromatografía líquida y espectrometría de masas acopladas que permiten separar y anal
El documento describe los principios de la espectroscopía atómica, incluyendo diferentes métodos como la espectroscopía de emisión atómica, absorción atómica y fluorescencia atómica. Explica cómo se pueden identificar metales en compuestos químicos mediante el análisis de sus espectros y describe aplicaciones como el análisis de aguas, suelos, bioquímica y medicina. Además, explica conceptos clave como llamas, lámparas de cátodo hueco y componentes b
Este documento describe varios métodos gravimétricos para el análisis químico, incluyendo métodos de precipitación, extracción, volatilización y electrogravimétricos. También describe ensayos previos realizados sobre muestras sólidas para identificar compuestos mediante la observación de coloraciones a la llama, cambios de color y desprendimientos de gases en tubos de ensayo calentados. El documento se enfoca en proporcionar detalles sobre el análisis gravimétrico del estaño mediante precipitación
Este documento presenta los procedimientos para realizar diversas pruebas de calidad para determinar el contenido de vitamina C en tabletas y frutas. Se describen los materiales, reactivos y procedimientos para realizar las pruebas de oxidación-reducción, voltamperometría, ensayos analíticos y espectrofotometría para medir la vitamina C en tabletas, pimientos y otros frutos. El objetivo es evaluar la calidad y cantidad de vitamina C para garantizar la inocuidad de los medicamentos y alimentos durante su vida
El documento describe los fundamentos y aplicaciones de la espectrometría de masas. Se explica que la espectrometría de masas permite analizar la composición química separando los iones en función de su relación masa-carga. El proceso implica cuatro etapas: ionización, aceleración, dispersión según masa/carga y detección. Se detallan los tipos de espectrómetros y las aplicaciones cualitativas y cuantitativas de la técnica.
Este documento describe los resultados de varios experimentos de cromatografía en capa fina realizados en un laboratorio de química orgánica. Los experimentos determinaron la polaridad de diferentes eluyentes y muestras, la pureza de sustancias, y proporcionaron un criterio parcial de identificación de compuestos en una muestra de medicamento. Los resultados incluyeron la determinación de valores de Rf y conclusiones sobre la selección de eluyentes óptimos.
Este documento describe el uso del software SnapGene para simular un gel de electroforesis de ADN. Se utilizaron las secuencias de 13 microorganismos obtenidas del NCBI y se cargaron en SnapGene. Luego, se simuló un gel de agarosa que separó las moléculas de ADN según su tamaño, visualizando las secuencias de los 13 microorganismos. El procedimiento permitió familiarizarse con las funciones básicas de SnapGene para la visualización y edición de secuencias de ADN.
SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA EMPLEANDO EL SOFTWARE SNAPGENE...ShirleyColana
Este documento presenta un informe sobre la simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el software SnapGene. Se describen brevemente los conceptos clave de electroforesis, ADN, gel de agarosa y simulación molecular. Luego, se detallan los pasos seguidos para descargar secuencias de ADN de un artículo científico, abrirlas en SnapGene y simular su separación en un gel de agarosa. El resultado final fue una simulación del patrón de bandas que se obtendría al separar las muestras de ADN por
Este documento describe el análisis de metales pesados en alimentos mediante espectrofotometría de absorción atómica. Explica que los metales pesados se encuentran de forma natural en los alimentos y pueden contaminarlos. La espectrofotometría de absorción atómica es una técnica precisa y sensible para medir bajas concentraciones de metales como el cadmio y el plomo, que son tóxicos incluso en pequeñas cantidades. El documento proporciona detalles sobre cómo preparar las muestras
1) El documento presenta una hoja de trabajo de análisis inorgánico II que incluye 10 ejercicios resueltos relacionados con equilibrio químico heterogéneo y gravimetría.
2) Se pide calcular solubilidades, identificar si mezclas forman soluciones saturadas, insaturadas o sobresaturadas, y realizar cálculos gravimétricos para determinar masas y porcentajes de compuestos.
3) Los ejercicios involucran reacciones químicas como precipitaciones, transformaciones y
Este documento describe los procesos de fermentación y catabolismo de carbohidratos en organismos organótrofos. Explica que la fermentación implica la oxidación parcial de sustratos orgánicos como la glucosa para regenerar el NAD+, resultando en la formación de productos como ácido láctico, etanol o glicerol. También describe las vías metabólicas principales como la glicólisis y la vía de la pentosa fosfato, así como los mecanismos de regulación y tipos de fermentación como la homoláct
Este documento describe el método de gravimetría para análisis químico, específicamente la precipitación. Explica que el analito se precipita formando un compuesto poco soluble que puede separarse por filtración y pesarse. También detalla las condiciones óptimas para la precipitación como diluir la solución y calentarla, así como los requisitos para el precipitado y su aplicación en el análisis de compuestos en la agricultura como sulfato, silicio y cloruro.
