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FUNDAMENTOS DE BIOLOGÍA
MOLECULAR Y TERAPIA GENÉTICA
DR. LUIS MARTIN AGUILAR CHIRINO
OTORRINOLARINGOLOGÍA Y CIRUGÍA DE CABEZA Y CUELLO
HOSPITAL CIVIL DE CULIACÁN
CULIACÁN, SINALOA; JUNIO 2022.
 Fundamentos de biología molecular: Función celular y regulación a nivel
genómico.
 Expresión de genes: La información para conducir todos los aspectos de la
función celular se encuentran en las moléculas del ADN.
Introducción
 ADN: Cinta de 1.8m
 Empaquetada alrededor de histonas -> compresión microscópica
 La expresión genética varía dependiendo la función celular.
Introducción
Transcripción
Desórden de función
celular
Muerte celular
Proliferación celular
anormal
Cáncer
Regulación negativa
Genes supresores
tumorales
Inhibición de
proliferación celular
anormal
Mutación o pérdida Cáncer
División Celular
 Ciclo celular -> Fases de
crecimiento y reproducción =
replicación del ADN
División Celular
 Ciclo celular -> Típicamente dura
entre 10-25 horas.
 G1 = 4 a 24 horas
 M = 1 hora (células hija)
 S = Síntesis (replicación de ADN)
 G2 = Crecimiento y duplicación
celular
 G0 = descanso
Terapia de genes
 “La expresión intrínseca de ciertos genes en los tejidos del
cuerpo pueden modificarse para tratar una enfermedad.”
 Reemplazo de gen defectuoso, mejora de la expresión del
gen o supresión de la expresión de genes.
Terapia de genes
•Enfermedades hereditarias raras
•Deficiencia de enzimas
•Ej. Gen ADA en médula ósea para tratar niños con
inmunodeficiencia combinada severa (SCID)
Reemplazo de genes
•Tratamiento de enfermedades adquiridas
•Cáncer/artritis/aterosclerosis
•Linfocitos infiltrantes de tumor (TILs) – se introdujo
TNF -> se reinplantaron en paciente
Mejora de la
expresión •Protooncogen – RET
•Inactivación al expresar forma mutante de gen RET
•RNAi (interferencia) – “silenciador de genes”
•Logrando disminuir >90% el mRNA
•Evitando activación del sistema inmune
•Efectos fuera del objetivo -> genes con 7 bases
pares en secuencia homóloga
Supresión de
expresión
Terapia de genes
 Edición del Genoma: Permite añadir, remover y corregir
genes; ex vivo o envíandolas a células objetivo in vivo.
Doudna & Charpentier
Mecanismo de defensa antiviral de
origen bacteriano
Aglomeración palindrómica corta
regularmente interespaciado de
repetición (CRISPR)
CRISPR-asociadas a 9 (Cas9)
cortan las secuencias de ADN viral
Nucleasa modificada (Tijera
molecular)
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específico de ADN
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directa (HDR)
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reparación
Nucleasas con efecto parecido a
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(TALENs)
Reconocen secuencias específicas
de ADN
Menos propenso a error que NHEJ
Terapia de genes de células somáticas vs germinales
Células somáticas
Médula ósea, hígado,
células tumorales,
músculo, piel, endotelio,
tiroides
Sin alteración del material
genético hereditario
Células germinales)
Espermatozoides y
Oovocitos
Puede prevenir
enfermedades hereditarias
Terapia de genes de células somáticas vs germinales
 Objetivos de terapia genética somática
Métodos de transporte de terapia de genes
Inyección directa
de ADN/ARN
Transferencia de
genees
Modulada
por virus
Nanopartículas
-Material
genético
-Saltar
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fisiológicas e
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Inyección directa de material genético
Microinyección
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Directo a
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Electroporación
-Células cultivadas
se exponen a ADN
con un impulso
eléctrico
Crea poros y el
plásmido de ADN
entra a la célula
 Transfección -> Plásmidos -> prolongan
el efecto silencioso de los siRNAs a 3-7
días.
