Existen diversos tipos de microscopios, incluyendo microscopios ópticos, compuestos, digitales, de fluorescencia, electrónicos, estéreos e invertidos, que se diferencian en sus sistemas de luz y lentes para obtener imágenes agrandadas de objetos pequeños. El microscopio compuesto, que utiliza múltiples lentes para proyectar y agrandar la imagen, es el tipo más común, mientras que el microscopio electrónico puede lograr mayores aumentos al usar electrones en lugar de luz. La historia de la