La técnica de absorción atómica permite cuantificar metales presentes en diferentes matrices a través de la descomposición de las muestras en átomos mediante una llama u horno de grafito. Existen tres métodos principales: atomización por llama, horno de grafito y generador de hidruros, cada uno apto para determinar diferentes elementos en diferentes concentraciones.
Los dispositivos de atomización debe efectuar la compleja tarea de convertir la especie del analito en átomos libres, iones elementales o ambos, en fase gaseosa. Estos dispositivos son clasificados en: Atomizadores Continuos y Atomizadores Discretos. En los primeros, las muestras se introducen de manera continua, como llamas y los plasmas, mientras que en los segundos, con un dispositivo como una jeringa o un automuestreador.
Este documento presenta información sobre la dicromatometría como método de análisis volumétrico. Describe las propiedades y aplicaciones del dicromato de potasio como oxidante en valoraciones redox, incluyendo la determinación de hierro en minerales como su principal uso. Explica los fundamentos teóricos de las titulaciones con dicromato, como su reacción con hierro (II) y la curva de titulación resultante. También resume protocolos experimentales para la determinación de hierro en muestras usando esta técnica.
El documento describe el método de electrogravimetría para separar y cuantificar iones en una sustancia mediante electrolisis. La electrogravimetría consiste en electrolizar una muestra y depositar los iones cuantitativamente en los electrodos. El metal depositado en el cátodo se pesa antes y después para calcular la cantidad original en la muestra. La técnica se puede usar con o sin control de potencial y permite determinar varios metales como cobre, plata y zinc.
El documento presenta los resultados de una práctica de laboratorio sobre la intoxicación por hierro en un cobayo. Se administró hierro por vía intraperitoneal al cobayo y se observó la sintomatología, incluyendo convulsiones y deceso en 1 hora y 11 minutos. Luego se realizaron disecciones y reacciones químicas para identificar el hierro en los órganos. El resumen incluye los objetivos, materiales, procedimiento y conclusiones clave de la práctica.
Este documento describe el método yodométrico de óxido-reducción para valorar soluciones estándar de tiosulfato de sodio y yodo. Explica cómo preparar soluciones de 0.1 N de cada uno y cómo estandarizarlas mediante titulaciones. El tiosulfato se estandariza con una solución de permanganato potásico y el yodo con el tiosulfato estandarizado previamente. Los cálculos muestran que la normalidad del tiosulfato fue de 0.030 N y la del yodo de 0.0728 N. Se con
Este documento presenta los detalles de una práctica de laboratorio sobre permanganimetría realizada por un equipo de 5 estudiantes de química analítica. La práctica incluye la preparación de una solución estándar de permanganato de potasio, su estandarización mediante oxalato de sodio y la determinación del porcentaje de peróxido de hidrógeno en un agua oxigenada mediante titulación con la solución de permanganato.
Este documento describe el método de espectroscopía de absorción atómica en llama para determinar la concentración de hierro en una muestra de vino blanco. Se realizaron rectas de calibración en agua y solución hidroalcohólica, obteniéndose concentraciones de hierro de 1.01 ppm y 0.90 ppm respectivamente. Sin embargo, el método de adición estándar determinó una concentración de 1.14 ppm, que es el valor adoptado al eliminar las interferencias de la matriz.