Lipofección
Encapsular
los
vectores
con lípidos
catiónicos
Inyección directa de RNA
siRNA
locorregional
Vía subcutánea entrando a
la microcirculación
Riesgo de fagocitosis por
macrófagos.
Vía oral
-No efectiva debido
al compromiso al
pasar por epitelio
intestinal
 TALENs y CRISPR-Cas9 + gRNA objetivo -> como mRNA o complejos de proteínas
Vía
intravenosa
siRNA con objetivo en
el gen VEGF =
reducción de tamaño
tumoral y niveles de
VEFG
Envío
hidrodinámico
-Método más común
-Grandes cantidades de
RNA en bolo IV
-Presión hidrostática
disrupte el endotelio
vascular y llega a los
tejidos.
Transporte mediados por virus
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Asociación-
adenovirus
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 Prototipo original – derivado del virus de la leucemia murina de
Moloney.
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con genes terapéuticos
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retrovirales y en línea celular con
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Transporte mediados por retrovirus
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terapia.
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Estrategias para administración de terapia de genes
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humana (90% de tumores)
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telomerasa humana
transcriptasa reversa (hTERT)
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células subsecuentemente.
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reconstructiva
 Estímulo de bFGF - > mejor vascularización
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Fundamentos de biología molecular y terapia genética

  • 1. FUNDAMENTOS DE BIOLOGÍA MOLECULAR Y TERAPIA GENÉTICA DR. LUIS MARTIN AGUILAR CHIRINO OTORRINOLARINGOLOGÍA Y CIRUGÍA DE CABEZA Y CUELLO HOSPITAL CIVIL DE CULIACÁN CULIACÁN, SINALOA; JUNIO 2022.
  • 2.  Fundamentos de biología molecular: Función celular y regulación a nivel genómico.  Expresión de genes: La información para conducir todos los aspectos de la función celular se encuentran en las moléculas del ADN. Introducción
  • 3.  ADN: Cinta de 1.8m  Empaquetada alrededor de histonas -> compresión microscópica  La expresión genética varía dependiendo la función celular. Introducción
  • 5. Desórden de función celular Muerte celular Proliferación celular anormal Cáncer Regulación negativa Genes supresores tumorales Inhibición de proliferación celular anormal Mutación o pérdida Cáncer División Celular  Ciclo celular -> Fases de crecimiento y reproducción = replicación del ADN
  • 6. División Celular  Ciclo celular -> Típicamente dura entre 10-25 horas.  G1 = 4 a 24 horas  M = 1 hora (células hija)  S = Síntesis (replicación de ADN)  G2 = Crecimiento y duplicación celular  G0 = descanso
  • 7. Terapia de genes  “La expresión intrínseca de ciertos genes en los tejidos del cuerpo pueden modificarse para tratar una enfermedad.”  Reemplazo de gen defectuoso, mejora de la expresión del gen o supresión de la expresión de genes.
  • 8. Terapia de genes •Enfermedades hereditarias raras •Deficiencia de enzimas •Ej. Gen ADA en médula ósea para tratar niños con inmunodeficiencia combinada severa (SCID) Reemplazo de genes •Tratamiento de enfermedades adquiridas •Cáncer/artritis/aterosclerosis •Linfocitos infiltrantes de tumor (TILs) – se introdujo TNF -> se reinplantaron en paciente Mejora de la expresión •Protooncogen – RET •Inactivación al expresar forma mutante de gen RET •RNAi (interferencia) – “silenciador de genes” •Logrando disminuir >90% el mRNA •Evitando activación del sistema inmune •Efectos fuera del objetivo -> genes con 7 bases pares en secuencia homóloga Supresión de expresión
