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Dr. MSc. Juan M. Rodríguez-Tafur Dávila
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11 Mar 2020
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Usando métodos de la teoría del valor extremo,
examinamos Las principales pandemias de la historia,
tratando de entender sus propiedades de cola. Aplicando
el enfoque de distribución sombra desarrollado por los
autores de conflictos violentos [5], proporcionamos
aproximada estimaciones de cantidades inmediato no
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en lo que se refiere a eventos de cola.
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Vemos un alto grado de incertidumbre en los modelos de
epidemiología como el modelo SIR –ya sea estructural al modelo o en
las distribuciones de parámetros, que evidentemente deberían ser
ellos mismos los eventos de cola. La recomendación es suspender las
conclusiones políticas derivadas de modelos epidemiologicos en
presencia de crecimiento multiplicativo y letalidad.
La existencia de una amenaza existencial debería afectar la política
haciendola de una manera seria y anular todas las sutilezas de
modelos epidemiológicos y de otro tipo que deberían limitarse a
informar decisiones sobre asuntos que se encuentran fuera de las
colas del distribución.
LOS VIRUS Y EL CORONAVIRUS
Virus
“Los virus son parásitos intracelulares obligados que consisten en
ADN o ARN con cubierta proteica llamada capside”
• GOODMAN & GILMAN'S THE PHARMACOLOGICAL BASIS OF THERAPEUTICS
Son los virus seres vivos?
Clasificación
Virus DNA
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• Rhabdovirus (rabia)
• Picornavirus (poliomielitis,
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• Arenavirus (meningitis, fiebre de
Lassa)
• Flavivirus (West Nile
meningoencefalitis, fiebre amarilla,
hepatitis C)
• Ortomixovirus (Influenza)
• Paramixovirus (sarampion, paperas)
• Coronavirus (resfríos, SARS)
• Retrovirus (HIV)
CLASIFICACION Y LA ESTRUCTURA DEL
SARS-CoV2
Ø 50 a 200 nm
¿SARS-CoV-2 FUE PRODUCIDO EN LABORATORIO?
o Se ha discutido mucho sobre el origen del virus SARS-CoV-2, incluyendo su posible
síntesis artificial.
o El análisis de los datos disponibles sobre el genoma de este virus muestra que es
imposible que se haya producido en un laboratorio, entre otras cosas porque:
- El SARS-CoV-2 tiene diferencias de secuencia claves respecto a otros coronavirus
conocidos (de humanos, murciélagos, pangolines, etc.) que pudieran haberse usado
como base para sintetizar artificialmente este nuevo virus.
- La zona de la proteína de las espículas virales (S) que se une al receptor celular
tiene una secuencia diferente de la del SARS-CoV-1 y no es la que correspondería a
un diseño artificial basado en análisis computacionales.
Por tanto, todas las pruebas indican que este coronavirus surgió por selección natural,
evolucionando en otro animal antes de ser transferido a los humanos, o bien
evolucionando en humanos tras su transferencia.
The proximal origin of SARS-CoV-2
https://www.nature.com/articles/s41591-020-0820-9
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Valencia D N (March 24, 2020) Brief Review on COVID-19:
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RESPUESTA ANTIVIRAL
Interferón
Rápida
Específica
VIRUS
Anticuerpo
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La Vía de la 2’5’ OAS
IFN
2’5’ OAS
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ARNasa L
Inactiva
ARNasa L
Activa
Cliva
ARN
VIRAL
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INFECCION VIRAL
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Muerte celular: Perforinas y Granzimas en la
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CTL o célula NK
gránulos contienen perforinas
y granzimas.
1.granzimas2. perforinas
Endocitosis
Movimiento a través
de la actina/ fibras del
microtubulo
Almacenaje
en vesciculas
+Ca++
Lísis
Osmótica
señal
Exite evidencia que son las
granzimas endocitadas y la
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que median la migración al
nucleo de las granzimas
para la apoptosis.
Núcleo
Clivaje
y activación
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Transporte de la
Gramzima B al núcleo.