Los métodos electroquímicos incluyen potenciometría, conductimetría, electrogravimetría y polarografía. La potenciometría mide potenciales en celdas electroquímicas y se usa para determinar pH y detectar puntos de equivalencia en titulaciones. La conductimetría mide la conductividad de soluciones iónicas y se aplica en análisis de aguas, suelos y procesos industriales. La electrogravimetría determina la cantidad de analito mediante su conversión electrolítica en un producto que
La espectrometría de masas es una técnica analítica que permite identificar compuestos desconocidos, cuantificar compuestos conocidos y elucidar la estructura y propiedades químicas de moléculas. Se utiliza para estudiar compuestos orgánicos, inorgánicos y biológicos, obteniendo información cualitativa y cuantitativa. Existen diversas técnicas como cromatografía de gases, cromatografía líquida y espectrometría de masas acopladas que permiten separar y anal
El documento describe los principios de la espectroscopía atómica, incluyendo diferentes métodos como la espectroscopía de emisión atómica, absorción atómica y fluorescencia atómica. Explica cómo se pueden identificar metales en compuestos químicos mediante el análisis de sus espectros y describe aplicaciones como el análisis de aguas, suelos, bioquímica y medicina. Además, explica conceptos clave como llamas, lámparas de cátodo hueco y componentes b
Este documento describe varios métodos gravimétricos para el análisis químico, incluyendo métodos de precipitación, extracción, volatilización y electrogravimétricos. También describe ensayos previos realizados sobre muestras sólidas para identificar compuestos mediante la observación de coloraciones a la llama, cambios de color y desprendimientos de gases en tubos de ensayo calentados. El documento se enfoca en proporcionar detalles sobre el análisis gravimétrico del estaño mediante precipitación
Este documento presenta los procedimientos para realizar diversas pruebas de calidad para determinar el contenido de vitamina C en tabletas y frutas. Se describen los materiales, reactivos y procedimientos para realizar las pruebas de oxidación-reducción, voltamperometría, ensayos analíticos y espectrofotometría para medir la vitamina C en tabletas, pimientos y otros frutos. El objetivo es evaluar la calidad y cantidad de vitamina C para garantizar la inocuidad de los medicamentos y alimentos durante su vida
El documento describe los fundamentos y aplicaciones de la espectrometría de masas. Se explica que la espectrometría de masas permite analizar la composición química separando los iones en función de su relación masa-carga. El proceso implica cuatro etapas: ionización, aceleración, dispersión según masa/carga y detección. Se detallan los tipos de espectrómetros y las aplicaciones cualitativas y cuantitativas de la técnica.
Este documento describe los resultados de varios experimentos de cromatografía en capa fina realizados en un laboratorio de química orgánica. Los experimentos determinaron la polaridad de diferentes eluyentes y muestras, la pureza de sustancias, y proporcionaron un criterio parcial de identificación de compuestos en una muestra de medicamento. Los resultados incluyeron la determinación de valores de Rf y conclusiones sobre la selección de eluyentes óptimos.
Este documento describe el uso del software SnapGene para simular un gel de electroforesis de ADN. Se utilizaron las secuencias de 13 microorganismos obtenidas del NCBI y se cargaron en SnapGene. Luego, se simuló un gel de agarosa que separó las moléculas de ADN según su tamaño, visualizando las secuencias de los 13 microorganismos. El procedimiento permitió familiarizarse con las funciones básicas de SnapGene para la visualización y edición de secuencias de ADN.
SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA EMPLEANDO EL SOFTWARE SNAPGENE...ShirleyColana
Este documento presenta un informe sobre la simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el software SnapGene. Se describen brevemente los conceptos clave de electroforesis, ADN, gel de agarosa y simulación molecular. Luego, se detallan los pasos seguidos para descargar secuencias de ADN de un artículo científico, abrirlas en SnapGene y simular su separación en un gel de agarosa. El resultado final fue una simulación del patrón de bandas que se obtendría al separar las muestras de ADN por
SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA UTILIZANDO EL SOFTWARE SNAPGEN...SalmaAnco1
Este documento describe una simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el software SnapGene. Se descargaron 13 secuencias de ADN de una publicación científica y se importaron al software. Luego se simuló la electroforesis para cada secuencia de ADN de forma individual obteniendo los resultados esperados. El objetivo fue comprender el procedimiento de simulación de electroforesis en gel de agarosa a través del uso del software SnapGene.
Este documento describe una simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el software SnapGene. Explica brevemente las funcionalidades de SnapGene y conceptos clave como ADN, ARN, secuencias de ADN y electroforesis. Luego detalla la metodología para realizar la simulación de electroforesis en SnapGene y analizar los resultados obtenidos.
PRACTICA DE SIMULACION DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSAMaribelMamaniGoya
El documento describe la simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el software SnapGene de 13 cepas bacterianas descritas en un artículo. Se utilizaron los códigos de acceso de NCBI para descargar las secuencias, las cuales fueron guardadas en SnapGene. Luego, se simuló la electroforesis de cada secuencia mostrando el rango de PCR y permitiendo visualizar las bandas sin problemas. El software permitió realizar satisfactoriamente la tarea.
SIMULACIÓN MOLECULAR DE ADN USANDO EL SOFTWARE SNAPGENE-CUELA CAMACHO AGUSTÍN...AgustnJuniorCuelaCam
Este documento describe la simulación de electroforesis de ADN usando el software SnapGene. Presenta información sobre NCBI, electroforesis, SnapGene y agarosa. Luego detalla los pasos del método, que incluyen descargar secuencias de ADN del NCBI, importarlas a SnapGene, y simular su separación en un gel de agarosa usando la herramienta de simulación de gel de SnapGene. Concluye que SnapGene es útil para visualizar y editar secuencias de ADN, y que la electroforesis separa fragmentos de ADN por tama
PRÁCTICA DE SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA UTILIZANDO EL PROGRAMA SNAP GENECON DATOS DEL ARTICULO CIENTIFICO "AISLAMIENTO DE BACTERIAS CON POTENCIAL BIORREMEDIADOR Y ANALISIS DE COMUNIDADES BACTERIANAS DE ZONA IMPACTADA POR PETROLEO EN CONDORCANQUI - AMAZONAS - PERÚ.
