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VIGILANCIA DEL VIRUS
CHIKUNGUNYA POR
LABORATORIO EN ARGENTINA
Bioq. Victoria Luppo
Laboratorio de Arbovirus
Instituto Nacional de Enfermedades Virales Humanas (INEVH)
“Dr. J.I.Maiztegui”- ANLIS, Pergamino-Argentina
 Virus del género Alphavirus y Flia Togaviridae
 Deriva de Makonde: “aquel que se encorva”
 Son esféricos, con una nucleocápside dentro
de una envoltura lipoproteica.
 Son virus con genoma de RNA de
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en el reconocimiento con el sistema inmune
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CHIKUNGUNYA
Proteínas no estructurales Proteínas estructurales
Está Relacionado Genéticamente Y
Serológicamente a O’nyong-nyong, Igbo
Ora Y En Menor Medida Mayaro Y Ross
River
• 1 Serotipo
•3 Genotipos Principales:
•Africa Occidental (selvatico)
•Africa Central/Este/Sur (ECSA)
•Asiatico-Americano
Selección, recolección y envío de muestras
VIREMIA Y CINETICA DE
ANTICUERPOS EN INFECCIONES POR
CHIKV
DIAS DE EVOLUCIÓN
Técnicas de laboratorio para
CHIKAislamiento viral e identificación
por IF o RT-PCR
Detección de
genoma viral
(RT-PCR
convencional y en
Tiempo Real )
Detección de anticuerpos contra
proteínas virales: Elisa IgM/IgG,
Neutralización por reducción del
número de placas.
Algoritmo para detección de CHIKV, DENV y
requerimientos de Bioseguridad
Muestra de Caso sospechoso de CHIKV y
DENV
< 8 días de evolución
RT- PCR DENV y CHIKV
NegativoPositivo
Negativo Positivo
IgM CHIKV
Negativo
Positivo
Estudiar por
técnica de
neutralización
para DEN y otros
Flavivirus
(BSL2, virus
quiméricos para
SLEV y WN, cepa
vacunal YFV)Aislamiento Viral
(BSL3)
Serología en
casos
RT-PCR (-) CHIK
en BSL2
Estudiar PAR SEROLÓGICO
por Neutralización r técnica
de para CHIK y otros
Alphavirus (BSL3)
Inactivación
1er paso
extracción
del RNA
(BSL2)
ELISA IgM DENV
(desde 4 dpi)
Secuenciación –
Filogenia
Solicita
Segunda
muestra
para repetir
serología
Algoritmo para detección de CHIKV, DENV y
requerimientos de Bioseguridad
Caso sospechos de DENV y CHIKV
≥ 8 días de evolución
ELISA IgM DENV y
CHIK V
Negativo DENV y
CHIKV
Positivo DENVPositivo
CHIKV
Serología
en BSL2
Estudiar
PAR SEROLÓGICO por
técnica de
neutralización para
CHIK y otros Alphavirus
( BSL3)
Estudiar
PAR SEROLÓGICO por
técnica de neutralización
para DENV y otros
Flavivirus
(BSL2, virus quiméricos
para SLEV y WN, cepa
vacunal YFV)
•Búsqueda de otros
Arbovirus
Se descarta caso
de DENV* o
CHIKV
*Estudio de segunda muestra para descartar posible
infección secundaria de DENV sin IgM (Clínica y
Epidemiología)
TÉCNICAS DIRECTAS
AISLAMIENTO VIRAL
 Gold Stándard de los métodos directos
 Muestra indicada: suero de fase aguda
(< de 8 días de evolución y perfectamente
conservada)
 Inoculación en lineas celulares suceptibles:
BHK-21, HeLa, Vero y C6/36. Efecto
citopático al 3er día.
 Confirmación por técnica de IF , RT-PCR
convencional o en real time del
sobrenadante celular.
