El Virreinato del Perú se estableció en 1542 a través de las Leyes de Indias emitidas por el rey Carlos I para controlar a los encomenderos. El virreinato tuvo una organización política y administrativa compleja tanto en España como en el territorio americano, con el virrey gobernando en América en nombre del rey español. Francisco Toledo organizó correctamente el virreinato en el siglo XVI estableciendo corregimientos, cabildos y reducciones.