INFORME DE SIMULACION MOLECULAR DE ADN USANDO EL SOFTWARE SNAP GENE.pdfMarisolPariiPm
Este documento presenta una simulación de electroforesis en gel de agarosa de 10 secuencias de ADN bacterianas utilizando el software SnapGene. Se descargaron las secuencias del NCBI y se cargaron en el programa para simular su separación en un gel de agarosa al 1%. Los resultados muestran la migración diferencial de las 10 secuencias a través del gel debido a sus diferencias de tamaño.
Simulación de Electroforesis en Gel de Agarosa empleando el Software SnapGene...paola622989
Este documento describe el uso del programa SnapGene para analizar secuencias de ADN de cepas bacterianas extraídas de un artículo científico. Se descargan las secuencias del sitio web NCBI y se guardan en formato FASTA. Luego, las secuencias se cargan en SnapGene donde se simula una electroforesis en gel de agarosa para visualizar las características de cada secuencia bacteriana. El análisis permitirá identificar las cepas con potencial para biorremediar zonas contaminadas con derrames de petróleo.
INFORME SOBRE TECNICAS MOLECULARES-ELECTROFORESIS.pdfCynthiaTChavez
Este documento describe los pasos realizados para simular un gel de agarosa usando el software SnapGene. Se obtuvieron secuencias de un artículo y se buscaron en NCBI para exportarlos a formato FASTA. Luego se abrieron en SnapGene, se guardaron como archivos SnapGene DNA y se simuló el gel de agarosa. Los resultados mostraron la migración de las secuencias en el gel.
SIMULACIÓN MOLECULAR DE ADN USANDO EL SOFTWARE SNAPGENE.pdfMayraTavaraLira
El documento describe la simulación de una electroforesis en gel de agarosa usando el software SnapGene. Los datos utilizados provienen de un artículo científico sobre la identificación de bacterias en una zona afectada por un derrame de petróleo. El resumen describe el procedimiento llevado a cabo, incluyendo la obtención de secuencias de ADN del artículo, la simulación de la electroforesis en SnapGene y el análisis de los resultados.
simulacion de electroforesis en Gel Agarosa mediante Software SnapGenekatlheen ale espinoza
La electroforesis puede separar fragmentos de ADN y ARN en función de su tamaño, poder visualizarlos mediante una sencilla tinción, y de esta forma determinar el contenido de ácidos nucleicos que se encuentra en una muestra, teniendo una estimación de su concentración y grado de entereza. Podemos además extraer del gel los fragmentos de ADN que sean de interés, para posteriormente utilizarlos en diferentes aplicaciones. Existen programas como el SnapGene que ayudan a simular estos procesos, para poder conocer anticipadamente los resultados de la manipulación que se realicen.
El SnapGene proporciona una forma sencilla y segura de planificar, visualizar y documentar los procedimientos diarios de biología molecular.
Simulación de Electroforesis en Gel de Agarosa utilizando el programa Snap GeneBrayan Chipana
SnapGene proporciona una forma sencilla y segura de planificar, visualizar y documentar los procedimientos diarios de biología molecular. El software tiene una interfaz intuitiva que puede realizar visualización de secuencias de ADN, anotación de secuencias, edición de secuencias, clonación, visualización de proteínas y simulación de métodos de clonación comunes.
INFORME PRACTICA SIMULACION DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA-SOSA PINO.pdfFlaviaSosaPino
Este documento presenta el informe de una práctica dirigida sobre técnicas moleculares de electroforesis de ADN simulada en gel de agarosa utilizando el programa SnapGene. El estudiante obtuvo secuencias de ADN de bacterias contaminantes de agua y suelo de un artículo del NCBI, y las cargó en SnapGene para simular una electroforesis y observar el comportamiento de los fragmentos de ADN. El estudiante concluyó que SnapGene es una herramienta útil para este tipo de simulaciones, y reconoció
Simulacion de electroforesis en gel agarosa juan carlos bustinza coilajuancarlos74381
Algunas diferencias principales entre ADN y ARN son:
- Composición: El ADN contiene desoxirribosa mientras que el ARN contiene ribosa como azúcar pentosa en su estructura.
