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Universidad Central de Venezuela
Facultad de Medicina
Escuela de Medicina Luis Razetti
Cátedra de Bioquímica


    Tema 2:
    Estructura y Función de
    las Proteínas (3/5)
          Prof. Vanessa Miguel
          vanessa.miguel@ucv.ve
          @bioquitips
                                   Noviembre 2011
Propiedades ácido base de los aa y las
proteínas



   Primero un repaso…
Ácidos y Bases (Bronsted-Lowry)

   un ácido es una sustancia capaz de donar
    un protón a otra sustancia.
   una base es una sustancia capaz de aceptar
    un protón
   las sustancias que pueden actuar como
    ácido y como base se conocen como
    sustancias anfóteras.
   El pH puede ser calculado en base a:
             pH = -log[H+]
Ácido Clorhídrico
Ácido Acético
Amoníaco
Ka

Considere la liberación de un protón por un
 ácido débil representado por HA:
                 HA ←→ H+ + A-
          Ácido débil   protón base conjugada
                                  ( sal )

La (sal ) o base conjugada, A- , es la forma
  ionizada de un ácido débil. La constante de
  disociación Ka es igual a
             Ka = [H+] [A-] / [HA]
Ecuación de Henderson-Hasselbalch
Ecuación de
Henderson-Hasselbalch
Curva de titulación


   Representación gráfica de la variación del pH
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Propiedades ácido-base aa

   Los grupos α-COOH y α-NH2 de los
    aminoácidos son capaces de ionizarse (al
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    los aminoácidos).
   Las siguientes reacciones de equilibrio iónico
    pueden ser escritas:
    R-COOH <——> R-COO– + H+
    R-NH3+ <——> R-NH2 + H+
Propiedades ácido-base aa
Aminoácido      pKa1   pKa2    pKaR

Ác. Aspártico   1,88    9,60   3,65
Ác. Glutámico   2,19    9,67   4,25
    Alanina     2,34    9,69
   Arginina     1,17    9,04   12,48   pKa1: pKa del grupo carboxilo
 Asparagina     2,02    8,80              COOH  COO- + H+
   Cisteína     1,96   10,28   8,18
 Fenilalanina   1,83    9,13
    Glicina     2,34    9,60            pKa2: pKa del grupo amino
  Glutamina     2,17    9,13                NH2 + H+  NH3+
   Histidina    1,82    9,17    6,0
  Isoleucina    2,36    9,68
    Leucina     2,36    9,60                pKaR: pKa del grupo R
     Lisina     2,18    8,95   10,53    Podrá tener características de
  Metionina     2,28    9,21           ácido o base débil según el caso
    Prolina     1,99   10,96
     Serina     2,21    9,15
   Tirosina     2,20    9,11   10,07
   Treonina     2,11    9,62
  Triptófano    2,38    9,39
     Valina     2,32    9,62
Propiedades ácido-base aa
   Para aa monoamino y monocarboxilos,
    son posibles dos ionizaciones: carboxilo
    (pKa) y amino (pKb).
   A pH 1 el 100% de las moléculas de aa
    están como ión positivo (todos sus grupos
    protonados) R-COOH, R-NH3+
   Al aumentar el pH se disocia el grupo
    carboxilo y luego el grupo amino (cambia
    carga eléctrica)
Propiedades ácido-base aa

   A pH 14 el 100% del aminoácido estará
    como ión negativo R-COO– R-NH2
Propiedades ácido-base aa

   La carga neta es la suma algebraica de todos
    los grupos con carga presentes de cualquier
    aminoácido, péptido o proteína.
   La carga neta dependerá del pH del ambiente
    acuoso circundante.
   Cuando la carga neta de un aminoácido o de
    una proteína es cero el pH será equivalente
    al punto isoeléctrico (pI).
Propiedades ácido-base aa
Ejemplo: Alanina
pKa1 = 2,34
pKa2 = 9,69
                           Zwitterion