 Aislamiento en laboratorio BSL-3 de cepas
obtenidas en el INEVH de casos importados
Aislamiento de cepas de CHIKV en el INEVH (BSL 3)
1. Se aislaron en celulas Vero
2. Identificación viral por RT-PCR
Real Time CHIKV
3. Titulación por UFP
4. Secuenciación de un fragmento
de Genoma Viral y filogenia
viral
Muestras de Suero de casos sospechosos
(< 8días de evolución)
 Se han obtenido stocks
virales con titulos ˜ 10 7
ufp /ml:
• cepa Asiatica
(aislamiento viral de
suero de un viajero
detectado en
Argentina)
 Celulas Vero C 76
RT-PCR en tiempo real CHIKV
 Inicialmente se usó un protocolo
diseñado por el Dr. Lanciotti 2007
(sensibilidad: 1UFP o 50 copias
genómicas)
 Diseño de sonda y primer en base a la
cepa prototipo S27
 Detecta todos los genotipos West
Africa, ECSA y Asia
 No hay reactividad para otros
Alphavirus (ONN, Ross River, Mayaro,
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• Recientemente se han diseñado 2 sets de primers y sonda más
específicos para el genotipo asiático circulante (Fort Collins- CDC)
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Sets de primer y sondas
• Set 1 (ECSA)
6856F
6981c
6919-FAM
• Set 2 (Asiático-América)
3855F
3957c1,2
3996-FAM1,2
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856F
962c
908-FAM
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• Set 1 (ECSA)
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• Set 2 (Asiático-América)
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• Set 3 (Asiático-América)
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Los sets 2 y 3 tienen mayor sensibilidad
que el set 1, por lo cual se recomienda
para el análisis de las cepas que circulan
actualmente en América
Los sets 2 y 3 tienen mayor sensibilidad
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actualmente en América
nsP1 nsP2 nsP3 nsP4 C E2 E1
AAAAAAAAAAA
No estructural estructural
RT-PCR convencional genérica para Alphavirus
 Oligonucleótidos degenerados en la región nsp4 (195pb)
 Detección de EEE, WEE, VEE, CHIK, Ross River, Sinbis, Semiliki Forest
 Para identificar el Alphavirus se requiere la secuenciación genómica
nsP1 nsP2 nsP3 nsP4 C E2 E1
AAAAAAA
No estructural estructural
E3
Identificación del
Genotipo Asiático
en viajeros
procedentes del
Caribe
Identificación del
Genotipo Asiático
en viajeros
procedentes del
Caribe
Caracterización Filogenética de cepas
circulantes
CHIKV detectado en Argentina- INEVH
2014
Congreso Argentino de Virología
CAV,2015
Análisis bayesiano, 1200 nt en la
región E ; 155 pb región nsp4.
Árboles de topología similar
TÉCNICAS SEROLÓGICAS
 Desde el 2011 el INEVH cuenta
con la técnica de Elisa IgM de
captura puesta a punto y
evaluada externamente a través
de proficiencia del CDC
 Permite detectar infección
actual o reciente
 Presenta cruce serológico con
otros alfavirus del mismo grupo
ej: virus Mayaro, Ross River,
Onyong nyong)
 Metodología in house que
utiliza reactivo producido en
INEVH
ELISA de captura IgM CHIK (P/N)
CHIK RR ONN VEE MAY EEE
12.3 1.5 15.3 0.89 1.9 1.2
10.6 1.2 13.9 1.1 1.9 1.3
14.5 1.7 17.3 1.1 3.1 0.89
20.4 0.92 20.7 1.5 7.1 1.8
26.6 4.9 27.4 2.2 1.7 1.5
21.2 1.5 24.7 2.2 1.2 1.6
15.3 1.5 8 1.6 1.9 2.2
31.3 1.5 24.6 1.7 2.9 1.8
22 1.6 15.9 1.8 1.4 1.4
18.8 0.59 13.1 1.2 1.5 1.1
34.3 3.7 22.6 1.6 2.8 9.1
Fuente: CDC
1. Anti IgM humano (4°C toda la noche)
2. Agregar suero de paciente en la dilución adecuada
(37°C , 1 Hora)
3. Agregar Antígeno (chik y normal para la misma muestra)
( 4°C toda la noche)
4. Agregar el Ac monoclonal conjugado con peroxidasa
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Fuente: CDC
5. Adición del Sustrato TMB. Dejar 30 min a 37°C y
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Linea Celular
C6 / 36
Incubación
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Inactivación por
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 Técnica serológica de referencia
para confirmar el diagnóstico
 Aumento en 4 veces el título
entre muestra
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de Alphavirus
 Se tituló stock viral de MAY para
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INCORPORACIÓN DEL DIAGNÓSTICO DE CHIKV EN LA RED NACIONAL DE
LABORATORIOS PARA DIAGNOSTICO DE DENGUE Y OTROS ARBOVIRUS
¡MUCHAS GRACIAS
POR SU ATENCIÓN!
