La microbiota natural es el conjunto de microorganismos que se localizan de manera normal en distintos sitios del cuerpo humano. Estos microorganismos se encuentran en relación simbiótica con el huésped y ayudan con funciones como la digestión y protección contra patógenos. La microbiota está compuesta por bacterias, hongos, protozoarios y otros microbios que se localizan en la piel, tracto gastrointestinal, genitourinario y otras áreas.