Epidemiologia 4: Estructura metodologica de un trabajo cientifico, Fases de r...
Coronavirus 2020 - Prof. Dr. Juan Rodriguez-Tafur
1. Dr. MSc. Juan M. Rodríguez-Tafur Dávila
Prof. Asociado de Farmacología e Inmunología
Facultad de Medicina de San Fernando
Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Aspectos inmunopatológicos de la
infección por SARS-CoV2
3. Estela de Roma, el cuidador de
la puerta.
Epoca del Rey Amenhotep III
18ava dinastía (1400 AC)
4. “Pequeñas
criaturas
invisibles a los
ojos, llenan la
atmósfera, y las
respiramos a
través de la nariz
causando graves
enfermedades.”
Marcus Terentius
Varro, De Re Rustica
libri III (100 A.C.)
18. https://www.academia.edu/42307438/Tail_Risk_of_Contagious_Diseases
Usando métodos de la teoría del valor extremo,
examinamos Las principales pandemias de la historia,
tratando de entender sus propiedades de cola. Aplicando
el enfoque de distribución sombra desarrollado por los
autores de conflictos violentos [5], proporcionamos
aproximada estimaciones de cantidades inmediato no
observables en los datos.
Las epidemias y las pandemias son extremadamente
peligrosas, con un potencial riesgo existencial para la
humanidad. Esta propiedad debería anular las
conclusiones derivadas de los modelos de epidemiología
en lo que se refiere a eventos de cola.
.
Vemos un alto grado de incertidumbre en los modelos de
epidemiología como el modelo SIR –ya sea estructural al modelo o en
las distribuciones de parámetros, que evidentemente deberían ser
ellos mismos los eventos de cola. La recomendación es suspender las
conclusiones políticas derivadas de modelos epidemiologicos en
presencia de crecimiento multiplicativo y letalidad.
La existencia de una amenaza existencial debería afectar la política
haciendola de una manera seria y anular todas las sutilezas de
modelos epidemiológicos y de otro tipo que deberían limitarse a
informar decisiones sobre asuntos que se encuentran fuera de las
colas del distribución.
20. Virus
“Los virus son parásitos intracelulares obligados que consisten en
ADN o ARN con cubierta proteica llamada capside”
• GOODMAN & GILMAN'S THE PHARMACOLOGICAL BASIS OF THERAPEUTICS
29. ¿SARS-CoV-2 FUE PRODUCIDO EN LABORATORIO?
o Se ha discutido mucho sobre el origen del virus SARS-CoV-2, incluyendo su posible
síntesis artificial.
o El análisis de los datos disponibles sobre el genoma de este virus muestra que es
imposible que se haya producido en un laboratorio, entre otras cosas porque:
- El SARS-CoV-2 tiene diferencias de secuencia claves respecto a otros coronavirus
conocidos (de humanos, murciélagos, pangolines, etc.) que pudieran haberse usado
como base para sintetizar artificialmente este nuevo virus.
- La zona de la proteína de las espículas virales (S) que se une al receptor celular
tiene una secuencia diferente de la del SARS-CoV-1 y no es la que correspondería a
un diseño artificial basado en análisis computacionales.
Por tanto, todas las pruebas indican que este coronavirus surgió por selección natural,
evolucionando en otro animal antes de ser transferido a los humanos, o bien
evolucionando en humanos tras su transferencia.
The proximal origin of SARS-CoV-2
https://www.nature.com/articles/s41591-020-0820-9
http://nextstrain.org
30. Valencia D N (March 24, 2020) Brief Review on COVID-19:
The 2020 Pandemic Caused by SARS-CoV-2.
Cureus 12(3): e7386. doi:10.7759/cureus.7386
33. Contagio y Transmisión el SARS-CoV2
• Estornudos, Tos
• Gotas de secreciones (0.1mm)
• Cercanía (2.05 m)
• Contacto con gotas o microgotas
• Entrada en mucosas
34. JAMA. Published online March 26, 2020. doi:10.1001/jama.2020.4756
JAMA Insights March 26, 2020
Turbulent Gas Clouds and Respiratory Pathogen Emissions Potential Implications for
Reducing Transmission of COVID-19
Bourouiba L.
35. JAMA. Published online March 26, 2020. doi:10.1001/jama.2020.4756
JAMA Insights March 26, 2020
Turbulent Gas Clouds and Respiratory Pathogen Emissions Potential Implications for
Reducing Transmission of COVID-19
Bourouiba L.
30 mts/second
36. JAMA Insights March 26, 2020
Turbulent Gas Clouds and Respiratory Pathogen Emissions Potential Implications for Reducing Transmission of
COVID-19
Bourouiba L.