- Ubicación: El ADN se encuentra principalmente en el núcleo celular, mientras que el ARN se encuentra tanto en el núcleo como en el citoplasma de la célula.
- Estructura: El ADN tiene forma de doble hélice, mientras que el ARN puede adoptar diferentes estructuras como simple hélice o bucles.
SIMULACION MOLECULAR DE ADN USANDO EL SOFTWARE SNAPGENE.pdfAnyeliCossiCruz
Este documento describe el uso del software SnapGene para simular procesos moleculares relacionados con el ADN, como la electroforesis en gel de agarosa. Explica brevemente el descubrimiento del ADN y proporciona detalles sobre SnapGene, la electroforesis, el ADN y los geles de agarosa. A continuación, detalla la metodología para descargar secuencias de ADN de la página web NCBI y simular una electroforesis en gel de agarosa usando SnapGene. Finalmente, presenta conclusiones sobre lo aprendido con respecto a la
Práctica de simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el prog...brendacahuanasillo
Este documento describe una simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el programa SnapGene con datos de un artículo científico. Se identificaron 13 cepas bacterianas aisladas y se obtuvieron sus secuencias del NCBI. Luego, se cargaron las secuencias en SnapGene y se simuló la electroforesis para visualizar el comportamiento de los fragmentos de ADN. El resultado mostró la migración de las 13 especies en el gel de acuerdo a su tamaño.
Este documento describe la simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el programa SnapGene con datos de un artículo científico sobre el aislamiento de bacterias con potencial biorremediador. El objetivo general fue realizar la simulación, mientras que los objetivos específicos fueron analizar las secuencias de 13 bandas de nucleótidos y identificar el gel de agarosa. La metodología incluyó descargar las secuencias del NCBI, abrir SnapGene, simular el gel de agarosa al 1% y visualizar el comportamiento de los 13
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El documento describe varios microorganismos y sus aplicaciones en la agroindustria, medicina y producción de materiales. Algunos microorganismos como Beauveria, Metarhizium y Paecilomyces se usan para controlar plagas agrícolas. La bacteria B. thuringiensis produce compuestos que controlan insectos dañinos. En medicina, las vacunas y antibióticos se producen usando microorganismos. Los microorganismos también se usan para crear biosensores, bioplásticos y otros biomateriales.
Tarea n°01 sinopsis cronológica de la biotecnología ambiental WendyHinojosaRamirez
El documento proporciona una línea de tiempo que resume los principales hitos y descubrimientos en el desarrollo de la biotecnología desde el 4000 AC hasta el presente, incluyendo el descubrimiento de la célula y los microorganismos, el desarrollo de la pasteurización, el descubrimiento del ADN y el código genético, el desarrollo de cultivos y vacunas genéticamente modificados, y los recientes avances en edición genética y el desarrollo de vacunas para COVID-19.
Mi Carnaval, Aplicación web para la gestión del carnaval y la predicción basa...micarnavaltupatrimon
Mi Carnaval es la plataforma que permite conectar al usuario con la cultura y la emoción del Carnaval de Blancos y Negros en la ciudad de Pasto, esta plataforma brinda una amplia oferta de productos, servicios, tiquetería e información relevante para generarle valor al usuario, además, la plataforma realiza un levantamiento de datos de los espectadores que se registran, capturando su actividad e información relevante para generar la analítica demográfica del evento en tiempo real, con estos datos se generan modelos predictivos, que permiten una mejor preparación y organización del evento, de esta manera ayudando a reducir la congestión, las largas filas y, así como a identificar áreas de alto riesgo de delincuencia y otros problemas de seguridad.
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Informe n°03 simulación de electroforesis en gel de agarosa
1.
2. Contenido
1. INTRODUCCIÓN..................................................................................................................... 2
2. OBJETIVOS.............................................................................................................................. 3
2.1. Objetivo General ............................................................................................................... 3
2.2. Objetivos Específicos......................................................................................................... 3
3. MARCO TEÓRICO ................................................................................................................. 3
3.1. Software Snap Gene.......................................................................................................... 3
3.2. Centro Nacional para la Investigación Biotecnológica (NCBI)..................................... 4
3.3. ADN Y ARN....................................................................................................................... 5
3.4. Electroforesis ..................................................................................................................... 5
3.5. Gel de Agarosa................................................................................................................... 6
4. METODOLOGÍA ..................................................................................................................... 6
5. RESULTADOS........................................................................................................................ 11
6. CONCLUSIÓNES................................................................................................................... 11
7. CUESTIONARIO.................................................................................................................... 12
8. REFERENCIAS ...................................................................................................................... 16
Referencias........................................................................................................................................ 16
3. 1. INTRODUCCIÓN
La electroforesis en geles de agarosa es una de las metodologías más utilizadas en el
laboratorio en todo lo relacionado con el trabajo con ácidos nucleicos. Mediante la
electroforesis podemos separar fragmentos de ADN y ARN en función de su tamaño,
visualizarlos mediante una sencilla tinción, y de esta forma determinar el contenido de
ácidos nucleicos de una muestra, teniendo una estimación de su concentración y grado
de entereza. Podemos además extraer del gel los fragmentos de ADN que sean de interés,
para posteriormente utilizarlos en diferentes aplicaciones.