Apoptosis!
TORMENTA DE CITOCINAS
In to the eye of Cytokine Storm
Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2012, 76(1):16. DOI: 10.1128/MMBR.05015-11
Journal of the American College of Cardiology
Volume 70, Issue 18, 31 October 2017, Pages 2278-2289
MECANISMOS DE EVASION VIRAL
Evasion Viral de la Inmunidad
1. Variación Antigénica – En la Influenza esto es un ejemplo clásico. Y tambien
se da en la hepatitis.
2. Inhibición de la expresión de moléculas de clase I del CMH o del
procesamiento antigénico.
adenoviruses
herpes – se une a TAP
CMV – mueve los CMH al citoplasma.
3. Supresión del Sistema Inmune:
EBV sintetiza un homólogo de IL-10 (viroquina).
HIV - AIDS
Pox viruses: receptores solubles de citoquinas – antagonistas
competitivos.
4. Infección de los Linfocitos – HIV, HHV-6.
Interferencia en las Moléculas de Clase
I del MHC
• Iniciación de la respuesta inmune requiere de la presentacón
del Antígeno viral.
• Para la destrucción de las células infectadas la presentación de
antigeno viral por las moleculas de clase I del MHC es critica
para iniciar una respuesta de las células T CD8+.
INHIBICION DEL PROCESAMIENTO ANTIGENOS O
LA EXPRESION DE MOLECULAS DE CLASE I
DIAGNOSTICO: “PRUEBA RAPIDA
SEROLOGICA
VERSUS PRUEBA MOLECULAR”
CUAL DE LAS DOS PRUEBAS ES DIAGNOSTICO
ETIOLOGICO?
• LA PRUEBA SEROLOGICA O RAPIDA
• LA PRUEBA MOLECULAR
EL PCR IDENTIFICA TRES GENES DEL CORONAVIRUS
INSERTADOS EN EL MATERIAL GENETICO HUMANO.
GENES ORF1ab, GEN E, GEN N.
DIAGNOSTICO ETIOLOGICO
From: Interpreting Diagnostic Tests for SARS-CoV-2
JAMA. Published online May 06, 2020. doi:10.1001/jama.2020.8259
Variación estimada a lo largo del tiempo en las pruebas de diagnóstico para la detección de la infección por SARS-CoV-2 en relación con el inicio de los síntomas
Los intervalos de tiempo estimados y las tasas de detección viral se basan en datos de varios informes publicados. Debido a la variabilidad en los valores entre los estudios,
los intervalos de tiempo estimados deben considerarse aproximaciones y la probabilidad de detección de infección por SARS-CoV-2 se presenta de forma cualitativa. SARS-
CoV-2 indica coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo; PCR, reacción en cadena de la polimerasa.
aLa detección solo ocurre si los pacientes reciben un seguimiento proactivo desde el momento de la exposición.
bEs más probable que registre un resultado negativo que positivo por PCR de un hisopo nasofaríngeo
CONCLUSIONES
CONCLUSIONES
• SRS-CoV-2 es un betacoronavirus que paso de especies animales a
infectar humanos por lo que esta pandemia es una Zoonosis.
• Esta pandemia hasta el dia de hoy, tal vez una de las menos letales
que ha sufrido el hombre en su historia.
• Esta probado por estudios de bioinformática y genómica que el virus
es una adaptación natural .
• La comprensión de los mecanismos moleculares de la infección
permitirán hallar una mejor aproximación terapéutica a este agente
patógeno asi como hallar una vacuna.
• Los mecanismos de evasión viral son muy importante al inicio de la
infección por eso la administración temprana de
inmunomoduladores puede cambiar el curso de la infección.
• El Dx clínicos en una pandemia, deben primar sobre el Dx de
laboratorio, ya que sino es así, se esta retrasando la terapia que
podrá agravar el curso de la infección.