       +1                       0                       -1

                    H+                        H+




        50 %                    50 %                     50 %


  A pH = 2,34 el 50 % de los           A pH = 9,69 el 50 % de los
grupos carboxilo se encuentra          grupos amino se encuentra
 protonado (COOH) y el 50 %            protonado (NH3+) y el 50 %
    restante se encuentra                 restante se encuentra
     desprotonado (COO-)                   desprotonado (NH2)
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Curva de titulación alanina
Titulación de la alanina
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     10
                                                                     pKa2= 9,6
                                      pKa2
      8                                                               H+

pH
      6                          pI

                                                                     pKa1= 2,4
      4                                Amortiguador                   H+
                                         (Buffer)

      2
                    pKa1
      0
                           [OH-] →           Modificado de: Juang RH (2004) BCbasics
Propiedades ácido-base de los aa




   NH3+




 Ácido Aspártico (pH1)      Histidina (pH 13)
CURVAS DE TITULACIÓN


Histidina                Aspártico




                          “Bioquímica” Mathews, van Holde
                          y Ahern. Addison Wesley 2002
Titulación de una proteína

   Al comienzo todos los grupos están totalmente
    protonados (pH < 1)
   El grupo alfa-carboxílico (-COOH) es el primero es
    desprotonarse
   Le siguen los grupos -COOH de las cadenas laterales
    (ácidos aspártico y glutámico)
   Luego siguen los grupos amino aromáticos en cadenas
    R (His) y el grupo -SH de cisteína.
   Siguen los grupos alfa-amino (-NH3+)
    Por último los grupos amino de las cadenas laterales
    (Lisina y Arginina)
Titulación ácido-base de una proteína


        Carga negativa neta




   pI


                              Carga positiva neta
Proteínas ácidas: punto isoeléctrico (pI) inferior a 7
       Ricas en Asp y Glu; al pH celular presentan
       carga negativa neta.

Proteínas básicas: punto isoeléctrico (pI) superior a 7
       Ricas en Arg y Lys; al pH celular presentan
       carga positiva neta.



                           En el medio biológico, son, por
                           lo general, más abundantes las
                                  proteínas ácidas.