SnapGene proporciona una forma sencilla y segura de planificar, visualizar y documentar
los procedimientos diarios de biología molecular. El software tiene una interfaz intuitiva
que puede realizar visualización de secuencias de ADN, anotación de secuencias, edición
de secuencias, clonación, visualización de proteínas y simulación de métodos de
clonación comunes.
Esta práctica de simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el programa
SNAP GENE utilizando los datos del articulo científico. Del articulo utilizamos las cebas
bacterianas aisladas que se encontraron en las muestras de agua contaminada y suelo
contaminado lo cual obtuvimos 13 cepas bacterianas seguidamente cada una fue buscada
en el sitio web del NCBI seguidamente cada secuencia de cada bacteria fue guarda en
una carpeta y luego se abrió el programa que se instaló el SNAPGENE y ahí se abrió
cada una de las 13 cepas bacterianas guardadas donde pudimos observar la recolección
de la secuencia de su ADN, para después obtener el fundamento de la técnica de
electroforesis, usando el programa SnapGene.
4. 2. OBJETIVOS
2.1. Objetivo General
Realizar una simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el programa
SnapGene con los datos del articulo científico ´´Aislamiento de baterías con
potencial biorremediador y análisis de comunidades bacterianas de zona impactada
por petróleo en Condorcanqui – Amazonas – Perú´´
2.2. Objetivos Específicos
• Analizar los conceptos básicos como el uso de los programas de simulación,
además de conocer el software SnapGene y el NCBI.
• Definir los términos de la técnica de electroforesis en el gel agarosa
• Analizar las secuencias presentadas en el artículo en la página web NCBI con la
asimilación del gel agarosa en el programa SnapGene.
3. MARCO TEÓRICO
3.1. Software Snap Gene
El software a utilizar Snap Gene admite una gran cantidad de formatos de archivo.
Como resultado, sus científicos pueden cambiar por completo a Snap Gene sin perder
datos, o pueden continuar usando software heredado junto con Snap Gene sin
conflictos.
Aprovechen el eficiente manejo de datos de Snap Gene para escanear grandes
secuencias de ADN con miles de características anotadas. Visualización de la
proteína Vea las múltiples vistas de una secuencia de proteínas. Personaliza la
5. visualización de regiones, sitios, enlaces y colores de secuencia. Edición de
secuencia intuitiva Edita fácilmente las secuencias de ADN y proteínas.
Snap Gene genera automáticamente un registro de cada edición de secuencia y
procedimiento de clonación, por lo que no perderá la pista de cómo se hizo una
construcción, incluso después de que un miembro del laboratorio se vaya SnapGene
genera automáticamente un registro de cada edición de secuencia y procedimiento
de clonación, por lo que no perderá la pista de cómo se hizo una construcción, incluso
después de que un miembro del laboratorio se vaya.
3.2. Centro Nacional para la Investigación Biotecnológica (NCBI)
El Centro Nacional para la Información Biotecnológica es parte de la Biblioteca
Nacional de Medicina de Estados Unidos, una rama de los Institutos Nacionales de
Salud. Almacena y constantemente actualiza la información referente a secuencias
genómicas en GenBank, un índice de artículos científicos referentes a biomedicina,
biotecnología, bioquímica, genética y genómica en PubMed, una recopilación de
enfermedades genéticas humanas en OMIM, además de otros datos biotecnológicos
de relevancia en diversas bases de datos. Todas las bases de datos del NCBI están
disponibles en línea de manera gratuita, y son accesibles usando el buscador.
6. El NCBI ofrece además algunas herramientas bioinformáticas para el análisis de
secuencias de ADN, ARN y proteínas, siendo BLAST una de las más usadas.
3.3. ADN Y ARN
El ARN y el ADN son polímeros formados por largas cadenas de nucleótidos. Un
nucleótido está formado por una molécula de azúcar (ribosa en el ARN o
desoxirribosa en el ADN) unido a un grupo fosfato y una base nitrogenada. Las bases
utilizadas en el ADN son la adenina (A), citosina (C), guanina (G) y timina (T). En
el ARN, la base uracilo (U) ocupa el lugar de la timina.