JAMA. Published online March 26, 2020. doi:10.1001/jama.2020.4756
DISTRIBUCION EN AMBIENTES CERRADOS
51. Proteína S (S1) → ACE2
TMPRSS2 → rompe a ACE2
TMPRSS2 → activa a Proteína S (S2)
Fusión de envoltura y membrana
Pathogens 2020, 9, 231;1:14
SARS-CoV2 VIA DE ENTRADA
A LAS CELULAS
52.
53.
54. Activación del Sistema inmunitario: Por el virus o como
consecuencia de la disminución de ECA-2 o de ambos
Injuria Inmune
65. Muerte celular: Perforinas y Granzimas en la
Infección Viral
CTL o célula NK
gránulos contienen perforinas
y granzimas.
1.granzimas2. perforinas
Endocitosis
Movimiento a través
de la actina/ fibras del
microtubulo
Almacenaje
en vesciculas
+Ca++
Lísis
Osmótica
señal
Exite evidencia que son las
granzimas endocitadas y la
union de las perforinas las
que median la migración al
nucleo de las granzimas
para la apoptosis.
Núcleo
Clivaje
y activación
de las caspasas.
Transporte de la
Gramzima B al núcleo.
Apoptosis!
72. Evasion Viral de la Inmunidad
1. Variación Antigénica – En la Influenza esto es un ejemplo clásico. Y tambien
se da en la hepatitis.
2. Inhibición de la expresión de moléculas de clase I del CMH o del
procesamiento antigénico.
adenoviruses
herpes – se une a TAP
CMV – mueve los CMH al citoplasma.
3. Supresión del Sistema Inmune:
EBV sintetiza un homólogo de IL-10 (viroquina).
HIV - AIDS
Pox viruses: receptores solubles de citoquinas – antagonistas
competitivos.
4. Infección de los Linfocitos – HIV, HHV-6.
73. Interferencia en las Moléculas de Clase
I del MHC
• Iniciación de la respuesta inmune requiere de la presentacón
del Antígeno viral.
• Para la destrucción de las células infectadas la presentación de
antigeno viral por las moleculas de clase I del MHC es critica
para iniciar una respuesta de las células T CD8+.
78. CUAL DE LAS DOS PRUEBAS ES DIAGNOSTICO
ETIOLOGICO?
• LA PRUEBA SEROLOGICA O RAPIDA
• LA PRUEBA MOLECULAR
79.
80.
81.
82. EL PCR IDENTIFICA TRES GENES DEL CORONAVIRUS
INSERTADOS EN EL MATERIAL GENETICO HUMANO.
GENES ORF1ab, GEN E, GEN N.
DIAGNOSTICO ETIOLOGICO
83. From: Interpreting Diagnostic Tests for SARS-CoV-2
JAMA. Published online May 06, 2020. doi:10.1001/jama.2020.8259
Variación estimada a lo largo del tiempo en las pruebas de diagnóstico para la detección de la infección por SARS-CoV-2 en relación con el inicio de los síntomas
Los intervalos de tiempo estimados y las tasas de detección viral se basan en datos de varios informes publicados. Debido a la variabilidad en los valores entre los estudios,
los intervalos de tiempo estimados deben considerarse aproximaciones y la probabilidad de detección de infección por SARS-CoV-2 se presenta de forma cualitativa. SARS-
CoV-2 indica coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo; PCR, reacción en cadena de la polimerasa.
aLa detección solo ocurre si los pacientes reciben un seguimiento proactivo desde el momento de la exposición.
bEs más probable que registre un resultado negativo que positivo por PCR de un hisopo nasofaríngeo
86. CONCLUSIONES
• SRS-CoV-2 es un betacoronavirus que paso de especies animales a
infectar humanos por lo que esta pandemia es una Zoonosis.
• Esta pandemia hasta el dia de hoy, tal vez una de las menos letales
que ha sufrido el hombre en su historia.
• Esta probado por estudios de bioinformática y genómica que el virus
es una adaptación natural .
• La comprensión de los mecanismos moleculares de la infección
permitirán hallar una mejor aproximación terapéutica a este agente
patógeno asi como hallar una vacuna.
• Los mecanismos de evasión viral son muy importante al inicio de la
infección por eso la administración temprana de
inmunomoduladores puede cambiar el curso de la infección.
• El Dx clínicos en una pandemia, deben primar sobre el Dx de
laboratorio, ya que sino es así, se esta retrasando la terapia que
podrá agravar el curso de la infección.