Coronavirus 2020 - Prof. Dr. Juan Rodriguez-Tafur

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Coronavirus 2020 - Prof. Dr. Juan Rodriguez-Tafur

  • 1. Dr. MSc. Juan M. Rodríguez-Tafur Dávila Prof. Asociado de Farmacología e Inmunología Facultad de Medicina de San Fernando Universidad Nacional Mayor de San Marcos Aspectos inmunopatológicos de la infección por SARS-CoV2
  • 3. Estela de Roma, el cuidador de la puerta. Epoca del Rey Amenhotep III 18ava dinastía (1400 AC)
  • 4. “Pequeñas criaturas invisibles a los ojos, llenan la atmósfera, y las respiramos a través de la nariz causando graves enfermedades.” Marcus Terentius Varro, De Re Rustica libri III (100 A.C.)
  • 5.
  • 7.
  • 8.
  • 11.
  • 13. COEFICIENTE BASICO DE REPRODUCTIBILIDAD
  • 14. COEFICIENTE BASICO DE REPRODUCTIBILIDAD Susceptible Infectado
  • 16. COEFICIENTE BASICO DE REPRODUCTIBILIDAD Susceptible Infectado
  • 17. No inmunizado pero todavia sano Inmunizado y sano No inmunizado, enfermo y contagiando
  • 18. https://www.academia.edu/42307438/Tail_Risk_of_Contagious_Diseases Usando métodos de la teoría del valor extremo, examinamos Las principales pandemias de la historia, tratando de entender sus propiedades de cola. Aplicando el enfoque de distribución sombra desarrollado por los autores de conflictos violentos [5], proporcionamos aproximada estimaciones de cantidades inmediato no observables en los datos. Las epidemias y las pandemias son extremadamente peligrosas, con un potencial riesgo existencial para la humanidad. Esta propiedad debería anular las conclusiones derivadas de los modelos de epidemiología en lo que se refiere a eventos de cola. . Vemos un alto grado de incertidumbre en los modelos de epidemiología como el modelo SIR –ya sea estructural al modelo o en las distribuciones de parámetros, que evidentemente deberían ser ellos mismos los eventos de cola. La recomendación es suspender las conclusiones políticas derivadas de modelos epidemiologicos en presencia de crecimiento multiplicativo y letalidad. La existencia de una amenaza existencial debería afectar la política haciendola de una manera seria y anular todas las sutilezas de modelos epidemiológicos y de otro tipo que deberían limitarse a informar decisiones sobre asuntos que se encuentran fuera de las colas del distribución.
  • 19. LOS VIRUS Y EL CORONAVIRUS
  • 20. Virus “Los virus son parásitos intracelulares obligados que consisten en ADN o ARN con cubierta proteica llamada capside” • GOODMAN & GILMAN'S THE PHARMACOLOGICAL BASIS OF THERAPEUTICS
  • 21. Son los virus seres vivos?
  • 22. Clasificación Virus DNA • Poxvirus (viruela) • Herpesvirus (varicella, herpes zoster, oral y genital) • Adenovirus (conjuntivitis, dolor de garganta) • Hepadnavirus (hepatitis B) • Papillomavirus (verrugas) Virus RNA • Rubella virus (German measles) • Rhabdovirus (rabia) • Picornavirus (poliomielitis, meningitis, resfríos, hepatitis A) • Arenavirus (meningitis, fiebre de Lassa) • Flavivirus (West Nile meningoencefalitis, fiebre amarilla, hepatitis C) • Ortomixovirus (Influenza) • Paramixovirus (sarampion, paperas) • Coronavirus (resfríos, SARS) • Retrovirus (HIV)
  • 23.
  • 24. CLASIFICACION Y LA ESTRUCTURA DEL SARS-CoV2
  • 25. Ø 50 a 200 nm
  • 26.
  • 27.
  • 28.