  • 9. Terapia de genes  Edición del Genoma: Permite añadir, remover y corregir genes; ex vivo o envíandolas a células objetivo in vivo. Doudna & Charpentier Mecanismo de defensa antiviral de origen bacteriano Aglomeración palindrómica corta regularmente interespaciado de repetición (CRISPR) CRISPR-asociadas a 9 (Cas9) cortan las secuencias de ADN viral Nucleasa modificada (Tijera molecular) Punto de quiebre en sitio específico de ADN Reparación mediante unión no homóloga (NHEJ) Reparación mediante homología directa (HDR) Uso de molde homólogo para la reparación Nucleasas con efecto parecido a activador de transcripción (TALENs) Reconocen secuencias específicas de ADN Menos propenso a error que NHEJ
  • 10. Terapia de genes de células somáticas vs germinales Células somáticas Médula ósea, hígado, células tumorales, músculo, piel, endotelio, tiroides Sin alteración del material genético hereditario Células germinales) Espermatozoides y Oovocitos Puede prevenir enfermedades hereditarias
  • 11. Terapia de genes de células somáticas vs germinales  Objetivos de terapia genética somática
  • 12. Métodos de transporte de terapia de genes Inyección directa de ADN/ARN Transferencia de genees Modulada por virus Nanopartículas -Material genético -Saltar barreras fisiológicas e inmunológica
  • 13. Inyección directa de material genético Microinyección de plásmidos Directo a núcleo Electroporación -Células cultivadas se exponen a ADN con un impulso eléctrico Crea poros y el plásmido de ADN entra a la célula  Transfección -> Plásmidos -> prolongan el efecto silencioso de los siRNAs a 3-7 días. Lipofección Encapsular los vectores con lípidos catiónicos
  • 14. Inyección directa de RNA siRNA locorregional Vía subcutánea entrando a la microcirculación Riesgo de fagocitosis por macrófagos. Vía oral -No efectiva debido al compromiso al pasar por epitelio intestinal  TALENs y CRISPR-Cas9 + gRNA objetivo -> como mRNA o complejos de proteínas Vía intravenosa siRNA con objetivo en el gen VEGF = reducción de tamaño tumoral y niveles de VEFG Envío hidrodinámico -Método más común -Grandes cantidades de RNA en bolo IV -Presión hidrostática disrupte el endotelio vascular y llega a los tejidos.
  • 15. Transporte mediados por virus Retrovirus Adenovirus Asociación- adenovirus
  • 16. Transporte mediados por retrovirus  Prototipo original – derivado del virus de la leucemia murina de Moloney. 1er – Partículas virales defectuosas con genes terapéuticos 2do – Vectores retrovirales de integrar permanentemente el gen en los cromosomas celulares 3er – Modificaciones en vectores retrovirales y en línea celular con características seguras y
  • 17. Transporte mediados por retrovirus  Limitación – Integración sólo en células en división activa.  Complicaciones – Ensayo para tratar SCID ligado a X, enfermedad granulomatosa crónica y síndrome de Wiskott-Aldrich -> leucermia a los 2.5-5 años posterior a la terapia.  Receptores de antígeno quiméricos (CARs) -> objetivo CD19 con remisión en leucemia linfoblástica aguda refractaria y linfoma de células B grandes.
  • 18. Transporte mediados por adenovirus  Vehículos poderosos y efectivos para transferencia de genes.  No integran genes en los cromosomas  Ventaja – infectan mayor diversidad de células (sin necesidad de división celular)  1ra gen – Deleción de E1a y E3 = sin replicación; los demás genes expresados desencadenan inmunidad.  2da gen – deleción de E1a, E2a, E3 y E4 = reducción de respuestas inmune.  Última gen – “sin agallas” – Sin genes virales.
  • 19. Transporte mediados por asociación a adenovirus  Los vectores AAV no son integrables = reducen riesgos de mutagénesis y respuesta inmune innata.  La expresión de genes es reducida relativamente en comparación con retrovirus.  Los vectores AAV serotipo 2 -> Sólo pueden infectar ciertas células  Los nuevos vectores AAV serotipo 1 -> Potencial infectante 1000x
  • 20. Transporte mediados por asociación a adenovirus
  • 21. Sistemas de transporte basado en nanopartículas  Nanotecnología: “Entendimiento y control de la materia en dimensiones de 1-100nm, donde fenómenos únicos permiten aplicaciones novedosas.”  Nanomedicina: Uso de moléculas <200nm (nanopartículas) para la construcción de propiedades específicas y liberación de características que mejoran el transporte, absorción o encapsulamiento de medidas terapéuticas.