Son moléculas relativamente sencillas, pero determinan en gran parte las
características que nos diferencian como especie y, hasta cierto punto, como
individuos. La organización básica de los nucleótidos que los componen determinan
la formación de proteínas.
3.4. Electroforesis
La electroforesis es una técnica para la separación de moléculas según la movilidad
de estas en un campo eléctrico a través de una matriz porosa, la cual finalmente las
separa por tamaños moleculares y carga eléctrica, dependiendo de la técnica que se
use. La técnica clásica utiliza una tira recubierta de una sustancia porosa impregnada
de un electrolito. Sus extremos se sumergen en dos depósitos independientes que
contienen ambos al electrolito y están unidos a los electrodos del generador de
7. corriente. La muestra se deposita en forma de un pequeño trazo transversal en la tira.
La distancia de migración se mide en relación un marcador interno. Las placas son
reveladas con sales de plata, azul de Coomassie, o reactivos en particular.
3.5. Gel de Agarosa
Los geles se comportan como un tamiz molecular y permiten separar moléculas
cargadas en función de su tamaño y forma. Así, moléculas de DNA de diferente
tamaño van a emigrar de forma distinta en una electroforesis en gel de agarosa.
La electroforesis en gel de agarosa se utiliza comúnmente para separar moléculas
en función de su carga, tamaño y forma. Se trata de un medio de separación
especialmente eficaz para las biomoléculas cargadas como el ADN, el ARN y las
proteínas.
4. METODOLOGÍA
• Para la presente practica utilizaremos el programa SNAP GENE para realizar una
SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA utilizando datos del
articulo científico "Aislamiento de bacterias con potencial biorremediador y análisis
8. de comunidades bacterianas de zona impactada por petróleo en Condorcanqui -
Amazonas – Perú”. El programa ya debe estar previamente instalada en su equipo.
• Primero abriremos la página del NCBI https://www.ncbi.nlm.nih.gov/, en el cual
descargaremos las siguientes secuencias de acuerdo al artículo “Aislamiento de
bacterias con potencial biorremediador y análisis de comunidades bacterianas de zona
impactada por derrame de petróleo en Condorcanqui – Amazonas – Perú”
• Procedemos a descargamos cada una de las secuencias mencionadas anteriormente,
clicando en Enviar a, expediente, formato FASTA y finalmente en crear un archivo.
9. • Ya guardada todas las secuencias.
• Abrimos el software SnapGene, click en OPEN, luego OPEN FILES, seleccionamos
las secuencias guardadas, e insertamos.
10. • Para añadir las otras secuencias restantes clicamos en “TOOLS”, luego EN
SIMULATE AGAROSE GEL. Esto nos llevará a una nueva ventana donde
agregaremos las demás secuencias.
• Aplicaremos el 1.0 % de agarosa.
• Adjuntamos las secuencias restantes haciendo click en los números, luego en
CHOOSE DNA SEQUENCES, abrimos la secuencia que sigue.
11. • Se puede observar cómo nos apareció y hacemos este paso con las 13 cepas
bacterianas aisladas (secuencias que hemos guardado en la carpeta).
12. 5. RESULTADOS
• Insertadas las 13 especies estudiadas del artículo, gracias a la simulación con gel de
agarosa podemos apreciar el comportamiento de los 13 nucleótidos.
6. CONCLUSIÓNES
En el programa SnapGene se realizó con 13 cepas bacterianas las cuales pudimos hacer
la simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el programa, fue fácil de
manipular con las respectivas indicaciones, en el cual el total de muestras escogidas
permitió dar a conocer el grafico de las bandas, la asimilación de gel agarosa permitió la
separación de cadenas en tamaños pequeños en el grafico en unidad de kb, también se
pudo reconocer las secuencias de genes específicas con las enzimas de restricción
identificadas en el proceso final.
La electroforesis en gel es una técnica utilizada para separar fragmentos de ADN según
su tamaño. Además, las muestras de ADN se cargan en pozos (ranuras) en un extremo de
un gel y se aplica una corriente eléctrica para arrastrarlas a través del gel.
13. Conocer este programa y saber las funciones que puede realizar es muy importante para
los estudiantes y también términos como gel agarosa y electroforesis fue crucial para
entablar los objetivos, el procedimiento y por ende las conclusiones finales de la práctica.
7. CUESTIONARIO
Indique diferencias entre el AND y ARN
Algunas de las diferencias entre ADN y ARN, por ejemplo, que el ADN es de cadena
doble y el ARN de cadena simple. Otras diferencias:
¿Qué es el SnapGene y como nos serviría en ingeniería ambiental?