  • 29. ¿SARS-CoV-2 FUE PRODUCIDO EN LABORATORIO? o Se ha discutido mucho sobre el origen del virus SARS-CoV-2, incluyendo su posible síntesis artificial. o El análisis de los datos disponibles sobre el genoma de este virus muestra que es imposible que se haya producido en un laboratorio, entre otras cosas porque: - El SARS-CoV-2 tiene diferencias de secuencia claves respecto a otros coronavirus conocidos (de humanos, murciélagos, pangolines, etc.) que pudieran haberse usado como base para sintetizar artificialmente este nuevo virus. - La zona de la proteína de las espículas virales (S) que se une al receptor celular tiene una secuencia diferente de la del SARS-CoV-1 y no es la que correspondería a un diseño artificial basado en análisis computacionales. Por tanto, todas las pruebas indican que este coronavirus surgió por selección natural, evolucionando en otro animal antes de ser transferido a los humanos, o bien evolucionando en humanos tras su transferencia. The proximal origin of SARS-CoV-2 https://www.nature.com/articles/s41591-020-0820-9 http://nextstrain.org
  • 30. Valencia D N (March 24, 2020) Brief Review on COVID-19: The 2020 Pandemic Caused by SARS-CoV-2. Cureus 12(3): e7386. doi:10.7759/cureus.7386
  • 31. VIAS DE CONTAGIO DEL SARS-CoV-2
  • 32.
  • 33. Contagio y Transmisión el SARS-CoV2 • Estornudos, Tos • Gotas de secreciones (0.1mm) • Cercanía (2.05 m) • Contacto con gotas o microgotas • Entrada en mucosas
  • 34. JAMA. Published online March 26, 2020. doi:10.1001/jama.2020.4756 JAMA Insights March 26, 2020 Turbulent Gas Clouds and Respiratory Pathogen Emissions Potential Implications for Reducing Transmission of COVID-19 Bourouiba L.
  • 35. JAMA. Published online March 26, 2020. doi:10.1001/jama.2020.4756 JAMA Insights March 26, 2020 Turbulent Gas Clouds and Respiratory Pathogen Emissions Potential Implications for Reducing Transmission of COVID-19 Bourouiba L. 30 mts/second
  • 36. JAMA Insights March 26, 2020 Turbulent Gas Clouds and Respiratory Pathogen Emissions Potential Implications for Reducing Transmission of COVID-19 Bourouiba L. JAMA. Published online March 26, 2020. doi:10.1001/jama.2020.4756 DISTRIBUCION EN AMBIENTES CERRADOS
  • 37.
  • 38.
  • 39.
  • 40.
  • 41.
  • 42. PERSISTENCIA Y VIABILIDAD DEL SARS-CoV-2 EN SUPERFICIES
  • 43. Mas de 4 horas Mas de 72 horas Mas de 24 horas
  • 44.
  • 45.
  • 46. 2019
  • 47.
  • 48. SARS-CoV2 VIA DE ENTRADA A LAS CELULAS
  • 49.
  • 50.
  • 51. Proteína S (S1) → ACE2 TMPRSS2 → rompe a ACE2 TMPRSS2 → activa a Proteína S (S2) Fusión de envoltura y membrana Pathogens 2020, 9, 231;1:14 SARS-CoV2 VIA DE ENTRADA A LAS CELULAS
  • 52.
  • 53.
  • 54. Activación del Sistema inmunitario: Por el virus o como consecuencia de la disminución de ECA-2 o de ambos Injuria Inmune
  • 56.
  • 57. 1. IgA en secreciones Neutralización 2. Interferones Bloqueo de la replicación 3. Fagocitos: Macrófagos (Opsonización) 4. Linfocitos Th2 Ig / Th1 IL-2, IFNү 5. Células citotóxicas: Linfocitos Tc y NK 6. Inflamación crónica Daño tisular RESPUESTA ANTIVIRAL
  • 58.
  • 61. La Vía de la 2’5’ OAS IFN 2’5’ OAS 2’5’ oligoadenilato ARNasa L Inactiva ARNasa L Activa Cliva ARN VIRAL
  • 62. La Vía de la PKR
  • 65. Muerte celular: Perforinas y Granzimas en la Infección Viral CTL o célula NK gránulos contienen perforinas y granzimas. 1.granzimas2. perforinas Endocitosis Movimiento a través de la actina/ fibras del microtubulo Almacenaje en vesciculas +Ca++ Lísis Osmótica señal Exite evidencia que son las granzimas endocitadas y la union de las perforinas las que median la migración al nucleo de las granzimas para la apoptosis. Núcleo Clivaje y activación de las caspasas. Transporte de la Gramzima B al núcleo. Apoptosis!