  • 22. Sistemas de transporte basado en nanopartículas  Nanopartículas lipídicas = <100nm, son las más comúnmente utilizadas.  Liposomas sensibles a pH = creados para liberar el contenido en microambiente ácido -> tumores  PEG – estabiliza el complejo siRNA-liposoma  Nanopartículas + PEG -> uso para neuroblastomas  Nanopartículas sólidas lipídicas -> transporte de medicamentos hidrofílicos e hidrofóbicos Nanopartícula Lípido/polímeros Cubiertas de polietileno glicol (PEG) Sólidas lipídicas
  • 23. Estrategias para administración de terapia de genes Ex-vivo In-vivo
  • 24. Estrategias para administración de terapia de genes  Ex-vivo: Ventaja – realizarse en laboratorio sin exposición a paciente con vector viral  Desventaja – Método de reimplantación.  In-vivo: Ventaja – infectar células hepáticas, endotelio, pulmones, tumores  Desventaja – exposición viral del paciente.
  • 25. Terapia de Genes  Posibilidad de modificar: inmunidad, crecimiento, desarrollo, regeneración y malignidad a nivel molecular. Terapia de genes Novedoso Expresión de sitio específico Mayor eficacia y eficiencia Medicina preventiva y reducción de costos Rutas de administración mejorardas
  • 26. Aplicación en Otorrinolaringología Terapia de genes Enfermedades hereditarias Oncología de cabeza y cuello (SCC) Modificación genética de TIL Estimulación in vivo de respuesta inmune antitumor Terapia de genes suicida
  • 27. Estimulación de respuesta inmune antitumor  Introducción de genes para citoquinas en células tumorales.  Tumores tienen deficiencia de expresión de antígenos MHC-1  Transferencia del gen HLA-B7 = actividad citolítica (fase clínica 1 contra SCC)  Transferencia de IL-2 -> regresión tumoral mediante estimulación de respuesta inmune citotóxica
  • 28. Terapia de genes suicida  Abordaje experimental – Inyección de herpesvirus con timidina quinasa a célula tumoral -> susceptibilidad a quimioterapia con ganciclovir.  Suspendido en 1996 por falta de recursos.
  • 29. Estrategias potenciadoras de genes Modificación de oncogenes y genes supresores de tumores Mutación en TP53 y CDKN2A = formación de tumores en cabeza y cuello Correción de gen TP53 con adenovirus Advexin (vector INGN-201) Uso de vectores con adenovirus sigue siendo controversial Inhibición de angiogenesis Regresión del aporte vascular tumoral Regresión de melanoma en ratones Enfoque en endostatina Inhibición del 45.9% de crecimiento enratones con SCC laríngeo humano Limitación de vida corta y dosis repetidas Inhibe neovascularización y crecimiento tumoral
  • 30. Estrategias supresoras de genes Silenciador de genes RNAi + técnicas de silenciador de genes Receptor de factor de crecimiento epidérmico (EGFR) Cetuximab + radioterapía Mejoría de supervivencia en paciente con cáncer de cabeza y cuello Genes inmortalizadores de células cancerígenas Complejo de telomerasa humana (90% de tumores) siRNA con adenovirus dirigido a telomerasa humana transcriptasa reversa (hTERT) Inhibición marcada de crecimiento celular con disminución de actividad de telomerasa
  • 31. Terapia de replicación de adenovirus condicionada  Infección selectiva y replicación en células tumorales objetivo con defectos genéticos heredados (ej. TP53)  Células tumorales con ausencia de TP53 permiten la replicación viral que elimina a la célula tumoral hospedera y propagarse a otras células subsecuentemente.  Primer ensayo – Onyx-015
  • 32. Terapia de Genes – Uso en cirugía plástica y reconstructiva  Estímulo de bFGF - > mejor vascularización  Estímulo IGF-1 -> mantiene masa muscular y reinnvervación  Vectores adenovirales -> factor neurotrófico en cerebro = previenen muerte de motoneuronas.  VEGF -> mediante plásmidos con lipofectina = mejora de la superviviencia de colgajos libres Terapia de genes Mejora de la expresión de factores de crecimiento Mejora de la reparación / regeneración celular Mejora de la angiogénesis y neovascularización Factores de crecimiento: TGF-a, IGF1, IGF2, PDGF, factor de crecimiento de nervios Rutas de administración mejorardas
