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Fosfato
Pentosa
Base púrica o
pirimidínica
(a) Estructura general de los nucleótidos
Pirimidina Purina
(b) Bases nitrogenadas
Adenina Guanina
Citosina Timina (ADN) Uracilo (ARN)
Pirimidina
Purinas
Nomenclatura de Nucleótidos y Ácidos Nucléicos
Bases Nucleósidos* Nucleótidos* Ácidos Nucléicos*
Purinas
Adenina Adenosina Adenilato RNA
Desoxiadenosina Desoxiadenilato ADN
Guanina Guanosina Guanilato ARN
Desoxiguanosina Desoxiguanilato ADN
Pirimidinas
Citosina Citidina Citidilato ARN
Desoxicitidina Desoxicitidilato ADN
Timina Timidina o Timidilato o ADN
desoxitimidina desoxitimidilato
Uracilo Uridina Uridilato ARN
Tabla 10-1
* Nucleósido y Nucleótido son términos genéricos que incluyen ambos las formas ribo- y desoxirribo-. Adviértase que estos
ribonucleósidos y ribonucleótidos se nombran simplemente como nucleósidos y nucleótidos (ej. riboadenosina como
adenosina), y los desoxirribonucleósidos y desoxirribonucleótidos como desoxinucleósidos y desoxinucleótidos (ej.
desoxirriboadenosina como desoxiadenosina). Ambas formas de nomenclatura son válidos, pero las formas más cortas
son de uso más frecuente. La Timidina es una excepción; el término ribotimidina se emplea para destacar su aparición
inusual en el ARN.
Nucleótido:
Símbolo:
Nucleósido:
Desoxiadenilato
(desoxiadenosina
5 -monofosfato)
Desoxiguanilato
(desoxiguanosina
5 -monofosfato)
Desoxitimidilato
(desoxitimidina
5 -monofosfato)
Desoxicitidilato
(desoxicitidina
5 -monofosfato)
A, dA, dAMP G, dG, dGMP T, dT, dTMP C, dC, dCMP
Desoxiadenosina Desoxiguanosina Desoxitimidina Desoxicitidina
(a) Desoxirribonucleótidos
Nucleótido:
Símbolo:
Nucleósido:
Adenilato (adenosina
5 -monofosfato)
Guanilato (guanosina
5 -monofosfato)
Uridilato (uridina
5 -monofosfato)
Citidilato (citidina
5 -monofosfato)
A, AMP G, GMP U, UMP C, CMP
Adenosina Guanosina Uridina Citidina
(b) Ribonucleótidos
Ribosa
Ribosa Ribosa
Ribosa
Inosina
7-Metilguanosina 4-Tiouridina
Pseudouridina
(b)
Adenina
Adenina Adenina
Adenina
Adenosin 5 -monofosfato Adenosin 2 -monofosfato Adenosin 3 -monofosfato Adenosin 2 , 3 -
monofosfato cíclico
extremo 5 extremo 5
extremo 3 extremo 3
ADN ARN
5
3
5
3
Unión
fosfodiester
AA C G T
P P P P P OH
Extremo 5 Extremo 3
Guanina
Adenina
Timina
Citosina
5
5
3
3
36 Å
3.4 Å
Surco
mayor
Surco
menor
20 Å
(a) (b) (c)
36 Å
3.4 Å
Surco
mayor
Surco
menor
20 Å
(a)
5
5
3
3
NuevaNueva
35
Cadena parentalCadena parental Cadenas hijas
(a)
3
5
1 2
3
4
7 5
6
Base
sin-Adenosina anti-Adenosina anti-Citidina
(b)
28 Å
Forma A Forma B Forma Z
Forma A Forma B Forma Z
Giro de la hélice derecha derecha izquierda
Diámetro ~ 26 Å ~ 20 Å ~ 18 Å
Pares de bases por 11 10.5 12
vuelta de hélice
Aumento de hélice por 2.6 Å 3.4 Å 3.7 Å
par de bases
Inclinación normal de 20º 6º 7º
la base respecto al eje
Conformación de pliegue terminal C-3 terminal C-2 terminal C-2 para
del azúcar pirimidinas; C-3 para
purinas
Conformación del anti anti anti para pirimidinas;
enlace glucosil sin para purinas
Repetición
especular
Palíndromo
5 3
35
Horquilla
(a)
5 3
(b)
53
5
3
3
5
Cruciforme
(a) Monocistrónica
(b) Policistrónica
5
5
3
3
Gen
Gen 1 Gen 2 Gen 3
(a) Monocistrónica
5 3
Gen
(b) Policistrónica
5 3
Gen 1 Gen 2 Gen 3
Cadena simple
Bulbo
Bucle
interno
Horquilla
(a)
Doble hélice en horquilla
(b)
Guanina
Uracilo
ADN doble hélice
Desnaturalización Renaturalización
ADN parcialmente
desnaturalizado
Separación
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Unión de hebras
por emparejamiento
de bases
Hebras separadas de
ADN en madejas
aleatorias
3 m
Dúplex
híbrido
Muestra 1 Muestra 2
Mezcla y
enfriamiento
Dúplex de la
muestra 1
Dúplex de la
muestra 2
Dúplex de la
muestra 1 y 2
P P P P P P P P P
3 A AC G G C T TC
P
P
PPP
T G C C G
P
P
OH OH
P
P
P
OH
A
dATP
dGTP
(a)
–––
–––
–––
–––
–––
Hebra
molde
Hebra
copia
3
Copia Molde de secuencia
desconocida
ADN polimerasa
cuatro dNTPs,
cuatro ddNTPs
Desnaturalización
A
A
T
T
C
G
G
G
G
T
T
C
Resultado generado por ordenador después de
pasar por el detector de migración de bandas
Etiquetas con
pigmentos en
segmentos se
someten a
electroforésis en
un gel capilar
Migración
ADN
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Rayo Láser
Láser
C C T G T T T G A T G G T G G T T C C G A A A T C G G
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Etiquetas con
pigmentos en
segmentos de ADN,
copiado del
molde de secuencia
desconocida
OO – P – O – P – O – P – O – CH2
| | |

O O O
O O O
H
H H
H
OHOH
Base
NMP
NDP
NTP
Abreviaturas de
Ribonucleósidos 5 -fosfato
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Desoxirribonucleósidos 5 -fosfato
Base Mono- Di- Tri- Base Mono- Di- Tri-
Adenina AMP ADP ATP
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Citosina CMP CDP CTP
Uracilo UMP UDP UTP
Adenina dAMP dADP dATP
Guanina dGMP dGDP dGTP
Citosina dCMP dCDP dCTP
Uracilo dUMP dUDP dUTP
OO – P – O – P – O – P – O – CH2
|

O O O
O O O
H
H H
H
OHOH
Adenina
 
| |
Anhídrido
Anhídrido
Éster
ATP
CH3 – C – O – C – CH3

O O

CH3 – C – O – CH3

O
Anhídrido acético,
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anhidro
Metil acetato,
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carboxílico
β-Mercaptoeltilamina Ácido Pantoténico
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O O – P – O – P – O – CH2
O O
O O
H
H H
H
OHO
Guanina
 
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|
P
O
|
P
|
|
O
O
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Adenosina 3 -5 -monofosfato cíclico
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