La ecoendoscopia es útil para estadificar el cáncer de recto y determinar el tratamiento, ya que permite evaluar la profundidad del tumor y la presencia de metástasis en ganglios linfáticos regionales. Aunque no puede diferenciar tejido inflamatorio de tumoral, aumenta la capacidad de delimitar las capas de la pared rectal. La ecoendoscopia también se utiliza para detectar recidivas del cáncer de recto de manera temprana.