  • 33. Terapia de Genes – Aplicacióin en laringología y neurootología  Estímulo hIGF-1 -> en músculos laríngeos de rata = incremento del diámetro muscular y placas motoras.  Introducción de gen GfB2 (conexina 26) -> mejoría de la audición en ratones con hipoacusia genética hereditaria Terapia de genes Apoyo en reparación de parálisis cordal Tratamiento para sordera en fase experimental Fases experimentales en terapia de oído interno

Notas del editor

  1. Los genes son copiados dentro del núcleo por la ARN polimerasa, lo que resulta en la producción de una hebra de ARN complementaria. Esto se procesa para producir ARN mensajero (ARNm), que sale del núcleo y se somete a una “traducción” por parte de los ribosomas para formar un producto proteico. Puede añadirsele azúcares, lípidos, fosfatos para modificar la proteína. El contro interno se realiza con enzimas citoplasmáticas -> si defectuoso = enfermedad; resguardar o liberar para efectos en el cuerpo
  2. G1 – Primera fase: enzimas, ácidos nucleícos y factores se generar y permitirán la replicación.
  3. Puede explotarse insertando el gen deseado en el área de corte del ADN para su corrección
  4. El gen transportado no es terapéutico, es un producto codificado por el gen para el resultado terapéutico esperado.
  5. Plásmido = vector de ADN circular Introducir genes a músculo o tiroides en tejidos in vivo mediante endocitosis. Los vectores de ADN son considerados “seguros”, no se incorporan en el cromosoma por lo que no alteran el genoma.
  6. Plásmido = vector de ADN circular Introducir genes a músculo o tiroides en tejidos in vivo mediante endocitosis. Los vectores de ADN son considerados “seguros”, no se incorporan en el cromosoma por lo que no alteran el genoma.
  7. Contrucción de partículas virales sintéticas sin función patológica e incapaces de reproducirse, con gen terapéutico en el genoma viral
  8. 1er – Capaces de infectar sin expresar patogenia 2do
  9. Reacción atribuida a activación de proto-oncogenes. CARs ha desencadenado síndrome de liberación de citoquinas y neurotoxicidad.
  10. 1- Baja eficiencia pero podría ayudar a estrategias de vacunas 2-Aumenta eficiencia de transporte de genes pero puede desencadenar problemas de seguridad 3-Facilita el cruce hacia la célula.
  11. 1- Baja eficiencia pero podría ayudar a estrategias de vacunas 2-Aumenta eficiencia de transporte de genes pero puede desencadenar problemas de seguridad 3-Facilita el cruce hacia la célula.
  12. Cáncer de mama -> lisosomas sensibles a pH con siRNA con oncogen objetivo indujeron regresión tumoral Nanopartícula con paclitaxel y siRNA con objetivo a la proteína Mcl-1 indujo regresión tumoral en carcinoma epitelial
  13. Ex-vivo: tejido de paciente es removido mediante biopsia, las célula se cultivan y se integran con genes, se re-implantan mediante transplante autólogo. In-vivo: Vectores DNA o virales (predominante adenovirales) se administran directamente en paciente.
  14. Ex-vivo: introducir permanentemente el gen recombinante en el paciente. In vivo – varía con respecto al tejido y enfermedad.
  15. Expresión de proteínas humanas en una dirección terapeútica
  16. Fibrosis quística -> introducción de gen CFTR en mucosa nasal normal con adenovirus. Estimulacion de TILs y mejora de supotencial antitumoral
  17. Onyx-015 -> deleción del gen para codificación de proteína unida a p53, el E1b-55 kDa
  18. bFGF (factor básico de crecimiento de fibroblastos) IGF- factor de crecimiento semejante a insulina
  19. Transporte adenoviral del gen Atoh-1 en conejillos de india resultaron en transformación de células no sensitivas en células ciliadas funcionales.