  • 66.
  • 68. In to the eye of Cytokine Storm Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2012, 76(1):16. DOI: 10.1128/MMBR.05015-11
  • 69. Journal of the American College of Cardiology Volume 70, Issue 18, 31 October 2017, Pages 2278-2289
  • 70.
  • 72. Evasion Viral de la Inmunidad 1. Variación Antigénica – En la Influenza esto es un ejemplo clásico. Y tambien se da en la hepatitis. 2. Inhibición de la expresión de moléculas de clase I del CMH o del procesamiento antigénico. adenoviruses herpes – se une a TAP CMV – mueve los CMH al citoplasma. 3. Supresión del Sistema Inmune: EBV sintetiza un homólogo de IL-10 (viroquina). HIV - AIDS Pox viruses: receptores solubles de citoquinas – antagonistas competitivos. 4. Infección de los Linfocitos – HIV, HHV-6.
  • 73. Interferencia en las Moléculas de Clase I del MHC • Iniciación de la respuesta inmune requiere de la presentacón del Antígeno viral. • Para la destrucción de las células infectadas la presentación de antigeno viral por las moleculas de clase I del MHC es critica para iniciar una respuesta de las células T CD8+.
  • 74.
  • 75. INHIBICION DEL PROCESAMIENTO ANTIGENOS O LA EXPRESION DE MOLECULAS DE CLASE I
  • 76.
  • 78. CUAL DE LAS DOS PRUEBAS ES DIAGNOSTICO ETIOLOGICO? • LA PRUEBA SEROLOGICA O RAPIDA • LA PRUEBA MOLECULAR
  • 79.
  • 80.
  • 81.
  • 82. EL PCR IDENTIFICA TRES GENES DEL CORONAVIRUS INSERTADOS EN EL MATERIAL GENETICO HUMANO. GENES ORF1ab, GEN E, GEN N. DIAGNOSTICO ETIOLOGICO
  • 83. From: Interpreting Diagnostic Tests for SARS-CoV-2 JAMA. Published online May 06, 2020. doi:10.1001/jama.2020.8259 Variación estimada a lo largo del tiempo en las pruebas de diagnóstico para la detección de la infección por SARS-CoV-2 en relación con el inicio de los síntomas Los intervalos de tiempo estimados y las tasas de detección viral se basan en datos de varios informes publicados. Debido a la variabilidad en los valores entre los estudios, los intervalos de tiempo estimados deben considerarse aproximaciones y la probabilidad de detección de infección por SARS-CoV-2 se presenta de forma cualitativa. SARS- CoV-2 indica coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo; PCR, reacción en cadena de la polimerasa. aLa detección solo ocurre si los pacientes reciben un seguimiento proactivo desde el momento de la exposición. bEs más probable que registre un resultado negativo que positivo por PCR de un hisopo nasofaríngeo
  • 84.
  • 86. CONCLUSIONES • SRS-CoV-2 es un betacoronavirus que paso de especies animales a infectar humanos por lo que esta pandemia es una Zoonosis. • Esta pandemia hasta el dia de hoy, tal vez una de las menos letales que ha sufrido el hombre en su historia. • Esta probado por estudios de bioinformática y genómica que el virus es una adaptación natural . • La comprensión de los mecanismos moleculares de la infección permitirán hallar una mejor aproximación terapéutica a este agente patógeno asi como hallar una vacuna. • Los mecanismos de evasión viral son muy importante al inicio de la infección por eso la administración temprana de inmunomoduladores puede cambiar el curso de la infección. • El Dx clínicos en una pandemia, deben primar sobre el Dx de laboratorio, ya que sino es así, se esta retrasando la terapia que podrá agravar el curso de la infección.