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  • 1. Universidad Central de Venezuela Facultad de Medicina Escuela de Medicina Luis Razetti Cátedra de Bioquímica Tema 2: Estructura y Función de las Proteínas (3/5) Prof. Vanessa Miguel vanessa.miguel@ucv.ve @bioquitips Noviembre 2011
  • 2. Propiedades ácido base de los aa y las proteínas  Primero un repaso…
  • 3. Ácidos y Bases (Bronsted-Lowry)  un ácido es una sustancia capaz de donar un protón a otra sustancia.  una base es una sustancia capaz de aceptar un protón  las sustancias que pueden actuar como ácido y como base se conocen como sustancias anfóteras.  El pH puede ser calculado en base a: pH = -log[H+]
  • 7. Ka Considere la liberación de un protón por un ácido débil representado por HA: HA ←→ H+ + A- Ácido débil protón base conjugada ( sal ) La (sal ) o base conjugada, A- , es la forma ionizada de un ácido débil. La constante de disociación Ka es igual a Ka = [H+] [A-] / [HA]
  • 10.
  • 11. Curva de titulación  Representación gráfica de la variación del pH de una solución debida al agregado de una base o un ácido
  • 12.
  • 14. Propiedades ácido-base aa  Los grupos α-COOH y α-NH2 de los aminoácidos son capaces de ionizarse (al igual que los grupos-R ácidos y básicos de los aminoácidos).  Las siguientes reacciones de equilibrio iónico pueden ser escritas: R-COOH <——> R-COO– + H+ R-NH3+ <——> R-NH2 + H+
  • 15. Propiedades ácido-base aa Aminoácido pKa1 pKa2 pKaR Ác. Aspártico 1,88 9,60 3,65 Ác. Glutámico 2,19 9,67 4,25 Alanina 2,34 9,69 Arginina 1,17 9,04 12,48 pKa1: pKa del grupo carboxilo Asparagina 2,02 8,80 COOH  COO- + H+ Cisteína 1,96 10,28 8,18 Fenilalanina 1,83 9,13 Glicina 2,34 9,60 pKa2: pKa del grupo amino Glutamina 2,17 9,13 NH2 + H+  NH3+ Histidina 1,82 9,17 6,0 Isoleucina 2,36 9,68 Leucina 2,36 9,60 pKaR: pKa del grupo R Lisina 2,18 8,95 10,53 Podrá tener características de Metionina 2,28 9,21 ácido o base débil según el caso Prolina 1,99 10,96 Serina 2,21 9,15 Tirosina 2,20 9,11 10,07 Treonina 2,11 9,62 Triptófano 2,38 9,39 Valina 2,32 9,62
  • 16. Propiedades ácido-base aa  Para aa monoamino y monocarboxilos, son posibles dos ionizaciones: carboxilo (pKa) y amino (pKb).  A pH 1 el 100% de las moléculas de aa están como ión positivo (todos sus grupos protonados) R-COOH, R-NH3+  Al aumentar el pH se disocia el grupo carboxilo y luego el grupo amino (cambia carga eléctrica)
  • 17.
  • 18. Propiedades ácido-base aa  A pH 14 el 100% del aminoácido estará como ión negativo R-COO– R-NH2
  • 19. Propiedades ácido-base aa  La carga neta es la suma algebraica de todos los grupos con carga presentes de cualquier aminoácido, péptido o proteína.  La carga neta dependerá del pH del ambiente acuoso circundante.  Cuando la carga neta de un aminoácido o de una proteína es cero el pH será equivalente al punto isoeléctrico (pI).
  • 20. Propiedades ácido-base aa Ejemplo: Alanina pKa1 = 2,34 pKa2 = 9,69 Zwitterion +1 0 -1 H+ H+ 50 % 50 % 50 % A pH = 2,34 el 50 % de los A pH = 9,69 el 50 % de los grupos carboxilo se encuentra grupos amino se encuentra protonado (COOH) y el 50 % protonado (NH3+) y el 50 % restante se encuentra restante se encuentra desprotonado (COO-) desprotonado (NH2)
  • 22. Curva de titulación alanina Titulación de la alanina 14 12 10 pKa2= 9,6 pKa2 8 H+ pH 6 pI pKa1= 2,4 4 Amortiguador H+ (Buffer) 2 pKa1 0 [OH-] → Modificado de: Juang RH (2004) BCbasics
  • 23. Propiedades ácido-base de los aa NH3+ Ácido Aspártico (pH1) Histidina (pH 13)
  • 24. CURVAS DE TITULACIÓN Histidina Aspártico “Bioquímica” Mathews, van Holde y Ahern. Addison Wesley 2002
  • 25. Titulación de una proteína  Al comienzo todos los grupos están totalmente protonados (pH < 1)  El grupo alfa-carboxílico (-COOH) es el primero es desprotonarse  Le siguen los grupos -COOH de las cadenas laterales (ácidos aspártico y glutámico)  Luego siguen los grupos amino aromáticos en cadenas R (His) y el grupo -SH de cisteína.  Siguen los grupos alfa-amino (-NH3+)  Por último los grupos amino de las cadenas laterales (Lisina y Arginina)
  • 26. Titulación ácido-base de una proteína Carga negativa neta pI Carga positiva neta
  • 27. Proteínas ácidas: punto isoeléctrico (pI) inferior a 7 Ricas en Asp y Glu; al pH celular presentan carga negativa neta. Proteínas básicas: punto isoeléctrico (pI) superior a 7 Ricas en Arg y Lys; al pH celular presentan carga positiva neta. En el medio biológico, son, por lo general, más abundantes las proteínas ácidas.