Bioq. Victoria Luppo
vluppo@anlis.gov.ar
Dra Alejandra Morales
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Lic Cintia Fabbri
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Vigilancia del chikungunya por laboratorio en Argentina (Victoria Luppo, INEVH)

  • 1. VIGILANCIA DEL VIRUS CHIKUNGUNYA POR LABORATORIO EN ARGENTINA Bioq. Victoria Luppo Laboratorio de Arbovirus Instituto Nacional de Enfermedades Virales Humanas (INEVH) “Dr. J.I.Maiztegui”- ANLIS, Pergamino-Argentina
  • 2.  Virus del género Alphavirus y Flia Togaviridae  Deriva de Makonde: “aquel que se encorva”  Son esféricos, con una nucleocápside dentro de una envoltura lipoproteica.  Son virus con genoma de RNA de polaridad positiva de aprox. 11.5 KB  Genes proteínas no estructurales: replicación del virus; genes de proteínas estructurales: implicadas en el reconocimiento con el sistema inmune (epítopes específicos) CHIKUNGUNYA Proteínas no estructurales Proteínas estructurales Está Relacionado Genéticamente Y Serológicamente a O’nyong-nyong, Igbo Ora Y En Menor Medida Mayaro Y Ross River • 1 Serotipo •3 Genotipos Principales: •Africa Occidental (selvatico) •Africa Central/Este/Sur (ECSA) •Asiatico-Americano
  • 3. Selección, recolección y envío de muestras
  • 4. VIREMIA Y CINETICA DE ANTICUERPOS EN INFECCIONES POR CHIKV DIAS DE EVOLUCIÓN
  • 5. Técnicas de laboratorio para CHIKAislamiento viral e identificación por IF o RT-PCR Detección de genoma viral (RT-PCR convencional y en Tiempo Real ) Detección de anticuerpos contra proteínas virales: Elisa IgM/IgG, Neutralización por reducción del número de placas.
  • 6. Algoritmo para detección de CHIKV, DENV y requerimientos de Bioseguridad Muestra de Caso sospechoso de CHIKV y DENV < 8 días de evolución RT- PCR DENV y CHIKV NegativoPositivo Negativo Positivo IgM CHIKV Negativo Positivo Estudiar por técnica de neutralización para DEN y otros Flavivirus (BSL2, virus quiméricos para SLEV y WN, cepa vacunal YFV)Aislamiento Viral (BSL3) Serología en casos RT-PCR (-) CHIK en BSL2 Estudiar PAR SEROLÓGICO por Neutralización r técnica de para CHIK y otros Alphavirus (BSL3) Inactivación 1er paso extracción del RNA (BSL2) ELISA IgM DENV (desde 4 dpi) Secuenciación – Filogenia Solicita Segunda muestra para repetir serología
  • 7. Algoritmo para detección de CHIKV, DENV y requerimientos de Bioseguridad Caso sospechos de DENV y CHIKV ≥ 8 días de evolución ELISA IgM DENV y CHIK V Negativo DENV y CHIKV Positivo DENVPositivo CHIKV Serología en BSL2 Estudiar PAR SEROLÓGICO por técnica de neutralización para CHIK y otros Alphavirus ( BSL3) Estudiar PAR SEROLÓGICO por técnica de neutralización para DENV y otros Flavivirus (BSL2, virus quiméricos para SLEV y WN, cepa vacunal YFV) •Búsqueda de otros Arbovirus Se descarta caso de DENV* o CHIKV *Estudio de segunda muestra para descartar posible infección secundaria de DENV sin IgM (Clínica y Epidemiología)
  • 9. AISLAMIENTO VIRAL  Gold Stándard de los métodos directos  Muestra indicada: suero de fase aguda (< de 8 días de evolución y perfectamente conservada)  Inoculación en lineas celulares suceptibles: BHK-21, HeLa, Vero y C6/36. Efecto citopático al 3er día.  Confirmación por técnica de IF , RT-PCR convencional o en real time del sobrenadante celular.  Aislamiento en laboratorio BSL-3 de cepas obtenidas en el INEVH de casos importados
  • 10. Aislamiento de cepas de CHIKV en el INEVH (BSL 3) 1. Se aislaron en celulas Vero 2. Identificación viral por RT-PCR Real Time CHIKV 3. Titulación por UFP 4. Secuenciación de un fragmento de Genoma Viral y filogenia viral Muestras de Suero de casos sospechosos (< 8días de evolución)  Se han obtenido stocks virales con titulos ˜ 10 7 ufp /ml: • cepa Asiatica (aislamiento viral de suero de un viajero detectado en Argentina)  Celulas Vero C 76
  • 11. RT-PCR en tiempo real CHIKV  Inicialmente se usó un protocolo diseñado por el Dr. Lanciotti 2007 (sensibilidad: 1UFP o 50 copias genómicas)  Diseño de sonda y primer en base a la cepa prototipo S27  Detecta todos los genotipos West Africa, ECSA y Asia  No hay reactividad para otros Alphavirus (ONN, Ross River, Mayaro, EEE, WEE, VEE, Semiliki Forest, Sinbis).
