Las mucosas son las fronteras del sistema inmunitario donde se encuentran los tejidos linfoides asociados a mucosas que producen y secretan IgA para protegernos de patógenos. Estas estructuras están expuestas permanentemente a microorganismos comensales que condicionan nuestra respuesta inmune. La intolerancia a esta flora puede producir enfermedades inflamatorias intestinales como la enfermedad de Crohn o la colitis ulcerosa.