La tercera generación de PCR ya está disponible en Uruguay a través de Biodiagnóstico. Conozca el Droplet Digital PCR de Biorad, formas de uso y casos de éxito.
Lo que antes era indetectable con otros métodos, ahora se puede cuantificar con Droplet Digital PCR. Descubrilo.
3. · Sistema versátil
· Cuantificación absoluta de cargas virales
· Cuantificación de biomarcadores en cáncer
· Diferenciación de variaciones genómicas
· Validación y cuantificación de librerías NGS
· Estudios de expresión de genes
· Ensayos validados
Beneficios
4. PREPARAR
REACCIÓN
GENERAR
DROPLETS
REALIZAR PCR
ANALIZAR
RESULTADOS
WORKFLOW
Combina tu muestra de
ADN, primers y/o sondas
con las Supermixes de
Biorad. Ensayos validados
de PrimePCR ddPCR de
Biorad también pueden
usarse.
Carga tu reacción de ddPCR
en los pocillos del
generador de gotas del
QX200. Se generarán 8 x
20.000 gotas por corrida. El
ADN blanco y el ADN
background se distribuirán
por azar en las gotas.
Transfiere las gotas a la
placa de PCR de 96 pocillos
y séllala. Corre el protocolo
de PCR.
Luego de la PCR, carga la
placa de 96 en el lector de
gotas del QX200. Gotas
positivas y negativas serán
leídas. Analiza las
concentraciones con el
Software QuantaSoft
6. Biomarcadores de cáncer
EJEMPLOS DE USO
Mutaciones asociadas al cáncer frecuentemente evaden la
detección debido su baja concentración en relación al ADN
wild-type presente en la muestra.
El nivel de sensibilidad del Sistema de PCR Digital (ddPCR)
QX200 supera las limitaciones impuestas por otros métodos
y permite cuantificar concentraciones tan bajas como de
1 en 1.000.000 de copias totales.
7. Lo que antes era indetectable con otros métodos, ahora se
puede cuantificar con Droplet Digital PCR.
Biomarcadores de cáncer
EJEMPLOS DE USO
8. Biomarcadores de cáncer
CASOSDEÉXITO
La detección de dicha mutación permite un mejor entendimiento de la resistencia a las terapias
inhibidoras de la Tirosin quinasa. Sin embargo, otras técnicas no tienen la sensibilidad
necesaria como para identificar de forma confiable al alelo T790M en un background de EGFR
wild type. Utilizando el Sistema de PCR Digital QX200, un investigador fue capaz de desarrollar
un ensayo que permite cuantificar la concentración del T790M.
Detección de la mutación T790M en el receptor del factor de
crecimiento epidérmico (EGFR).
9. Reservorios virales
El obtener medidas exactas y reproducibles de ADN y
ARN viral es esencial al estudiar un patógeno.
El sistema QX200 tiene una sensibilidad tal que permite
detectar cantidades extremadamente pequeñas de
material genético viral y distinguirlo a su vez de mezclas
complejas.
EJEMPLOS DE USO
10. Reservorios virales
Los investigadores pueden obtener el verdadero número de
copias del genoma viral al generar ADN complementario a
través de una transcripción reversa.
EJEMPLOS DE USO
11. CASOSDEÉXITO
Un investigador comparó el desempeño de la PCR cuantitativa (qPCR) y la PCR Digital (ddPCR) a
la hora de detectar la infección residual de HIV en un set de muestras que incluía una niña que
se había negativizado para el virus según la qPCR, no ocurriendo lo mismo cuando se analizó la
muestra a través de la ddPCR.
El investigador encontró que la PCR Digital es 5 veces más sensible que la qPCR al medir copias
de ADN viral/millón de celulas y 20 veces más exacta cuando se miden las secuencias largas
terminales repetidas (2-LTR circles).
Reservorios virales
qPCR vs ddPCR en la detección del VIH
12. Variaciones genómicas
La variación en el número de copias (CNV) es una fuente
importante de variabilidad interindividual en el genoma
humano.
Al CNV también se lo ha asociado con enfermedades
neurológicas, enfermedades autoinmunes y con
diferentes clases de cáncer, así como también con la
respuesta adversa a diferentes terapias.
EJEMPLOS DE USO
13. Variaciones genómicas
El mayor obstáculo técnico en la estimación del CNV es
la habilidad de poder discriminar con confianza
estadística entre los estados de CN consecutivos.
Al particionar la reacción de amplificación en miles de
gotas, a través del Sistema QX200, se logra resolver
muestras de un alto número de copias consecutivas con
un grado de confianza estadístico excelente.
EJEMPLOS DE USO
14. CASOSDEÉXITO
Un investigador que estudiaba un gen altamente replicado, involucrado en la evolución del
crecimiento del cerebro humano, necesitaba un método para validar pequeñas variaciones del
CN en diferentes muestras. El sistema QX200 resultó ser mucho más efectivo que los otros
métodos con los que el investigador venía trabajando, mostrando no solo una mayor precisión
en la detección de pequeñas diferencias en los estados de CN altos, sino que también una
excelente reproductibilidad. Estas ventajas le permiten al investigador adentrarse más en
profundidad en diferentes patologías como enfermedades neurodegenerativas, autismo,
microcefalia, entre otras.
Variaciones genómicas
Mayor precisión, mayor reproductibilidad al estudiar la CNV