  • 12. RT-PCR en tiempo real CHIKV • Recientemente se han diseñado 2 sets de primers y sonda más específicos para el genotipo asiático circulante (Fort Collins- CDC) (sin publicar aún) • Se analizaron en el INEVH diluciones seriadas de una de las cepas aisladas en el INEVH procedente de República Dominicana Sets de primer y sondas • Set 1 (ECSA) 6856F 6981c 6919-FAM • Set 2 (Asiático-América) 3855F 3957c1,2 3996-FAM1,2 • Set 3 (Asiático-América) 856F 962c 908-FAM Sets de primer y sondas • Set 1 (ECSA) 6856F 6981c 6919-FAM • Set 2 (Asiático-América) 3855F 3957c1,2 3996-FAM1,2 • Set 3 (Asiático-América) 856F 962c 908-FAM Los sets 2 y 3 tienen mayor sensibilidad que el set 1, por lo cual se recomienda para el análisis de las cepas que circulan actualmente en América Los sets 2 y 3 tienen mayor sensibilidad que el set 1, por lo cual se recomienda para el análisis de las cepas que circulan actualmente en América nsP1 nsP2 nsP3 nsP4 C E2 E1 AAAAAAAAAAA No estructural estructural
  • 13. RT-PCR convencional genérica para Alphavirus  Oligonucleótidos degenerados en la región nsp4 (195pb)  Detección de EEE, WEE, VEE, CHIK, Ross River, Sinbis, Semiliki Forest  Para identificar el Alphavirus se requiere la secuenciación genómica nsP1 nsP2 nsP3 nsP4 C E2 E1 AAAAAAA No estructural estructural E3
  • 14. Identificación del Genotipo Asiático en viajeros procedentes del Caribe Identificación del Genotipo Asiático en viajeros procedentes del Caribe Caracterización Filogenética de cepas circulantes CHIKV detectado en Argentina- INEVH 2014 Congreso Argentino de Virología CAV,2015 Análisis bayesiano, 1200 nt en la región E ; 155 pb región nsp4. Árboles de topología similar
  • 16.  Desde el 2011 el INEVH cuenta con la técnica de Elisa IgM de captura puesta a punto y evaluada externamente a través de proficiencia del CDC  Permite detectar infección actual o reciente  Presenta cruce serológico con otros alfavirus del mismo grupo ej: virus Mayaro, Ross River, Onyong nyong)  Metodología in house que utiliza reactivo producido en INEVH ELISA de captura IgM CHIK (P/N) CHIK RR ONN VEE MAY EEE 12.3 1.5 15.3 0.89 1.9 1.2 10.6 1.2 13.9 1.1 1.9 1.3 14.5 1.7 17.3 1.1 3.1 0.89 20.4 0.92 20.7 1.5 7.1 1.8 26.6 4.9 27.4 2.2 1.7 1.5 21.2 1.5 24.7 2.2 1.2 1.6 15.3 1.5 8 1.6 1.9 2.2 31.3 1.5 24.6 1.7 2.9 1.8 22 1.6 15.9 1.8 1.4 1.4 18.8 0.59 13.1 1.2 1.5 1.1 34.3 3.7 22.6 1.6 2.8 9.1 Fuente: CDC
  • 17. 1. Anti IgM humano (4°C toda la noche) 2. Agregar suero de paciente en la dilución adecuada (37°C , 1 Hora) 3. Agregar Antígeno (chik y normal para la misma muestra) ( 4°C toda la noche) 4. Agregar el Ac monoclonal conjugado con peroxidasa rábano (37°, 1 Hora) Fuente: CDC 5. Adición del Sustrato TMB. Dejar 30 min a 37°C y solución de Stop. Leer a 450 nm
  • 18. Linea Celular C6 / 36 Incubación x días, 34ºC Monitoreo por ECP y/o IFI 100 % Infección Descongelamiento Sonicado y centrifgado Inactivación por irradiación gamma Inoculación viral ANTIGENO p/ ELISA IgM Congelamiento -70ºC VeroC76 /BHK-21
  • 19.  Técnica serológica de referencia para confirmar el diagnóstico  Aumento en 4 veces el título entre muestra aguda/convalesciente.  Estudiar especificidad con panel de Alphavirus  Se tituló stock viral de MAY para incorporar al panel
  • 20. INCORPORACIÓN DEL DIAGNÓSTICO DE CHIKV EN LA RED NACIONAL DE LABORATORIOS PARA DIAGNOSTICO DE DENGUE Y OTROS ARBOVIRUS
  • 21. ¡MUCHAS GRACIAS POR SU ATENCIÓN! Bioq. Victoria Luppo vluppo@anlis.gov.ar Dra Alejandra Morales amorales@anlis.gov.ar Lic Cintia Fabbri cfabbri@anlis.gov.ar