SnapGene es el primer software de biología molecular, genera automáticamente un
registro de cada edición de secuencia y procedimiento de donación. Asimismo, nos
permite la visualización de secuencias de ADN, la anotación de secuencias, la edición de
secuencias, la clonación, la visualización de proteínas y la simulación de métodos de
clonación comunes.
14. En la ingeniería ambiental nos serviría, por ejemplo, para disponer de de
microorganismos suficientes con potencial biorremediador, esto gracias a la clonación
como proceso estipulante del software en reconocimiento
¿Qué es el GEN 16s y para qué tipos de microorganismos sería útil?
El ARN ribosomal 16S, conocidos como genes del ARNr 16S, y se utilizan para la
reconstrucción de filogenias debido a sus bajas tasas de evolución.
Esta molécula ha sido reconocida como un poderoso marcador universal debido a que se
encuentra en todos los organismos conocidos. Su estructura parece mantenerse por largos
periodos de tiempo y, como su función no ha cambiado, los cambios en la secuencia
probablemente son aleatorios.
El gen ARNr 16S ha demostrado ser de gran utilidad para describir y caracterizar las
comunidades microbianas marinas, especialmente los organismos no cultivados. Las
nuevas técnicas de secuenciación han contribuido al incremento exponencial de registro
de secuencias, aunque parciales, del ARNr 16S como elemento de código de barras para
microorganismos. Consecuentemente, ha sido necesaria una revisión de conceptos y
métodos de clasificación taxonómica para estos organismos.
Describir el proceso de electroforesis para ADN
La electroforesis es un método de separación de biomoléculas como el ADN o ARN de
acuerdo a su tamaño, permitiendo además su aislamiento cortando la zona de interés. La
electroforesis en ácidos nucleicos es muy versátil, porque permite una observación
directa de cada fragmento separado directamente en el gel, ya que, su tinción mediante
un compuesto llamado bromuro de etidio, hace visible al ADN o ARN (fluoresce)
15. mediante la emisión de luz ultravioleta. Cuando una corriente eléctrica se aplica sobre el
gel de agarosa el ADN tiene una carga negativa y migra hacia el ánodo (polo positivo).
16. ¿Qué es la agarosa?
La agarosa es un polímero lineal compuesto de residuos alternantes de D-galactosa y 3,6-
anhidro-L-galactosa unidos por enlaces glucosídicos α(13) y β(14). Las cadenas del
polímero de agarosa forman fibras helicoidales, que al solidificar forma una malla
tridimensional de canales con diámetros entre 50 y >200 nm (Kirkpatrick 1990).
La agarosa es un producto natural que forma una matriz inerte y no tóxica que supone
una herramienta indispensable en gran cantidad de técnicas de biología molecular,
bioquímica y biología celular. Su uso más extendido es para construir geles que permitan
separar moléculas de ADN mediante electroforesis, además de ser utilizada para fijar
moléculas a su estructura como anticuerpos, antígenos y enzimas. Igualmente se utiliza
para el cultivo celular y en microbiología.
¿Qué es un marcador de peso molecular, cuáles son sus tipos?
Los marcadores de peso molecular para ADN son una herramienta utilizada durante la
electroforesis para conocer el tamaño estimado de un fragmento y es comúnmente usada
en laboratorios de biología molecular, al igual que, en áreas como la medicina, la
agricultura, la industria, entre otras.
Existen dos tipos de marcadores moleculares: los marcadores bioquímicos y los
marcadores de ADN. Los marcadores bioquímicos incluyen a las proteínas y las
isoenzimas o aloenzimas y constituyen la primera generación de marcadores moleculares.
17. 8. REFERENCIAS
Referencias
EDVOTEK. (2018). Principios y práctica de la electroforesis en gel de agarosa . Obtenido de
https://www.edvotek.com
Fierro, F. F. (s.f.). Electroforesis de ADN. Mexico: Universidad Autónoma Metropolitana.
Lawrence C. Brody, P. (s.f.). Nucleotido. Obtenido de NIH: https://www.genome.gov
Mora, D. A., & Rodríguez, A. S. (Octubre de 2017). Access Medicina. Obtenido de Electroforesis:
https://accessmedicina.mhmedical.com
NCBI. (s.f.). Obtenido de Centro Nacional de Informacion Biotecnologica:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov
Rodicio, M. d. (2004). Identificación bacteriana mediante secuenciación del ARNr 16S. España:
Universidad de Oviedo.
Salud, C. d. (27 de Octubre de 2017). ADN y ARN concepto, diferencias y funciones. Obtenido de
https://www.universidadviu.com/pe