Los tres polos de investigación de la Universidad Fermín Toro son: 1) Promoción de la Paz, enfocado en educar ciudadanos con perfil ético comprometidos con valores de paz. 2) Hombre, Ciudad y Territorio, que busca mejorar la calidad de vida del ciudadano a través de la participación comunitaria. 3) Identidad y Multiculturalismo, que promueve respetar la identidad propia y de los demás en un mundo globalizado.